192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2791 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2791  hypothetical protein  100 
 
 
272 aa  532  1e-150  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.169514  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1130  hypothetical protein  99.26 
 
 
272 aa  528  1e-149  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2154  hypothetical protein  49.06 
 
 
188 aa  143  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0961076  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3232  protein of unknown function DUF421  38.36 
 
 
230 aa  141  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.151812  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2726  hypothetical protein  37.17 
 
 
230 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1009  hypothetical protein  33.77 
 
 
230 aa  125  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1074  hypothetical protein  33.77 
 
 
230 aa  125  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.325553 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0981  hypothetical protein  33.19 
 
 
230 aa  125  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00314697  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1040  hypothetical protein  33.19 
 
 
230 aa  125  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.169724  normal  0.241147 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1426  hypothetical protein  32.75 
 
 
230 aa  125  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.320436  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3028  membrane protein-like protein  36.73 
 
 
230 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1089  hypothetical protein  33.19 
 
 
230 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2194  protein of unknown function DUF421  33.8 
 
 
232 aa  118  7.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1415  hypothetical protein  27.49 
 
 
227 aa  119  7.999999999999999e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.228022 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2617  hypothetical protein  29.3 
 
 
230 aa  116  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00910  conserved inner membrane protein  30.7 
 
 
230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2737  protein of unknown function DUF421  30.7 
 
 
230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0253622  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00917  hypothetical protein  30.7 
 
 
230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1012  hypothetical protein  30.7 
 
 
230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000212287  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1003  hypothetical protein  30.7 
 
 
230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0243553  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2690  hypothetical protein  30.7 
 
 
230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.355377  normal  0.77182 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2422  hypothetical protein  30.7 
 
 
230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000473983  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2215  hypothetical protein  30.7 
 
 
230 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.297842 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1067  hypothetical protein  30.26 
 
 
230 aa  112  6e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0942748  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3115  protein of unknown function DUF421  30.05 
 
 
229 aa  108  7.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5259  protein of unknown function DUF421  28.18 
 
 
229 aa  102  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0626  protein of unknown function DUF421  26.38 
 
 
239 aa  98.2  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0141494  normal  0.718153 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0625  protein of unknown function DUF421  30.05 
 
 
226 aa  93.2  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00740952  normal  0.965778 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0520  protein of unknown function DUF421  30.9 
 
 
233 aa  89.7  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5258  membrane protein-like protein  23.56 
 
 
228 aa  87  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3116  protein of unknown function DUF421  27.35 
 
 
229 aa  84.7  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0519  protein of unknown function DUF421  28.84 
 
 
228 aa  80.5  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5467  protein of unknown function DUF421  28.64 
 
 
225 aa  80.1  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.244646 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2146  hypothetical protein  28.67 
 
 
202 aa  77  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.573525  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0711  protein of unknown function DUF421  26.85 
 
 
248 aa  76.6  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2415  hypothetical protein  31.37 
 
 
166 aa  75.5  0.0000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.696624  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2764  hypothetical protein  28.57 
 
 
172 aa  74.7  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2566  hypothetical protein  30.67 
 
 
165 aa  73.9  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.31826  hitchhiker  0.0000735154 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2486  hypothetical protein  26.92 
 
 
163 aa  73.6  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3332  hypothetical protein  28.85 
 
 
175 aa  72  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0719  protein of unknown function DUF421  25.58 
 
 
286 aa  70.9  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2187  hypothetical protein  27.62 
 
 
289 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000023722  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2827  hypothetical protein  30.61 
 
 
165 aa  68.6  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.209727  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4082  protein of unknown function DUF421  27.15 
 
 
171 aa  68.6  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5983  hypothetical protein  30.5 
 
 
165 aa  67.8  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0201045 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0854  hypothetical protein  29.58 
 
 
155 aa  67.4  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2513  hypothetical protein  26.04 
 
 
235 aa  67  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3305  protein of unknown function DUF421  29.28 
 
 
258 aa  64.7  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00266927  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2460  protein of unknown function DUF421  26.85 
 
