184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3115 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_3115  protein of unknown function DUF421  100 
 
 
229 aa  476  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5259  protein of unknown function DUF421  57.02 
 
 
229 aa  278  4e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0520  protein of unknown function DUF421  55.8 
 
 
233 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0626  protein of unknown function DUF421  49.55 
 
 
239 aa  231  5e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0141494  normal  0.718153 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5258  membrane protein-like protein  38.86 
 
 
228 aa  179  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0519  protein of unknown function DUF421  39.91 
 
 
228 aa  178  5.999999999999999e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3116  protein of unknown function DUF421  36.96 
 
 
229 aa  158  8e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0625  protein of unknown function DUF421  34.8 
 
 
226 aa  154  8e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00740952  normal  0.965778 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2617  hypothetical protein  31.84 
 
 
230 aa  144  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2194  protein of unknown function DUF421  30.63 
 
 
232 aa  119  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2726  hypothetical protein  31.98 
 
 
230 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3028  membrane protein-like protein  31.53 
 
 
230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2791  hypothetical protein  30.05 
 
 
272 aa  108  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.169514  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1130  hypothetical protein  29.58 
 
 
272 aa  107  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1426  hypothetical protein  27.8 
 
 
230 aa  105  4e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.320436  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1415  hypothetical protein  27.03 
 
 
227 aa  102  5e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.228022 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3232  protein of unknown function DUF421  27.9 
 
 
230 aa  99.4  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.151812  normal  0.639877 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00910  conserved inner membrane protein  26.91 
 
 
230 aa  98.2  9e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2737  protein of unknown function DUF421  26.91 
 
 
230 aa  98.2  9e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0253622  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2422  hypothetical protein  26.91 
 
 
230 aa  98.2  9e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000473983  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00917  hypothetical protein  26.91 
 
 
230 aa  98.2  9e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1012  hypothetical protein  26.91 
 
 
230 aa  98.2  9e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000212287  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1003  hypothetical protein  26.91 
 
 
230 aa  98.2  9e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0243553  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2690  hypothetical protein  26.91 
 
 
230 aa  98.2  9e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.355377  normal  0.77182 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5467  protein of unknown function DUF421  27.06 
 
 
225 aa  97.8  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.244646 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2215  hypothetical protein  26.91 
 
 
230 aa  97.4  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.297842 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1009  hypothetical protein  27.35 
 
 
230 aa  95.5  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1074  hypothetical protein  27.35 
 
 
230 aa  95.5  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.325553 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0981  hypothetical protein  27.35 
 
 
230 aa  95.1  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00314697  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1040  hypothetical protein  27.35 
 
 
230 aa  95.1  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.169724  normal  0.241147 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1089  hypothetical protein  27.35 
 
 
230 aa  95.1  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1067  hypothetical protein  26.46 
 
 
230 aa  95.1  9e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0942748  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3175  hypothetical protein  26.7 
 
 
227 aa  79.3  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.979599  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1504  hypothetical protein  33.94 
 
 
177 aa  77.8  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1555  hypothetical protein  30.77 
 
 
232 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2084  protein of unknown function DUF421  32.43 
 
 
228 aa  73.2  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.138808  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2154  hypothetical protein  28.24 
 
 
188 aa  72.4  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0961076  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0436  hypothetical protein  30.46 
 
 
224 aa  72.4  0.000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617619  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5983  hypothetical protein  28.97 
 
 
165 aa  71.6  0.000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0201045 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3273  protein of unknown function DUF421  27.61 
 
 
232 aa  71.6  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1348  hypothetical protein  27.97 
 
 
232 aa  69.7  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6410  membrane protein-like protein  33.1 
 
 
170 aa  67.8  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0321  protein of unknown function DUF421  26.67 
 
 
241 aa  67.8  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.78667 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2486  hypothetical protein  27.5 
 
 
163 aa  66.2  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0321  hypothetical protein  26.75 
 
 
225 aa  66.6  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.911962  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1108  hypothetical protein  27.22 
 
 
175 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.628779  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0947  protein of unknown function DUF421  22.78 
 
