198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5467 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_5467  protein of unknown function DUF421  100 
 
 
225 aa  459  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.244646 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2617  hypothetical protein  45.33 
 
 
230 aa  210  1e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1415  hypothetical protein  41.52 
 
 
227 aa  197  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.228022 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2194  protein of unknown function DUF421  42.04 
 
 
232 aa  191  9e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00910  conserved inner membrane protein  42.21 
 
 
230 aa  176  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2737  protein of unknown function DUF421  42.21 
 
 
230 aa  176  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0253622  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00917  hypothetical protein  42.21 
 
 
230 aa  176  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1067  hypothetical protein  42.21 
 
 
230 aa  176  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0942748  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2422  hypothetical protein  42.21 
 
 
230 aa  176  2e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000473983  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2690  hypothetical protein  42.21 
 
 
230 aa  176  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.355377  normal  0.77182 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2215  hypothetical protein  42.21 
 
 
230 aa  177  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.297842 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1012  hypothetical protein  42.21 
 
 
230 aa  176  2e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000212287  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1003  hypothetical protein  42.21 
 
 
230 aa  176  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0243553  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1426  hypothetical protein  40.2 
 
 
230 aa  175  6e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.320436  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3232  protein of unknown function DUF421  37.61 
 
 
230 aa  172  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.151812  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1040  hypothetical protein  40.7 
 
 
230 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.169724  normal  0.241147 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1074  hypothetical protein  40.7 
 
 
230 aa  168  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.325553 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0981  hypothetical protein  40.7 
 
 
230 aa  168  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00314697  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1009  hypothetical protein  40.7 
 
 
230 aa  168  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1089  hypothetical protein  40.7 
 
 
230 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2726  hypothetical protein  34.38 
 
 
230 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3028  membrane protein-like protein  33.93 
 
 
230 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2486  hypothetical protein  35.9 
 
 
163 aa  122  6e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3115  protein of unknown function DUF421  27.06 
 
 
229 aa  104  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5258  membrane protein-like protein  24.07 
 
 
228 aa  99.8  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0626  protein of unknown function DUF421  26.5 
 
 
239 aa  96.7  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0141494  normal  0.718153 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0519  protein of unknown function DUF421  28.84 
 
 
228 aa  92.8  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0625  protein of unknown function DUF421  24.88 
 
 
226 aa  89.7  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00740952  normal  0.965778 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2791  hypothetical protein  28.64 
 
 
272 aa  89.4  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.169514  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5259  protein of unknown function DUF421  26.27 
 
 
229 aa  88.6  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1130  hypothetical protein  28.14 
 
 
272 aa  87.8  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0321  hypothetical protein  33.12 
 
 
225 aa  84.3  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.911962  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0520  protein of unknown function DUF421  27.03 
 
 
233 aa  83.2  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3116  protein of unknown function DUF421  24.31 
 
 
229 aa  82.4  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0719  protein of unknown function DUF421  30.46 
 
 
286 aa  78.6  0.00000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1555  hypothetical protein  31.61 
 
 
232 aa  77  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3175  hypothetical protein  29.63 
 
 
227 aa  77  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.979599  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2513  hypothetical protein  31.68 
 
 
235 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2671  protein of unknown function DUF421  29.48 
 
 
242 aa  75.9  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113456  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1469  hypothetical protein  30.07 
 
 
226 aa  75.1  0.0000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3332  hypothetical protein  27.46 
 
 
175 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1348  hypothetical protein  31.61 
 
 
232 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2154  hypothetical protein  26.79 
 
 
188 aa  73.9  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0961076  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2084  protein of unknown function DUF421  30.99 
 
 
228 aa  73.2  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.138808  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5983  hypothetical protein  25.66 
 
 
165 aa  72  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0201045 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3273  protein of unknown function DUF421  34.03 
 
 
232 aa  72  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0702  hypothetical protein  27.52 
 
 
215 aa  71.6  0.000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00491681  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3305  protein of unknown function DUF421  31.01 
 
 
258 aa  71.2  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00266927  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0436  hypothetical protein  28.17 
 
