165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_2201 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_2201  membrane protein-like protein  100 
 
 		 186 aa  379  1e-104  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11408  hypothetical protein  38.32 
 
 		 181 aa  115  3e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0751825  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1504  hypothetical protein  35.1 
 
 		 177 aa  96.7  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03310  hypothetical protein  40.48 
 
 		 170 aa  96.7  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2218  hypothetical protein  37.16 
 
 		 172 aa  95.9  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.450386  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06995  hypothetical protein  32.05 
 
 		 174 aa  95.9  3e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.294218  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2641  hypothetical protein  30.3 
 
 		 175 aa  92  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.865763  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2686  hypothetical protein  30.3 
 
 		 175 aa  92  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.565782  normal  0.0102559 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0914  hypothetical protein  35.66 
 
 		 172 aa  91.3  7e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2670  hypothetical protein  30.3 
 
 		 175 aa  91.3  8e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1589  hypothetical protein  31.17 
 
 		 185 aa  86.7  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3352  protein of unknown function DUF421  35.25 
 
 		 173 aa  84.7  7e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1106  membrane protein-like protein  29.93 
 
 		 227 aa  83.2  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00481139  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0112  hypothetical protein  28.67 
 
 		 166 aa  82  0.000000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2827  membrane protein-like protein  31.17 
 
 		 165 aa  81.6  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.138476 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0434  hypothetical protein  28.86 
 
 		 179 aa  80.5  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3820  hypothetical protein  30.37 
 
 		 171 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4212  protein of unknown function DUF421  30.19 
 
 		 188 aa  80.1  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.983168 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3992  hypothetical protein  29.66 
 
 		 226 aa  79  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1313  protein of unknown function DUF421  26.44 
 
 		 184 aa  77.8  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03100  predicted membrane protein  25.28 
 
 		 187 aa  76.3  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.954321  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0551  membrane protein-like protein  26.06 
 
 		 180 aa  76.6  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000937148 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2271  hypothetical protein  31.79 
 
 		 170 aa  75.1  0.0000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3305  protein of unknown function DUF421  27.92 
 
 		 258 aa  72.8  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00266927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12630  predicted membrane protein  26.57 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2247  protein of unknown function DUF421  27.33 
 
 		 168 aa  72.4  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3005  hypothetical protein  30.71 
 
 		 147 aa  71.6  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.166871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6410  membrane protein-like protein  27.95 
 
 		 170 aa  70.9  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3285  membrane protein-like protein  31.85 
 
 		 160 aa  70.5  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.22155  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6863  protein of unknown function DUF421  25 
 
 		 146 aa  67.4  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2513  hypothetical protein  22.92 
 
 		 235 aa  66.2  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1426  hypothetical protein  23.28 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.320436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2961  membrane protein-like  29.3 
 
 		 177 aa  65.5  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6439  conserved hypothetical membrane-anchored protein  26.24 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1485  protein of unknown function DUF421  30.26 
 
 		 234 aa  64.7  0.0000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05340  predicted membrane protein  25 
 
 		 242 aa  64.3  0.0000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00296282  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0769  hypothetical protein  26.43 
 
 		 147 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1122  protein of unknown function DUF421  27.54 
 
 		 242 aa  63.9  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0399  protein of unknown function DUF421  31.16 
 
 		 166 aa  63.5  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2138  hypothetical protein  22.08 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2581  membrane protein-like protein  25.17 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.604139  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3287  hypothetical protein  26.76 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.581053  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0792  protein of unknown function DUF421  24 
 
 		 286 aa  62.8  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0198  protein of unknown function DUF421  24.82 
 
 		 164 aa  62  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3224  protein of unknown function DUF421  21.09 
 
 		 173 aa  62  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826771  normal  0.0304981 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1555  hypothetical protein  23.36 
 
 		 232 aa  62  0.000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3836  hypothetical protein  36.36 
 
 		 121 aa  62  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.147989  normal  0.0810838 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0321  protein of unknown function DUF421  25.64 
 
 		 241 aa  61.6  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.78667 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2187  hypothetical protein  25.68 
 
 		 289 aa  61.6  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000023722  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1348  hypothetical protein  24.09 
 
 		 232 aa  61.2  0.000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1658  protein of unknown function DUF421  23.33 
 
 		 286 aa  61.2  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4346  protein of unknown function DUF421  27.81 
 
 		 174 aa  61.2  0.000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0250687  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0408  hypothetical protein  25.68 
 
 		 289 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5983  hypothetical protein  25.68 
 
 		 165 aa  60.5  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0201045 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4999  hypothetical protein  25 
 
 		 289 aa  60.1  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5379  hypothetical protein  25 
 
 		 289 aa  60.1  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5235  hypothetical protein  25 
 
 		 289 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1466  hypothetical protein  25.68 
 
 		 286 aa  60.1  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1968  protein of unknown function DUF421  28.1 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4828  hypothetical protein  25 
 
 		 289 aa  59.3  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4843  hypothetical protein  25 
 
 		 289 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5688  hypothetical protein  25 
 
 		 289 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0981  hypothetical protein  25.33 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00314697  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1040  hypothetical protein  25.33 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.169724  normal  0.241147 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1089  hypothetical protein  25.33 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0719  protein of unknown function DUF421  22.08 
 
 		 286 aa  58.5  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1009  hypothetical protein  25.33 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1074  hypothetical protein  25.33 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.325553 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02060  predicted membrane protein  23.53 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2090  hypothetical protein  27.27 
 
 		 245 aa  57.8  0.00000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2764  hypothetical protein  24.44 
 
 		 172 aa  57.4  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1130  hypothetical protein  21.99 
 
 		 272 aa  57.4  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2154  hypothetical protein  23.03 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0961076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2791  hypothetical protein  21.99 
 
 		 272 aa  57.4  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.169514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0702  hypothetical protein  23.24 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00491681  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00910  conserved inner membrane protein  23.57 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2737  protein of unknown function DUF421  23.57 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0253622  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00917  hypothetical protein  23.57 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4499  hypothetical protein  24.81 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00871532  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2636  protein of unknown function DUF421  25.71 
 
 		 161 aa  57  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.753675  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1012  protein of unknown function DUF421  25 
 
 		 243 aa  57  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1459  hypothetical protein  23.61 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.902977  normal  0.138264 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3510  hypothetical protein  25.55 
 
 		 146 aa  57  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4548  hypothetical protein  24.81 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00119776  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1067  hypothetical protein  23.57 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0942748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3028  membrane protein-like protein  23.57 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3692  hypothetical protein  24.32 
 
 		 289 aa  57  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1012  hypothetical protein  23.57 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000212287  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1003  hypothetical protein  23.57 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0243553  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1059  protein of unknown function DUF421  23.53 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2690  hypothetical protein  23.57 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.355377  normal  0.77182 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2215  hypothetical protein  23.57 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.297842 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2422  hypothetical protein  23.57 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000473983  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2237  hypothetical protein  23.81 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2726  hypothetical protein  23.57 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5311  hypothetical protein  24.32 
 
 		 289 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2671  protein of unknown function DUF421  24.34 
 
 		 242 aa  55.5  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113456  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0321  hypothetical protein  22.79 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.911962  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5269  hypothetical protein  24.32 
 
 		 289 aa  55.1  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4261  hypothetical protein  25.81 
 
 		 218 aa  54.7  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00116962  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>