125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1374 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1374  protein of unknown function DUF421  100 
 
 
248 aa  508  1e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.381341  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1059  protein of unknown function DUF421  32.83 
 
 
215 aa  128  8.000000000000001e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1758  hypothetical protein  32.16 
 
 
212 aa  121  8e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1296  protein of unknown function DUF421  32.5 
 
 
217 aa  119  6e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000143526  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0218  protein of unknown function DUF421  32.96 
 
 
220 aa  116  3e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0485499  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2411  hypothetical protein  31.16 
 
 
211 aa  113  4.0000000000000004e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1650  hypothetical protein  32.65 
 
 
211 aa  111  9e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000336324  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10230  predicted membrane protein  29.31 
 
 
221 aa  108  8.000000000000001e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.561065  normal  0.0782602 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0967  hypothetical protein  31.12 
 
 
212 aa  107  2e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1926  hypothetical protein  27.36 
 
 
228 aa  106  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.328835  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1704  hypothetical protein  26.42 
 
 
228 aa  105  8e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1685  hypothetical protein  26.42 
 
 
228 aa  105  8e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.376353  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1838  hypothetical protein  26.42 
 
 
228 aa  105  8e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.315149  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1882  hypothetical protein  26.42 
 
 
228 aa  105  8e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.929447 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1660  hypothetical protein  26.89 
 
 
228 aa  105  9e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0800376  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1698  hypothetical protein  26.89 
 
 
228 aa  104  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1844  hypothetical protein  26.89 
 
 
228 aa  104  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1961  hypothetical protein  26.42 
 
 
228 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.139623  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3499  hypothetical protein  25.94 
 
 
228 aa  103  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.664218  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1712  hypothetical protein  25.47 
 
 
227 aa  100  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.144314  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1825  protein of unknown function DUF421  24.64 
 
 
225 aa  90.5  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2460  protein of unknown function DUF421  24.64 
 
 
273 aa  84  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0223  conserved membrane protein YetF  23.7 
 
 
182 aa  82  0.000000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2671  protein of unknown function DUF421  24.69 
 
 
242 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113456  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0321  protein of unknown function DUF421  23.38 
 
 
241 aa  80.1  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.78667 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2090  hypothetical protein  24.44 
 
 
245 aa  79.3  0.00000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1122  protein of unknown function DUF421  24.11 
 
 
242 aa  75.9  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0719  hypothetical protein  25 
 
 
230 aa  75.1  0.0000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.772033  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1968  protein of unknown function DUF421  22.98 
 
 
245 aa  74.7  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1466  hypothetical protein  23.83 
 
 
286 aa  67  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3273  protein of unknown function DUF421  21.43 
 
 
232 aa  65.9  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0566  hypothetical protein  25 
 
 
237 aa  63.9  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1658  protein of unknown function DUF421  23.42 
 
 
286 aa  63.5  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1485  protein of unknown function DUF421  22.73 
 
 
234 aa  63.2  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05340  predicted membrane protein  20.82 
 
 
242 aa  63.5  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00296282  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0792  protein of unknown function DUF421  21.97 
 
 
286 aa  63.2  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1504  hypothetical protein  26.39 
 
 
177 aa  61.6  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1938  protein of unknown function DUF421  21.59 
 
 
236 aa  61.6  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0702  hypothetical protein  19.79 
 
 
215 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00491681  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05430  predicted membrane protein  25.29 
 
 
209 aa  60.5  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.054004  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4533  hypothetical protein  19.67 
 
 
215 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0230316  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2138  hypothetical protein  20.98 
 
 
229 aa  59.7  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4309  hypothetical protein  19.67 
 
 
215 aa  59.3  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0126531  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4158  hypothetical protein  19.67 
 
 
215 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0166527  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0127  hypothetical protein  26.32 
 
 
241 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4644  hypothetical protein  19.67 
 
 
215 aa  59.3  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.101491  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4548  hypothetical protein  20.22 
 
 
215 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00119776  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4499  hypothetical protein  20.22 
 
