205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3285 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3285  membrane protein-like protein  100 
 
 		 160 aa  310  3.9999999999999997e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.22155  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2827  membrane protein-like protein  73.42 
 
 		 165 aa  226  8e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.138476 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3992  hypothetical protein  70.25 
 
 		 226 aa  220  7e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3352  protein of unknown function DUF421  67.11 
 
 		 173 aa  192  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3820  hypothetical protein  58.33 
 
 		 171 aa  174  4e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4212  protein of unknown function DUF421  58.94 
 
 		 188 aa  174  6e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.983168 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1504  hypothetical protein  53.5 
 
 		 177 aa  167  4e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2670  hypothetical protein  55.48 
 
 		 175 aa  157  5e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2641  hypothetical protein  55.48 
 
 		 175 aa  156  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.865763  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2686  hypothetical protein  55.48 
 
 		 175 aa  156  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.565782  normal  0.0102559 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3836  hypothetical protein  74.31 
 
 		 121 aa  156  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.147989  normal  0.0810838 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1313  protein of unknown function DUF421  45.81 
 
 		 184 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1589  hypothetical protein  43.42 
 
 		 185 aa  144  4.0000000000000006e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0112  hypothetical protein  51.75 
 
 		 166 aa  143  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4346  protein of unknown function DUF421  55.13 
 
 		 174 aa  138  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0250687  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6410  membrane protein-like protein  45.39 
 
 		 170 aa  130  5e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0399  protein of unknown function DUF421  50.66 
 
 		 166 aa  124  8.000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0551  membrane protein-like protein  38.96 
 
 		 180 aa  122  3e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000937148 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0434  hypothetical protein  35.9 
 
 		 179 aa  116  9.999999999999999e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2271  hypothetical protein  38.71 
 
 		 170 aa  108  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03310  hypothetical protein  39.31 
 
 		 170 aa  89.7  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3940  hypothetical protein  32.48 
 
 		 159 aa  88.6  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.179392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2218  hypothetical protein  38.93 
 
 		 172 aa  87.8  6e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.450386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1106  membrane protein-like protein  30.37 
 
 		 227 aa  86.7  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00481139  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0914  hypothetical protein  36.64 
 
 		 172 aa  85.9  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0436  hypothetical protein  30.14 
 
 		 224 aa  85.5  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617619  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11408  hypothetical protein  32 
 
 		 181 aa  85.1  3e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0751825  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1012  protein of unknown function DUF421  32.31 
 
 		 243 aa  84.7  5e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5983  hypothetical protein  30.77 
 
 		 165 aa  83.6  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0201045 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0321  hypothetical protein  31.82 
 
 		 225 aa  80.9  0.000000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.911962  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2247  protein of unknown function DUF421  28.67 
 
 		 168 aa  81.3  0.000000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0198  protein of unknown function DUF421  30.15 
 
 		 164 aa  80.9  0.000000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2201  membrane protein-like protein  31.85 
 
 		 186 aa  80.9  0.000000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3305  protein of unknown function DUF421  30.66 
 
 		 258 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00266927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1469  hypothetical protein  29.2 
 
 		 226 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2581  membrane protein-like protein  28.17 
 
 		 172 aa  79  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.604139  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4082  protein of unknown function DUF421  28.97 
 
 		 171 aa  78.2  0.00000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3175  hypothetical protein  26.28 
 
 		 227 aa  78.2  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.979599  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3409  hypothetical protein  28.47 
 
 		 172 aa  77.8  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00991237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3224  protein of unknown function DUF421  28.89 
 
 		 173 aa  77.4  0.00000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826771  normal  0.0304981 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2513  hypothetical protein  26.67 
 
 		 235 aa  77  0.00000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3510  hypothetical protein  32.86 
 
 		 146 aa  75.9  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3563  hypothetical protein  36.03 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.9488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1799  protein of unknown function DUF421  30.83 
 
 		 224 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0271913  normal  0.21316 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6439  conserved hypothetical membrane-anchored protein  29.37 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1555  hypothetical protein  26.03 
 
 		 232 aa  75.1  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0702  hypothetical protein  27.01 
 
 		 215 aa  74.7  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00491681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2639  YdfS  28.28 
 
