224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A1040 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011149  SeAg_B0981  hypothetical protein  99.57 
 
 		 230 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00314697  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1040  hypothetical protein  100 
 
 		 230 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.169724  normal  0.241147 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1074  hypothetical protein  99.57 
 
 		 230 aa  468  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.325553 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1089  hypothetical protein  99.13 
 
 		 230 aa  468  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1009  hypothetical protein  99.57 
 
 		 230 aa  468  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2215  hypothetical protein  86.09 
 
 		 230 aa  410  1e-114  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.297842 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00910  conserved inner membrane protein  85.65 
 
 		 230 aa  408  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2737  protein of unknown function DUF421  85.65 
 
 		 230 aa  408  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0253622  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1003  hypothetical protein  85.65 
 
 		 230 aa  408  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0243553  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2690  hypothetical protein  85.65 
 
 		 230 aa  408  1e-113  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.355377  normal  0.77182 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2422  hypothetical protein  85.65 
 
 		 230 aa  408  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000473983  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00917  hypothetical protein  85.65 
 
 		 230 aa  408  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1012  hypothetical protein  85.65 
 
 		 230 aa  408  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000212287  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1067  hypothetical protein  85.22 
 
 		 230 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0942748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1426  hypothetical protein  79.91 
 
 		 230 aa  395  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.320436  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2726  hypothetical protein  47.53 
 
 		 230 aa  218  6e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3028  membrane protein-like protein  47.09 
 
 		 230 aa  216  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2617  hypothetical protein  39.65 
 
 		 230 aa  186  3e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3232  protein of unknown function DUF421  40.62 
 
 		 230 aa  180  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.151812  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2194  protein of unknown function DUF421  38.77 
 
 		 232 aa  170  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1415  hypothetical protein  40.53 
 
 		 227 aa  167  9e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.228022 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5467  protein of unknown function DUF421  40.7 
 
 		 225 aa  159  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.244646 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1130  hypothetical protein  33.62 
 
 		 272 aa  126  3e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2791  hypothetical protein  33.19 
 
 		 272 aa  125  7e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.169514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2486  hypothetical protein  35.54 
 
 		 163 aa  100  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2154  hypothetical protein  33.76 
 
 		 188 aa  96.7  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0961076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0519  protein of unknown function DUF421  30.52 
 
 		 228 aa  96.3  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5259  protein of unknown function DUF421  28.05 
 
 		 229 aa  95.5  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3115  protein of unknown function DUF421  27.35 
 
 		 229 aa  95.1  8e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0626  protein of unknown function DUF421  24.32 
 
 		 239 aa  84.3  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0141494  normal  0.718153 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5258  membrane protein-like protein  26.13 
 
 		 228 aa  84.7  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3116  protein of unknown function DUF421  25.91 
 
 		 229 aa  81.3  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0625  protein of unknown function DUF421  23.79 
 
 		 226 aa  81.3  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00740952  normal  0.965778 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0719  protein of unknown function DUF421  28.4 
 
 		 286 aa  79.3  0.00000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11070  conserved hypothetical membrane-anchored protein  30.28 
 
 		 149 aa  77.8  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3273  protein of unknown function DUF421  29.29 
 
 		 232 aa  73.6  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4843  hypothetical protein  28.07 
 
 		 289 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5688  hypothetical protein  28.07 
 
 		 289 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4999  hypothetical protein  28.07 
 
 		 289 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4828  hypothetical protein  28.07 
 
 		 289 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5379  hypothetical protein  28.07 
 
 		 289 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5235  hypothetical protein  28.07 
 
 		 289 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05340  predicted membrane protein  30.66 
 
 		 242 aa  72.8  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00296282  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0408  hypothetical protein  30 
 
 		 289 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2187  hypothetical protein  28.07 
 
 		 289 aa  72  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000023722  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1106  membrane protein-like protein  26.03 
 
 		 227 aa  71.6  0.000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00481139  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3332  hypothetical protein  27.56 
 
