226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3005 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3005  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  290  3e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.166871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0769  hypothetical protein  65.52 
 
 		 147 aa  202  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3177  hypothetical protein  64.14 
 
 		 149 aa  192  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755267  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11070  conserved hypothetical membrane-anchored protein  62.07 
 
 		 149 aa  184  4e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36940  hypothetical protein  65.52 
 
 		 149 aa  175  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.309583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1459  hypothetical protein  55.86 
 
 		 151 aa  171  1.9999999999999998e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.902977  normal  0.138264 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3287  hypothetical protein  57.93 
 
 		 149 aa  165  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.581053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3510  hypothetical protein  50.34 
 
 		 146 aa  150  4e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2636  protein of unknown function DUF421  50.68 
 
 		 161 aa  147  6e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.753675  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4754  hypothetical protein  51.03 
 
 		 146 aa  145  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204724  normal  0.0118925 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3133  hypothetical protein  46.26 
 
 		 149 aa  144  5e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.152895 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0707  hypothetical protein  51.72 
 
 		 150 aa  143  7.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0159977  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2764  hypothetical protein  45.58 
 
 		 172 aa  143  1e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6439  conserved hypothetical membrane-anchored protein  42.86 
 
 		 150 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6863  protein of unknown function DUF421  45.14 
 
 		 146 aa  135  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02060  predicted membrane protein  44.83 
 
 		 164 aa  134  3.0000000000000003e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1650  hypothetical protein  46.9 
 
 		 156 aa  132  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0747624  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2827  hypothetical protein  36.73 
 
 		 165 aa  100  8e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.209727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0198  protein of unknown function DUF421  34.03 
 
 		 164 aa  99.4  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2513  hypothetical protein  30.99 
 
 		 235 aa  95.9  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3305  protein of unknown function DUF421  33.8 
 
 		 258 aa  89.7  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00266927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05340  predicted membrane protein  31.69 
 
 		 242 aa  89  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00296282  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1106  membrane protein-like protein  31.47 
 
 		 227 aa  85.9  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00481139  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3332  hypothetical protein  32.86 
 
 		 175 aa  83.6  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3940  hypothetical protein  37.32 
 
 		 159 aa  83.2  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.179392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1504  hypothetical protein  29.85 
 
 		 177 aa  82.8  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3383  hypothetical protein  34.72 
 
 		 158 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1485  protein of unknown function DUF421  33.1 
 
 		 234 aa  81.6  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1026  hypothetical protein  38.46 
 
 		 172 aa  79.7  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.170093  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5983  hypothetical protein  32.62 
 
 		 165 aa  79.7  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0201045 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3224  protein of unknown function DUF421  30.34 
 
 		 173 aa  80.1  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826771  normal  0.0304981 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2090  hypothetical protein  32.14 
 
 		 245 aa  78.6  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3563  hypothetical protein  28.47 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.9488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1469  hypothetical protein  26.76 
 
 		 226 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0321  protein of unknown function DUF421  28.57 
 
 		 241 aa  77  0.00000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.78667 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2237  hypothetical protein  30.07 
 
 		 163 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4082  protein of unknown function DUF421  28.89 
 
 		 171 aa  75.9  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0711  protein of unknown function DUF421  27.59 
 
 		 248 aa  75.5  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0702  hypothetical protein  26.06 
 
 		 215 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00491681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0551  membrane protein-like protein  30.28 
 
 		 180 aa  74.3  0.0000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000937148 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1348  hypothetical protein  27.97 
 
 		 232 aa  73.6  0.0000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4363  hypothetical protein  32.64 
 
 		 167 aa  73.6  0.0000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2247  protein of unknown function DUF421  27.21 
 
 		 168 aa  72.8  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1555  hypothetical protein  27.27 
 
 		 232 aa  73.6  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0947  protein of unknown function DUF421  27.89 
 
 		 178 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.528971  normal  0.296252 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0854  hypothetical protein  29.29 
 
 		 155 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2030  hypothetical protein  31.47 
 
 		 164 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.334364  normal  0.673359 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1415  hypothetical protein  23.4 
 
