220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5983 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_5983  hypothetical protein  100 
 
 
165 aa  333  3.9999999999999995e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0201045 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4363  hypothetical protein  69.57 
 
 
167 aa  239  1e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3051  protein of unknown function DUF421  73.55 
 
 
155 aa  216  1e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3332  hypothetical protein  49.03 
 
 
175 aa  165  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3940  hypothetical protein  45.45 
 
 
159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.179392  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2247  protein of unknown function DUF421  37.5 
 
 
168 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3563  hypothetical protein  40.67 
 
 
158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.9488  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0854  hypothetical protein  37.82 
 
 
155 aa  112  3e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2636  protein of unknown function DUF421  41.13 
 
 
161 aa  108  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.753675  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0919  hypothetical protein  37.01 
 
 
155 aa  108  4.0000000000000004e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.043093 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2764  hypothetical protein  37.5 
 
 
172 aa  106  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2581  membrane protein-like protein  37.16 
 
 
172 aa  106  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.604139  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3383  hypothetical protein  39.46 
 
 
158 aa  103  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2146  hypothetical protein  34.15 
 
 
202 aa  103  9e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.573525  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4082  protein of unknown function DUF421  36.49 
 
 
171 aa  103  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3224  protein of unknown function DUF421  33.79 
 
 
173 aa  101  6e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826771  normal  0.0304981 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2827  hypothetical protein  34.01 
 
 
165 aa  98.6  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.209727  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0707  hypothetical protein  41.1 
 
 
150 aa  96.3  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0159977  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0947  protein of unknown function DUF421  33.77 
 
 
178 aa  96.3  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.528971  normal  0.296252 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0825  hypothetical protein  36.59 
 
 
205 aa  95.5  3e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.102228 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3305  protein of unknown function DUF421  35.42 
 
 
258 aa  95.1  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00266927  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2415  hypothetical protein  34.42 
 
 
166 aa  94  8e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.696624  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3510  hypothetical protein  37.06 
 
 
146 aa  93.6  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1555  hypothetical protein  28.83 
 
 
232 aa  93.6  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1348  hypothetical protein  28.83 
 
 
232 aa  92.4  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0198  protein of unknown function DUF421  28.87 
 
 
164 aa  92  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2566  hypothetical protein  33.12 
 
 
165 aa  92  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.31826  hitchhiker  0.0000735154 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3409  hypothetical protein  31.79 
 
 
172 aa  91.7  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00991237  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1251  protein of unknown function DUF421  35.06 
 
 
175 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0812  protein of unknown function DUF421  43.88 
 
 
173 aa  89.7  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.954202 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2030  hypothetical protein  32.17 
 
 
164 aa  89.4  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.334364  normal  0.673359 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1415  hypothetical protein  30.52 
 
 
227 aa  89.4  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.228022 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4754  hypothetical protein  35.86 
 
 
146 aa  89.4  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204724  normal  0.0118925 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6439  conserved hypothetical membrane-anchored protein  32.41 
 
 
150 aa  88.6  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1108  hypothetical protein  33.77 
 
 
175 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.628779  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02060  predicted membrane protein  34.97 
 
 
164 aa  87.4  8e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5498  hypothetical protein  32.03 
 
 
173 aa  86.7  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12630  predicted membrane protein  29.29 
 
 
211 aa  86.7  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1459  hypothetical protein  39.01 
 
 
151 aa  87  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.902977  normal  0.138264 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6233  hypothetical protein  33.1 
 
 
160 aa  84.3  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303175  normal  0.107487 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11070  conserved hypothetical membrane-anchored protein  34.75 
 
 
149 aa  84  8e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0321  hypothetical protein  30.57 
 
 
225 aa  84  9e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.911962  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3820  hypothetical protein  31.85 
 
 
171 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0674  hypothetical protein  29.5 
 
 
143 aa  83.6  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6863  protein of unknown function DUF421  31.69 
 
 
146 aa  83.6  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0436  hypothetical protein  29.71 
 
 
224 aa  82.4  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617619  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0702  hypothetical protein  25.97 
 
 
215 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00491681  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3133  hypothetical protein  31.94 
 
 
149 aa  82.8  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.152895 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3175  hypothetical protein  28.28 
 
