160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0218 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_0218  protein of unknown function DUF421  100 
 
 
220 aa  439  9.999999999999999e-123  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0485499  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1059  protein of unknown function DUF421  53.62 
 
 
215 aa  241  7e-63  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1758  hypothetical protein  50 
 
 
212 aa  218  5e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2411  hypothetical protein  49.28 
 
 
211 aa  203  2e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1296  protein of unknown function DUF421  47.37 
 
 
217 aa  201  6e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000143526  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1650  hypothetical protein  43.69 
 
 
211 aa  181  8.000000000000001e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000336324  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0967  hypothetical protein  45.81 
 
 
212 aa  180  1e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10230  predicted membrane protein  37.14 
 
 
221 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.561065  normal  0.0782602 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1374  protein of unknown function DUF421  32.49 
 
 
248 aa  125  7e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.381341  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2460  protein of unknown function DUF421  26.54 
 
 
273 aa  94.7  9e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4158  hypothetical protein  31.15 
 
 
215 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0166527  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4309  hypothetical protein  31.15 
 
 
215 aa  93.6  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0126531  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4644  hypothetical protein  31.15 
 
 
215 aa  93.6  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.101491  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0223  conserved membrane protein YetF  31.84 
 
 
182 aa  94  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4548  hypothetical protein  30.6 
 
 
215 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00119776  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4147  hypothetical protein  30.6 
 
 
215 aa  92.8  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000615268  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4494  hypothetical protein  30.6 
 
 
215 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000327358 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0702  hypothetical protein  30.98 
 
 
215 aa  91.7  9e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00491681  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4499  hypothetical protein  30.05 
 
 
215 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00871532  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1825  protein of unknown function DUF421  27.01 
 
 
225 aa  90.5  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4533  hypothetical protein  30.98 
 
 
215 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0230316  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3499  hypothetical protein  25.59 
 
 
228 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.664218  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1660  hypothetical protein  26.07 
 
 
228 aa  85.9  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0800376  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0792  protein of unknown function DUF421  30.35 
 
 
286 aa  85.9  5e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0321  protein of unknown function DUF421  28.37 
 
 
241 aa  85.5  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.78667 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1926  hypothetical protein  25.59 
 
 
228 aa  85.5  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.328835  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1704  hypothetical protein  24.88 
 
 
228 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1685  hypothetical protein  24.88 
 
 
228 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.376353  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1838  hypothetical protein  24.88 
 
 
228 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.315149  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1844  hypothetical protein  25.59 
 
 
228 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1882  hypothetical protein  24.88 
 
 
228 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.929447 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4261  hypothetical protein  28.49 
 
 
218 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00116962  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1961  hypothetical protein  25.59 
 
 
228 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.139623  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2671  protein of unknown function DUF421  27.96 
 
 
242 aa  82  0.000000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113456  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1698  hypothetical protein  24.4 
 
 
228 aa  81.6  0.000000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2090  hypothetical protein  26.39 
 
 
245 aa  80.5  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1658  protein of unknown function DUF421  28.17 
 
 
286 aa  79.3  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1712  hypothetical protein  23.96 
 
 
227 aa  78.2  0.00000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.144314  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22070  predicted membrane protein  30.32 
 
 
228 aa  77.8  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1122  protein of unknown function DUF421  28.1 
 
 
242 aa  77  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12630  predicted membrane protein  28.42 
 
 
211 aa  74.3  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0719  hypothetical protein  24.88 
 
 
230 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.772033  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3910  hypothetical protein  29.9 
 
 
234 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0966557  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0408  hypothetical protein  31.12 
 
 
289 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4230  hypothetical protein  29.52 
 
 
234 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000285959  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0220  hypothetical protein  25 
 
 
253 aa  68.6  0.00000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1466  hypothetical protein  25.37 
 
 
286 aa  68.9  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2189  hypothetical protein  27.22 
 
 
241 aa  68.6  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000145811  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3999  hypothetical protein  32.18 
 
