136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2536 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2536  hypothetical protein  100 
 
 
182 aa  359  1e-98  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2202  hypothetical protein  47.2 
 
 
167 aa  137  7.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.359342 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5498  hypothetical protein  38.65 
 
 
173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2562  hypothetical protein  32.52 
 
 
164 aa  104  8e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2237  hypothetical protein  36.88 
 
 
163 aa  102  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0051  hypothetical protein  32.21 
 
 
160 aa  99.8  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2030  hypothetical protein  37.89 
 
 
164 aa  99.8  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.334364  normal  0.673359 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0053  hypothetical protein  32.21 
 
 
160 aa  99  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3817  hypothetical protein  37.34 
 
 
163 aa  94.7  7e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4894  hypothetical protein  37.34 
 
 
163 aa  94.7  7e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.292864 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2115  hypothetical membrane associated protein  32.28 
 
 
199 aa  92.4  3e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0071  hypothetical protein  32.28 
 
 
159 aa  91.3  6e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6233  hypothetical protein  37.75 
 
 
160 aa  87  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303175  normal  0.107487 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2084  protein of unknown function DUF421  31.54 
 
 
228 aa  74.3  0.0000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.138808  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4224  hypothetical protein  31.45 
 
 
196 aa  74.3  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.434687  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1339  hypothetical protein  32.32 
 
 
167 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3114  hypothetical protein  32.32 
 
 
167 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2990  hypothetical protein  32.32 
 
 
167 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.138787  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2827  hypothetical protein  31.17 
 
 
165 aa  73.2  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.209727  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0321  hypothetical protein  31.65 
 
 
225 aa  72.8  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.911962  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3005  hypothetical protein  31.43 
 
 
147 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.166871  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1469  hypothetical protein  30.71 
 
 
226 aa  68.2  0.00000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2636  protein of unknown function DUF421  31.43 
 
 
161 aa  67.8  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.753675  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3175  hypothetical protein  27.59 
 
 
227 aa  66.6  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.979599  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1067  hypothetical protein  30.43 
 
 
230 aa  65.1  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0942748  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00910  conserved inner membrane protein  30.43 
 
 
230 aa  64.3  0.0000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2737  protein of unknown function DUF421  30.43 
 
 
230 aa  64.3  0.0000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0253622  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1012  hypothetical protein  30.43 
 
 
230 aa  64.3  0.0000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000212287  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1003  hypothetical protein  30.43 
 
 
230 aa  64.3  0.0000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0243553  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2690  hypothetical protein  30.43 
 
 
230 aa  64.3  0.0000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.355377  normal  0.77182 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2215  hypothetical protein  30.43 
 
 
230 aa  64.3  0.0000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.297842 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2422  hypothetical protein  30.43 
 
 
230 aa  64.3  0.0000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000473983  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00917  hypothetical protein  30.43 
 
 
230 aa  64.3  0.0000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1589  hypothetical protein  31.72 
 
 
185 aa  63.9  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0769  hypothetical protein  28.87 
 
 
147 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1106  membrane protein-like protein  31.13 
 
 
227 aa  63.2  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00481139  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1009  hypothetical protein  28.87 
 
 
230 aa  62.4  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1074  hypothetical protein  28.87 
 
 
230 aa  62.4  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.325553 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1089  hypothetical protein  28.87 
 
 
230 aa  62.4  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0981  hypothetical protein  28.87 
 
 
230 aa  62.4  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00314697  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1040  hypothetical protein  28.87 
 
 
230 aa  62.4  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.169724  normal  0.241147 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05340  predicted membrane protein  29.33 
 
 
242 aa  61.2  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00296282  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1485  protein of unknown function DUF421  34.01 
 
 
234 aa  61.2  0.000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1313  protein of unknown function DUF421  29.88 
 
 
184 aa  61.2  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1426  hypothetical protein  27.5 
 
 
230 aa  60.5  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.320436  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12630  predicted membrane protein  28.3 
 
 
211 aa  60.8  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0702  hypothetical protein  28.77 
 
 
215 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00491681  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1555  hypothetical protein  25.32 
 
 
232 aa  58.5  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2146  hypothetical protein  28.38 
 
