204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2961 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_2961  membrane protein-like  100 
 
 
177 aa  353  5.999999999999999e-97  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1589  hypothetical protein  30.13 
 
 
185 aa  77.8  0.00000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2201  membrane protein-like protein  29.3 
 
 
186 aa  76.6  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5983  hypothetical protein  29.05 
 
 
165 aa  72  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0201045 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0321  protein of unknown function DUF421  28.08 
 
 
241 aa  72  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.78667 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1704  hypothetical protein  25.45 
 
 
228 aa  71.6  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1685  hypothetical protein  25.45 
 
 
228 aa  71.6  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.376353  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1882  hypothetical protein  25.45 
 
 
228 aa  71.6  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.929447 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1838  hypothetical protein  25.45 
 
 
228 aa  71.6  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.315149  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11408  hypothetical protein  26.24 
 
 
181 aa  71.2  0.000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0751825  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3305  protein of unknown function DUF421  27.97 
 
 
258 aa  69.7  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00266927  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06995  hypothetical protein  26.47 
 
 
174 aa  69.7  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.294218  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1313  protein of unknown function DUF421  28.87 
 
 
184 aa  69.3  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1698  hypothetical protein  25.15 
 
 
228 aa  68.6  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4363  hypothetical protein  30.94 
 
 
167 aa  68.6  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3499  hypothetical protein  24.24 
 
 
228 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.664218  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1926  hypothetical protein  24.71 
 
 
228 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.328835  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1106  membrane protein-like protein  31.25 
 
 
227 aa  67  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00481139  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0551  membrane protein-like protein  24.69 
 
 
180 aa  67.4  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000937148 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1712  hypothetical protein  25.5 
 
 
227 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.144314  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1122  protein of unknown function DUF421  24.66 
 
 
242 aa  66.2  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0702  hypothetical protein  28.66 
 
 
215 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00491681  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1961  hypothetical protein  24.71 
 
 
228 aa  64.7  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.139623  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1660  hypothetical protein  24.71 
 
 
228 aa  64.7  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0800376  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03100  predicted membrane protein  30.52 
 
 
187 aa  64.7  0.0000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.954321  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1348  hypothetical protein  25.9 
 
 
232 aa  64.7  0.0000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6439  conserved hypothetical membrane-anchored protein  28.67 
 
 
150 aa  64.3  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1844  hypothetical protein  24.71 
 
 
228 aa  64.3  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6863  protein of unknown function DUF421  26.06 
 
 
146 aa  64.3  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3332  hypothetical protein  26.81 
 
 
175 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0321  hypothetical protein  27.21 
 
 
225 aa  64.3  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.911962  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1555  hypothetical protein  25.9 
 
 
232 aa  63.5  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03310  hypothetical protein  29.37 
 
 
170 aa  63.2  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1504  hypothetical protein  29.86 
 
 
177 aa  62.8  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2146  hypothetical protein  26.28 
 
 
202 aa  62.8  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.573525  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05340  predicted membrane protein  31.65 
 
 
242 aa  62.4  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00296282  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1469  hypothetical protein  26.35 
 
 
226 aa  62.4  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4754  hypothetical protein  28.78 
 
 
146 aa  62.4  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204724  normal  0.0118925 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6410  membrane protein-like protein  31.41 
 
 
170 aa  62.8  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2215  hypothetical protein  27.7 
 
 
230 aa  62  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.297842 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1067  hypothetical protein  27.7 
 
 
230 aa  62  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0942748  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2671  protein of unknown function DUF421  22.15 
 
 
242 aa  62  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113456  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00910  conserved inner membrane protein  27.7 
 
 
230 aa  62  0.000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2737  protein of unknown function DUF421  27.7 
 
 
230 aa  62  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0253622  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1938  protein of unknown function DUF421  28.12 
 
 
236 aa  62  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2690  hypothetical protein  27.7 
 
 
230 aa  62  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.355377  normal  0.77182 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00917  hypothetical protein  27.7 
 
 
230 aa  62  0.000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3510  hypothetical protein  27.86 
 
 
146 aa  62  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2422  hypothetical protein  27.7 
 
 
230 aa  62  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000473983  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1012  hypothetical protein  27.7 
 
