154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0625 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0625  protein of unknown function DUF421  100 
 
 		 226 aa  466  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00740952  normal  0.965778 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0519  protein of unknown function DUF421  63.27 
 
 		 228 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3116  protein of unknown function DUF421  50 
 
 		 229 aa  221  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5258  membrane protein-like protein  46.49 
 
 		 228 aa  214  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3115  protein of unknown function DUF421  34.8 
 
 		 229 aa  160  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5259  protein of unknown function DUF421  37.28 
 
 		 229 aa  155  5.0000000000000005e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0626  protein of unknown function DUF421  37.38 
 
 		 239 aa  154  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0141494  normal  0.718153 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2617  hypothetical protein  28.77 
 
 		 230 aa  133  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0520  protein of unknown function DUF421  35.81 
 
 		 233 aa  128  6e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2194  protein of unknown function DUF421  30.32 
 
 		 232 aa  114  7.999999999999999e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3232  protein of unknown function DUF421  27.75 
 
 		 230 aa  107  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.151812  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1130  hypothetical protein  30.05 
 
 		 272 aa  102  7e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2791  hypothetical protein  30.05 
 
 		 272 aa  102  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.169514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1415  hypothetical protein  27.96 
 
 		 227 aa  97.4  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.228022 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2726  hypothetical protein  26.76 
 
 		 230 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3028  membrane protein-like protein  26.29 
 
 		 230 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5467  protein of unknown function DUF421  24.88 
 
 		 225 aa  91.7  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.244646 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1089  hypothetical protein  24.23 
 
 		 230 aa  86.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0981  hypothetical protein  24.23 
 
 		 230 aa  86.3  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00314697  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1040  hypothetical protein  23.79 
 
 		 230 aa  86.3  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.169724  normal  0.241147 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2154  hypothetical protein  28.8 
 
 		 188 aa  85.9  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0961076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1009  hypothetical protein  24.67 
 
 		 230 aa  85.5  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1074  hypothetical protein  24.67 
 
 		 230 aa  85.5  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.325553 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5983  hypothetical protein  29.87 
 
 		 165 aa  79  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0201045 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1067  hypothetical protein  24.02 
 
 		 230 aa  78.2  0.00000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0942748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2215  hypothetical protein  23.5 
 
 		 230 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.297842 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00910  conserved inner membrane protein  23.58 
 
 		 230 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2737  protein of unknown function DUF421  23.58 
 
 		 230 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0253622  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00917  hypothetical protein  23.58 
 
 		 230 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1012  hypothetical protein  23.58 
 
 		 230 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000212287  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1003  hypothetical protein  23.58 
 
 		 230 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0243553  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2690  hypothetical protein  23.58 
 
 		 230 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.355377  normal  0.77182 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2422  hypothetical protein  23.58 
 
 		 230 aa  76.6  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000473983  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1426  hypothetical protein  23.7 
 
 		 230 aa  75.5  0.0000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.320436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4363  hypothetical protein  27.92 
 
 		 167 aa  72  0.000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3332  hypothetical protein  26.03 
 
 		 175 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1555  hypothetical protein  24.65 
 
 		 232 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6410  membrane protein-like protein  28.38 
 
 		 170 aa  69.7  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2486  hypothetical protein  26.72 
 
 		 163 aa  68.9  0.00000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1348  hypothetical protein  23.94 
 
 		 232 aa  67.8  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2581  membrane protein-like protein  20.83 
 
 		 172 aa  67.8  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.604139  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12630  predicted membrane protein  22.83 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3383  hypothetical protein  27.4 
 
 		 158 aa  66.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2513  hypothetical protein  26.99 
 
 		 235 aa  65.9  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2415  hypothetical protein  27.85 
 
 		 166 aa  65.1  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.696624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2827  hypothetical protein  25.87 
 
 		 165 aa  65.1  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.209727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2343  protein of unknown function DUF421  25.17 
 
 		 170 aa  63.9  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2566  hypothetical protein  27.22 
 
 		 165 aa  63.2  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.31826  hitchhiker  0.0000735154 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3224  protein of unknown function DUF421  22.92 
 
