144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5259 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5259  protein of unknown function DUF421  100 
 
 
229 aa  469  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3115  protein of unknown function DUF421  57.02 
 
 
229 aa  278  4e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0520  protein of unknown function DUF421  51.98 
 
 
233 aa  226  3e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0626  protein of unknown function DUF421  44.05 
 
 
239 aa  225  4e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0141494  normal  0.718153 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5258  membrane protein-like protein  38.86 
 
 
228 aa  170  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3116  protein of unknown function DUF421  36.96 
 
 
229 aa  156  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0625  protein of unknown function DUF421  37.28 
 
 
226 aa  150  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00740952  normal  0.965778 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0519  protein of unknown function DUF421  36.8 
 
 
228 aa  150  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2617  hypothetical protein  32.13 
 
 
230 aa  125  7e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2194  protein of unknown function DUF421  32.14 
 
 
232 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2791  hypothetical protein  28.18 
 
 
272 aa  102  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.169514  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1130  hypothetical protein  28.18 
 
 
272 aa  102  5e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1415  hypothetical protein  25.11 
 
 
227 aa  98.6  7e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.228022 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1426  hypothetical protein  27.27 
 
 
230 aa  97.1  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.320436  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1009  hypothetical protein  28.05 
 
 
230 aa  95.9  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1074  hypothetical protein  28.05 
 
 
230 aa  95.9  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.325553 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0981  hypothetical protein  28.05 
 
 
230 aa  95.5  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00314697  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1040  hypothetical protein  28.05 
 
 
230 aa  95.5  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.169724  normal  0.241147 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00910  conserved inner membrane protein  26.7 
 
 
230 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2737  protein of unknown function DUF421  26.7 
 
 
230 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0253622  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00917  hypothetical protein  26.7 
 
 
230 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1012  hypothetical protein  26.7 
 
 
230 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000212287  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1003  hypothetical protein  26.7 
 
 
230 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0243553  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2690  hypothetical protein  26.7 
 
 
230 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.355377  normal  0.77182 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2215  hypothetical protein  26.7 
 
 
230 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.297842 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2422  hypothetical protein  26.7 
 
 
230 aa  94.4  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000473983  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1089  hypothetical protein  27.6 
 
 
230 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1067  hypothetical protein  26.24 
 
 
230 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0942748  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2726  hypothetical protein  26.58 
 
 
230 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3028  membrane protein-like protein  26.13 
 
 
230 aa  88.2  9e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3232  protein of unknown function DUF421  26.41 
 
 
230 aa  84.3  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.151812  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5467  protein of unknown function DUF421  26.27 
 
 
225 aa  82  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.244646 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3305  protein of unknown function DUF421  29.3 
 
 
258 aa  71.2  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00266927  normal 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2486  hypothetical protein  25.33 
 
 
163 aa  69.3  0.00000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1504  hypothetical protein  27.75 
 
 
177 aa  68.6  0.00000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1555  hypothetical protein  27.27 
 
 
232 aa  67.8  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0321  protein of unknown function DUF421  26 
 
 
241 aa  67.4  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.78667 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1466  hypothetical protein  26.75 
 
 
286 aa  66.6  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2513  hypothetical protein  26.21 
 
 
235 aa  65.9  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1106  membrane protein-like protein  25.34 
 
 
227 aa  65.5  0.0000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00481139  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0719  protein of unknown function DUF421  27.45 
 
 
286 aa  65.5  0.0000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2090  hypothetical protein  27.67 
 
 
245 aa  65.1  0.0000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0947  protein of unknown function DUF421  25.44 
 
 
178 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.528971  normal  0.296252 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5983  hypothetical protein  26.35 
 
 
165 aa  63.9  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0201045 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1348  hypothetical protein  26.57 
 
 
232 aa  62.4  0.000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3820  hypothetical protein  28.21 
 
 
171 aa  62.4  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3175  hypothetical protein  23.84 
 
 
227 aa  62.4  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.979599  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0198  protein of unknown function DUF421  25.36 
 
