207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2194 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2194  protein of unknown function DUF421  100 
 
 		 232 aa  473  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2617  hypothetical protein  48.71 
 
 		 230 aa  224  1e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3232  protein of unknown function DUF421  46.82 
 
 		 230 aa  213  2.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.151812  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1415  hypothetical protein  42.54 
 
 		 227 aa  187  2e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.228022 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5467  protein of unknown function DUF421  42.04 
 
 		 225 aa  179  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.244646 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2215  hypothetical protein  41.74 
 
 		 230 aa  178  5.999999999999999e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.297842 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1067  hypothetical protein  41.28 
 
 		 230 aa  176  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0942748  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00910  conserved inner membrane protein  41.28 
 
 		 230 aa  176  3e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2737  protein of unknown function DUF421  41.28 
 
 		 230 aa  176  3e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0253622  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2690  hypothetical protein  41.28 
 
 		 230 aa  176  3e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.355377  normal  0.77182 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00917  hypothetical protein  41.28 
 
 		 230 aa  176  3e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1012  hypothetical protein  41.28 
 
 		 230 aa  176  3e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000212287  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1003  hypothetical protein  41.28 
 
 		 230 aa  176  3e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0243553  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2422  hypothetical protein  41.28 
 
 		 230 aa  176  3e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000473983  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1426  hypothetical protein  36.12 
 
 		 230 aa  172  2.9999999999999996e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.320436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1074  hypothetical protein  38.77 
 
 		 230 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.325553 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1009  hypothetical protein  38.77 
 
 		 230 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1040  hypothetical protein  38.77 
 
 		 230 aa  170  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.169724  normal  0.241147 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0981  hypothetical protein  38.77 
 
 		 230 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00314697  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1089  hypothetical protein  38.33 
 
 		 230 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2726  hypothetical protein  40 
 
 		 230 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3028  membrane protein-like protein  39.56 
 
 		 230 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3115  protein of unknown function DUF421  30.63 
 
 		 229 aa  119  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2791  hypothetical protein  33.8 
 
 		 272 aa  118  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.169514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1130  hypothetical protein  33.8 
 
 		 272 aa  118  9e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5259  protein of unknown function DUF421  32.14 
 
 		 229 aa  113  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5258  membrane protein-like protein  27.56 
 
 		 228 aa  112  7.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0519  protein of unknown function DUF421  35.71 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0625  protein of unknown function DUF421  30.32 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00740952  normal  0.965778 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0626  protein of unknown function DUF421  28.07 
 
 		 239 aa  103  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0141494  normal  0.718153 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2486  hypothetical protein  37.59 
 
 		 163 aa  100  3e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2154  hypothetical protein  32.26 
 
 		 188 aa  92  7e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0961076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0520  protein of unknown function DUF421  29.6 
 
 		 233 aa  90.1  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3116  protein of unknown function DUF421  27.43 
 
 		 229 aa  87.4  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5983  hypothetical protein  30.52 
 
 		 165 aa  80.5  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0201045 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3992  hypothetical protein  28.48 
 
 		 226 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0321  hypothetical protein  30.06 
 
 		 225 aa  79.3  0.00000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.911962  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3820  hypothetical protein  30.5 
 
 		 171 aa  78.2  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2764  hypothetical protein  27.08 
 
 		 172 aa  77.8  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3332  hypothetical protein  29.86 
 
 		 175 aa  76.3  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3563  hypothetical protein  34.04 
 
 		 158 aa  76.3  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.9488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3305  protein of unknown function DUF421  31.95 
 
 		 258 aa  75.9  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00266927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05340  predicted membrane protein  24.86 
 
 		 242 aa  74.3  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00296282  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4363  hypothetical protein  28.67 
 
 		 167 aa  74.3  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0854  hypothetical protein  30.61 
 
 		 155 aa  74.7  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3175  hypothetical protein  27.54 
 
 		 227 aa  73.9  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.979599  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2827  membrane protein-like protein  28.47 
 
 		 165 aa  74.3  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.138476 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2671  protein of unknown function DUF421  25.87 
 
