237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_3175 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_3175  hypothetical protein  100 
 
 		 227 aa  451  1.0000000000000001e-126  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.979599  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2084  protein of unknown function DUF421  62.5 
 
 		 228 aa  286  2e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.138808  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1469  hypothetical protein  60.27 
 
 		 226 aa  285  4e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0321  hypothetical protein  58.74 
 
 		 225 aa  281  7.000000000000001e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.911962  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0436  hypothetical protein  61.88 
 
 		 224 aa  278  6e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617619  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1799  protein of unknown function DUF421  60.1 
 
 		 224 aa  268  5e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0271913  normal  0.21316 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1012  protein of unknown function DUF421  57.27 
 
 		 243 aa  246  2e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22070  predicted membrane protein  57.21 
 
 		 228 aa  245  4e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3273  protein of unknown function DUF421  52.68 
 
 		 232 aa  236  3e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2513  hypothetical protein  49.3 
 
 		 235 aa  214  9e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3305  protein of unknown function DUF421  52.11 
 
 		 258 aa  211  9e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00266927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0321  protein of unknown function DUF421  44.24 
 
 		 241 aa  207  9e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.78667 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05340  predicted membrane protein  43.24 
 
 		 242 aa  190  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00296282  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1348  hypothetical protein  42.04 
 
 		 232 aa  186  3e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1555  hypothetical protein  42.29 
 
 		 232 aa  186  4e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2090  hypothetical protein  43.95 
 
 		 245 aa  183  2.0000000000000003e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1485  protein of unknown function DUF421  42.27 
 
 		 234 aa  176  3e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1968  protein of unknown function DUF421  43.95 
 
 		 245 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0566  hypothetical protein  40.18 
 
 		 237 aa  168  8e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0711  protein of unknown function DUF421  41.4 
 
 		 248 aa  163  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0719  protein of unknown function DUF421  38.39 
 
 		 286 aa  163  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2138  hypothetical protein  41.44 
 
 		 229 aa  162  6e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0220  hypothetical protein  41.44 
 
 		 253 aa  160  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12630  predicted membrane protein  39.59 
 
 		 211 aa  149  4e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0702  hypothetical protein  37.73 
 
 		 215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00491681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05430  predicted membrane protein  45.83 
 
 		 209 aa  146  3e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.054004  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2671  protein of unknown function DUF421  36.56 
 
 		 242 aa  142  5e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113456  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1122  protein of unknown function DUF421  36.36 
 
 		 242 aa  139  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0792  protein of unknown function DUF421  36.49 
 
 		 286 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4499  hypothetical protein  37.73 
 
 		 215 aa  134  9e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00871532  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1658  protein of unknown function DUF421  36.07 
 
 		 286 aa  133  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4548  hypothetical protein  37.73 
 
 		 215 aa  133  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00119776  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4261  hypothetical protein  37.73 
 
 		 218 aa  132  6e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00116962  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4158  hypothetical protein  36.82 
 
 		 215 aa  131  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0166527  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4309  hypothetical protein  36.94 
 
 		 215 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0126531  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4533  hypothetical protein  35.45 
 
 		 215 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0230316  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4644  hypothetical protein  36.94 
 
 		 215 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.101491  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4147  hypothetical protein  36.49 
 
 		 215 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000615268  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4494  hypothetical protein  36.49 
 
 		 215 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000327358 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4943  hypothetical protein  34.86 
 
 		 289 aa  129  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0127  hypothetical protein  32.14 
 
 		 241 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0231  hypothetical protein  33.64 
 
 		 289 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.723048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1466  hypothetical protein  34.72 
 
 		 286 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5253  hypothetical protein  34.1 
 
 		 289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0408  hypothetical protein  35.91 
 
 		 289 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0204  hypothetical protein  33.64 
 
 		 289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5688  hypothetical protein  33.94 
 
 		 289 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1334  hypothetical protein  32.75 
 