 
164 aa  62.4  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3332  hypothetical protein  25.77 
 
 
175 aa  62  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0408  hypothetical protein  25.64 
 
 
289 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0321  hypothetical protein  24.32 
 
 
225 aa  59.7  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.911962  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2084  protein of unknown function DUF421  27.97 
 
 
228 aa  59.7  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.138808  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4224  hypothetical protein  27.22 
 
 
196 aa  59.7  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.434687  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3273  protein of unknown function DUF421  28 
 
 
232 aa  59.7  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1469  hypothetical protein  25.85 
 
 
226 aa  59.7  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6410  membrane protein-like protein  24.16 
 
 
170 aa  59.7  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2154  hypothetical protein  23.03 
 
 
188 aa  59.3  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0961076  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4943  hypothetical protein  26.92 
 
 
289 aa  57.8  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5269  hypothetical protein  26.92 
 
 
289 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5253  hypothetical protein  26.28 
 
 
289 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2187  hypothetical protein  24 
 
 
289 aa  57.4  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000023722  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4828  hypothetical protein  25.64 
 
 
289 aa  57.4  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4843  hypothetical protein  25.64 
 
 
289 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0204  hypothetical protein  26.92 
 
 
289 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3692  hypothetical protein  26.58 
 
 
289 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0231  hypothetical protein  26.92 
 
 
289 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.723048  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5311  hypothetical protein  26.92 
 
 
289 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5688  hypothetical protein  25.64 
 
 
289 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2332  hypothetical protein  21.85 
 
 
165 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.232765  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0792  protein of unknown function DUF421  24.34 
 
 
286 aa  56.6  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0436  hypothetical protein  26.14 
 
 
224 aa  57  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617619  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4999  hypothetical protein  25.64 
 
 
289 aa  56.2  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5379  hypothetical protein  25.64 
 
 
289 aa  56.2  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5235  hypothetical protein  25.64 
 
 
289 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2406  hypothetical protein  27.27 
 
 
165 aa  56.6  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.285928  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1485  protein of unknown function DUF421  27.81 
 
 
234 aa  56.2  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0112  hypothetical protein  22.7 
 
 
166 aa  55.8  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2138  hypothetical protein  24.5 
 
 
229 aa  55.8  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1313  protein of unknown function DUF421  20.9 
 
 
184 aa  55.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3409  hypothetical protein  27.61 
 
 
172 aa  55.5  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00991237  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0220  hypothetical protein  25.79 
 
 
253 aa  55.5  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12630  predicted membrane protein  21.88 
 
 
211 aa  55.5  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0702  hypothetical protein  22.92 
 
 
215 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00491681  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4363  hypothetical protein  24.38 
 
 
167 aa  55.1  0.0000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1658  protein of unknown function DUF421  24.34 
 
 
286 aa  55.1  0.0000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2189  hypothetical protein  20.71 
 
 
241 aa  54.3  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000145811  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2763  hypothetical protein  22.73 
 
 
165 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000337071 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2644  hypothetical protein  21.19 
 
 
165 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0254116  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2563  hypothetical protein  22.73 
 
 
165 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2607  hypothetical protein  22.07 
 
 
165 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00192347  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3352  protein of unknown function DUF421  22.44 
 
 
173 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4309  hypothetical protein  26.04 
 
 
215 aa  53.1  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0126531  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4147  hypothetical protein  26.04 
 
 
215 aa  52.8  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000615268  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4644  hypothetical protein  26.04 
 
 
215 aa  53.1  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.101491  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3563  hypothetical protein  31.36 
 
 
158 aa  52.8  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.9488  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1251  protein of unknown function DUF421  21.43 
 
 
175 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4494  hypothetical protein  26.04 
 
 
215 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000327358 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4158  hypothetical protein  25.83 
 
 
215 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0166527  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2188  hypothetical protein  25.28 
 
 
206 aa  52.4  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000216241  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4533  hypothetical protein  23.66 
 
 
215 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0230316  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>