 		 236 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1348  hypothetical protein  26.03 
 
 		 232 aa  74.3  0.0000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05340  predicted membrane protein  26.12 
 
 		 242 aa  74.3  0.0000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00296282  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4754  hypothetical protein  32.14 
 
 		 146 aa  74.3  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204724  normal  0.0118925 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0719  protein of unknown function DUF421  26.57 
 
 		 286 aa  73.2  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2343  protein of unknown function DUF421  31.47 
 
 		 170 aa  73.6  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12630  predicted membrane protein  30.15 
 
 		 211 aa  72  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0812  protein of unknown function DUF421  37.41 
 
 		 173 aa  72  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.954202 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6863  protein of unknown function DUF421  28.17 
 
 		 146 aa  71.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1026  hypothetical protein  39.62 
 
 		 172 aa  71.6  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.170093  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3177  hypothetical protein  29.41 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755267  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5498  hypothetical protein  33.56 
 
 		 173 aa  71.2  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0947  protein of unknown function DUF421  32.19 
 
 		 178 aa  70.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.528971  normal  0.296252 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2636  protein of unknown function DUF421  31.88 
 
 		 161 aa  70.9  0.000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.753675  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1459  hypothetical protein  31.65 
 
 		 151 aa  70.5  0.000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.902977  normal  0.138264 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3273  protein of unknown function DUF421  26.28 
 
 		 232 aa  70.5  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0566  hypothetical protein  25.81 
 
 		 237 aa  70.9  0.000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0792  protein of unknown function DUF421  27.27 
 
 		 286 aa  70.9  0.000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1251  protein of unknown function DUF421  31.41 
 
 		 175 aa  70.5  0.000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1485  protein of unknown function DUF421  29.93 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3005  hypothetical protein  28.36 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.166871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3332  hypothetical protein  27.46 
 
 		 175 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2202  hypothetical protein  32.52 
 
 		 167 aa  70.5  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359342 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1108  hypothetical protein  32.05 
 
 		 175 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.628779  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4499  hypothetical protein  27.69 
 
 		 215 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00871532  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0321  protein of unknown function DUF421  24.26 
 
 		 241 aa  69.3  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.78667 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2764  hypothetical protein  29.1 
 
 		 172 aa  69.7  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4548  hypothetical protein  27.69 
 
 		 215 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00119776  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2415  hypothetical protein  29.41 
 
 		 166 aa  69.3  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.696624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6233  hypothetical protein  33.57 
 
 		 160 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303175  normal  0.107487 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2566  hypothetical protein  29.03 
 
 		 165 aa  69.3  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.31826  hitchhiker  0.0000735154 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2084  protein of unknown function DUF421  24.83 
 
 		 228 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.138808  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0523  protein of unknown function DUF421  30.52 
 
 		 175 aa  68.9  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2194  protein of unknown function DUF421  27.21 
 
 		 232 aa  68.9  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0711  protein of unknown function DUF421  30.88 
 
 		 248 aa  68.6  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2090  hypothetical protein  29.85 
 
 		 245 aa  68.9  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2146  hypothetical protein  29.08 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.573525  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1415  hypothetical protein  21.62 
 
 		 227 aa  67.4  0.00000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.228022 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0919  hypothetical protein  33.33 
 
 		 155 aa  67  0.00000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.043093 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4261  hypothetical protein  27.2 
 
 		 218 aa  67  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00116962  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4309  hypothetical protein  26.15 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0126531  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4158  hypothetical protein  26.15 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0166527  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1938  protein of unknown function DUF421  25.56 
 
 		 236 aa  66.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4644  hypothetical protein  26.15 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.101491  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3232  protein of unknown function DUF421  25.85 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.151812  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4533  hypothetical protein  26.15 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0230316  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2726  hypothetical protein  28.89 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1658  protein of unknown function DUF421  26.52 
 
 		 286 aa  66.2  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4147  hypothetical protein  26.15 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000615268  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4494  hypothetical protein  26.15 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000327358 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06995  hypothetical protein  30.77 
 
 		 174 aa  66.2  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.294218  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1466  hypothetical protein  28.89 
 
 		 286 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11070  conserved hypothetical membrane-anchored protein  27.21 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>