 
215 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00871532  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2513  hypothetical protein  21.92 
 
 
235 aa  58.5  0.00000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2189  hypothetical protein  23.97 
 
 
241 aa  58.5  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000145811  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4147  hypothetical protein  19.13 
 
 
215 aa  58.5  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000615268  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1799  protein of unknown function DUF421  22.39 
 
 
224 aa  58.5  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0271913  normal  0.21316 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2382  protein of unknown function DUF421  22.33 
 
 
281 aa  58.2  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173055  normal  0.818165 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6410  membrane protein-like protein  23.29 
 
 
170 aa  58.2  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4494  hypothetical protein  19.13 
 
 
215 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000327358 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4261  hypothetical protein  20.97 
 
 
218 aa  55.8  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00116962  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3177  hypothetical protein  28.46 
 
 
149 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755267  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0408  hypothetical protein  22.33 
 
 
289 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1012  protein of unknown function DUF421  19.47 
 
 
243 aa  55.1  0.0000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3692  hypothetical protein  22.17 
 
 
289 aa  54.7  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0436  hypothetical protein  19.7 
 
 
224 aa  53.9  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617619  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4828  hypothetical protein  21.4 
 
 
289 aa  53.5  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1334  hypothetical protein  23.53 
 
 
225 aa  53.5  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5311  hypothetical protein  22.33 
 
 
289 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1124  protein of unknown function DUF421  26.6 
 
 
223 aa  53.5  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4843  hypothetical protein  21.4 
 
 
289 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0769  hypothetical protein  29.13 
 
 
147 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3175  hypothetical protein  21.19 
 
 
227 aa  53.1  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.979599  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5688  hypothetical protein  21.4 
 
 
289 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4999  hypothetical protein  21.4 
 
 
289 aa  52.8  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5379  hypothetical protein  21.4 
 
 
289 aa  52.8  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5235  hypothetical protein  21.4 
 
 
289 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36940  hypothetical protein  28.57 
 
 
149 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.309583  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22070  predicted membrane protein  24.35 
 
 
228 aa  52.8  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11070  conserved hypothetical membrane-anchored protein  27.27 
 
 
149 aa  52.4  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6863  protein of unknown function DUF421  28.06 
 
 
146 aa  52  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0321  hypothetical protein  18 
 
 
225 aa  52  0.000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.911962  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0711  protein of unknown function DUF421  22.69 
 
 
248 aa  50.8  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0231  hypothetical protein  21.86 
 
 
289 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.723048  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3305  protein of unknown function DUF421  20.62 
 
 
258 aa  50.4  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00266927  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5253  hypothetical protein  21.86 
 
 
289 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3232  protein of unknown function DUF421  21.62 
 
 
230 aa  50.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.151812  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0204  hypothetical protein  21.4 
 
 
289 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2188  hypothetical protein  28.35 
 
 
206 aa  49.7  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000216241  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5269  hypothetical protein  21.86 
 
 
289 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4943  hypothetical protein  21.86 
 
 
289 aa  48.9  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2187  hypothetical protein  21.46 
 
 
289 aa  48.9  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000023722  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2764  hypothetical protein  26.14 
 
 
172 aa  47.8  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1589  hypothetical protein  21.74 
 
 
185 aa  48.5  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3005  hypothetical protein  24.63 
 
 
147 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.166871  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2639  YdfS  22.1 
 
 
236 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0220  hypothetical protein  24.15 
 
 
253 aa  47  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2194  protein of unknown function DUF421  19.87 
 
 
232 aa  47  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1733  hypothetical protein  23.2 
 
 
221 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0352264  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1348  hypothetical protein  19.9 
 
 
232 aa  46.6  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2617  hypothetical protein  23.2 
 
 
230 aa  46.6  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1487  hypothetical protein  23.2 
 
 
221 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3817  hypothetical protein  26.53 
 
 
163 aa  46.2  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4894  hypothetical protein  26.53 
 
 
163 aa  46.2  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.292864 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1497  hypothetical protein  23.2 
 
 
221 aa  45.8  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000932542  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>