160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4894 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_3817  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  319  9.000000000000001e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4894  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  319  9.000000000000001e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.292864 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2030  hypothetical protein  63.58 
 
 		 164 aa  217  3.9999999999999997e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.334364  normal  0.673359 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2237  hypothetical protein  60.74 
 
 		 163 aa  208  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5498  hypothetical protein  62.73 
 
 		 173 aa  205  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1339  hypothetical protein  61.15 
 
 		 167 aa  174  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3114  hypothetical protein  61.15 
 
 		 167 aa  174  4e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2990  hypothetical protein  61.15 
 
 		 167 aa  174  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.138787  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2562  hypothetical protein  41.72 
 
 		 164 aa  141  5e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4224  hypothetical protein  39.49 
 
 		 196 aa  123  9e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.434687  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6233  hypothetical protein  40.26 
 
 		 160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303175  normal  0.107487 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0071  hypothetical protein  30.13 
 
 		 159 aa  88.6  3e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2202  hypothetical protein  36.02 
 
 		 167 aa  87.4  7e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359342 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2115  hypothetical membrane associated protein  29.75 
 
 		 199 aa  86.3  1e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2536  hypothetical protein  37.34 
 
 		 182 aa  84  9e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5983  hypothetical protein  30.82 
 
 		 165 aa  79  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0201045 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4363  hypothetical protein  32.14 
 
 		 167 aa  74.3  0.0000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2247  protein of unknown function DUF421  29.14 
 
 		 168 aa  73.2  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3940  hypothetical protein  35.42 
 
 		 159 aa  72.8  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.179392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6439  conserved hypothetical membrane-anchored protein  29.05 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1589  hypothetical protein  27.86 
 
 		 185 aa  68.6  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3005  hypothetical protein  30.56 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.166871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1313  protein of unknown function DUF421  28.4 
 
 		 184 aa  67.8  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3177  hypothetical protein  29.25 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755267  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3332  hypothetical protein  29.5 
 
 		 175 aa  67  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1106  membrane protein-like protein  28.28 
 
 		 227 aa  64.7  0.0000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00481139  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0711  protein of unknown function DUF421  28.08 
 
 		 248 aa  64.7  0.0000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11070  conserved hypothetical membrane-anchored protein  28.47 
 
 		 149 aa  63.5  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0051  hypothetical protein  24.84 
 
 		 160 aa  63.5  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3352  protein of unknown function DUF421  32.09 
 
 		 173 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0053  hypothetical protein  25.32 
 
 		 160 aa  62.4  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0769  hypothetical protein  27.78 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2084  protein of unknown function DUF421  27.46 
 
 		 228 aa  62  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.138808  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2670  hypothetical protein  29.41 
 
 		 175 aa  62.4  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4754  hypothetical protein  28.08 
 
 		 146 aa  62  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204724  normal  0.0118925 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0436  hypothetical protein  26.24 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617619  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0434  hypothetical protein  26.06 
 
 		 179 aa  61.6  0.000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3273  protein of unknown function DUF421  28.86 
 
 		 232 aa  61.2  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0551  membrane protein-like protein  26.53 
 
 		 180 aa  61.2  0.000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000937148 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1712  hypothetical protein  28 
 
 		 227 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.144314  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1469  hypothetical protein  25.35 
 
 		 226 aa  60.8  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2764  hypothetical protein  24.31 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1926  hypothetical protein  26.35 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.328835  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1844  hypothetical protein  25.52 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1660  hypothetical protein  24.83 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0800376  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3051  protein of unknown function DUF421  29.46 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1961  hypothetical protein  24.83 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.139623  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3510  hypothetical protein  26.39 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36940  hypothetical protein  30.23 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.309583  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6863  protein of unknown function DUF421  27.03 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3175  hypothetical protein  23.78 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.979599  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3499  hypothetical protein  27.03 
 
 		 228 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.664218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0112  hypothetical protein  27.03 
 
 		 166 aa  58.5  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1882  hypothetical protein  25.68 
 
 		 228 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.929447 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1704  hypothetical protein  25.68 
 
 		 228 aa  58.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1685  hypothetical protein  25.68 
 
 		 228 aa  58.5  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.376353  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1838  hypothetical protein  25.68 
 
 		 228 aa  58.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.315149  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2513  hypothetical protein  28.17 
 
 		 235 aa  58.5  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2827  hypothetical protein  26.8 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.209727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2636  protein of unknown function DUF421  25 
 
 		 161 aa  58.2  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.753675  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4212  protein of unknown function DUF421  31.39 
 
 		 188 aa  57.8  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.983168 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1650  hypothetical protein  27.21 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0747624  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2641  hypothetical protein  28.76 
 
 		 175 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.865763  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2686  hypothetical protein  28.76 
 
 		 175 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.565782  normal  0.0102559 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4082  protein of unknown function DUF421  29.71 
 
 		 171 aa  56.6  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0198  protein of unknown function DUF421  26.85 
 
 		 164 aa  57  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3305  protein of unknown function DUF421  26.71 
 
 		 258 aa  57  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00266927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1348  hypothetical protein  23.29 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1698  hypothetical protein  25.74 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0321  protein of unknown function DUF421  27.4 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.78667 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1466  hypothetical protein  28.97 
 
 		 286 aa  55.1  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2827  membrane protein-like protein  26.21 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.138476 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1504  hypothetical protein  30.08 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2189  hypothetical protein  24.49 
 
 		 241 aa  54.3  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000145811  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0127  hypothetical protein  24.83 
 
 		 241 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1555  hypothetical protein  23.29 
 
 		 232 aa  53.9  0.0000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00910  conserved inner membrane protein  25.35 
 
 		 230 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2737  protein of unknown function DUF421  25.35 
 
 		 230 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0253622  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00917  hypothetical protein  25.35 
 
 		 230 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0707  hypothetical protein  27.03 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0159977  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1067  hypothetical protein  25.35 
 
 		 230 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0942748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0919  hypothetical protein  26.97 
 
 		 155 aa  53.9  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.043093 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1012  hypothetical protein  25.35 
 
 		 230 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000212287  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1003  hypothetical protein  25.35 
 
 		 230 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0243553  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2690  hypothetical protein  25.35 
 
 		 230 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.355377  normal  0.77182 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2215  hypothetical protein  25.35 
 
 		 230 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.297842 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2422  hypothetical protein  25.35 
 
 		 230 aa  53.5  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000473983  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0854  hypothetical protein  26.75 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1459  hypothetical protein  25 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.902977  normal  0.138264 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2271  hypothetical protein  28.47 
 
 		 170 aa  52.8  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0321  hypothetical protein  25.17 
 
 		 225 aa  53.1  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.911962  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3133  hypothetical protein  23.65 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.152895 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3287  hypothetical protein  23.13 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.581053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12630  predicted membrane protein  24.32 
 
 		 211 aa  52.4  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0702  hypothetical protein  25.87 
 
 		 215 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00491681  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1012  protein of unknown function DUF421  24.81 
 
 		 243 aa  51.6  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05340  predicted membrane protein  23.42 
 
 		 242 aa  51.6  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00296282  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3383  hypothetical protein  27.7 
 
 		 158 aa  51.6  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1040  hypothetical protein  24.65 
 
 		 230 aa  51.2  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.169724  normal  0.241147 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1009  hypothetical protein  24.65 
 
 		 230 aa  51.2  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>