230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A3332 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A3332  hypothetical protein  100 
 
 		 175 aa  358  2e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4363  hypothetical protein  53.66 
 
 		 167 aa  180  7e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5983  hypothetical protein  49.03 
 
 		 165 aa  165  2.9999999999999998e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0201045 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3051  protein of unknown function DUF421  53.55 
 
 		 155 aa  159  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3563  hypothetical protein  45.7 
 
 		 158 aa  150  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.9488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3940  hypothetical protein  45.33 
 
 		 159 aa  135  3.0000000000000003e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.179392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0919  hypothetical protein  41.83 
 
 		 155 aa  128  5.0000000000000004e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.043093 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0854  hypothetical protein  41.18 
 
 		 155 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2764  hypothetical protein  39.16 
 
 		 172 aa  115  3e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2636  protein of unknown function DUF421  42.21 
 
 		 161 aa  115  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.753675  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4082  protein of unknown function DUF421  37.41 
 
 		 171 aa  114  6e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2581  membrane protein-like protein  37.41 
 
 		 172 aa  108  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.604139  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0321  hypothetical protein  35.33 
 
 		 225 aa  105  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.911962  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3224  protein of unknown function DUF421  35.86 
 
 		 173 aa  105  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826771  normal  0.0304981 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2247  protein of unknown function DUF421  37.68 
 
 		 168 aa  105  4e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3175  hypothetical protein  35.76 
 
 		 227 aa  103  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.979599  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0436  hypothetical protein  34.23 
 
 		 224 aa  103  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617619  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6863  protein of unknown function DUF421  38.85 
 
 		 146 aa  101  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3305  protein of unknown function DUF421  35.76 
 
 		 258 aa  101  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00266927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3383  hypothetical protein  37.25 
 
 		 158 aa  101  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0812  protein of unknown function DUF421  47.83 
 
 		 173 aa  101  6e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.954202 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2084  protein of unknown function DUF421  34.78 
 
 		 228 aa  99.8  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.138808  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6439  conserved hypothetical membrane-anchored protein  37.67 
 
 		 150 aa  97.8  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0825  hypothetical protein  37.97 
 
 		 205 aa  97.4  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.102228 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1026  hypothetical protein  44.44 
 
 		 172 aa  97.4  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.170093  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1589  hypothetical protein  34.03 
 
 		 185 aa  95.9  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1555  hypothetical protein  30.43 
 
 		 232 aa  96.3  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1869  membrane protein-like protein  42.86 
 
 		 199 aa  95.9  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.262643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02060  predicted membrane protein  38.46 
 
 		 164 aa  95.5  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2827  hypothetical protein  33.12 
 
 		 165 aa  95.1  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.209727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2513  hypothetical protein  33.56 
 
 		 235 aa  94.7  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4754  hypothetical protein  35.92 
 
 		 146 aa  95.1  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204724  normal  0.0118925 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2146  hypothetical protein  31.29 
 
 		 202 aa  93.6  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.573525  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3273  protein of unknown function DUF421  36.3 
 
 		 232 aa  94  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1469  hypothetical protein  31.65 
 
 		 226 aa  92.8  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0769  hypothetical protein  36.43 
 
 		 147 aa  92.4  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0719  protein of unknown function DUF421  29.49 
 
 		 286 aa  91.7  5e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0702  hypothetical protein  30.87 
 
 		 215 aa  91.3  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00491681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1348  hypothetical protein  28.99 
 
 		 232 aa  91.3  7e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2343  protein of unknown function DUF421  39.86 
 
 		 170 aa  91.3  7e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0198  protein of unknown function DUF421  30 
 
 		 164 aa  90.9  8e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3409  hypothetical protein  34.48 
 
 		 172 aa  90.9  9e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00991237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3133  hypothetical protein  34.27 
 
 		 149 aa  90.9  9e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.152895 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11070  conserved hypothetical membrane-anchored protein  33.57 
 
 		 149 aa  90.1  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3510  hypothetical protein  32.14 
 
 		 146 aa  90.5  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1650  hypothetical protein  37.09 
 
 		 156 aa  89.4  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0747624  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1106  membrane protein-like protein  31.08 
 
 		 227 aa  88.6  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00481139  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1459  hypothetical protein  37.86 
 
 		 151 aa  88.2  5e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.902977  normal  0.138264 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2090  hypothetical protein  33.76 
 
