198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03310 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03310  hypothetical protein  100 
 
 		 170 aa  341  2.9999999999999997e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0914  hypothetical protein  61.54 
 
 		 172 aa  221  4e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2218  hypothetical protein  59.88 
 
 		 172 aa  202  2e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.450386  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11408  hypothetical protein  42.28 
 
 		 181 aa  129  2.0000000000000002e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0751825  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06995  hypothetical protein  45.52 
 
 		 174 aa  118  3e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.294218  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2201  membrane protein-like protein  39.69 
 
 		 186 aa  97.8  6e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3285  membrane protein-like protein  39.31 
 
 		 160 aa  85.5  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.22155  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1504  hypothetical protein  33.33 
 
 		 177 aa  84.3  8e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1589  hypothetical protein  31.01 
 
 		 185 aa  82.4  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0399  protein of unknown function DUF421  34.59 
 
 		 166 aa  82  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2827  membrane protein-like protein  35.88 
 
 		 165 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.138476 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1313  protein of unknown function DUF421  29.03 
 
 		 184 aa  79.7  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3820  hypothetical protein  34.44 
 
 		 171 aa  78.6  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05340  predicted membrane protein  28.26 
 
 		 242 aa  77.8  0.00000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00296282  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3352  protein of unknown function DUF421  33.56 
 
 		 173 aa  77.8  0.00000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2641  hypothetical protein  33.54 
 
 		 175 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.865763  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2686  hypothetical protein  33.54 
 
 		 175 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.565782  normal  0.0102559 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4212  protein of unknown function DUF421  32.26 
 
 		 188 aa  76.3  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.983168 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2670  hypothetical protein  32.26 
 
 		 175 aa  75.1  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3992  hypothetical protein  32.62 
 
 		 226 aa  74.7  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0434  hypothetical protein  25.97 
 
 		 179 aa  72.8  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0112  hypothetical protein  30.28 
 
 		 166 aa  71.6  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1555  hypothetical protein  26.45 
 
 		 232 aa  72  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6410  membrane protein-like protein  33.81 
 
 		 170 aa  71.6  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0321  hypothetical protein  30.82 
 
 		 225 aa  71.2  0.000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.911962  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2194  protein of unknown function DUF421  27.46 
 
 		 232 aa  70.1  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1469  hypothetical protein  31.16 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12630  predicted membrane protein  29.08 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1348  hypothetical protein  25.16 
 
 		 232 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1122  protein of unknown function DUF421  28.15 
 
 		 242 aa  68.2  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2764  hypothetical protein  26.49 
 
 		 172 aa  68.6  0.00000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2271  hypothetical protein  28.39 
 
 		 170 aa  67.4  0.00000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2513  hypothetical protein  27.33 
 
 		 235 aa  66.2  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2671  protein of unknown function DUF421  27.94 
 
 		 242 aa  66.2  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113456  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2189  hypothetical protein  25.55 
 
 		 241 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000145811  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4346  protein of unknown function DUF421  33.57 
 
 		 174 aa  65.9  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0250687  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4754  hypothetical protein  31.43 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204724  normal  0.0118925 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0436  hypothetical protein  26.67 
 
 		 224 aa  64.3  0.0000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617619  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2382  protein of unknown function DUF421  30.71 
 
 		 281 aa  64.3  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173055  normal  0.818165 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1106  membrane protein-like protein  24.65 
 
 		 227 aa  63.5  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00481139  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1012  protein of unknown function DUF421  29.08 
 
 		 243 aa  63.5  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0702  hypothetical protein  22.36 
 
 		 215 aa  62  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00491681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0321  protein of unknown function DUF421  24.83 
 
 		 241 aa  62  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.78667 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0551  membrane protein-like protein  24.1 
 
 		 180 aa  62  0.000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000937148 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0127  hypothetical protein  24.39 
 
 		 241 aa  61.6  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4082  protein of unknown function DUF421  27.45 
 
 		 171 aa  60.8  0.000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1130  hypothetical protein  27.33 
 
 		 272 aa  60.8  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3175  hypothetical protein  26.81 
 
 		 227 aa  60.8  0.000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.979599  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3273  protein of unknown function DUF421  26.81 
 
 		 232 aa  60.8  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2791  hypothetical protein  27.33 
 
 		 272 aa  60.8  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.169514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3940  hypothetical protein  29.77 
 
 		 159 aa  60.5  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.179392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0220  hypothetical protein  26.71 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3563  hypothetical protein  30.41 
 
 		 158 aa  60.5  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.9488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1459  hypothetical protein  25.74 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.902977  normal  0.138264 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3305  protein of unknown function DUF421  24.14 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00266927  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2247  protein of unknown function DUF421  25.32 
 
 		 168 aa  58.5  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4548  hypothetical protein  23.74 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00119776  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1799  protein of unknown function DUF421  25.95 
 
 		 224 aa  58.2  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0271913  normal  0.21316 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1938  protein of unknown function DUF421  27.66 
 
 		 236 aa  57.4  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2726  hypothetical protein  26.52 
 
 		 230 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4499  hypothetical protein  23.74 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00871532  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0769  hypothetical protein  23.91 
 
 		 147 aa  57  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3510  hypothetical protein  25.17 
 
 		 146 aa  57  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3177  hypothetical protein  26.09 
 
 		 149 aa  57  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755267  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0719  protein of unknown function DUF421  26.52 
 
 		 286 aa  56.6  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0919  hypothetical protein  26.8 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.043093 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1466  hypothetical protein  27.41 
 
 		 286 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05430  predicted membrane protein  31.9 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.054004  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3028  membrane protein-like protein  26.52 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2115  hypothetical membrane associated protein  27.74 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5983  hypothetical protein  25.77 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0201045 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1882  hypothetical protein  25.74 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.929447 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1704  hypothetical protein  25.74 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1685  hypothetical protein  25.74 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.376353  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4533  hypothetical protein  23.02 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0230316  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1838  hypothetical protein  25.74 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.315149  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0854  hypothetical protein  26.8 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2154  hypothetical protein  26.39 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0961076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0566  hypothetical protein  21.85 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4309  hypothetical protein  23.02 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0126531  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4158  hypothetical protein  23.02 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0166527  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3332  hypothetical protein  23.18 
 
 		 175 aa  55.5  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4644  hypothetical protein  23.02 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.101491  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4261  hypothetical protein  24.6 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00116962  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4147  hypothetical protein  23.02 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000615268  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1658  protein of unknown function DUF421  24.26 
 
 		 286 aa  55.1  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6233  hypothetical protein  26.67 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303175  normal  0.107487 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4494  hypothetical protein  23.02 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000327358 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22070  predicted membrane protein  26.02 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0792  protein of unknown function DUF421  22.67 
 
 		 286 aa  54.7  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2562  hypothetical protein  26.67 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2090  hypothetical protein  25.32 
 
 		 245 aa  54.3  0.0000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0071  hypothetical protein  27.74 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00910  conserved inner membrane protein  27.4 
 
 		 230 aa  54.3  0.0000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2737  protein of unknown function DUF421  27.4 
 
 		 230 aa  54.3  0.0000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0253622  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2690  hypothetical protein  27.4 
 
 		 230 aa  54.3  0.0000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.355377  normal  0.77182 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00917  hypothetical protein  27.4 
 
 		 230 aa  54.3  0.0000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2422  hypothetical protein  27.4 
 
 		 230 aa  54.3  0.0000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000473983  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1012  hypothetical protein  27.4 
 
 		 230 aa  54.3  0.0000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000212287  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1003  hypothetical protein  27.4 
 
 		 230 aa  54.3  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0243553  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>