197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3992 on replicon NC_007488
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007488  RSP_3992  hypothetical protein  100 
 
 
226 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2827  membrane protein-like protein  71.34 
 
 
165 aa  239  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.138476 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3285  membrane protein-like protein  70.25 
 
 
160 aa  203  2e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.22155  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3352  protein of unknown function DUF421  63.06 
 
 
173 aa  194  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4212  protein of unknown function DUF421  57.89 
 
 
188 aa  185  6e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.983168 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3820  hypothetical protein  59.74 
 
 
171 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1504  hypothetical protein  52.44 
 
 
177 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2641  hypothetical protein  52.6 
 
 
175 aa  158  5e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.865763  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2686  hypothetical protein  52.6 
 
 
175 aa  158  5e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.565782  normal  0.0102559 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2670  hypothetical protein  52.6 
 
 
175 aa  158  8e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1589  hypothetical protein  49.34 
 
 
185 aa  157  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3836  hypothetical protein  70.37 
 
 
121 aa  150  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.147989  normal  0.0810838 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1313  protein of unknown function DUF421  48.63 
 
 
184 aa  146  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0112  hypothetical protein  49.29 
 
 
166 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4346  protein of unknown function DUF421  50.66 
 
 
174 aa  131  6.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0250687  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0399  protein of unknown function DUF421  48.37 
 
 
166 aa  124  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6410  membrane protein-like protein  41.67 
 
 
170 aa  120  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0434  hypothetical protein  37.66 
 
 
179 aa  118  7e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0551  membrane protein-like protein  37.18 
 
 
180 aa  117  9.999999999999999e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000937148 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2271  hypothetical protein  36.54 
 
 
170 aa  107  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11408  hypothetical protein  31.17 
 
 
181 aa  90.5  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0751825  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3563  hypothetical protein  37.24 
 
 
158 aa  83.6  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.9488  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0914  hypothetical protein  33.8 
 
 
172 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2415  hypothetical protein  32.68 
 
 
166 aa  82.4  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.696624  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2566  hypothetical protein  32.47 
 
 
165 aa  80.9  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.31826  hitchhiker  0.0000735154 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2218  hypothetical protein  32.82 
 
 
172 aa  80.5  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.450386  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1415  hypothetical protein  24.32 
 
 
227 aa  79.7  0.00000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.228022 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2194  protein of unknown function DUF421  28.48 
 
 
232 aa  80.1  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1251  protein of unknown function DUF421  32.89 
 
 
175 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2201  membrane protein-like protein  29.66 
 
 
186 aa  78.6  0.00000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1012  protein of unknown function DUF421  29.46 
 
 
243 aa  78.6  0.00000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1108  hypothetical protein  32.21 
 
 
175 aa  78.2  0.00000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.628779  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3332  hypothetical protein  29.08 
 
 
175 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1106  membrane protein-like protein  27.01 
 
 
227 aa  77.8  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00481139  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0436  hypothetical protein  25.36 
 
 
224 aa  77  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617619  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0919  hypothetical protein  32.86 
 
 
155 aa  76.6  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.043093 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1485  protein of unknown function DUF421  31.08 
 
 
234 aa  76.3  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3940  hypothetical protein  33.59 
 
 
159 aa  75.5  0.0000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.179392  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0523  protein of unknown function DUF421  31.25 
 
 
175 aa  75.1  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0854  hypothetical protein  31.91 
 
 
155 aa  75.1  0.0000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3232  protein of unknown function DUF421  25.34 
 
 
230 aa  73.9  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.151812  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03310  hypothetical protein  34.13 
 
 
170 aa  73.2  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2247  protein of unknown function DUF421  27.41 
 
 
168 aa  72.8  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0702  hypothetical protein  26.28 
 
 
215 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00491681  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6439  conserved hypothetical membrane-anchored protein  24.29 
 
 
150 aa  72  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1459  hypothetical protein  30.43 
 
 
151 aa  70.5  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.902977  normal  0.138264 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0719  protein of unknown function DUF421  25.52 
 
 
286 aa  70.5  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3305  protein of unknown function DUF421  27.34 
 
 
258 aa  70.1  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00266927  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0321  hypothetical protein  24.14 
 