 		 245 aa  88.2  6e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2566  hypothetical protein  34.03 
 
 		 165 aa  85.9  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.31826  hitchhiker  0.0000735154 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2415  hypothetical protein  32.9 
 
 		 166 aa  86.7  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.696624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0947  protein of unknown function DUF421  33.12 
 
 		 178 aa  85.1  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.528971  normal  0.296252 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1012  protein of unknown function DUF421  33.6 
 
 		 243 aa  84.7  6e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05340  predicted membrane protein  28.1 
 
 		 242 aa  84.7  6e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00296282  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2154  hypothetical protein  34.97 
 
 		 188 aa  84.7  7e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0961076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1485  protein of unknown function DUF421  34.75 
 
 		 234 aa  84.3  8e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3005  hypothetical protein  32.86 
 
 		 147 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.166871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0220  hypothetical protein  34.84 
 
 		 253 aa  82  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2138  hypothetical protein  29.41 
 
 		 229 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1251  protein of unknown function DUF421  32.21 
 
 		 175 aa  82  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1799  protein of unknown function DUF421  34.06 
 
 		 224 aa  82  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0271913  normal  0.21316 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2641  hypothetical protein  32.88 
 
 		 175 aa  82  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.865763  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2686  hypothetical protein  32.88 
 
 		 175 aa  82  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.565782  normal  0.0102559 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2670  hypothetical protein  32.88 
 
 		 175 aa  82  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3177  hypothetical protein  32.86 
 
 		 149 aa  82  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755267  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1108  hypothetical protein  32.21 
 
 		 175 aa  81.3  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.628779  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4499  hypothetical protein  29.87 
 
 		 215 aa  81.6  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00871532  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4548  hypothetical protein  30.2 
 
 		 215 aa  81.3  0.000000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00119776  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4261  hypothetical protein  32.17 
 
 		 218 aa  80.9  0.000000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00116962  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4309  hypothetical protein  29.22 
 
 		 215 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0126531  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4644  hypothetical protein  29.22 
 
 		 215 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.101491  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4158  hypothetical protein  29.22 
 
 		 215 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0166527  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3352  protein of unknown function DUF421  27.95 
 
 		 173 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2187  hypothetical protein  27.22 
 
 		 289 aa  79  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000023722  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4147  hypothetical protein  28.57 
 
 		 215 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000615268  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4494  hypothetical protein  28.57 
 
 		 215 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000327358 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0523  protein of unknown function DUF421  34.75 
 
 		 175 aa  79  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4533  hypothetical protein  28.86 
 
 		 215 aa  78.6  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0230316  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3992  hypothetical protein  29.08 
 
 		 226 aa  78.2  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5311  hypothetical protein  28.1 
 
 		 289 aa  77.8  0.00000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2617  hypothetical protein  24.55 
 
 		 230 aa  77.8  0.00000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0321  protein of unknown function DUF421  28.38 
 
 		 241 aa  77.8  0.00000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.78667 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21740  predicted membrane protein  27.78 
 
 		 167 aa  77.8  0.00000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.963565  normal  0.777873 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4943  hypothetical protein  28.57 
 
 		 289 aa  77.4  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1504  hypothetical protein  31.25 
 
 		 177 aa  77  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3692  hypothetical protein  27.56 
 
 		 289 aa  77  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4212  protein of unknown function DUF421  28.77 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.983168 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0231  hypothetical protein  27.98 
 
 		 289 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.723048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2194  protein of unknown function DUF421  29.86 
 
 		 232 aa  76.3  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5253  hypothetical protein  28.21 
 
 		 289 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5688  hypothetical protein  26.8 
 
 		 289 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0112  hypothetical protein  29.41 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4843  hypothetical protein  26.8 
 
 		 289 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0707  hypothetical protein  33.57 
 
 		 150 aa  75.5  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0159977  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4828  hypothetical protein  26.8 
 
 		 289 aa  75.1  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0408  hypothetical protein  24.85 
 
 		 289 aa  74.7  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0204  hypothetical protein  27.45 
 
 		 289 aa  75.1  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2827  membrane protein-like protein  28.06 
 
 		 165 aa  74.7  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.138476 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0711  protein of unknown function DUF421  28.19 
 
 		 248 aa  74.3  0.0000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4999  hypothetical protein  26.8 
 
 		 289 aa  73.9  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>