 		 175 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3005  hypothetical protein  28.06 
 
 		 147 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.166871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2764  hypothetical protein  26.06 
 
 		 172 aa  70.1  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5983  hypothetical protein  29.79 
 
 		 165 aa  70.1  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0201045 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2406  hypothetical protein  28.68 
 
 		 165 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.285928  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1555  hypothetical protein  28.26 
 
 		 232 aa  69.7  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3177  hypothetical protein  27.34 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755267  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5311  hypothetical protein  28.67 
 
 		 289 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2332  hypothetical protein  27.97 
 
 		 165 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.232765  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0520  protein of unknown function DUF421  23.58 
 
 		 233 aa  68.9  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0321  hypothetical protein  28.48 
 
 		 225 aa  68.6  0.00000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.911962  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0198  protein of unknown function DUF421  25 
 
 		 164 aa  68.6  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2607  hypothetical protein  27.78 
 
 		 165 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00192347  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5269  hypothetical protein  26.9 
 
 		 289 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1348  hypothetical protein  28.99 
 
 		 232 aa  67.8  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0792  protein of unknown function DUF421  26.24 
 
 		 286 aa  67.4  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1466  hypothetical protein  26.06 
 
 		 286 aa  67  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1469  hypothetical protein  24.76 
 
 		 226 aa  67  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1658  protein of unknown function DUF421  26.53 
 
 		 286 aa  67.4  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2562  hypothetical protein  29.8 
 
 		 164 aa  67.4  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5253  hypothetical protein  26.9 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2563  hypothetical protein  27.4 
 
 		 165 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36940  hypothetical protein  30.4 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.309583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2644  hypothetical protein  27.97 
 
 		 165 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0254116  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2763  hypothetical protein  27.4 
 
 		 165 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000337071 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0204  hypothetical protein  28 
 
 		 289 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0231  hypothetical protein  28 
 
 		 289 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.723048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3692  hypothetical protein  26.32 
 
 		 289 aa  65.1  0.0000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2671  protein of unknown function DUF421  30 
 
 		 242 aa  64.7  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113456  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4943  hypothetical protein  27.33 
 
 		 289 aa  64.7  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0769  hypothetical protein  29.2 
 
 		 147 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0127  hypothetical protein  26.85 
 
 		 241 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0436  hypothetical protein  24.09 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617619  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4363  hypothetical protein  26.32 
 
 		 167 aa  62.8  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3992  hypothetical protein  23.78 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5498  hypothetical protein  26.76 
 
 		 173 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2189  hypothetical protein  26.85 
 
 		 241 aa  62.4  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000145811  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3563  hypothetical protein  29.08 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.9488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3133  hypothetical protein  22.97 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.152895 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3305  protein of unknown function DUF421  26.17 
 
 		 258 aa  62  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00266927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1938  protein of unknown function DUF421  31.21 
 
 		 236 aa  62  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1108  hypothetical protein  27.7 
 
 		 175 aa  61.6  0.000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.628779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2411  hypothetical protein  27.43 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3940  hypothetical protein  32.62 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.179392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4082  protein of unknown function DUF421  26.14 
 
 		 171 aa  61.6  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0523  protein of unknown function DUF421  28.67 
 
 		 175 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1459  hypothetical protein  27.97 
 
 		 151 aa  60.5  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.902977  normal  0.138264 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3224  protein of unknown function DUF421  26.24 
 
 		 173 aa  60.8  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826771  normal  0.0304981 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2581  membrane protein-like protein  25.33 
 
 		 172 aa  60.8  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.604139  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2827  membrane protein-like protein  24.14 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.138476 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1251  protein of unknown function DUF421  29.33 
 
 		 175 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0551  membrane protein-like protein  20.73 
 
 		 180 aa  59.7  0.00000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000937148 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1825  protein of unknown function DUF421  33.83 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0566  hypothetical protein  19.15 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>