214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1459 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1459  hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  297  3e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.902977  normal  0.138264 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3177  hypothetical protein  57.53 
 
 
149 aa  177  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755267  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0769  hypothetical protein  56.55 
 
 
147 aa  176  9e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11070  conserved hypothetical membrane-anchored protein  58.62 
 
 
149 aa  176  9e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3287  hypothetical protein  58.11 
 
 
149 aa  174  4e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.581053  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3005  hypothetical protein  55.86 
 
 
147 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.166871  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3133  hypothetical protein  56.55 
 
 
149 aa  171  3.9999999999999995e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.152895 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2636  protein of unknown function DUF421  57.53 
 
 
161 aa  168  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.753675  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02060  predicted membrane protein  54.67 
 
 
164 aa  163  5.9999999999999996e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0707  hypothetical protein  57.43 
 
 
150 aa  163  6.9999999999999995e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0159977  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2764  hypothetical protein  50.34 
 
 
172 aa  155  1e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36940  hypothetical protein  60 
 
 
149 aa  155  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.309583  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1650  hypothetical protein  52.35 
 
 
156 aa  152  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0747624  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3510  hypothetical protein  50 
 
 
146 aa  150  4e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4754  hypothetical protein  51.37 
 
 
146 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204724  normal  0.0118925 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6439  conserved hypothetical membrane-anchored protein  48 
 
 
150 aa  142  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6863  protein of unknown function DUF421  48.98 
 
 
146 aa  140  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2827  hypothetical protein  40.41 
 
 
165 aa  104  4e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.209727  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0198  protein of unknown function DUF421  35.42 
 
 
164 aa  97.1  8e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2581  membrane protein-like protein  36.11 
 
 
172 aa  90.5  6e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.604139  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2513  hypothetical protein  33.79 
 
 
235 aa  90.5  8e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0321  protein of unknown function DUF421  30.56 
 
 
241 aa  90.5  8e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.78667 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3224  protein of unknown function DUF421  34.46 
 
 
173 aa  89.4  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826771  normal  0.0304981 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3332  hypothetical protein  37.86 
 
 
175 aa  88.2  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5983  hypothetical protein  39.01 
 
 
165 aa  87  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0201045 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3563  hypothetical protein  36.3 
 
 
158 aa  87.4  7e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.9488  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4082  protein of unknown function DUF421  34.04 
 
 
171 aa  87  8e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0854  hypothetical protein  34.48 
 
 
155 aa  86.7  9e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0919  hypothetical protein  34.93 
 
 
155 aa  86.7  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.043093 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1469  hypothetical protein  29.66 
 
 
226 aa  85.9  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3305  protein of unknown function DUF421  32.43 
 
 
258 aa  85.5  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00266927  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0825  hypothetical protein  37.32 
 
 
205 aa  84.3  5e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.102228 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3383  hypothetical protein  36.05 
 
 
158 aa  84  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0112  hypothetical protein  35.71 
 
 
166 aa  83.6  9e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2247  protein of unknown function DUF421  32.14 
 
 
168 aa  83.6  9e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1348  hypothetical protein  31.97 
 
 
232 aa  80.5  0.000000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3820  hypothetical protein  33.1 
 
 
171 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3940  hypothetical protein  34.72 
 
 
159 aa  80.1  0.000000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.179392  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1485  protein of unknown function DUF421  35.86 
 
 
234 aa  79.7  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05340  predicted membrane protein  27.4 
 
 
242 aa  79  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00296282  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1504  hypothetical protein  32.62 
 
 
177 aa  79  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1869  membrane protein-like protein  39.06 
 
 
199 aa  77.8  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.262643  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1555  hypothetical protein  30.61 
 
 
232 aa  77.4  0.00000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4363  hypothetical protein  34 
 
 
167 aa  76.3  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1012  protein of unknown function DUF421  32.31 
 
 
243 aa  76.3  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0436  hypothetical protein  27.27 
 
 
224 aa  73.6  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617619  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0702  hypothetical protein  28.67 
 
 
215 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00491681  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0321  hypothetical protein  28.08 
 
 
225 aa  72.4  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.911962  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1026  hypothetical protein  39.73 
 
