194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0551 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0551  membrane protein-like protein  100 
 
 		 180 aa  369  1e-101  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000937148 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0434  hypothetical protein  68.72 
 
 		 179 aa  259  1e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1504  hypothetical protein  38.41 
 
 		 177 aa  124  6e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2271  hypothetical protein  41.98 
 
 		 170 aa  121  7e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2827  membrane protein-like protein  37.66 
 
 		 165 aa  120  9e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.138476 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3992  hypothetical protein  37.18 
 
 		 226 aa  117  6e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3285  membrane protein-like protein  38.96 
 
 		 160 aa  117  9e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.22155  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4212  protein of unknown function DUF421  36.26 
 
 		 188 aa  117  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.983168 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3352  protein of unknown function DUF421  35.44 
 
 		 173 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2670  hypothetical protein  33.91 
 
 		 175 aa  111  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2641  hypothetical protein  32.95 
 
 		 175 aa  110  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.865763  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2686  hypothetical protein  32.95 
 
 		 175 aa  110  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.565782  normal  0.0102559 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1589  hypothetical protein  32.18 
 
 		 185 aa  110  9e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4346  protein of unknown function DUF421  35.62 
 
 		 174 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0250687  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1313  protein of unknown function DUF421  32.37 
 
 		 184 aa  106  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0112  hypothetical protein  34.72 
 
 		 166 aa  103  9e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0399  protein of unknown function DUF421  32.26 
 
 		 166 aa  98.6  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3820  hypothetical protein  32.08 
 
 		 171 aa  97.8  8e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6410  membrane protein-like protein  31.41 
 
 		 170 aa  87.8  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0321  protein of unknown function DUF421  27.95 
 
 		 241 aa  83.2  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.78667 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11408  hypothetical protein  23.64 
 
 		 181 aa  78.2  0.00000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0751825  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1485  protein of unknown function DUF421  26.17 
 
 		 234 aa  77.4  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2201  membrane protein-like protein  26.06 
 
 		 186 aa  76.6  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2084  protein of unknown function DUF421  25 
 
 		 228 aa  75.5  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.138808  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3005  hypothetical protein  30.28 
 
 		 147 aa  74.3  0.0000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.166871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2513  hypothetical protein  22.54 
 
 		 235 aa  73.6  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5983  hypothetical protein  25.85 
 
 		 165 aa  72.8  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0201045 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2671  protein of unknown function DUF421  27.54 
 
 		 242 aa  72.4  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113456  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1555  hypothetical protein  25.34 
 
 		 232 aa  71.6  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1348  hypothetical protein  24.4 
 
 		 232 aa  71.6  0.000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3305  protein of unknown function DUF421  28.17 
 
 		 258 aa  70.9  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00266927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3224  protein of unknown function DUF421  25.35 
 
 		 173 aa  70.9  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826771  normal  0.0304981 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1012  protein of unknown function DUF421  27.34 
 
 		 243 aa  70.5  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0711  protein of unknown function DUF421  25.52 
 
 		 248 aa  69.3  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12630  predicted membrane protein  25.69 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2194  protein of unknown function DUF421  25.6 
 
 		 232 aa  68.6  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3175  hypothetical protein  26.57 
 
 		 227 aa  68.6  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.979599  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0436  hypothetical protein  24.22 
 
 		 224 aa  68.9  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617619  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3836  hypothetical protein  32.77 
 
 		 121 aa  68.6  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.147989  normal  0.0810838 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2247  protein of unknown function DUF421  25.49 
 
 		 168 aa  68.2  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05340  predicted membrane protein  20.65 
 
 		 242 aa  67  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00296282  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1650  hypothetical protein  28.1 
 
 		 156 aa  67.4  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0747624  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5498  hypothetical protein  23.9 
 
 		 173 aa  67  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1459  hypothetical protein  23.81 
 
 		 151 aa  67  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.902977  normal  0.138264 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2827  hypothetical protein  25.17 
 
