177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0626 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_0626  protein of unknown function DUF421  100 
 
 
239 aa  494  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0141494  normal  0.718153 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0520  protein of unknown function DUF421  66.52 
 
 
233 aa  312  3.9999999999999997e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3115  protein of unknown function DUF421  49.55 
 
 
229 aa  231  5e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5259  protein of unknown function DUF421  44.05 
 
 
229 aa  225  4e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3116  protein of unknown function DUF421  37.72 
 
 
229 aa  151  7e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0519  protein of unknown function DUF421  33.18 
 
 
228 aa  149  6e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0625  protein of unknown function DUF421  37.38 
 
 
226 aa  148  7e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00740952  normal  0.965778 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5258  membrane protein-like protein  32.16 
 
 
228 aa  145  7.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2617  hypothetical protein  27.65 
 
 
230 aa  119  6e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1415  hypothetical protein  28.83 
 
 
227 aa  107  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.228022 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2194  protein of unknown function DUF421  28.07 
 
 
232 aa  103  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2791  hypothetical protein  26.38 
 
 
272 aa  98.2  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.169514  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1130  hypothetical protein  26.41 
 
 
272 aa  96.3  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3232  protein of unknown function DUF421  28.07 
 
 
230 aa  96.3  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.151812  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5467  protein of unknown function DUF421  26.5 
 
 
225 aa  92  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.244646 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1426  hypothetical protein  24.77 
 
 
230 aa  87  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.320436  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1089  hypothetical protein  24.32 
 
 
230 aa  85.5  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1009  hypothetical protein  24.32 
 
 
230 aa  85.1  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1074  hypothetical protein  24.32 
 
 
230 aa  85.1  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.325553 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1040  hypothetical protein  24.32 
 
 
230 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.169724  normal  0.241147 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0981  hypothetical protein  24.32 
 
 
230 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00314697  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1067  hypothetical protein  21.62 
 
 
230 aa  78.2  0.00000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0942748  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00910  conserved inner membrane protein  21.62 
 
 
230 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2737  protein of unknown function DUF421  21.62 
 
 
230 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0253622  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00917  hypothetical protein  21.62 
 
 
230 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1012  hypothetical protein  21.62 
 
 
230 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000212287  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1003  hypothetical protein  21.62 
 
 
230 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0243553  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2690  hypothetical protein  21.62 
 
 
230 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.355377  normal  0.77182 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2215  hypothetical protein  21.62 
 
 
230 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.297842 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2422  hypothetical protein  21.62 
 
 
230 aa  77.8  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000473983  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3305  protein of unknown function DUF421  34 
 
 
258 aa  73.6  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00266927  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3175  hypothetical protein  32.62 
 
 
227 aa  73.2  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.979599  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6410  membrane protein-like protein  28.66 
 
 
170 aa  72  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2726  hypothetical protein  23.18 
 
 
230 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3028  membrane protein-like protein  23.18 
 
 
230 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12630  predicted membrane protein  28.57 
 
 
211 aa  69.3  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0321  hypothetical protein  27.33 
 
 
225 aa  68.2  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.911962  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0702  hypothetical protein  25.74 
 
 
215 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00491681  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2084  protein of unknown function DUF421  31.13 
 
 
228 aa  67  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.138808  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3332  hypothetical protein  27.54 
 
 
175 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4363  hypothetical protein  29.22 
 
 
167 aa  66.6  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1348  hypothetical protein  30.94 
 
 
232 aa  65.9  0.0000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1469  hypothetical protein  26.58 
 
 
226 aa  65.9  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1555  hypothetical protein  30.22 
 
 
232 aa  65.9  0.0000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0719  protein of unknown function DUF421  26.45 
 
 
286 aa  65.5  0.0000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5983  hypothetical protein  27.59 
 
 
165 aa  65.5  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0201045 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2189  hypothetical protein  22.58 
 
 
241 aa  65.1  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000145811  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0112  hypothetical protein  27.88 
 
 
166 aa  64.7  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2154  hypothetical protein  22.94 
 
 
188 aa  64.7  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0961076  normal 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2486  hypothetical protein  25.85 
 
