204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_11408 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_11408  hypothetical protein  100 
 
 
181 aa  358  3e-98  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0751825  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2218  hypothetical protein  44.22 
 
 
172 aa  130  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.450386  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06995  hypothetical protein  40 
 
 
174 aa  127  6e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.294218  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0914  hypothetical protein  41.98 
 
 
172 aa  125  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03310  hypothetical protein  43.06 
 
 
170 aa  124  6e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2201  membrane protein-like protein  38.32 
 
 
186 aa  115  3e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1589  hypothetical protein  37.23 
 
 
185 aa  97.8  7e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1504  hypothetical protein  30.52 
 
 
177 aa  94.4  7e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0112  hypothetical protein  33.97 
 
 
166 aa  93.6  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2827  membrane protein-like protein  32.43 
 
 
165 aa  94  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.138476 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3992  hypothetical protein  31.17 
 
 
226 aa  90.5  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2670  hypothetical protein  32.05 
 
 
175 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2641  hypothetical protein  32.05 
 
 
175 aa  89  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.865763  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2686  hypothetical protein  32.05 
 
 
175 aa  89  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.565782  normal  0.0102559 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3352  protein of unknown function DUF421  30.77 
 
 
173 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1485  protein of unknown function DUF421  29.03 
 
 
234 aa  85.9  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4212  protein of unknown function DUF421  27.98 
 
 
188 aa  85.1  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.983168 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12630  predicted membrane protein  26.92 
 
 
211 aa  80.1  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0434  hypothetical protein  24.72 
 
 
179 aa  79  0.00000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0321  protein of unknown function DUF421  29.76 
 
 
241 aa  78.2  0.00000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.78667 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3285  membrane protein-like protein  32 
 
 
160 aa  78.6  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.22155  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0551  membrane protein-like protein  23.64 
 
 
180 aa  78.2  0.00000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000937148 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05340  predicted membrane protein  28.3 
 
 
242 aa  76.6  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00296282  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1313  protein of unknown function DUF421  24.22 
 
 
184 aa  76.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0399  protein of unknown function DUF421  31.08 
 
 
166 aa  76.6  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1106  membrane protein-like protein  28.17 
 
 
227 aa  75.1  0.0000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00481139  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3820  hypothetical protein  27.7 
 
 
171 aa  74.3  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2513  hypothetical protein  27.94 
 
 
235 aa  73.9  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0220  hypothetical protein  28.08 
 
 
253 aa  72.4  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1012  protein of unknown function DUF421  31.2 
 
 
243 aa  72  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4346  protein of unknown function DUF421  28.9 
 
 
174 aa  71.6  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0250687  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2764  hypothetical protein  25.32 
 
 
172 aa  71.6  0.000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2154  hypothetical protein  29.87 
 
 
188 aa  70.9  0.000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0961076  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2271  hypothetical protein  25.15 
 
 
170 aa  70.5  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2187  hypothetical protein  29.34 
 
 
289 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000023722  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6410  membrane protein-like protein  26.8 
 
 
170 aa  68.2  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4843  hypothetical protein  30.26 
 
 
289 aa  68.2  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0408  hypothetical protein  30.12 
 
 
289 aa  68.2  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1466  hypothetical protein  28.87 
 
 
286 aa  67.8  0.00000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2090  hypothetical protein  28.86 
 
 
245 aa  67.8  0.00000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4828  hypothetical protein  29.61 
 
 
289 aa  67  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5688  hypothetical protein  30.41 
 
 
289 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3305  protein of unknown function DUF421  27.08 
 
 
258 aa  67.4  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00266927  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2194  protein of unknown function DUF421  25 
 
 
232 aa  67  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4999  hypothetical protein  29.73 
 
 
289 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2189  hypothetical protein  29.22 
 
 
241 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000145811  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5235  hypothetical protein  29.73 
 
 
289 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5379  hypothetical protein  29.73 
 
 
289 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1469  hypothetical protein  25.9 
 
 
226 aa  66.2  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2138  hypothetical protein  27.33 
 
 
229 aa  66.2  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0127  hypothetical protein  28.1 
 