 
230 aa  62  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000212287  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1003  hypothetical protein  27.7 
 
 
230 aa  62  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0243553  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0127  hypothetical protein  23.6 
 
 
241 aa  61.6  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3177  hypothetical protein  27.97 
 
 
149 aa  61.2  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755267  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2154  hypothetical protein  28.21 
 
 
188 aa  60.8  0.000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0961076  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2513  hypothetical protein  23.78 
 
 
235 aa  60.8  0.000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3175  hypothetical protein  24.66 
 
 
227 aa  60.5  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.979599  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0711  protein of unknown function DUF421  27.4 
 
 
248 aa  60.5  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22070  predicted membrane protein  26.77 
 
 
228 aa  59.7  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2202  hypothetical protein  30.07 
 
 
167 aa  60.1  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.359342 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1012  protein of unknown function DUF421  31.11 
 
 
243 aa  60.1  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0434  hypothetical protein  22.02 
 
 
179 aa  60.1  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4533  hypothetical protein  28.85 
 
 
215 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0230316  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3273  protein of unknown function DUF421  24.83 
 
 
232 aa  60.1  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02060  predicted membrane protein  25.3 
 
 
164 aa  59.3  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4894  hypothetical protein  28.03 
 
 
163 aa  59.3  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.292864 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3817  hypothetical protein  28.03 
 
 
163 aa  59.3  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1650  hypothetical protein  25.87 
 
 
156 aa  58.9  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0747624  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2764  hypothetical protein  28.47 
 
 
172 aa  58.5  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2084  protein of unknown function DUF421  26.06 
 
 
228 aa  58.9  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.138808  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0566  hypothetical protein  25.19 
 
 
237 aa  58.9  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1426  hypothetical protein  26.85 
 
 
230 aa  58.5  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.320436  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0436  hypothetical protein  25.18 
 
 
224 aa  57.8  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617619  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0051  hypothetical protein  27.22 
 
 
160 aa  57.4  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1485  protein of unknown function DUF421  30.34 
 
 
234 aa  57.4  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3133  hypothetical protein  24.29 
 
 
149 aa  57.4  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.152895 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2115  hypothetical membrane associated protein  25.85 
 
 
199 aa  57  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2189  hypothetical protein  21.69 
 
 
241 aa  56.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000145811  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3409  hypothetical protein  27.14 
 
 
172 aa  56.6  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00991237  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2460  protein of unknown function DUF421  25.48 
 
 
273 aa  57  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3285  membrane protein-like protein  28.57 
 
 
160 aa  56.2  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.22155  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4499  hypothetical protein  29.11 
 
 
215 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00871532  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4158  hypothetical protein  27.56 
 
 
215 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0166527  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4346  protein of unknown function DUF421  29.29 
 
 
174 aa  55.8  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0250687  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2670  hypothetical protein  28.57 
 
 
175 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3005  hypothetical protein  26.95 
 
 
147 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.166871  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4548  hypothetical protein  28.48 
 
 
215 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00119776  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0053  hypothetical protein  27.39 
 
 
160 aa  55.5  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1825  protein of unknown function DUF421  27.56 
 
 
225 aa  55.5  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0674  hypothetical protein  26.43 
 
 
143 aa  55.1  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3224  protein of unknown function DUF421  27.78 
 
 
173 aa  55.1  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826771  normal  0.0304981 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4309  hypothetical protein  26.47 
 
 
215 aa  54.7  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0126531  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4999  hypothetical protein  24.49 
 
 
289 aa  54.7  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5235  hypothetical protein  24.49 
 
 
289 aa  54.7  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4828  hypothetical protein  24.49 
 
 
289 aa  55.1  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4644  hypothetical protein  26.47 
 
 
215 aa  54.7  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.101491  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5379  hypothetical protein  24.49 
 
 
289 aa  54.7  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0981  hypothetical protein  25.5 
 
 
230 aa  54.7  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00314697  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0769  hypothetical protein  24.82 
 
 
147 aa  54.7  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1374  protein of unknown function DUF421  23.03 
 
 
248 aa  54.7  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.381341  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1009  hypothetical protein  25.5 
 
 
230 aa  54.7  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>