 
227 aa  82.4  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.979599  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21740  predicted membrane protein  32.73 
 
 
167 aa  82  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.963565  normal  0.777873 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0769  hypothetical protein  33.33 
 
 
147 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0434  hypothetical protein  26.49 
 
 
179 aa  82  0.000000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3287  hypothetical protein  34.25 
 
 
149 aa  82  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.581053  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4224  hypothetical protein  31.01 
 
 
196 aa  81.3  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.434687  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2237  hypothetical protein  29.37 
 
 
163 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6410  membrane protein-like protein  31.87 
 
 
170 aa  81.6  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0523  protein of unknown function DUF421  33.1 
 
 
175 aa  81.3  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4212  protein of unknown function DUF421  31.97 
 
 
188 aa  80.5  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.983168 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2194  protein of unknown function DUF421  30.52 
 
 
232 aa  80.5  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3005  hypothetical protein  32.62 
 
 
147 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.166871  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1106  membrane protein-like protein  31.54 
 
 
227 aa  80.1  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00481139  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2513  hypothetical protein  28.57 
 
 
235 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3177  hypothetical protein  32.88 
 
 
149 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755267  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4894  hypothetical protein  30.82 
 
 
163 aa  79  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.292864 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2827  membrane protein-like protein  30.99 
 
 
165 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.138476 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3817  hypothetical protein  30.82 
 
 
163 aa  79  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3285  membrane protein-like protein  30.77 
 
 
160 aa  79  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.22155  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1012  protein of unknown function DUF421  30 
 
 
243 aa  77  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2617  hypothetical protein  26.62 
 
 
230 aa  77  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2343  protein of unknown function DUF421  33.77 
 
 
170 aa  75.9  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2084  protein of unknown function DUF421  26.62 
 
 
228 aa  75.5  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.138808  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05340  predicted membrane protein  24.53 
 
 
242 aa  75.1  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00296282  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4533  hypothetical protein  27.27 
 
 
215 aa  74.7  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0230316  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0625  protein of unknown function DUF421  29.87 
 
 
226 aa  74.7  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00740952  normal  0.965778 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0519  protein of unknown function DUF421  30.77 
 
 
228 aa  74.3  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1026  hypothetical protein  41.73 
 
 
172 aa  74.3  0.0000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.170093  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4261  hypothetical protein  27.85 
 
 
218 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00116962  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4499  hypothetical protein  26.62 
 
 
215 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00871532  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0719  protein of unknown function DUF421  24.66 
 
 
286 aa  72.4  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3352  protein of unknown function DUF421  25.35 
 
 
173 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4548  hypothetical protein  26.62 
 
 
215 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00119776  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1869  membrane protein-like protein  33.86 
 
 
199 aa  72.8  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.262643  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0551  membrane protein-like protein  25.85 
 
 
180 aa  72.8  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000937148 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4494  hypothetical protein  27.27 
 
 
215 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000327358 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4309  hypothetical protein  27.27 
 
 
215 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0126531  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4147  hypothetical protein  27.27 
 
 
215 aa  72  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000615268  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4158  hypothetical protein  27.27 
 
 
215 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0166527  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4644  hypothetical protein  27.27 
 
 
215 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.101491  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1469  hypothetical protein  25.69 
 
 
226 aa  72  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3115  protein of unknown function DUF421  28.97 
 
 
229 aa  71.6  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3273  protein of unknown function DUF421  31.43 
 
 
232 aa  71.6  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1504  hypothetical protein  28 
 
 
177 aa  71.2  0.000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1466  hypothetical protein  26.67 
 
 
286 aa  70.9  0.000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1650  hypothetical protein  30.34 
 
 
156 aa  70.5  0.000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0747624  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1067  hypothetical protein  28.95 
 
 
230 aa  70.5  0.000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0942748  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00917  hypothetical protein  28.95 
 
 
230 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2422  hypothetical protein  28.95 
 
 
230 aa  70.5  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000473983  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0981  hypothetical protein  29.79 
 
 
230 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00314697  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1012  hypothetical protein  28.95 
 
 
230 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000212287  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1003  hypothetical protein  28.95 
 
 
230 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0243553  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>