146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_6233 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_6233  hypothetical protein  100 
 
 
160 aa  309  1e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303175  normal  0.107487 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3817  hypothetical protein  40.26 
 
 
163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4894  hypothetical protein  40.26 
 
 
163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.292864 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5498  hypothetical protein  39.61 
 
 
173 aa  105  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2030  hypothetical protein  38.96 
 
 
164 aa  102  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.334364  normal  0.673359 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0071  hypothetical protein  34.62 
 
 
159 aa  101  5e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2237  hypothetical protein  38.96 
 
 
163 aa  100  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2115  hypothetical membrane associated protein  33.97 
 
 
199 aa  99  3e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4224  hypothetical protein  36.71 
 
 
196 aa  98.2  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.434687  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2562  hypothetical protein  37.5 
 
 
164 aa  96.7  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1339  hypothetical protein  41.77 
 
 
167 aa  94.7  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3114  hypothetical protein  41.77 
 
 
167 aa  94.7  5e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2990  hypothetical protein  41.77 
 
 
167 aa  94.7  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.138787  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4363  hypothetical protein  35.21 
 
 
167 aa  92.4  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5983  hypothetical protein  33.1 
 
 
165 aa  84.3  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0201045 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2202  hypothetical protein  33.33 
 
 
167 aa  83.6  9e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.359342 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1589  hypothetical protein  37.11 
 
 
185 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2536  hypothetical protein  37.75 
 
 
182 aa  78.2  0.00000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0051  hypothetical protein  30.19 
 
 
160 aa  77  0.00000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0053  hypothetical protein  30.19 
 
 
160 aa  77  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0702  hypothetical protein  31.39 
 
 
215 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00491681  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3051  protein of unknown function DUF421  36.29 
 
 
155 aa  75.5  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2827  hypothetical protein  31.51 
 
 
165 aa  74.3  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.209727  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3940  hypothetical protein  35.92 
 
 
159 aa  73.2  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.179392  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2827  membrane protein-like protein  37.41 
 
 
165 aa  70.9  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.138476 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4261  hypothetical protein  33.87 
 
 
218 aa  70.9  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00116962  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4499  hypothetical protein  32.26 
 
 
215 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00871532  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4548  hypothetical protein  32.26 
 
 
215 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00119776  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3992  hypothetical protein  34.69 
 
 
226 aa  68.6  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0919  hypothetical protein  30.41 
 
 
155 aa  68.2  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.043093 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0854  hypothetical protein  30.41 
 
 
155 aa  67.8  0.00000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4533  hypothetical protein  31.45 
 
 
215 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0230316  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0112  hypothetical protein  33.59 
 
 
166 aa  67  0.00000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4147  hypothetical protein  31.45 
 
 
215 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000615268  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3383  hypothetical protein  32.19 
 
 
158 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4494  hypothetical protein  31.45 
 
 
215 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000327358 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2247  protein of unknown function DUF421  25.56 
 
 
168 aa  66.2  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4309  hypothetical protein  30.65 
 
 
215 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0126531  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4158  hypothetical protein  30.65 
 
 
215 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0166527  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4644  hypothetical protein  30.65 
 
 
215 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.101491  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05340  predicted membrane protein  27.21 
 
 
242 aa  65.5  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00296282  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3332  hypothetical protein  28.67 
 
 
175 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0825  hypothetical protein  32.41 
 
 
205 aa  63.5  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.102228 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1313  protein of unknown function DUF421  29.32 
 
 
184 aa  62  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3285  membrane protein-like protein  32.48 
 
 
160 aa  61.6  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.22155  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1106  membrane protein-like protein  27.74 
 
 
227 aa  61.2  0.000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00481139  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2670  hypothetical protein  30.41 
 
 
175 aa  60.5  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4212  protein of unknown function DUF421  32.21 
 
 
188 aa  59.3  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.983168 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3563  hypothetical protein  30.14 
 
 
158 aa  58.5  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.9488  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4082  protein of unknown function DUF421  25.37 
 