 
273 aa  65.1  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0919  hypothetical protein  28.17 
 
 
155 aa  65.1  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.043093 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4828  hypothetical protein  29.89 
 
 
289 aa  63.5  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5688  hypothetical protein  29.89 
 
 
289 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4843  hypothetical protein  29.89 
 
 
289 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1589  hypothetical protein  23.74 
 
 
185 aa  63.9  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0566  hypothetical protein  25 
 
 
237 aa  63.5  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2827  membrane protein-like protein  27.1 
 
 
165 aa  63.5  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.138476 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6410  membrane protein-like protein  27.97 
 
 
170 aa  63.2  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0408  hypothetical protein  28.66 
 
 
289 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0702  hypothetical protein  22.97 
 
 
215 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00491681  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11070  conserved hypothetical membrane-anchored protein  28.15 
 
 
149 aa  62.8  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4999  hypothetical protein  29.89 
 
 
289 aa  62.8  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3992  hypothetical protein  25.32 
 
 
226 aa  62.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5379  hypothetical protein  29.89 
 
 
289 aa  62.8  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5235  hypothetical protein  29.89 
 
 
289 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2218  hypothetical protein  29.55 
 
 
172 aa  62.4  0.000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.450386  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0769  hypothetical protein  26.43 
 
 
147 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1938  protein of unknown function DUF421  23.94 
 
 
236 aa  61.6  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2636  protein of unknown function DUF421  27.4 
 
 
161 aa  62  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.753675  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1698  hypothetical protein  23.33 
 
 
228 aa  61.6  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3005  hypothetical protein  31.62 
 
 
147 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.166871  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11408  hypothetical protein  24.49 
 
 
181 aa  60.8  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0751825  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0220  hypothetical protein  25.42 
 
 
253 aa  61.2  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0112  hypothetical protein  28.67 
 
 
166 aa  60.8  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1459  hypothetical protein  26.24 
 
 
151 aa  60.8  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.902977  normal  0.138264 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5269  hypothetical protein  25.41 
 
 
289 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0399  protein of unknown function DUF421  28.48 
 
 
166 aa  61.2  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5311  hypothetical protein  26.75 
 
 
289 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2090  hypothetical protein  26.17 
 
 
245 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0127  hypothetical protein  28.19 
 
 
241 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3692  hypothetical protein  24.72 
 
 
289 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0436  hypothetical protein  24.4 
 
 
224 aa  60.1  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617619  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3273  protein of unknown function DUF421  25.44 
 
 
232 aa  60.1  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0321  hypothetical protein  24.32 
 
 
225 aa  59.7  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.911962  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3563  hypothetical protein  27.59 
 
 
158 aa  59.7  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.9488  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4754  hypothetical protein  27.46 
 
 
146 aa  59.7  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204724  normal  0.0118925 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1825  protein of unknown function DUF421  25 
 
 
225 aa  59.7  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0947  protein of unknown function DUF421  27.33 
 
 
178 aa  59.7  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.528971  normal  0.296252 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1712  hypothetical protein  23.67 
 
 
227 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.144314  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4943  hypothetical protein  24.86 
 
 
289 aa  58.9  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0321  protein of unknown function DUF421  23.84 
 
 
241 aa  58.9  0.00000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.78667 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5253  hypothetical protein  24.86 
 
 
289 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0204  hypothetical protein  26.11 
 
 
289 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1251  protein of unknown function DUF421  26.92 
 
 
175 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1108  hypothetical protein  26.92 
 
 
175 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.628779  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2247  protein of unknown function DUF421  23.78 
 
 
168 aa  57.8  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0674  hypothetical protein  25.71 
 
 
143 aa  58.2  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4363  hypothetical protein  26.97 
 
 
167 aa  57.8  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2138  hypothetical protein  22.69 
 
 
229 aa  57.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0198  protein of unknown function DUF421  25.34 
 
 
164 aa  57.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0231  hypothetical protein  26.11 
 
 
289 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.723048  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>