 		 165 aa  67.4  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.209727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2764  hypothetical protein  23.97 
 
 		 172 aa  65.9  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1469  hypothetical protein  19.86 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4754  hypothetical protein  23.78 
 
 		 146 aa  65.1  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204724  normal  0.0118925 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1106  membrane protein-like protein  24.5 
 
 		 227 aa  64.7  0.0000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00481139  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1122  protein of unknown function DUF421  25 
 
 		 242 aa  64.3  0.0000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3510  hypothetical protein  23.08 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0769  hypothetical protein  23.94 
 
 		 147 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2218  hypothetical protein  26.45 
 
 		 172 aa  63.9  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.450386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0321  hypothetical protein  22.02 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.911962  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1426  hypothetical protein  23.33 
 
 		 230 aa  64.3  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.320436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3177  hypothetical protein  22.22 
 
 		 149 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755267  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0914  hypothetical protein  26.28 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0719  protein of unknown function DUF421  26 
 
 		 286 aa  63.2  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3287  hypothetical protein  25.17 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.581053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4082  protein of unknown function DUF421  24.31 
 
 		 171 aa  62.8  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02060  predicted membrane protein  24.67 
 
 		 164 aa  62  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0220  hypothetical protein  25.95 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1026  hypothetical protein  26.49 
 
 		 172 aa  62.4  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.170093  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06995  hypothetical protein  26.35 
 
 		 174 aa  62  0.000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.294218  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4894  hypothetical protein  26.53 
 
 		 163 aa  61.2  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.292864 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4363  hypothetical protein  21.92 
 
 		 167 aa  61.2  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3817  hypothetical protein  26.53 
 
 		 163 aa  61.2  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1938  protein of unknown function DUF421  23.13 
 
 		 236 aa  60.8  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2187  hypothetical protein  25.52 
 
 		 289 aa  60.8  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000023722  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1415  hypothetical protein  20.95 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.228022 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0198  protein of unknown function DUF421  23.4 
 
 		 164 aa  60.5  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1251  protein of unknown function DUF421  23.53 
 
 		 175 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3940  hypothetical protein  26.56 
 
 		 159 aa  60.5  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.179392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1799  protein of unknown function DUF421  25 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0271913  normal  0.21316 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1108  hypothetical protein  23.53 
 
 		 175 aa  60.5  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.628779  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00910  conserved inner membrane protein  21.95 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2737  protein of unknown function DUF421  21.95 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0253622  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1040  hypothetical protein  20.73 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.169724  normal  0.241147 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2422  hypothetical protein  21.95 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000473983  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2215  hypothetical protein  21.95 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.297842 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1074  hypothetical protein  20.96 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.325553 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1009  hypothetical protein  20.96 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00917  hypothetical protein  21.95 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2690  hypothetical protein  21.95 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.355377  normal  0.77182 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1089  hypothetical protein  20.73 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2154  hypothetical protein  20.98 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0961076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2343  protein of unknown function DUF421  23.94 
 
 		 170 aa  60.1  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0981  hypothetical protein  20.96 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00314697  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1067  hypothetical protein  21.95 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0942748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1012  hypothetical protein  21.95 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000212287  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1003  hypothetical protein  21.95 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0243553  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3115  protein of unknown function DUF421  24.06 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0408  hypothetical protein  24.14 
 
 		 289 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0702  hypothetical protein  22.6 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00491681  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11070  conserved hypothetical membrane-anchored protein  23.29 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3332  hypothetical protein  22.35 
 
 		 175 aa  58.5  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2030  hypothetical protein  24.53 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.334364  normal  0.673359 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5467  protein of unknown function DUF421  22.5 
 
 		 225 aa  58.2  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.244646 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5311  hypothetical protein  24.83 
 
 		 289 aa  57.8  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5688  hypothetical protein  24.14 
 
 		 289 aa  58.2  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>