87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_03100 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_03100  predicted membrane protein  100 
 
 
187 aa  357  4e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.954321  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2201  membrane protein-like protein  25.28 
 
 
186 aa  76.3  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1589  hypothetical protein  28.37 
 
 
185 aa  67  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1504  hypothetical protein  26.99 
 
 
177 aa  66.2  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0825  hypothetical protein  36.36 
 
 
205 aa  60.8  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.102228 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3224  protein of unknown function DUF421  23.27 
 
 
173 aa  60.8  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826771  normal  0.0304981 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1106  membrane protein-like protein  25.32 
 
 
227 aa  59.3  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00481139  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3177  hypothetical protein  27.27 
 
 
149 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755267  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2961  membrane protein-like  30.52 
 
 
177 aa  58.2  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2247  protein of unknown function DUF421  23.78 
 
 
168 aa  57  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4082  protein of unknown function DUF421  23.87 
 
 
171 aa  56.6  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1313  protein of unknown function DUF421  20.73 
 
 
184 aa  55.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4363  hypothetical protein  27.54 
 
 
167 aa  55.1  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0321  protein of unknown function DUF421  25 
 
 
241 aa  55.1  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.78667 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2513  hypothetical protein  28.87 
 
 
235 aa  54.7  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2641  hypothetical protein  26.86 
 
 
175 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.865763  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2686  hypothetical protein  26.86 
 
 
175 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.565782  normal  0.0102559 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2581  membrane protein-like protein  26.32 
 
 
172 aa  53.9  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.604139  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0702  hypothetical protein  25.9 
 
 
215 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00491681  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0711  protein of unknown function DUF421  23.97 
 
 
248 aa  52  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3352  protein of unknown function DUF421  26.87 
 
 
173 aa  52  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11070  conserved hypothetical membrane-anchored protein  24.64 
 
 
149 aa  51.6  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2187  hypothetical protein  23.29 
 
 
289 aa  51.2  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000023722  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2670  hypothetical protein  26.38 
 
 
175 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0112  hypothetical protein  24.36 
 
 
166 aa  49.7  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0551  membrane protein-like protein  21.08 
 
 
180 aa  50.4  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000937148 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5311  hypothetical protein  24.66 
 
 
289 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1650  hypothetical protein  24.09 
 
 
156 aa  48.9  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0747624  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2827  membrane protein-like protein  26.67 
 
 
165 aa  48.9  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.138476 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0198  protein of unknown function DUF421  20.28 
 
 
164 aa  48.9  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0408  hypothetical protein  23.29 
 
 
289 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4828  hypothetical protein  23.29 
 
 
289 aa  48.5  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3692  hypothetical protein  24.14 
 
 
289 aa  48.5  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4843  hypothetical protein  23.29 
 
 
289 aa  48.1  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02060  predicted membrane protein  21.34 
 
 
164 aa  48.1  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3992  hypothetical protein  26.9 
 
 
226 aa  48.1  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5688  hypothetical protein  23.29 
 
 
289 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5235  hypothetical protein  23.45 
 
 
289 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5379  hypothetical protein  23.45 
 
 
289 aa  48.1  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4999  hypothetical protein  23.45 
 
 
289 aa  48.1  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4533  hypothetical protein  25 
 
 
215 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0230316  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0204  hypothetical protein  23.97 
 
 
289 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2764  hypothetical protein  20.14 
 
 
172 aa  47.4  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4212  protein of unknown function DUF421  26.11 
 
 
188 aa  47  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.983168 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0231  hypothetical protein  24.14 
 
 
289 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.723048  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4943  hypothetical protein  24.14 
 
 
289 aa  47  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1334  hypothetical protein  27.59 
 
 
225 aa  46.6  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3175  hypothetical protein  21.53 
 
 
227 aa  46.2  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.979599  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4644  hypothetical protein  24.22 
 
 
215 aa  45.8  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.101491  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5983  hypothetical protein  22.76 
 
 
165 aa  45.8  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0201045 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5253  hypothetical protein  23.45 
 
 
289 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4309  hypothetical protein  24.22 
 
 
215 aa  45.8  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0126531  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03310  hypothetical protein  23.24 
 
 
170 aa  45.8  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4548  hypothetical protein  25 
 
 
215 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00119776  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0769  hypothetical protein  19.87 
 
 
147 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0321  hypothetical protein  22.76 
 
 
225 aa  46.2  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.911962  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4499  hypothetical protein  25 
 
 
215 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00871532  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3005  hypothetical protein  20 
 
 
147 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.166871  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4147  hypothetical protein  24.22 
 
 
215 aa  45.8  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000615268  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4158  hypothetical protein  24.22 
 
 
215 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0166527  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4494  hypothetical protein  24.22 
 
 
215 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000327358 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5269  hypothetical protein  23.29 
 
 
289 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4261  hypothetical protein  26.4 
 
 
218 aa  45.1  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00116962  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05340  predicted membrane protein  23.31 
 
 
242 aa  45.1  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00296282  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2671  protein of unknown function DUF421  32.79 
 
 
242 aa  45.1  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113456  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0947  protein of unknown function DUF421  21.69 
 
 
178 aa  45.1  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.528971  normal  0.296252 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1938  protein of unknown function DUF421  23.46 
 
 
236 aa  44.7  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12630  predicted membrane protein  23.78 
 
 
211 aa  44.7  0.0009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2154  hypothetical protein  25.5 
 
 
188 aa  44.7  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0961076  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3409  hypothetical protein  22.36 
 
 
172 aa  44.7  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00991237  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2084  protein of unknown function DUF421  24.66 
 
 
228 aa  43.9  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.138808  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1459  hypothetical protein  22.15 
 
 
151 aa  43.1  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.902977  normal  0.138264 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2343  protein of unknown function DUF421  27.08 
 
 
170 aa  43.5  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1122  protein of unknown function DUF421  28.09 
 
 
242 aa  43.5  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36940  hypothetical protein  24.24 
 
 
149 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.309583  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1712  hypothetical protein  24.09 
 
 
227 aa  43.9  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.144314  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1251  protein of unknown function DUF421  23.74 
 
 
175 aa  42.7  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6863  protein of unknown function DUF421  20.42 
 
 
146 aa  42.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3133  hypothetical protein  22.86 
 
 
149 aa  42.7  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.152895 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1108  hypothetical protein  23.74 
 
 
175 aa  42.7  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.628779  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0127  hypothetical protein  26.36 
 
 
241 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3820  hypothetical protein  22.97 
 
 
171 aa  42.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0436  hypothetical protein  25.35 
 
 
224 aa  42.4  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617619  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4754  hypothetical protein  20.14 
 
 
146 aa  42  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204724  normal  0.0118925 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3940  hypothetical protein  27.27 
 
 
159 aa  41.6  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.179392  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22070  predicted membrane protein  22.61 
 
 
228 aa  41.6  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0399  protein of unknown function DUF421  25.52 
 
 
166 aa  41.6  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>