229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2154 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2154  hypothetical protein  100 
 
 		 188 aa  374  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0961076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1130  hypothetical protein  49.06 
 
 		 272 aa  143  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2791  hypothetical protein  49.06 
 
 		 272 aa  143  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.169514  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00910  conserved inner membrane protein  33.12 
 
 		 230 aa  98.6  5e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2737  protein of unknown function DUF421  33.12 
 
 		 230 aa  98.6  5e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0253622  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1003  hypothetical protein  33.12 
 
 		 230 aa  98.6  5e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0243553  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1012  hypothetical protein  33.12 
 
 		 230 aa  98.6  5e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000212287  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00917  hypothetical protein  33.12 
 
 		 230 aa  98.6  5e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2215  hypothetical protein  33.12 
 
 		 230 aa  98.6  5e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.297842 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2690  hypothetical protein  33.12 
 
 		 230 aa  98.6  5e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.355377  normal  0.77182 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2422  hypothetical protein  33.12 
 
 		 230 aa  98.6  5e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000473983  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1067  hypothetical protein  33.12 
 
 		 230 aa  98.2  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0942748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1009  hypothetical protein  33.76 
 
 		 230 aa  96.7  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0981  hypothetical protein  33.76 
 
 		 230 aa  96.7  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00314697  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1089  hypothetical protein  33.76 
 
 		 230 aa  96.7  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1040  hypothetical protein  33.76 
 
 		 230 aa  96.7  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.169724  normal  0.241147 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3232  protein of unknown function DUF421  35.26 
 
 		 230 aa  96.7  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.151812  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1074  hypothetical protein  33.76 
 
 		 230 aa  96.7  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.325553 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1426  hypothetical protein  32.48 
 
 		 230 aa  95.1  5e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.320436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2194  protein of unknown function DUF421  32.26 
 
 		 232 aa  92  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2617  hypothetical protein  29.11 
 
 		 230 aa  89.4  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1415  hypothetical protein  27.92 
 
 		 227 aa  87  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.228022 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3028  membrane protein-like protein  31.29 
 
 		 230 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2343  protein of unknown function DUF421  36.11 
 
 		 170 aa  85.1  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1938  protein of unknown function DUF421  30.95 
 
 		 236 aa  85.5  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3305  protein of unknown function DUF421  30.56 
 
 		 258 aa  84.7  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00266927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3332  hypothetical protein  34.97 
 
 		 175 aa  84.7  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2726  hypothetical protein  30.67 
 
 		 230 aa  84.3  9e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05340  predicted membrane protein  27.63 
 
 		 242 aa  83.2  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00296282  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1485  protein of unknown function DUF421  36 
 
 		 234 aa  83.2  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0321  protein of unknown function DUF421  30 
 
 		 241 aa  82.8  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.78667 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0127  hypothetical protein  29.8 
 
 		 241 aa  81.6  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1348  hypothetical protein  27.08 
 
 		 232 aa  81.6  0.000000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0711  protein of unknown function DUF421  29.45 
 
 		 248 aa  80.9  0.000000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2189  hypothetical protein  29.14 
 
 		 241 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000145811  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4082  protein of unknown function DUF421  30.28 
 
 		 171 aa  80.5  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0625  protein of unknown function DUF421  28.8 
 
 		 226 aa  80.5  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00740952  normal  0.965778 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1012  protein of unknown function DUF421  30.82 
 
 		 243 aa  79.3  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1555  hypothetical protein  25.69 
 
 		 232 aa  79  0.00000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2146  hypothetical protein  29.45 
 
 		 202 aa  78.6  0.00000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.573525  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2671  protein of unknown function DUF421  32.17 
 
 		 242 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113456  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02060  predicted membrane protein  27.97 
 
 		 164 aa  77.4  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0321  hypothetical protein  28.77 
 
 		 225 aa  77  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.911962  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0519  protein of unknown function DUF421  30.19 
 
 		 228 aa  77  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0220  hypothetical protein  31.54 
 
 		 253 aa  76.3  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2581  membrane protein-like protein  24.24 
 
 		 172 aa  76.3  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.604139  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2187  hypothetical protein  30.77 
 
