207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4212 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4212  protein of unknown function DUF421  100 
 
 		 188 aa  378  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.983168 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3992  hypothetical protein  57.89 
 
 		 226 aa  185  3e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3352  protein of unknown function DUF421  56.4 
 
 		 173 aa  185  3e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2827  membrane protein-like protein  56.67 
 
 		 165 aa  174  9e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.138476 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1504  hypothetical protein  49.16 
 
 		 177 aa  167  1e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3820  hypothetical protein  50.96 
 
 		 171 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3285  membrane protein-like protein  58.94 
 
 		 160 aa  160  8.000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.22155  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1589  hypothetical protein  46.2 
 
 		 185 aa  152  4e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1313  protein of unknown function DUF421  44.97 
 
 		 184 aa  149  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2641  hypothetical protein  46.34 
 
 		 175 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.865763  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2686  hypothetical protein  46.34 
 
 		 175 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.565782  normal  0.0102559 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2670  hypothetical protein  46.34 
 
 		 175 aa  138  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0112  hypothetical protein  46.1 
 
 		 166 aa  132  3e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4346  protein of unknown function DUF421  46.06 
 
 		 174 aa  125  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0250687  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0399  protein of unknown function DUF421  47.06 
 
 		 166 aa  120  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3836  hypothetical protein  59.22 
 
 		 121 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.147989  normal  0.0810838 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0551  membrane protein-like protein  36.26 
 
 		 180 aa  117  9.999999999999999e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000937148 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0434  hypothetical protein  36.36 
 
 		 179 aa  111  5e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6410  membrane protein-like protein  41.06 
 
 		 170 aa  110  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2271  hypothetical protein  33.77 
 
 		 170 aa  96.7  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0914  hypothetical protein  32.68 
 
 		 172 aa  88.6  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2218  hypothetical protein  34.9 
 
 		 172 aa  87.4  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.450386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3224  protein of unknown function DUF421  30.15 
 
 		 173 aa  85.9  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826771  normal  0.0304981 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11408  hypothetical protein  27.98 
 
 		 181 aa  85.1  6e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0751825  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2247  protein of unknown function DUF421  30.07 
 
 		 168 aa  82.8  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1485  protein of unknown function DUF421  31.29 
 
 		 234 aa  82  0.000000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5983  hypothetical protein  31.97 
 
 		 165 aa  80.5  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0201045 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2201  membrane protein-like protein  30.19 
 
 		 186 aa  80.1  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2566  hypothetical protein  33.1 
 
 		 165 aa  80.1  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.31826  hitchhiker  0.0000735154 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3940  hypothetical protein  35.19 
 
 		 159 aa  78.6  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.179392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2415  hypothetical protein  32.39 
 
 		 166 aa  78.2  0.00000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.696624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0436  hypothetical protein  27.78 
 
 		 224 aa  77.4  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617619  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1466  hypothetical protein  29.87 
 
 		 286 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3332  hypothetical protein  28.77 
 
 		 175 aa  76.6  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3409  hypothetical protein  28.83 
 
 		 172 aa  76.6  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00991237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0702  hypothetical protein  27.97 
 
 		 215 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00491681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12630  predicted membrane protein  28.06 
 
 		 211 aa  75.1  0.0000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3563  hypothetical protein  33.09 
 
 		 158 aa  73.9  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.9488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2581  membrane protein-like protein  26.35 
 
 		 172 aa  73.9  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.604139  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05340  predicted membrane protein  25.71 
 
 		 242 aa  73.6  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00296282  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0719  protein of unknown function DUF421  26.95 
 
 		 286 aa  73.2  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1106  membrane protein-like protein  28.68 
 
 		 227 aa  73.2  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00481139  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1251  protein of unknown function DUF421  29.8 
 
 		 175 aa  72  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4363  hypothetical protein  29.93 
 
 		 167 aa  71.6  0.000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03310  hypothetical protein  32.26 
 
 		 170 aa  71.2  0.000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06995  hypothetical protein  26.38 
 
 		 174 aa  71.2  0.000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.294218  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0812  protein of unknown function DUF421  33.33 
 
