149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2237 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2237  hypothetical protein  100 
 
 
163 aa  322  9e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2030  hypothetical protein  85.8 
 
 
164 aa  277  5e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.334364  normal  0.673359 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3817  hypothetical protein  60.74 
 
 
163 aa  208  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4894  hypothetical protein  60.74 
 
 
163 aa  208  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.292864 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5498  hypothetical protein  61.96 
 
 
173 aa  198  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1339  hypothetical protein  64.97 
 
 
167 aa  179  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3114  hypothetical protein  64.97 
 
 
167 aa  179  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2990  hypothetical protein  64.97 
 
 
167 aa  179  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.138787  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2562  hypothetical protein  41.72 
 
 
164 aa  138  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4224  hypothetical protein  34.62 
 
 
196 aa  114  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.434687  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6233  hypothetical protein  38.96 
 
 
160 aa  100  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303175  normal  0.107487 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2202  hypothetical protein  36.11 
 
 
167 aa  97.8  5e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.359342 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0071  hypothetical protein  30.61 
 
 
159 aa  93.6  1e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2115  hypothetical membrane associated protein  29.93 
 
 
199 aa  91.7  4e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2536  hypothetical protein  36.84 
 
 
182 aa  89.7  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5983  hypothetical protein  29.37 
 
 
165 aa  81.6  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0201045 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3005  hypothetical protein  30.07 
 
 
147 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.166871  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2636  protein of unknown function DUF421  30.07 
 
 
161 aa  74.7  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.753675  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6439  conserved hypothetical membrane-anchored protein  26.8 
 
 
150 aa  73.6  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0053  hypothetical protein  27.21 
 
 
160 aa  72  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0051  hypothetical protein  27.21 
 
 
160 aa  72  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2764  hypothetical protein  26.53 
 
 
172 aa  71.6  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0769  hypothetical protein  29.58 
 
 
147 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1106  membrane protein-like protein  30.61 
 
 
227 aa  68.9  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00481139  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3051  protein of unknown function DUF421  31.01 
 
 
155 aa  67.4  0.00000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3940  hypothetical protein  28.29 
 
 
159 aa  67  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.179392  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1313  protein of unknown function DUF421  25.15 
 
 
184 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1589  hypothetical protein  27.1 
 
 
185 aa  65.5  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1459  hypothetical protein  27.97 
 
 
151 aa  65.5  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.902977  normal  0.138264 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1504  hypothetical protein  27.5 
 
 
177 aa  65.5  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0198  protein of unknown function DUF421  28.67 
 
 
164 aa  65.1  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0112  hypothetical protein  31.39 
 
 
166 aa  64.7  0.0000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1555  hypothetical protein  24.31 
 
 
232 aa  64.7  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4363  hypothetical protein  26.03 
 
 
167 aa  64.7  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6863  protein of unknown function DUF421  24.16 
 
 
146 aa  64.3  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1348  hypothetical protein  25.69 
 
 
232 aa  64.3  0.0000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3510  hypothetical protein  26.39 
 
 
146 aa  63.9  0.0000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1485  protein of unknown function DUF421  28.97 
 
 
234 aa  63.5  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3332  hypothetical protein  30.14 
 
 
175 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2513  hypothetical protein  28.87 
 
 
235 aa  63.2  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4754  hypothetical protein  25.87 
 
 
146 aa  63.5  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204724  normal  0.0118925 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2827  hypothetical protein  28 
 
 
165 aa  63.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.209727  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2247  protein of unknown function DUF421  28.86 
 
 
168 aa  63.2  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3133  hypothetical protein  27.33 
 
 
149 aa  62  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.152895 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3287  hypothetical protein  25.52 
 
 
149 aa  62  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.581053  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1469  hypothetical protein  26.06 
 
 
226 aa  61.2  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0707  hypothetical protein  25.35 
 
 
150 aa  60.8  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0159977  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3273  protein of unknown function DUF421  26.85 
 
 
232 aa  59.7  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3820  hypothetical protein  24.84 
 
 
171 aa  59.7  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1926  hypothetical protein  24.83 
 