 
172 aa  71.6  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.170093  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1589  hypothetical protein  31.72 
 
 
185 aa  72  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2030  hypothetical protein  30.99 
 
 
164 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.334364  normal  0.673359 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3273  protein of unknown function DUF421  27.27 
 
 
232 aa  70.9  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3175  hypothetical protein  26.9 
 
 
227 aa  71.2  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.979599  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0711  protein of unknown function DUF421  29.73 
 
 
248 aa  70.9  0.000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3992  hypothetical protein  30.43 
 
 
226 aa  70.5  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2343  protein of unknown function DUF421  38.3 
 
 
170 aa  70.1  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4147  hypothetical protein  30.08 
 
 
215 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000615268  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0947  protein of unknown function DUF421  27.59 
 
 
178 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.528971  normal  0.296252 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4494  hypothetical protein  30.08 
 
 
215 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000327358 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2146  hypothetical protein  29.79 
 
 
202 aa  70.1  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.573525  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1106  membrane protein-like protein  26.39 
 
 
227 aa  69.3  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00481139  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12630  predicted membrane protein  27.78 
 
 
211 aa  69.3  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4346  protein of unknown function DUF421  32.65 
 
 
174 aa  68.6  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0250687  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4309  hypothetical protein  29.32 
 
 
215 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0126531  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4158  hypothetical protein  29.32 
 
 
215 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0166527  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4644  hypothetical protein  29.32 
 
 
215 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.101491  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2218  hypothetical protein  26.8 
 
 
172 aa  68.6  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.450386  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3409  hypothetical protein  25.69 
 
 
172 aa  67.4  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00991237  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0674  hypothetical protein  25.71 
 
 
143 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0551  membrane protein-like protein  23.81 
 
 
180 aa  67  0.00000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000937148 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2154  hypothetical protein  27.52 
 
 
188 aa  67  0.00000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0961076  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4499  hypothetical protein  28.57 
 
 
215 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00871532  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4548  hypothetical protein  28.57 
 
 
215 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00119776  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2670  hypothetical protein  28.57 
 
 
175 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0566  hypothetical protein  27.7 
 
 
237 aa  66.2  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3352  protein of unknown function DUF421  30.5 
 
 
173 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0812  protein of unknown function DUF421  34.04 
 
 
173 aa  65.9  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.954202 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2237  hypothetical protein  27.97 
 
 
163 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0434  hypothetical protein  21.62 
 
 
179 aa  65.1  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2641  hypothetical protein  28.57 
 
 
175 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.865763  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2686  hypothetical protein  28.57 
 
 
175 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.565782  normal  0.0102559 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2084  protein of unknown function DUF421  27.92 
 
 
228 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.138808  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1313  protein of unknown function DUF421  28.06 
 
 
184 aa  65.1  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2194  protein of unknown function DUF421  23.61 
 
 
232 aa  63.9  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0914  hypothetical protein  30.28 
 
 
172 aa  63.9  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4533  hypothetical protein  29.01 
 
 
215 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0230316  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0399  protein of unknown function DUF421  27.86 
 
 
166 aa  63.5  0.0000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3051  protein of unknown function DUF421  34.97 
 
 
155 aa  63.5  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2827  membrane protein-like protein  27.54 
 
 
165 aa  63.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.138476 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5498  hypothetical protein  28.08 
 
 
173 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11408  hypothetical protein  25.18 
 
 
181 aa  62.4  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0751825  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4224  hypothetical protein  28.87 
 
 
196 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.434687  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4261  hypothetical protein  29.13 
 
 
218 aa  62.4  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00116962  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0523  protein of unknown function DUF421  27.86 
 
 
175 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1799  protein of unknown function DUF421  24.44 
 
 
224 aa  62  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0271913  normal  0.21316 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3285  membrane protein-like protein  31.65 
 
 
160 aa  62  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.22155  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4212  protein of unknown function DUF421  27.74 
 
 
188 aa  61.6  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.983168 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2737  protein of unknown function DUF421  27.27 
 
 
230 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0253622  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00917  hypothetical protein  27.27 
 
 
230 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1012  hypothetical protein  27.27 
 
 
230 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000212287  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>