153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4224 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4224  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  395  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.434687  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2562  hypothetical protein  44.94 
 
 		 164 aa  140  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3817  hypothetical protein  39.49 
 
 		 163 aa  123  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4894  hypothetical protein  39.49 
 
 		 163 aa  123  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.292864 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5498  hypothetical protein  35.9 
 
 		 173 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2237  hypothetical protein  34.62 
 
 		 163 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2030  hypothetical protein  34.62 
 
 		 164 aa  112  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.334364  normal  0.673359 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1339  hypothetical protein  38.32 
 
 		 167 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3114  hypothetical protein  38.32 
 
 		 167 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2990  hypothetical protein  38.32 
 
 		 167 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.138787  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6233  hypothetical protein  36.71 
 
 		 160 aa  98.2  8e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303175  normal  0.107487 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2202  hypothetical protein  32.34 
 
 		 167 aa  89.4  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359342 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2115  hypothetical membrane associated protein  31.21 
 
 		 199 aa  81.6  0.000000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0071  hypothetical protein  31.21 
 
 		 159 aa  81.6  0.000000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5983  hypothetical protein  31.01 
 
 		 165 aa  81.3  0.000000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0201045 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0051  hypothetical protein  30.99 
 
 		 160 aa  77.8  0.00000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0053  hypothetical protein  30.99 
 
 		 160 aa  77  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4363  hypothetical protein  32.68 
 
 		 167 aa  76.6  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3177  hypothetical protein  28.57 
 
 		 149 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755267  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36940  hypothetical protein  30.23 
 
 		 149 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.309583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2636  protein of unknown function DUF421  30.07 
 
 		 161 aa  71.2  0.000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.753675  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3005  hypothetical protein  30.71 
 
 		 147 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.166871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3940  hypothetical protein  31.13 
 
 		 159 aa  68.6  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.179392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3051  protein of unknown function DUF421  33.78 
 
 		 155 aa  68.6  0.00000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11070  conserved hypothetical membrane-anchored protein  27.08 
 
 		 149 aa  67.8  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0707  hypothetical protein  30.99 
 
 		 150 aa  67  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0159977  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2827  hypothetical protein  28.4 
 
 		 165 aa  66.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.209727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3287  hypothetical protein  27.86 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.581053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2536  hypothetical protein  31.45 
 
 		 182 aa  63.9  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4212  protein of unknown function DUF421  30.66 
 
 		 188 aa  64.3  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.983168 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2764  hypothetical protein  25.9 
 
 		 172 aa  62.8  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6439  conserved hypothetical membrane-anchored protein  28.57 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1459  hypothetical protein  28.87 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.902977  normal  0.138264 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1313  protein of unknown function DUF421  23.31 
 
 		 184 aa  61.6  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0769  hypothetical protein  26.39 
 
 		 147 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1504  hypothetical protein  25.75 
 
 		 177 aa  61.2  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1650  hypothetical protein  29.86 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0747624  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3563  hypothetical protein  31.15 
 
 		 158 aa  60.5  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.9488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5259  protein of unknown function DUF421  27.22 
 
 		 229 aa  59.7  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3115  protein of unknown function DUF421  25.32 
 
 		 229 aa  59.7  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0626  protein of unknown function DUF421  26.25 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0141494  normal  0.718153 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0198  protein of unknown function DUF421  22.86 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3820  hypothetical protein  26.14 
 
 		 171 aa  58.5  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2827  membrane protein-like protein  28.48 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.138476 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3332  hypothetical protein  25.79 
 
 		 175 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2247  protein of unknown function DUF421  24 
 
 		 168 aa  57.4  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1124  protein of unknown function DUF421  26.22 
 
 		 223 aa  57  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3352  protein of unknown function DUF421  28.57 
 
 		 173 aa  57  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6410  membrane protein-like protein  27.71 
 