 
171 aa  58.2  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0321  protein of unknown function DUF421  27.01 
 
 
241 aa  58.2  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.78667 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1469  hypothetical protein  28.78 
 
 
226 aa  57  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2154  hypothetical protein  29.11 
 
 
188 aa  56.2  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0961076  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2641  hypothetical protein  29.73 
 
 
175 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.865763  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2686  hypothetical protein  29.73 
 
 
175 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.565782  normal  0.0102559 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0626  protein of unknown function DUF421  29.49 
 
 
239 aa  55.5  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0141494  normal  0.718153 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3224  protein of unknown function DUF421  22.3 
 
 
173 aa  55.8  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826771  normal  0.0304981 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1012  protein of unknown function DUF421  28.8 
 
 
243 aa  54.7  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0434  hypothetical protein  26.47 
 
 
179 aa  54.7  0.0000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0551  membrane protein-like protein  25.55 
 
 
180 aa  54.3  0.0000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000937148 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3305  protein of unknown function DUF421  28.57 
 
 
258 aa  54.3  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00266927  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1504  hypothetical protein  27.27 
 
 
177 aa  53.9  0.0000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2343  protein of unknown function DUF421  27.4 
 
 
170 aa  53.9  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2218  hypothetical protein  29.41 
 
 
172 aa  53.5  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.450386  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0674  hypothetical protein  23.94 
 
 
143 aa  53.9  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3352  protein of unknown function DUF421  28.86 
 
 
173 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3820  hypothetical protein  30.14 
 
 
171 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1130  hypothetical protein  28.21 
 
 
272 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3510  hypothetical protein  28.17 
 
 
146 aa  52.8  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0399  protein of unknown function DUF421  29.38 
 
 
166 aa  52.8  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2791  hypothetical protein  28.21 
 
 
272 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.169514  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6439  conserved hypothetical membrane-anchored protein  27.97 
 
 
150 aa  53.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12630  predicted membrane protein  25.18 
 
 
211 aa  52  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11408  hypothetical protein  27.78 
 
 
181 aa  52.4  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0751825  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02060  predicted membrane protein  26.76 
 
 
164 aa  51.6  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6410  membrane protein-like protein  28.19 
 
 
170 aa  50.4  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0198  protein of unknown function DUF421  25 
 
 
164 aa  50.4  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2617  hypothetical protein  22.78 
 
 
230 aa  50.1  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3005  hypothetical protein  27.91 
 
 
147 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.166871  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0711  protein of unknown function DUF421  24.46 
 
 
248 aa  50.1  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1009  hypothetical protein  24.09 
 
 
230 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1074  hypothetical protein  24.09 
 
 
230 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.325553 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1089  hypothetical protein  24.09 
 
 
230 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0981  hypothetical protein  24.09 
 
 
230 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00314697  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1040  hypothetical protein  24.09 
 
 
230 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.169724  normal  0.241147 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2146  hypothetical protein  22.54 
 
 
202 aa  49.7  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.573525  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4754  hypothetical protein  26.39 
 
 
146 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204724  normal  0.0118925 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03310  hypothetical protein  27.2 
 
 
170 aa  49.7  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2563  hypothetical protein  21.37 
 
 
165 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2763  hypothetical protein  21.37 
 
 
165 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000337071 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3273  protein of unknown function DUF421  25.36 
 
 
232 aa  48.9  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6863  protein of unknown function DUF421  25 
 
 
146 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2513  hypothetical protein  25.17 
 
 
235 aa  48.5  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3115  protein of unknown function DUF421  27.22 
 
 
229 aa  48.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0436  hypothetical protein  21.17 
 
 
224 aa  47.8  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617619  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3175  hypothetical protein  21.58 
 
 
227 aa  47.8  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.979599  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2215  hypothetical protein  23.36 
 
 
230 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.297842 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1067  hypothetical protein  23.36 
 
 
230 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0942748  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2737  protein of unknown function DUF421  23.36 
 
 
230 aa  47.4  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0253622  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00917  hypothetical protein  23.36 
 
 
230 aa  47.4  0.00009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>