 
228 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.328835  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2271  hypothetical protein  28.06 
 
 
170 aa  58.9  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4082  protein of unknown function DUF421  25 
 
 
171 aa  58.9  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3177  hypothetical protein  25 
 
 
149 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755267  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11070  conserved hypothetical membrane-anchored protein  25 
 
 
149 aa  58.9  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3175  hypothetical protein  24.66 
 
 
227 aa  58.2  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.979599  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00910  conserved inner membrane protein  23.94 
 
 
230 aa  58.2  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2737  protein of unknown function DUF421  23.94 
 
 
230 aa  58.2  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0253622  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1844  hypothetical protein  24.83 
 
 
228 aa  58.2  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1067  hypothetical protein  23.94 
 
 
230 aa  58.2  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0942748  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00917  hypothetical protein  23.94 
 
 
230 aa  58.2  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3305  protein of unknown function DUF421  27.4 
 
 
258 aa  58.2  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00266927  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2617  hypothetical protein  23.31 
 
 
230 aa  58.2  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1012  hypothetical protein  23.94 
 
 
230 aa  58.2  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000212287  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1003  hypothetical protein  23.94 
 
 
230 aa  58.2  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0243553  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2690  hypothetical protein  23.94 
 
 
230 aa  58.2  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.355377  normal  0.77182 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2215  hypothetical protein  23.94 
 
 
230 aa  58.2  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.297842 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2422  hypothetical protein  23.94 
 
 
230 aa  58.2  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000473983  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1660  hypothetical protein  24.14 
 
 
228 aa  57.4  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0800376  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1961  hypothetical protein  24.14 
 
 
228 aa  57.4  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.139623  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2827  membrane protein-like protein  25.9 
 
 
165 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.138476 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2201  membrane protein-like protein  23.81 
 
 
186 aa  56.6  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1712  hypothetical protein  24.83 
 
 
227 aa  57  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.144314  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1009  hypothetical protein  23.94 
 
 
230 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1074  hypothetical protein  23.94 
 
 
230 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.325553 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1089  hypothetical protein  23.94 
 
 
230 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0981  hypothetical protein  23.94 
 
 
230 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00314697  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1040  hypothetical protein  23.94 
 
 
230 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.169724  normal  0.241147 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6410  membrane protein-like protein  24.83 
 
 
170 aa  55.5  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2670  hypothetical protein  28.57 
 
 
175 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1704  hypothetical protein  23.45 
 
 
228 aa  55.1  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1685  hypothetical protein  23.45 
 
 
228 aa  55.1  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.376353  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1838  hypothetical protein  23.45 
 
 
228 aa  55.1  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.315149  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2641  hypothetical protein  28.57 
 
 
175 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.865763  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2686  hypothetical protein  28.57 
 
 
175 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.565782  normal  0.0102559 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1882  hypothetical protein  23.45 
 
 
228 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.929447 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0711  protein of unknown function DUF421  24.66 
 
 
248 aa  55.1  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0321  hypothetical protein  24.48 
 
 
225 aa  54.7  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.911962  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0436  hypothetical protein  22.7 
 
 
224 aa  54.7  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617619  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3285  membrane protein-like protein  32.86 
 
 
160 aa  54.7  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.22155  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3499  hypothetical protein  24.32 
 
 
228 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.664218  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02060  predicted membrane protein  25.17 
 
 
164 aa  53.9  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12630  predicted membrane protein  24.03 
 
 
211 aa  53.5  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0321  protein of unknown function DUF421  25.49 
 
 
241 aa  53.5  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.78667 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3352  protein of unknown function DUF421  26.8 
 
 
173 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3563  hypothetical protein  27.21 
 
 
158 aa  51.6  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.9488  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05340  predicted membrane protein  26.67 
 
 
242 aa  50.8  0.000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00296282  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11408  hypothetical protein  23.13 
 
 
181 aa  50.4  0.000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0751825  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3383  hypothetical protein  26.67 
 
 
158 aa  50.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1426  hypothetical protein  23.24 
 
 
230 aa  50.1  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.320436  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36940  hypothetical protein  24.6 
 
 
149 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.309583  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>