 
241 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1415  hypothetical protein  20.57 
 
 
227 aa  65.9  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.228022 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4943  hypothetical protein  30.92 
 
 
289 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0702  hypothetical protein  27.27 
 
 
215 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00491681  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0436  hypothetical protein  24.39 
 
 
224 aa  65.1  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617619  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1938  protein of unknown function DUF421  27.44 
 
 
236 aa  64.7  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0719  protein of unknown function DUF421  27.1 
 
 
286 aa  64.7  0.0000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0711  protein of unknown function DUF421  29.37 
 
 
248 aa  64.3  0.0000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4082  protein of unknown function DUF421  28.47 
 
 
171 aa  63.5  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5269  hypothetical protein  28.31 
 
 
289 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3175  hypothetical protein  25.69 
 
 
227 aa  62.8  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.979599  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3287  hypothetical protein  27.08 
 
 
149 aa  63.2  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.581053  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5253  hypothetical protein  27.71 
 
 
289 aa  62.4  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1459  hypothetical protein  25.18 
 
 
151 aa  62.4  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.902977  normal  0.138264 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0321  hypothetical protein  26.06 
 
 
225 aa  62.8  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.911962  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0204  hypothetical protein  27.71 
 
 
289 aa  62.4  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5498  hypothetical protein  25.16 
 
 
173 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0231  hypothetical protein  27.71 
 
 
289 aa  62  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.723048  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0769  hypothetical protein  22.45 
 
 
147 aa  62  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3692  hypothetical protein  28.29 
 
 
289 aa  62  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5311  hypothetical protein  27.71 
 
 
289 aa  61.6  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0792  protein of unknown function DUF421  26.92 
 
 
286 aa  61.2  0.000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1799  protein of unknown function DUF421  24.84 
 
 
224 aa  61.2  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0271913  normal  0.21316 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3332  hypothetical protein  22.14 
 
 
175 aa  60.8  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1968  protein of unknown function DUF421  28 
 
 
245 aa  61.2  0.000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2084  protein of unknown function DUF421  24.69 
 
 
228 aa  60.8  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.138808  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02060  predicted membrane protein  22.56 
 
 
164 aa  60.8  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1130  hypothetical protein  24.49 
 
 
272 aa  60.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1658  protein of unknown function DUF421  25.66 
 
 
286 aa  60.5  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1555  hypothetical protein  22.15 
 
 
232 aa  60.5  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2791  hypothetical protein  24.49 
 
 
272 aa  60.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.169514  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2382  protein of unknown function DUF421  28.24 
 
 
281 aa  60.8  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173055  normal  0.818165 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3005  hypothetical protein  23.88 
 
 
147 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.166871  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4499  hypothetical protein  27.34 
 
 
215 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00871532  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4548  hypothetical protein  27.34 
 
 
215 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00119776  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1348  hypothetical protein  22.82 
 
 
232 aa  58.9  0.00000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3836  hypothetical protein  30.59 
 
 
121 aa  58.5  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.147989  normal  0.0810838 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2961  membrane protein-like  26.24 
 
 
177 aa  58.5  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1122  protein of unknown function DUF421  26.32 
 
 
242 aa  58.5  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0566  hypothetical protein  27.82 
 
 
237 aa  58.2  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3028  membrane protein-like protein  21.39 
 
 
230 aa  57.8  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3224  protein of unknown function DUF421  24.34 
 
 
173 aa  57.8  0.00000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826771  normal  0.0304981 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3115  protein of unknown function DUF421  24.34 
 
 
229 aa  57  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2726  hypothetical protein  20.81 
 
 
230 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2639  YdfS  28.9 
 
 
236 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0707  hypothetical protein  20.13 
 
 
150 aa  56.6  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0159977  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4261  hypothetical protein  28 
 
 
218 aa  57  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00116962  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1869  membrane protein-like protein  25.55 
 
 
199 aa  56.2  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.262643  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0719  hypothetical protein  24.49 
 
 
230 aa  55.8  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.772033  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2247  protein of unknown function DUF421  21.33 
 
 
168 aa  55.8  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>