 		 289 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000023722  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2084  protein of unknown function DUF421  27.27 
 
 		 228 aa  75.5  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.138808  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0702  hypothetical protein  27.46 
 
 		 215 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00491681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3692  hypothetical protein  30.77 
 
 		 289 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1704  hypothetical protein  26.09 
 
 		 228 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1685  hypothetical protein  26.09 
 
 		 228 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.376353  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1838  hypothetical protein  26.09 
 
 		 228 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.315149  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1882  hypothetical protein  26.09 
 
 		 228 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.929447 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0436  hypothetical protein  29.52 
 
 		 224 aa  73.2  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617619  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3499  hypothetical protein  26.09 
 
 		 228 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.664218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5258  membrane protein-like protein  27.5 
 
 		 228 aa  72.8  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3175  hypothetical protein  29.25 
 
 		 227 aa  72.8  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.979599  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2513  hypothetical protein  26.39 
 
 		 235 aa  72.8  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3115  protein of unknown function DUF421  28.24 
 
 		 229 aa  72.4  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5467  protein of unknown function DUF421  26.79 
 
 		 225 aa  72  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.244646 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1926  hypothetical protein  26.19 
 
 		 228 aa  72  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.328835  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5311  hypothetical protein  29.37 
 
 		 289 aa  72  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2247  protein of unknown function DUF421  28.57 
 
 		 168 aa  71.6  0.000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1844  hypothetical protein  25.47 
 
 		 228 aa  71.2  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1660  hypothetical protein  25.47 
 
 		 228 aa  71.2  0.000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0800376  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0408  hypothetical protein  29.66 
 
 		 289 aa  71.2  0.000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1961  hypothetical protein  25.47 
 
 		 228 aa  71.2  0.000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.139623  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5269  hypothetical protein  29.37 
 
 		 289 aa  71.2  0.000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0566  hypothetical protein  25.17 
 
 		 237 aa  71.2  0.000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4494  hypothetical protein  27.81 
 
 		 215 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000327358 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4499  hypothetical protein  27.7 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00871532  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4147  hypothetical protein  27.81 
 
 		 215 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000615268  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11408  hypothetical protein  29.87 
 
 		 181 aa  70.9  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0751825  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4754  hypothetical protein  28.97 
 
 		 146 aa  70.5  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204724  normal  0.0118925 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5253  hypothetical protein  28.67 
 
 		 289 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4309  hypothetical protein  27.15 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0126531  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4158  hypothetical protein  27.15 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0166527  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4644  hypothetical protein  27.15 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.101491  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3273  protein of unknown function DUF421  26.39 
 
 		 232 aa  69.3  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0204  hypothetical protein  28.67 
 
 		 289 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0231  hypothetical protein  28.67 
 
 		 289 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.723048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1469  hypothetical protein  26 
 
 		 226 aa  69.3  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0792  protein of unknown function DUF421  29.27 
 
 		 286 aa  68.9  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4548  hypothetical protein  27.78 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00119776  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1712  hypothetical protein  24.1 
 
 		 227 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.144314  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4230  hypothetical protein  28.05 
 
 		 234 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000285959  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1589  hypothetical protein  25.53 
 
 		 185 aa  68.6  0.00000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0719  protein of unknown function DUF421  25.15 
 
 		 286 aa  68.6  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1122  protein of unknown function DUF421  28.67 
 
 		 242 aa  68.6  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4363  hypothetical protein  27.74 
 
 		 167 aa  68.6  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3910  hypothetical protein  29.68 
 
 		 234 aa  68.2  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0966557  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4843  hypothetical protein  29.37 
 
 		 289 aa  68.2  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4943  hypothetical protein  27.97 
 
 		 289 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5688  hypothetical protein  29.37 
 
 		 289 aa  68.2  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4268  hypothetical protein  28.85 
 
 		 234 aa  68.2  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.929825  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2138  hypothetical protein  27.33 
 
 		 229 aa  68.2  0.00000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4828  hypothetical protein  29.37 
 
 		 289 aa  67.8  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2090  hypothetical protein  25.17 
 
 		 245 aa  68.2  0.00000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4999  hypothetical protein  29.37 
 
 		 289 aa  67.8  0.00000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>