 		 173 aa  70.5  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.954202 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1108  hypothetical protein  29.14 
 
 		 175 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.628779  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4499  hypothetical protein  27.2 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00871532  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4261  hypothetical protein  28 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00116962  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3305  protein of unknown function DUF421  28.78 
 
 		 258 aa  70.1  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00266927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4548  hypothetical protein  27.2 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00119776  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1658  protein of unknown function DUF421  30.53 
 
 		 286 aa  69.3  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0321  hypothetical protein  31.34 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.911962  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4082  protein of unknown function DUF421  25.77 
 
 		 171 aa  68.6  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0523  protein of unknown function DUF421  27.81 
 
 		 175 aa  68.6  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6439  conserved hypothetical membrane-anchored protein  28 
 
 		 150 aa  67.8  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0792  protein of unknown function DUF421  27.21 
 
 		 286 aa  67.8  0.00000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4309  hypothetical protein  26.4 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0126531  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4147  hypothetical protein  26.4 
 
 		 215 aa  67  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000615268  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4158  hypothetical protein  26.4 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0166527  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4644  hypothetical protein  26.4 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.101491  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2194  protein of unknown function DUF421  27.21 
 
 		 232 aa  67  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2202  hypothetical protein  31.21 
 
 		 167 aa  67.4  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359342 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4494  hypothetical protein  26.4 
 
 		 215 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000327358 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4533  hypothetical protein  26.4 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0230316  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1012  protein of unknown function DUF421  25.58 
 
 		 243 aa  67.4  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0198  protein of unknown function DUF421  27.82 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2636  protein of unknown function DUF421  26.09 
 
 		 161 aa  67  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.753675  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0321  protein of unknown function DUF421  26.62 
 
 		 241 aa  66.2  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.78667 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6863  protein of unknown function DUF421  26.9 
 
 		 146 aa  66.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1469  hypothetical protein  25 
 
 		 226 aa  66.2  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4754  hypothetical protein  29.25 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204724  normal  0.0118925 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2090  hypothetical protein  25.53 
 
 		 245 aa  66.2  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1415  hypothetical protein  23.9 
 
 		 227 aa  65.5  0.0000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.228022 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2764  hypothetical protein  26.12 
 
 		 172 aa  65.5  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3175  hypothetical protein  23.74 
 
 		 227 aa  65.1  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.979599  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3051  protein of unknown function DUF421  28 
 
 		 155 aa  64.7  0.0000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2138  hypothetical protein  26.12 
 
 		 229 aa  64.7  0.0000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4224  hypothetical protein  30.66 
 
 		 196 aa  64.3  0.0000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.434687  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2617  hypothetical protein  24.82 
 
 		 230 aa  64.3  0.0000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1122  protein of unknown function DUF421  27.16 
 
 		 242 aa  63.9  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3005  hypothetical protein  26.12 
 
 		 147 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.166871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2513  hypothetical protein  25.18 
 
 		 235 aa  63.9  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0947  protein of unknown function DUF421  26.81 
 
 		 178 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.528971  normal  0.296252 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0919  hypothetical protein  28.36 
 
 		 155 aa  63.5  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.043093 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1968  protein of unknown function DUF421  26.21 
 
 		 245 aa  62.8  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1799  protein of unknown function DUF421  25.37 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0271913  normal  0.21316 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1650  hypothetical protein  26.09 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0747624  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2146  hypothetical protein  25.17 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.573525  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1026  hypothetical protein  33.33 
 
 		 172 aa  62.4  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.170093  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5498  hypothetical protein  27.54 
 
 		 173 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2827  hypothetical protein  26.88 
 
 		 165 aa  62  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.209727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0854  hypothetical protein  27.61 
 
 		 155 aa  62  0.000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1459  hypothetical protein  27.74 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.902977  normal  0.138264 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2671  protein of unknown function DUF421  23.4 
 
 		 242 aa  61.2  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113456  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2084  protein of unknown function DUF421  27.08 
 
 		 228 aa  60.8  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.138808  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2030  hypothetical protein  30 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.334364  normal  0.673359 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0711  protein of unknown function DUF421  27.03 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2639  YdfS  22.78 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>