 		 225 aa  126  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2189  hypothetical protein  30.36 
 
 		 241 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000145811  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4843  hypothetical protein  33.94 
 
 		 289 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5311  hypothetical protein  33.64 
 
 		 289 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4828  hypothetical protein  33.49 
 
 		 289 aa  124  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4999  hypothetical protein  33.49 
 
 		 289 aa  123  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5379  hypothetical protein  33.49 
 
 		 289 aa  123  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5235  hypothetical protein  33.49 
 
 		 289 aa  123  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5269  hypothetical protein  33.18 
 
 		 289 aa  122  4e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2639  YdfS  36.57 
 
 		 236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2187  hypothetical protein  33.64 
 
 		 289 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000023722  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1660  hypothetical protein  32.88 
 
 		 228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0800376  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3692  hypothetical protein  31.8 
 
 		 289 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1733  hypothetical protein  34.13 
 
 		 221 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0352264  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1712  hypothetical protein  30.32 
 
 		 227 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.144314  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1704  hypothetical protein  31.08 
 
 		 228 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1685  hypothetical protein  31.08 
 
 		 228 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.376353  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1838  hypothetical protein  31.08 
 
 		 228 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.315149  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1882  hypothetical protein  31.08 
 
 		 228 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.929447 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1961  hypothetical protein  32.43 
 
 		 228 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.139623  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1786  hypothetical protein  33.65 
 
 		 221 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1844  hypothetical protein  31.53 
 
 		 228 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1926  hypothetical protein  31.08 
 
 		 228 aa  116  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.328835  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1497  hypothetical protein  33.33 
 
 		 221 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000932542  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1487  hypothetical protein  33.65 
 
 		 221 aa  115  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1679  hypothetical protein  34.31 
 
 		 221 aa  114  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1525  hypothetical protein  33.17 
 
 		 221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1643  hypothetical protein  33.17 
 
 		 221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.820484  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1710  hypothetical protein  33.17 
 
 		 221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1698  hypothetical protein  31.19 
 
 		 228 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3499  hypothetical protein  30.18 
 
 		 228 aa  112  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.664218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3665  hypothetical protein  33.82 
 
 		 221 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.397621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2382  protein of unknown function DUF421  33.92 
 
 		 281 aa  112  6e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173055  normal  0.818165 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1106  membrane protein-like protein  35.22 
 
 		 227 aa  111  9e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00481139  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1529  hypothetical protein  34.8 
 
 		 221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.64166  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1938  protein of unknown function DUF421  28.9 
 
 		 236 aa  108  5e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1124  protein of unknown function DUF421  32.26 
 
 		 223 aa  108  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2460  protein of unknown function DUF421  32.11 
 
 		 273 aa  106  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3332  hypothetical protein  35.76 
 
 		 175 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4363  hypothetical protein  31.03 
 
 		 167 aa  95.1  8e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4288  hypothetical protein  29.22 
 
 		 234 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000645093  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1825  protein of unknown function DUF421  27.32 
 
 		 225 aa  94  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4230  hypothetical protein  28.77 
 
 		 234 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000285959  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02060  predicted membrane protein  33.1 
 
 		 164 aa  92.4  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3910  hypothetical protein  28.77 
 
 		 234 aa  92  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0966557  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0719  hypothetical protein  24.11 
 
 		 230 aa  91.7  9e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.772033  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4268  hypothetical protein  28.31 
 
 		 234 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.929825  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0966  hypothetical protein  26.94 
 
 		 234 aa  88.2  9e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000924114  normal  0.424893 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3999  hypothetical protein  26.94 
 
 		 234 aa  88.2  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0223  conserved membrane protein YetF  28.9 
 
 		 182 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6863  protein of unknown function DUF421  32.39 
 
 		 146 aa  87.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6439  conserved hypothetical membrane-anchored protein  32.19 
 
 		 150 aa  86.3  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3051  protein of unknown function DUF421  33.33 
 
 		 155 aa  83.2  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>