 
178 aa  66.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.528971  normal  0.296252 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0702  hypothetical protein  27.71 
 
 
215 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00491681  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1251  protein of unknown function DUF421  26.63 
 
 
175 aa  65.1  0.0000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12630  predicted membrane protein  24.49 
 
 
211 aa  64.7  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2513  hypothetical protein  25.31 
 
 
235 aa  64.7  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4943  hypothetical protein  25.75 
 
 
289 aa  64.7  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2764  hypothetical protein  24.86 
 
 
172 aa  63.9  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0914  hypothetical protein  25.79 
 
 
172 aa  64.3  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0566  hypothetical protein  26.06 
 
 
237 aa  64.3  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6863  protein of unknown function DUF421  27.08 
 
 
146 aa  63.5  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0220  hypothetical protein  28.74 
 
 
253 aa  63.2  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3305  protein of unknown function DUF421  28.24 
 
 
258 aa  63.5  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00266927  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3352  protein of unknown function DUF421  25.9 
 
 
173 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5269  hypothetical protein  26.04 
 
 
289 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5253  hypothetical protein  26.04 
 
 
289 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0198  protein of unknown function DUF421  26.95 
 
 
164 aa  62.4  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4082  protein of unknown function DUF421  25.66 
 
 
171 aa  62.4  0.000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4363  hypothetical protein  27.27 
 
 
167 aa  62  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2562  hypothetical protein  25.81 
 
 
164 aa  60.8  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0204  hypothetical protein  25.68 
 
 
289 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2343  protein of unknown function DUF421  28.07 
 
 
170 aa  61.6  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3332  hypothetical protein  26.38 
 
 
175 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3992  hypothetical protein  27.27 
 
 
226 aa  61.2  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0523  protein of unknown function DUF421  26.11 
 
 
175 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0792  protein of unknown function DUF421  26.47 
 
 
286 aa  60.8  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3692  hypothetical protein  25.44 
 
 
289 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5311  hypothetical protein  25.68 
 
 
289 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0231  hypothetical protein  25.68 
 
 
289 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.723048  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0719  protein of unknown function DUF421  27.01 
 
 
286 aa  59.7  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0408  hypothetical protein  24.85 
 
 
289 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4224  hypothetical protein  25.32 
 
 
196 aa  59.7  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.434687  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0112  hypothetical protein  24.24 
 
 
166 aa  59.3  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0919  hypothetical protein  29.49 
 
 
155 aa  59.7  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.043093 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2415  hypothetical protein  23.78 
 
 
166 aa  59.7  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.696624  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0551  membrane protein-like protein  24.06 
 
 
180 aa  59.3  0.00000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000937148 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5688  hypothetical protein  25.44 
 
 
289 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2189  hypothetical protein  24.71 
 
 
241 aa  58.9  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000145811  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4828  hypothetical protein  25.44 
 
 
289 aa  58.9  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4843  hypothetical protein  25.44 
 
 
289 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6439  conserved hypothetical membrane-anchored protein  26.53 
 
 
150 aa  58.9  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0434  hypothetical protein  22.86 
 
 
179 aa  58.5  0.00000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1469  hypothetical protein  25.71 
 
 
226 aa  58.5  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02060  predicted membrane protein  26.35 
 
 
164 aa  58.5  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5235  hypothetical protein  25.44 
 
 
289 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4999  hypothetical protein  25.44 
 
 
289 aa  58.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0854  hypothetical protein  29.61 
 
 
155 aa  57.8  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5379  hypothetical protein  25.44 
 
 
289 aa  58.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3563  hypothetical protein  25.68 
 
 
158 aa  58.2  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.9488  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2581  membrane protein-like protein  24.65 
 
 
172 aa  57.8  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.604139  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05340  predicted membrane protein  24.07 
 
 
242 aa  57.8  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00296282  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2187  hypothetical protein  24.85 
 
 
289 aa  57.4  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000023722  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3409  hypothetical protein  28.57 
 
 
172 aa  57  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00991237  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11408  hypothetical protein  24.34 
 
 
181 aa  57  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0751825  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2827  hypothetical protein  23.13 
 
 
165 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.209727  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>