 		 170 aa  56.2  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2218  hypothetical protein  30.52 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.450386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0112  hypothetical protein  28.06 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1040  hypothetical protein  24.57 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.169724  normal  0.241147 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1009  hypothetical protein  24.57 
 
 		 230 aa  54.7  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1074  hypothetical protein  24.57 
 
 		 230 aa  54.7  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.325553 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0981  hypothetical protein  24.57 
 
 		 230 aa  54.7  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00314697  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0914  hypothetical protein  30.77 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1089  hypothetical protein  24.57 
 
 		 230 aa  54.7  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1415  hypothetical protein  23.53 
 
 		 227 aa  54.3  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.228022 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1426  hypothetical protein  24.46 
 
 		 230 aa  53.5  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.320436  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00910  conserved inner membrane protein  24 
 
 		 230 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2737  protein of unknown function DUF421  24 
 
 		 230 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0253622  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11408  hypothetical protein  22.82 
 
 		 181 aa  53.1  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0751825  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00917  hypothetical protein  24 
 
 		 230 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0523  protein of unknown function DUF421  27.12 
 
 		 175 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2617  hypothetical protein  22.3 
 
 		 230 aa  52.8  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1012  hypothetical protein  24 
 
 		 230 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000212287  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1003  hypothetical protein  24 
 
 		 230 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0243553  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2690  hypothetical protein  24 
 
 		 230 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.355377  normal  0.77182 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2215  hypothetical protein  24 
 
 		 230 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.297842 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2422  hypothetical protein  24 
 
 		 230 aa  53.1  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000473983  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2581  membrane protein-like protein  24 
 
 		 172 aa  52.8  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.604139  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1251  protein of unknown function DUF421  24.24 
 
 		 175 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1108  hypothetical protein  24.85 
 
 		 175 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.628779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1067  hypothetical protein  25.17 
 
 		 230 aa  52  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0942748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4754  hypothetical protein  25 
 
 		 146 aa  52  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204724  normal  0.0118925 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2726  hypothetical protein  27.22 
 
 		 230 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6863  protein of unknown function DUF421  25.17 
 
 		 146 aa  51.6  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1825  protein of unknown function DUF421  22.86 
 
 		 225 aa  50.8  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2607  hypothetical protein  22.79 
 
 		 165 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00192347  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0520  protein of unknown function DUF421  25.56 
 
 		 233 aa  50.8  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3992  hypothetical protein  31.11 
 
 		 226 aa  51.2  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1466  hypothetical protein  26.8 
 
 		 286 aa  50.8  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1469  hypothetical protein  21.89 
 
 		 226 aa  50.8  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2406  hypothetical protein  22.79 
 
 		 165 aa  50.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.285928  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2332  hypothetical protein  23.53 
 
 		 165 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.232765  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2644  hypothetical protein  22.79 
 
 		 165 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0254116  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0825  hypothetical protein  30.14 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.102228 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2194  protein of unknown function DUF421  24.26 
 
 		 232 aa  50.1  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0854  hypothetical protein  29.17 
 
 		 155 aa  50.1  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3383  hypothetical protein  29.17 
 
 		 158 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1589  hypothetical protein  25.87 
 
 		 185 aa  49.7  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0702  hypothetical protein  21.38 
 
 		 215 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00491681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3510  hypothetical protein  25.35 
 
 		 146 aa  49.7  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3175  hypothetical protein  21.3 
 
 		 227 aa  49.3  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.979599  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3028  membrane protein-like protein  26.63 
 
 		 230 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0947  protein of unknown function DUF421  21.38 
 
 		 178 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.528971  normal  0.296252 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2763  hypothetical protein  23.19 
 
 		 165 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000337071 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0919  hypothetical protein  30.77 
 
 		 155 aa  49.3  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.043093 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3285  membrane protein-like protein  28.86 
 
 		 160 aa  49.3  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.22155  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2563  hypothetical protein  23.19 
 
 		 165 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>