 
225 aa  70.1  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.911962  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6863  protein of unknown function DUF421  25 
 
 
146 aa  70.1  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5983  hypothetical protein  29.5 
 
 
165 aa  69.7  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0201045 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2202  hypothetical protein  28.31 
 
 
167 aa  69.7  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.359342 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0321  protein of unknown function DUF421  21.38 
 
 
241 aa  68.9  0.00000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.78667 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4548  hypothetical protein  26.56 
 
 
215 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00119776  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2581  membrane protein-like protein  26.06 
 
 
172 aa  68.9  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.604139  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4499  hypothetical protein  26.56 
 
 
215 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00871532  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6233  hypothetical protein  34.69 
 
 
160 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303175  normal  0.107487 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2639  YdfS  27.08 
 
 
236 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0812  protein of unknown function DUF421  34.59 
 
 
173 aa  68.2  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.954202 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4261  hypothetical protein  28 
 
 
218 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00116962  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4309  hypothetical protein  25.58 
 
 
215 aa  67  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0126531  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05340  predicted membrane protein  24.81 
 
 
242 aa  67.4  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00296282  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4158  hypothetical protein  25.78 
 
 
215 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0166527  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4644  hypothetical protein  25.58 
 
 
215 aa  67  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.101491  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3510  hypothetical protein  29.29 
 
 
146 aa  67  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06995  hypothetical protein  29.45 
 
 
174 aa  66.6  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.294218  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4494  hypothetical protein  25.58 
 
 
215 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000327358 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4147  hypothetical protein  25.58 
 
 
215 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000615268  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2671  protein of unknown function DUF421  25.34 
 
 
242 aa  66.6  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113456  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3028  membrane protein-like protein  27.4 
 
 
230 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3177  hypothetical protein  26.87 
 
 
149 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755267  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3005  hypothetical protein  28.89 
 
 
147 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.166871  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4533  hypothetical protein  25.78 
 
 
215 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0230316  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3409  hypothetical protein  23.08 
 
 
172 aa  65.9  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00991237  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1469  hypothetical protein  23.61 
 
 
226 aa  65.9  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2726  hypothetical protein  26.71 
 
 
230 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1426  hypothetical protein  22.97 
 
 
230 aa  65.5  0.0000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.320436  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12630  predicted membrane protein  26.47 
 
 
211 aa  65.1  0.0000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11070  conserved hypothetical membrane-anchored protein  22.96 
 
 
149 aa  65.1  0.0000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2084  protein of unknown function DUF421  23.36 
 
 
228 aa  64.3  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.138808  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2617  hypothetical protein  20.95 
 
 
230 aa  64.7  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0947  protein of unknown function DUF421  28 
 
 
178 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.528971  normal  0.296252 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3224  protein of unknown function DUF421  25 
 
 
173 aa  63.9  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826771  normal  0.0304981 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3175  hypothetical protein  21.53 
 
 
227 aa  63.9  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.979599  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2513  hypothetical protein  27.14 
 
 
235 aa  63.9  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4754  hypothetical protein  29.86 
 
 
146 aa  63.5  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204724  normal  0.0118925 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4082  protein of unknown function DUF421  24.48 
 
 
171 aa  63.2  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1089  hypothetical protein  23.78 
 
 
230 aa  63.2  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0566  hypothetical protein  25.49 
 
 
237 aa  63.2  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1466  hypothetical protein  28.8 
 
 
286 aa  63.5  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00917  hypothetical protein  23.42 
 
 
230 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0198  protein of unknown function DUF421  24.11 
 
 
164 aa  62.8  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1074  hypothetical protein  23.78 
 
 
230 aa  62.8  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.325553 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1130  hypothetical protein  25.32 
 
 
272 aa  62.8  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1555  hypothetical protein  22.46 
 
 
232 aa  63.2  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2791  hypothetical protein  25.32 
 
 
272 aa  62.8  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.169514  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2215  hypothetical protein  23.42 
 
 
230 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.297842 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1009  hypothetical protein  23.78 
 
 
230 aa  62.8  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1012  hypothetical protein  23.42 
 
 
230 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000212287  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2422  hypothetical protein  23.42 
 
 
230 aa  62.8  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000473983  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>