 
202 aa  58.2  0.00000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.573525  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1348  hypothetical protein  24.68 
 
 
232 aa  58.2  0.00000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2827  membrane protein-like protein  32.31 
 
 
165 aa  57  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.138476 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4363  hypothetical protein  28.38 
 
 
167 aa  56.2  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3332  hypothetical protein  30.46 
 
 
175 aa  55.5  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02060  predicted membrane protein  25 
 
 
164 aa  55.5  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2513  hypothetical protein  33.33 
 
 
235 aa  55.8  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2617  hypothetical protein  24.84 
 
 
230 aa  55.5  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11070  conserved hypothetical membrane-anchored protein  26.21 
 
 
149 aa  55.5  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1122  protein of unknown function DUF421  24.39 
 
 
242 aa  55.1  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0220  hypothetical protein  26.21 
 
 
253 aa  55.1  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1251  protein of unknown function DUF421  26.53 
 
 
175 aa  54.7  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1459  hypothetical protein  28.77 
 
 
151 aa  54.3  0.0000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.902977  normal  0.138264 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4499  hypothetical protein  27.92 
 
 
215 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00871532  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0112  hypothetical protein  29.5 
 
 
166 aa  53.9  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0719  protein of unknown function DUF421  25.83 
 
 
286 aa  53.9  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1108  hypothetical protein  26.53 
 
 
175 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.628779  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2090  hypothetical protein  27.27 
 
 
245 aa  53.9  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4548  hypothetical protein  27.92 
 
 
215 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00119776  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4828  hypothetical protein  25.17 
 
 
289 aa  53.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3305  protein of unknown function DUF421  30 
 
 
258 aa  53.5  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00266927  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4754  hypothetical protein  26.62 
 
 
146 aa  53.1  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204724  normal  0.0118925 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0436  hypothetical protein  26.35 
 
 
224 aa  53.1  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617619  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2764  hypothetical protein  25.69 
 
 
172 aa  52.8  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0321  protein of unknown function DUF421  26.32 
 
 
241 aa  52.8  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.78667 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4999  hypothetical protein  25.17 
 
 
289 aa  52  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5379  hypothetical protein  25.17 
 
 
289 aa  52  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5983  hypothetical protein  25.16 
 
 
165 aa  52  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0201045 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5235  hypothetical protein  25.17 
 
 
289 aa  52  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5269  hypothetical protein  24.49 
 
 
289 aa  51.6  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4843  hypothetical protein  24.49 
 
 
289 aa  51.2  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0792  protein of unknown function DUF421  27.21 
 
 
286 aa  51.6  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5688  hypothetical protein  24.49 
 
 
289 aa  51.6  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2247  protein of unknown function DUF421  24.84 
 
 
168 aa  51.2  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2154  hypothetical protein  28.08 
 
 
188 aa  50.8  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0961076  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4261  hypothetical protein  31.2 
 
 
218 aa  51.2  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00116962  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0674  hypothetical protein  26.95 
 
 
143 aa  50.8  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2138  hypothetical protein  27.27 
 
 
229 aa  50.4  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2566  hypothetical protein  27.85 
 
 
165 aa  50.4  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.31826  hitchhiker  0.0000735154 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2187  hypothetical protein  22.45 
 
 
289 aa  50.1  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000023722  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3383  hypothetical protein  27.03 
 
 
158 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3510  hypothetical protein  25.17 
 
 
146 aa  50.1  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1758  hypothetical protein  32 
 
 
212 aa  50.1  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0566  hypothetical protein  24.48 
 
 
237 aa  49.7  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2194  protein of unknown function DUF421  23.61 
 
 
232 aa  50.1  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1799  protein of unknown function DUF421  28.46 
 
 
224 aa  49.7  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0271913  normal  0.21316 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3273  protein of unknown function DUF421  27.97 
 
 
232 aa  50.1  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5311  hypothetical protein  24.49 
 
 
289 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0408  hypothetical protein  23.13 
 
 
289 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1504  hypothetical protein  28.78 
 
 
177 aa  49.3  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0204  hypothetical protein  24.49 
 
 
289 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6410  membrane protein-like protein  27.74 
 
 
170 aa  49.3  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>