146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5498 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_5498  hypothetical protein  100 
 
 		 173 aa  345  1e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3817  hypothetical protein  62.73 
 
 		 163 aa  205  3e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4894  hypothetical protein  62.73 
 
 		 163 aa  205  3e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.292864 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2237  hypothetical protein  61.96 
 
 		 163 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2030  hypothetical protein  62.73 
 
 		 164 aa  195  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.334364  normal  0.673359 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1339  hypothetical protein  64.24 
 
 		 167 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3114  hypothetical protein  64.24 
 
 		 167 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2990  hypothetical protein  64.24 
 
 		 167 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.138787  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2562  hypothetical protein  41.1 
 
 		 164 aa  148  4e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4224  hypothetical protein  35.9 
 
 		 196 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.434687  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6233  hypothetical protein  39.61 
 
 		 160 aa  105  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303175  normal  0.107487 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2536  hypothetical protein  38.65 
 
 		 182 aa  95.9  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2202  hypothetical protein  32.92 
 
 		 167 aa  90.9  8e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359342 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5983  hypothetical protein  32.03 
 
 		 165 aa  86.7  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0201045 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0071  hypothetical protein  29.33 
 
 		 159 aa  80.9  0.000000000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4363  hypothetical protein  32.45 
 
 		 167 aa  79.7  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2115  hypothetical membrane associated protein  28.67 
 
 		 199 aa  79  0.00000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6439  conserved hypothetical membrane-anchored protein  29.93 
 
 		 150 aa  75.9  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0053  hypothetical protein  28.19 
 
 		 160 aa  73.9  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0051  hypothetical protein  28.19 
 
 		 160 aa  73.9  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3352  protein of unknown function DUF421  30.88 
 
 		 173 aa  72  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0434  hypothetical protein  24.84 
 
 		 179 aa  71.2  0.000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1313  protein of unknown function DUF421  23.16 
 
 		 184 aa  71.2  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0769  hypothetical protein  27.78 
 
 		 147 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11070  conserved hypothetical membrane-anchored protein  26.85 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3051  protein of unknown function DUF421  36.36 
 
 		 155 aa  69.3  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2827  membrane protein-like protein  30.07 
 
 		 165 aa  69.3  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.138476 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6863  protein of unknown function DUF421  27.03 
 
 		 146 aa  67.8  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3005  hypothetical protein  26.39 
 
 		 147 aa  67.4  0.00000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.166871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0551  membrane protein-like protein  23.9 
 
 		 180 aa  67  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000937148 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3510  hypothetical protein  25.69 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3285  membrane protein-like protein  33.56 
 
 		 160 aa  66.6  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.22155  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0711  protein of unknown function DUF421  26.71 
 
 		 248 aa  66.2  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3177  hypothetical protein  26.39 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755267  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0112  hypothetical protein  31.39 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12630  predicted membrane protein  25.79 
 
 		 211 aa  64.3  0.0000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2764  hypothetical protein  23.61 
 
 		 172 aa  63.5  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1504  hypothetical protein  27.04 
 
 		 177 aa  63.9  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4754  hypothetical protein  27.08 
 
 		 146 aa  63.5  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204724  normal  0.0118925 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00910  conserved inner membrane protein  27.46 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2737  protein of unknown function DUF421  27.46 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0253622  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1459  hypothetical protein  28.08 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.902977  normal  0.138264 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00917  hypothetical protein  27.46 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1012  hypothetical protein  27.46 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000212287  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1003  hypothetical protein  27.46 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0243553  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2690  hypothetical protein  27.46 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.355377  normal  0.77182 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2215  hypothetical protein  27.46 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.297842 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2422  hypothetical protein  27.46 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000473983  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3940  hypothetical protein  31.72 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.179392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1067  hypothetical protein  27.46 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0942748  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11408  hypothetical protein  25.16 
 
 		 181 aa  62.4  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0751825  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6410  membrane protein-like protein  27.34 
 
 		 170 aa  62.4  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1469  hypothetical protein  24.14 
 
 		 226 aa  62.4  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1426  hypothetical protein  26.06 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.320436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4212  protein of unknown function DUF421  27.54 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.983168 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1009  hypothetical protein  26.76 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1074  hypothetical protein  26.76 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.325553 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1089  hypothetical protein  26.76 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0981  hypothetical protein  26.76 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00314697  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1040  hypothetical protein  26.76 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.169724  normal  0.241147 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1589  hypothetical protein  26.85 
 
 		 185 aa  62  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2247  protein of unknown function DUF421  25.97 
 
 		 168 aa  62  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3287  hypothetical protein  26.03 
 
 		 149 aa  62  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.581053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0436  hypothetical protein  23.78 
 
 		 224 aa  62  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617619  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1485  protein of unknown function DUF421  30.14 
 
 		 234 aa  62  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0321  hypothetical protein  25.33 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.911962  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3175  hypothetical protein  23.45 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.979599  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1650  hypothetical protein  25.34 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0747624  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2084  protein of unknown function DUF421  26.62 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.138808  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2827  hypothetical protein  27.45 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.209727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36940  hypothetical protein  27.78 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.309583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2636  protein of unknown function DUF421  25 
 
 		 161 aa  58.2  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.753675  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1555  hypothetical protein  24.5 
 
 		 232 aa  58.2  0.00000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1348  hypothetical protein  25.17 
 
 		 232 aa  58.2  0.00000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3563  hypothetical protein  28.66 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.9488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2513  hypothetical protein  25.52 
 
 		 235 aa  57.8  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2617  hypothetical protein  23.38 
 
 		 230 aa  57.4  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3992  hypothetical protein  27.27 
 
 		 226 aa  57  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1106  membrane protein-like protein  25.35 
 
 		 227 aa  57  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00481139  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2581  membrane protein-like protein  26.39 
 
 		 172 aa  57  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.604139  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3224  protein of unknown function DUF421  24.34 
 
 		 173 aa  56.2  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826771  normal  0.0304981 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3273  protein of unknown function DUF421  24.83 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0321  protein of unknown function DUF421  27.27 
 
 		 241 aa  55.1  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.78667 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0198  protein of unknown function DUF421  27.08 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2189  hypothetical protein  24.67 
 
 		 241 aa  55.1  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000145811  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3332  hypothetical protein  29.29 
 
 		 175 aa  55.1  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3305  protein of unknown function DUF421  28.67 
 
 		 258 aa  55.1  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00266927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2154  hypothetical protein  29.33 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0961076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3133  hypothetical protein  23.18 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.152895 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1712  hypothetical protein  26.67 
 
 		 227 aa  54.3  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.144314  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0707  hypothetical protein  27.78 
 
 		 150 aa  53.9  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0159977  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0127  hypothetical protein  24.66 
 
 		 241 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1415  hypothetical protein  23.45 
 
 		 227 aa  52  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.228022 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2726  hypothetical protein  23.84 
 
 		 230 aa  52  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3820  hypothetical protein  28.57 
 
 		 171 aa  51.6  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05340  predicted membrane protein  28.57 
 
 		 242 aa  51.2  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00296282  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1466  hypothetical protein  26.71 
 
 		 286 aa  51.2  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1926  hypothetical protein  23.45 
 
 		 228 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.328835  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3115  protein of unknown function DUF421  23.9 
 
 		 229 aa  50.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1698  hypothetical protein  24.14 
 
 		 228 aa  50.4  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>