 		 227 aa  72  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.228022 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2415  hypothetical protein  29.86 
 
 		 166 aa  71.6  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.696624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2201  membrane protein-like protein  30.71 
 
 		 186 aa  71.6  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1968  protein of unknown function DUF421  29.33 
 
 		 245 aa  71.2  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3409  hypothetical protein  28.57 
 
 		 172 aa  71.6  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00991237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1589  hypothetical protein  31.39 
 
 		 185 aa  71.2  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0674  hypothetical protein  30.99 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1869  membrane protein-like protein  33.59 
 
 		 199 aa  71.2  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.262643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3273  protein of unknown function DUF421  27.97 
 
 		 232 aa  71.6  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0719  protein of unknown function DUF421  26.57 
 
 		 286 aa  70.9  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1040  hypothetical protein  28.06 
 
 		 230 aa  70.5  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.169724  normal  0.241147 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1089  hypothetical protein  28.06 
 
 		 230 aa  70.5  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0981  hypothetical protein  28.06 
 
 		 230 aa  70.5  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00314697  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1074  hypothetical protein  28.06 
 
 		 230 aa  70.5  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.325553 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4224  hypothetical protein  30.71 
 
 		 196 aa  70.5  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.434687  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3175  hypothetical protein  26.06 
 
 		 227 aa  70.5  0.000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.979599  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1009  hypothetical protein  28.06 
 
 		 230 aa  70.5  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0112  hypothetical protein  25.93 
 
 		 166 aa  70.1  0.000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3051  protein of unknown function DUF421  31.21 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2146  hypothetical protein  32.62 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.573525  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4548  hypothetical protein  26.52 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00119776  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4499  hypothetical protein  26.52 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00871532  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4261  hypothetical protein  28.12 
 
 		 218 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00116962  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4147  hypothetical protein  26.52 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000615268  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1339  hypothetical protein  33.33 
 
 		 167 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4494  hypothetical protein  26.52 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000327358 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2566  hypothetical protein  29.79 
 
 		 165 aa  68.9  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.31826  hitchhiker  0.0000735154 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0919  hypothetical protein  27.86 
 
 		 155 aa  68.6  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.043093 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3114  hypothetical protein  33.33 
 
 		 167 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2990  hypothetical protein  33.33 
 
 		 167 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.138787  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0566  hypothetical protein  28.77 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2581  membrane protein-like protein  25.85 
 
 		 172 aa  68.9  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.604139  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4894  hypothetical protein  30.56 
 
 		 163 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.292864 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3817  hypothetical protein  30.56 
 
 		 163 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2343  protein of unknown function DUF421  32.17 
 
 		 170 aa  68.6  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2617  hypothetical protein  25.17 
 
 		 230 aa  68.6  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0434  hypothetical protein  28.17 
 
 		 179 aa  68.2  0.00000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2827  membrane protein-like protein  27.41 
 
 		 165 aa  68.2  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.138476 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2562  hypothetical protein  32.39 
 
 		 164 aa  67.8  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1012  protein of unknown function DUF421  27.56 
 
 		 243 aa  67.8  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4309  hypothetical protein  25.76 
 
 		 215 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0126531  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4158  hypothetical protein  25.76 
 
 		 215 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0166527  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4533  hypothetical protein  25.76 
 
 		 215 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0230316  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5498  hypothetical protein  26.39 
 
 		 173 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4644  hypothetical protein  25.76 
 
 		 215 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.101491  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1426  hypothetical protein  27.34 
 
 		 230 aa  67  0.00000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.320436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3232  protein of unknown function DUF421  31.69 
 
 		 230 aa  67  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.151812  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3352  protein of unknown function DUF421  27.21 
 
 		 173 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3692  hypothetical protein  25.53 
 
 		 289 aa  67  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3992  hypothetical protein  28.89 
 
 		 226 aa  66.6  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0792  protein of unknown function DUF421  25 
 
 		 286 aa  67  0.00000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2737  protein of unknown function DUF421  25.9 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0253622  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1067  hypothetical protein  25.9 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0942748  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>