 
224 aa  70.1  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617619  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0127  hypothetical protein  27.75 
 
 
241 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0914  hypothetical protein  26.57 
 
 
172 aa  67.8  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1124  protein of unknown function DUF421  24 
 
 
223 aa  67.8  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2189  hypothetical protein  27.23 
 
 
241 aa  67  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000145811  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1589  hypothetical protein  25.87 
 
 
185 aa  67  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0321  protein of unknown function DUF421  25.86 
 
 
241 aa  65.9  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.78667 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4494  hypothetical protein  28.19 
 
 
215 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000327358 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4147  hypothetical protein  28.19 
 
 
215 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000615268  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4309  hypothetical protein  28.19 
 
 
215 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0126531  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4644  hypothetical protein  28.19 
 
 
215 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.101491  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4533  hypothetical protein  27.52 
 
 
215 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0230316  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0792  protein of unknown function DUF421  27.27 
 
 
286 aa  64.7  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0434  hypothetical protein  22.15 
 
 
179 aa  64.7  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4158  hypothetical protein  27.52 
 
 
215 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0166527  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1106  membrane protein-like protein  24.34 
 
 
227 aa  63.9  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00481139  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4363  hypothetical protein  21.99 
 
 
167 aa  63.9  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2827  membrane protein-like protein  25.97 
 
 
165 aa  63.2  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.138476 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4499  hypothetical protein  26.85 
 
 
215 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00871532  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3005  hypothetical protein  24.29 
 
 
147 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.166871  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4548  hypothetical protein  26.85 
 
 
215 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00119776  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3352  protein of unknown function DUF421  23.81 
 
 
173 aa  62.4  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3992  hypothetical protein  23.03 
 
 
226 aa  62.4  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3563  hypothetical protein  26.9 
 
 
158 aa  62.4  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.9488  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3177  hypothetical protein  26.06 
 
 
149 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755267  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4082  protein of unknown function DUF421  27.46 
 
 
171 aa  62.4  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11408  hypothetical protein  23.95 
 
 
181 aa  62.8  0.000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0751825  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11070  conserved hypothetical membrane-anchored protein  22.92 
 
 
149 aa  62.4  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2764  hypothetical protein  23.57 
 
 
172 aa  62  0.000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4261  hypothetical protein  25.5 
 
 
218 aa  61.2  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00116962  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0966  hypothetical protein  22.92 
 
 
234 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000924114  normal  0.424893 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3820  hypothetical protein  22.45 
 
 
171 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2827  hypothetical protein  21.52 
 
 
165 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.209727  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1799  protein of unknown function DUF421  26.76 
 
 
224 aa  60.1  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0271913  normal  0.21316 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1658  protein of unknown function DUF421  27.75 
 
 
286 aa  59.7  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3999  hypothetical protein  22.08 
 
 
234 aa  59.7  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0551  membrane protein-like protein  22.5 
 
 
180 aa  59.7  0.00000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000937148 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4230  hypothetical protein  21.43 
 
 
234 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000285959  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4268  hypothetical protein  21.43 
 
 
234 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.929825  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0769  hypothetical protein  22.86 
 
 
147 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0220  hypothetical protein  27.27 
 
 
253 aa  59.3  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0566  hypothetical protein  28.21 
 
 
237 aa  59.3  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4288  hypothetical protein  21.43 
 
 
234 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000645093  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1313  protein of unknown function DUF421  22.89 
 
 
184 aa  58.9  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1466  hypothetical protein  25.97 
 
 
286 aa  58.5  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3910  hypothetical protein  20.78 
 
 
234 aa  58.2  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0966557  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5253  hypothetical protein  26.37 
 
 
289 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2247  protein of unknown function DUF421  22.36 
 
 
168 aa  57.8  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02060  predicted membrane protein  22.7 
 
 
164 aa  57.8  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1938  protein of unknown function DUF421  27.15 
 
 
236 aa  58.2  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12630  predicted membrane protein  21.13 
 
 
211 aa  58.2  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0198  protein of unknown function DUF421  23.4 
 
 
164 aa  58.2  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>