 
234 aa  68.2  0.00000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4288  hypothetical protein  29.9 
 
 
234 aa  68.2  0.00000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000645093  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1968  protein of unknown function DUF421  23.94 
 
 
245 aa  67.8  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05430  predicted membrane protein  30.72 
 
 
209 aa  67.4  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.054004  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4268  hypothetical protein  30.27 
 
 
234 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.929825  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2382  protein of unknown function DUF421  28.38 
 
 
281 aa  66.2  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173055  normal  0.818165 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1938  protein of unknown function DUF421  24.07 
 
 
236 aa  65.9  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1124  protein of unknown function DUF421  28.42 
 
 
223 aa  65.9  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3305  protein of unknown function DUF421  26.09 
 
 
258 aa  65.9  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00266927  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3028  membrane protein-like protein  26.14 
 
 
230 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2187  hypothetical protein  33.53 
 
 
289 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000023722  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2726  hypothetical protein  26.14 
 
 
230 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1348  hypothetical protein  26.76 
 
 
232 aa  65.1  0.0000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2188  hypothetical protein  35.35 
 
 
206 aa  64.3  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000216241  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0966  hypothetical protein  29.9 
 
 
234 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000924114  normal  0.424893 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1555  hypothetical protein  25.34 
 
 
232 aa  64.7  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2138  hypothetical protein  23.58 
 
 
229 aa  64.7  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3692  hypothetical protein  32.34 
 
 
289 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5688  hypothetical protein  28.57 
 
 
289 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3175  hypothetical protein  28.39 
 
 
227 aa  63.9  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.979599  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1485  protein of unknown function DUF421  30.94 
 
 
234 aa  63.5  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4843  hypothetical protein  28.57 
 
 
289 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0127  hypothetical protein  24.85 
 
 
241 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2513  hypothetical protein  23.47 
 
 
235 aa  62.4  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4828  hypothetical protein  28.06 
 
 
289 aa  62  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5311  hypothetical protein  28.57 
 
 
289 aa  61.6  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4999  hypothetical protein  28.06 
 
 
289 aa  60.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5379  hypothetical protein  28.06 
 
 
289 aa  60.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1106  membrane protein-like protein  31.47 
 
 
227 aa  61.2  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00481139  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5235  hypothetical protein  28.06 
 
 
289 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0719  protein of unknown function DUF421  23.36 
 
 
286 aa  60.1  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5253  hypothetical protein  28.57 
 
 
289 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1497  hypothetical protein  27.96 
 
 
221 aa  59.7  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000932542  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4943  hypothetical protein  28.06 
 
 
289 aa  60.1  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05340  predicted membrane protein  22.07 
 
 
242 aa  59.7  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00296282  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1525  hypothetical protein  28.74 
 
 
221 aa  59.3  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1643  hypothetical protein  28.74 
 
 
221 aa  59.3  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.820484  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1710  hypothetical protein  28.74 
 
 
221 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5269  hypothetical protein  31.52 
 
 
289 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0231  hypothetical protein  28.06 
 
 
289 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.723048  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2617  hypothetical protein  27.78 
 
 
230 aa  58.9  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0204  hypothetical protein  30.91 
 
 
289 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1487  hypothetical protein  28.74 
 
 
221 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3224  protein of unknown function DUF421  27.63 
 
 
173 aa  58.5  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826771  normal  0.0304981 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1733  hypothetical protein  28.74 
 
 
221 aa  58.2  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0352264  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5259  protein of unknown function DUF421  27.67 
 
 
229 aa  58.2  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0566  hypothetical protein  25.71 
 
 
237 aa  58.2  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3051  protein of unknown function DUF421  31.3 
 
 
155 aa  57  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2146  hypothetical protein  36.56 
 
 
202 aa  57  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.573525  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1786  hypothetical protein  28.16 
 
 
221 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1504  hypothetical protein  26.76 
 
 
177 aa  56.6  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3665  hypothetical protein  30 
 
 
221 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.397621  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>