164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1059 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1059  protein of unknown function DUF421  100 
 
 		 215 aa  430  1e-120  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1758  hypothetical protein  50 
 
 		 212 aa  226  3e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0218  protein of unknown function DUF421  53.62 
 
 		 220 aa  225  4e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0485499  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2411  hypothetical protein  48.34 
 
 		 211 aa  216  2.9999999999999998e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0967  hypothetical protein  49.29 
 
 		 212 aa  211  9e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1296  protein of unknown function DUF421  44.29 
 
 		 217 aa  205  4e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000143526  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1650  hypothetical protein  44.98 
 
 		 211 aa  194  8.000000000000001e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000336324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10230  predicted membrane protein  35.05 
 
 		 221 aa  153  2e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.561065  normal  0.0782602 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1374  protein of unknown function DUF421  32.83 
 
 		 248 aa  128  6e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.381341  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2671  protein of unknown function DUF421  28.12 
 
 		 242 aa  86.7  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113456  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0321  protein of unknown function DUF421  26.91 
 
 		 241 aa  85.1  7e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.78667 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2090  hypothetical protein  25.93 
 
 		 245 aa  84.3  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3499  hypothetical protein  23.74 
 
 		 228 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.664218  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1926  hypothetical protein  25.11 
 
 		 228 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.328835  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1704  hypothetical protein  22.37 
 
 		 228 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1685  hypothetical protein  22.37 
 
 		 228 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.376353  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1882  hypothetical protein  22.37 
 
 		 228 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.929447 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1838  hypothetical protein  22.37 
 
 		 228 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.315149  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1712  hypothetical protein  25.81 
 
 		 227 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.144314  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1698  hypothetical protein  23.74 
 
 		 228 aa  79  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1660  hypothetical protein  24.12 
 
 		 228 aa  79  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0800376  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1961  hypothetical protein  24.12 
 
 		 228 aa  78.6  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.139623  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4499  hypothetical protein  25.81 
 
 		 215 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00871532  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4158  hypothetical protein  25.81 
 
 		 215 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0166527  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1122  protein of unknown function DUF421  25.44 
 
 		 242 aa  77  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1844  hypothetical protein  23.74 
 
 		 228 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4309  hypothetical protein  25.81 
 
 		 215 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0126531  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0127  hypothetical protein  28.24 
 
 		 241 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4644  hypothetical protein  25.81 
 
 		 215 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.101491  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4548  hypothetical protein  25.81 
 
 		 215 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00119776  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0792  protein of unknown function DUF421  25.88 
 
 		 286 aa  75.1  0.0000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4147  hypothetical protein  25.27 
 
 		 215 aa  75.1  0.0000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000615268  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4494  hypothetical protein  25.27 
 
 		 215 aa  75.1  0.0000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000327358 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0702  hypothetical protein  24.75 
 
 		 215 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00491681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4533  hypothetical protein  25.27 
 
 		 215 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0230316  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2460  protein of unknown function DUF421  22.79 
 
 		 273 aa  73.2  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2189  hypothetical protein  26.51 
 
 		 241 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000145811  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1825  protein of unknown function DUF421  21.86 
 
 		 225 aa  71.2  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0566  hypothetical protein  25.23 
 
 		 237 aa  71.2  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0220  hypothetical protein  24.22 
 
 		 253 aa  70.1  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22070  predicted membrane protein  25.12 
 
 		 228 aa  70.1  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05340  predicted membrane protein  23.11 
 
 		 242 aa  70.5  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00296282  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1658  protein of unknown function DUF421  25.76 
 
 		 286 aa  69.3  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1466  hypothetical protein  24.39 
 
 		 286 aa  69.3  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3028  membrane protein-like protein  23.23 
 
 		 230 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2726  hypothetical protein  23.23 
 
 		 230 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3232  protein of unknown function DUF421  27.45 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.151812  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1968  protein of unknown function DUF421  24.77 
 
 		 245 aa  66.6  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1426  hypothetical protein  21.94 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.320436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1348  hypothetical protein  22.43 
 
 		 232 aa  66.2  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4261  hypothetical protein  23.28 
 
 		 218 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00116962  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1938  protein of unknown function DUF421  22.73 
 
 		 236 aa  65.5  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1555  hypothetical protein  21.5 
 
 		 232 aa  65.1  0.0000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1485  protein of unknown function DUF421  27.1 
 
 		 234 aa  64.7  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2194  protein of unknown function DUF421  25.15 
 
 		 232 aa  63.2  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2138  hypothetical protein  23.42 
 
 		 229 aa  62.4  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05430  predicted membrane protein  29.49 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.054004  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0223  conserved membrane protein YetF  28.16 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3305  protein of unknown function DUF421  27.92 
 
 		 258 aa  62  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00266927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2154  hypothetical protein  26.62 
 
 		 188 aa  61.2  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0961076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2215  hypothetical protein  21.94 
 
 		 230 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.297842 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00910  conserved inner membrane protein  21.94 
 
 		 230 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2737  protein of unknown function DUF421  21.94 
 
 		 230 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0253622  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2513  hypothetical protein  24.15 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00917  hypothetical protein  21.94 
 
 		 230 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1012  hypothetical protein  21.94 
 
 		 230 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000212287  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1003  hypothetical protein  21.94 
 
 		 230 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0243553  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0436  hypothetical protein  22.49 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617619  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2690  hypothetical protein  21.94 
 
 		 230 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.355377  normal  0.77182 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1799  protein of unknown function DUF421  21.61 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0271913  normal  0.21316 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2422  hypothetical protein  21.94 
 
 		 230 aa  60.8  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000473983  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1067  hypothetical protein  21.94 
 
 		 230 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0942748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12630  predicted membrane protein  24.19 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2639  YdfS  22.03 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0719  hypothetical protein  23.53 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.772033  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0711  protein of unknown function DUF421  25.96 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1009  hypothetical protein  22.22 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1074  hypothetical protein  22.22 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.325553 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0981  hypothetical protein  22.22 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00314697  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1040  hypothetical protein  22.22 
 
 		 230 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.169724  normal  0.241147 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3992  hypothetical protein  24.06 
 
 		 226 aa  57  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1089  hypothetical protein  22.22 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2201  membrane protein-like protein  23.53 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2617  hypothetical protein  21.57 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1589  hypothetical protein  27.82 
 
 		 185 aa  54.3  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3175  hypothetical protein  21.61 
 
 		 227 aa  54.7  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.979599  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2486  hypothetical protein  19.63 
 
 		 163 aa  53.9  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0719  protein of unknown function DUF421  21.05 
 
 		 286 aa  53.5  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1733  hypothetical protein  29.37 
 
 		 221 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0352264  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1525  hypothetical protein  29.37 
 
 		 221 aa  52.8  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1497  hypothetical protein  27.97 
 
 		 221 aa  52.8  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000932542  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1487  hypothetical protein  29.37 
 
 		 221 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1786  hypothetical protein  29.37 
 
 		 221 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1643  hypothetical protein  29.37 
 
 		 221 aa  52.8  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.820484  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1710  hypothetical protein  29.37 
 
 		 221 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1106  membrane protein-like protein  26.9 
 
 		 227 aa  52.4  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00481139  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4082  protein of unknown function DUF421  28 
 
 		 171 aa  52.4  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1504  hypothetical protein  23.49 
 
 		 177 aa  52  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0321  hypothetical protein  21.84 
 
 		 225 aa  51.6  0.000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.911962  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1334  hypothetical protein  27.44 
 
 		 225 aa  51.6  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>