 		 173 aa  62.8  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826771  normal  0.0304981 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1251  protein of unknown function DUF421  27.16 
 
 		 175 aa  61.6  0.000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4082  protein of unknown function DUF421  20.14 
 
 		 171 aa  61.2  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1108  hypothetical protein  27.16 
 
 		 175 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.628779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0702  hypothetical protein  23.74 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00491681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2764  hypothetical protein  26.39 
 
 		 172 aa  59.3  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0321  hypothetical protein  22.45 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.911962  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3175  hypothetical protein  21.77 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.979599  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2247  protein of unknown function DUF421  23.88 
 
 		 168 aa  58.9  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2084  protein of unknown function DUF421  23.61 
 
 		 228 aa  58.5  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.138808  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3305  protein of unknown function DUF421  27.22 
 
 		 258 aa  57.8  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00266927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3051  protein of unknown function DUF421  27.08 
 
 		 155 aa  57  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0854  hypothetical protein  24.68 
 
 		 155 aa  57  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0112  hypothetical protein  23.53 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0919  hypothetical protein  24.05 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.043093 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4754  hypothetical protein  25.17 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204724  normal  0.0118925 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3563  hypothetical protein  22.7 
 
 		 158 aa  55.1  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.9488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1469  hypothetical protein  20.95 
 
 		 226 aa  54.7  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1485  protein of unknown function DUF421  22.82 
 
 		 234 aa  54.3  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4499  hypothetical protein  24.6 
 
 		 215 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00871532  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4212  protein of unknown function DUF421  21.14 
 
 		 188 aa  54.3  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.983168 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4261  hypothetical protein  25.81 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00116962  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4548  hypothetical protein  24.6 
 
 		 215 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00119776  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4309  hypothetical protein  23.81 
 
 		 215 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0126531  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4158  hypothetical protein  23.81 
 
 		 215 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0166527  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3409  hypothetical protein  28.57 
 
 		 172 aa  53.5  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00991237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4644  hypothetical protein  23.81 
 
 		 215 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.101491  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0436  hypothetical protein  20.57 
 
 		 224 aa  53.5  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617619  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0523  protein of unknown function DUF421  25.95 
 
 		 175 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4147  hypothetical protein  23.81 
 
 		 215 aa  53.1  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000615268  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4494  hypothetical protein  23.81 
 
 		 215 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000327358 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3910  hypothetical protein  23.97 
 
 		 234 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0966557  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2460  protein of unknown function DUF421  23.36 
 
 		 273 aa  52.4  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3510  hypothetical protein  23.4 
 
 		 146 aa  52.4  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0198  protein of unknown function DUF421  23.94 
 
 		 164 aa  52.4  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1712  hypothetical protein  22.22 
 
 		 227 aa  52  0.000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.144314  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4268  hypothetical protein  23.29 
 
 		 234 aa  51.6  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.929825  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4533  hypothetical protein  23.02 
 
 		 215 aa  51.6  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0230316  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11070  conserved hypothetical membrane-anchored protein  20.55 
 
 		 149 aa  51.2  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0434  hypothetical protein  22.7 
 
 		 179 aa  51.2  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3285  membrane protein-like protein  22.89 
 
 		 160 aa  51.2  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.22155  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4230  hypothetical protein  22.6 
 
 		 234 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000285959  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1704  hypothetical protein  20.26 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1685  hypothetical protein  20.26 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.376353  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1882  hypothetical protein  20.26 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.929447 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2189  hypothetical protein  21.13 
 
 		 241 aa  50.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000145811  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0769  hypothetical protein  23.61 
 
 		 147 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1838  hypothetical protein  20.26 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.315149  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2146  hypothetical protein  25 
 
 		 202 aa  50.8  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.573525  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21740  predicted membrane protein  27.87 
 
 		 167 aa  50.4  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.963565  normal  0.777873 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4288  hypothetical protein  22.6 
 
 		 234 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000645093  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1106  membrane protein-like protein  22.5 
 
 		 227 aa  49.7  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00481139  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>