 
163 aa  63.5  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3273  protein of unknown function DUF421  30.5 
 
 
232 aa  63.2  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05340  predicted membrane protein  26.32 
 
 
242 aa  63.2  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00296282  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0127  hypothetical protein  21.53 
 
 
241 aa  62.4  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1106  membrane protein-like protein  30.37 
 
 
227 aa  62  0.000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00481139  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2513  hypothetical protein  28.26 
 
 
235 aa  61.2  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0198  protein of unknown function DUF421  26.24 
 
 
164 aa  61.2  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2566  hypothetical protein  29.19 
 
 
165 aa  60.5  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.31826  hitchhiker  0.0000735154 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2763  hypothetical protein  27.34 
 
 
165 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000337071 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4212  protein of unknown function DUF421  27.66 
 
 
188 aa  59.7  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.983168 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2415  hypothetical protein  28.31 
 
 
166 aa  59.3  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.696624  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2827  hypothetical protein  23.4 
 
 
165 aa  59.3  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.209727  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4224  hypothetical protein  26.25 
 
 
196 aa  58.9  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.434687  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2332  hypothetical protein  25.9 
 
 
165 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.232765  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2146  hypothetical protein  26.74 
 
 
202 aa  58.5  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.573525  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2382  protein of unknown function DUF421  29.79 
 
 
281 aa  58.2  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173055  normal  0.818165 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02060  predicted membrane protein  24.67 
 
 
164 aa  58.5  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2563  hypothetical protein  27.34 
 
 
165 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3563  hypothetical protein  30.46 
 
 
158 aa  57.4  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.9488  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1504  hypothetical protein  26.99 
 
 
177 aa  57  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2138  hypothetical protein  28.67 
 
 
229 aa  57  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1485  protein of unknown function DUF421  24.11 
 
 
234 aa  57  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4499  hypothetical protein  25.63 
 
 
215 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00871532  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3910  hypothetical protein  25 
 
 
234 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0966557  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0966  hypothetical protein  24.18 
 
 
234 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000924114  normal  0.424893 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4230  hypothetical protein  23.67 
 
 
234 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000285959  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4268  hypothetical protein  24.34 
 
 
234 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.929825  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4548  hypothetical protein  28.05 
 
 
215 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00119776  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0321  protein of unknown function DUF421  26.39 
 
 
241 aa  56.2  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.78667 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3383  hypothetical protein  22.7 
 
 
158 aa  56.2  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0792  protein of unknown function DUF421  26.39 
 
 
286 aa  56.2  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4082  protein of unknown function DUF421  25 
 
 
171 aa  56.2  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3999  hypothetical protein  23.68 
 
 
234 aa  56.2  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4288  hypothetical protein  23.68 
 
 
234 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000645093  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2406  hypothetical protein  25.18 
 
 
165 aa  55.8  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.285928  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1466  hypothetical protein  25.71 
 
 
286 aa  55.5  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0436  hypothetical protein  27.46 
 
 
224 aa  55.5  0.0000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617619  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6233  hypothetical protein  29.49 
 
 
160 aa  55.5  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303175  normal  0.107487 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2607  hypothetical protein  25.9 
 
 
165 aa  55.1  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00192347  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1938  protein of unknown function DUF421  26.28 
 
 
236 aa  55.1  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11408  hypothetical protein  22.97 
 
 
181 aa  54.7  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0751825  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4158  hypothetical protein  26.83 
 
 
215 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0166527  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0220  hypothetical protein  25.34 
 
 
253 aa  55.1  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3224  protein of unknown function DUF421  25.17 
 
 
173 aa  54.7  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826771  normal  0.0304981 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2764  hypothetical protein  26.53 
 
 
172 aa  53.9  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3409  hypothetical protein  24.2 
 
 
172 aa  54.3  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00991237  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2644  hypothetical protein  25.9 
 
 
165 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0254116  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2641  hypothetical protein  25 
 
 
175 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.865763  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2686  hypothetical protein  25 
 
 
175 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.565782  normal  0.0102559 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0919  hypothetical protein  30 
 
 
155 aa  54.3  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.043093 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2562  hypothetical protein  27.1 
 
 
164 aa  53.9  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>