 		 242 aa  73.2  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113456  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2415  hypothetical protein  25 
 
 		 166 aa  72.8  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.696624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2566  hypothetical protein  25.45 
 
 		 165 aa  72  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.31826  hitchhiker  0.0000735154 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0919  hypothetical protein  30.5 
 
 		 155 aa  72  0.000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.043093 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2084  protein of unknown function DUF421  25 
 
 		 228 aa  71.2  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.138808  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3273  protein of unknown function DUF421  30.77 
 
 		 232 aa  71.6  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0434  hypothetical protein  25.53 
 
 		 179 aa  70.5  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0914  hypothetical protein  29.33 
 
 		 172 aa  69.7  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3352  protein of unknown function DUF421  28.89 
 
 		 173 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0436  hypothetical protein  23.93 
 
 		 224 aa  68.9  0.00000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617619  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11070  conserved hypothetical membrane-anchored protein  24.66 
 
 		 149 aa  68.6  0.00000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0551  membrane protein-like protein  25.6 
 
 		 180 aa  68.6  0.00000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000937148 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0769  hypothetical protein  25 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0707  hypothetical protein  29.17 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0159977  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5688  hypothetical protein  26.49 
 
 		 289 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0399  protein of unknown function DUF421  30.26 
 
 		 166 aa  68.2  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4828  hypothetical protein  25.95 
 
 		 289 aa  67  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4212  protein of unknown function DUF421  27.21 
 
 		 188 aa  67  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.983168 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11408  hypothetical protein  25 
 
 		 181 aa  67  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0751825  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2513  hypothetical protein  29.88 
 
 		 235 aa  67  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4843  hypothetical protein  25.95 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02060  predicted membrane protein  28.29 
 
 		 164 aa  67  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0220  hypothetical protein  30.54 
 
 		 253 aa  67  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4999  hypothetical protein  26.35 
 
 		 289 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0408  hypothetical protein  25.44 
 
 		 289 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5379  hypothetical protein  26.35 
 
 		 289 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5235  hypothetical protein  26.35 
 
 		 289 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03310  hypothetical protein  27.34 
 
 		 170 aa  66.2  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2827  hypothetical protein  27.46 
 
 		 165 aa  66.2  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.209727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0198  protein of unknown function DUF421  25.34 
 
 		 164 aa  65.9  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2218  hypothetical protein  29.41 
 
 		 172 aa  65.9  0.0000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.450386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3177  hypothetical protein  24.31 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755267  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3285  membrane protein-like protein  27.33 
 
 		 160 aa  65.5  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.22155  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0719  protein of unknown function DUF421  26.16 
 
 		 286 aa  65.5  0.0000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1504  hypothetical protein  26 
 
 		 177 aa  65.5  0.0000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0321  protein of unknown function DUF421  26.53 
 
 		 241 aa  65.5  0.0000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.78667 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2247  protein of unknown function DUF421  28.86 
 
 		 168 aa  65.1  0.0000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2187  hypothetical protein  27.61 
 
 		 289 aa  64.7  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000023722  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2189  hypothetical protein  30.77 
 
 		 241 aa  64.7  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000145811  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2636  protein of unknown function DUF421  25.69 
 
 		 161 aa  64.7  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.753675  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1555  hypothetical protein  25.9 
 
 		 232 aa  65.1  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0112  hypothetical protein  24.65 
 
 		 166 aa  64.3  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1459  hypothetical protein  23.61 
 
 		 151 aa  63.9  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.902977  normal  0.138264 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1348  hypothetical protein  25.18 
 
 		 232 aa  64.3  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12630  predicted membrane protein  22.5 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0566  hypothetical protein  25.62 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3133  hypothetical protein  22.22 
 
 		 149 aa  63.5  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.152895 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0127  hypothetical protein  29.37 
 
 		 241 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4943  hypothetical protein  26.01 
 
 		 289 aa  63.2  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2343  protein of unknown function DUF421  28.19 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1469  hypothetical protein  26.95 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1059  protein of unknown function DUF421  25.15 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4754  hypothetical protein  27.08 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204724  normal  0.0118925 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>