162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0519 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_0519  protein of unknown function DUF421  100 
 
 
228 aa  468  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0625  protein of unknown function DUF421  62.77 
 
 
226 aa  277  8e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00740952  normal  0.965778 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5258  membrane protein-like protein  46.7 
 
 
228 aa  228  8e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3116  protein of unknown function DUF421  48.91 
 
 
229 aa  213  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3115  protein of unknown function DUF421  39.91 
 
 
229 aa  188  7e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5259  protein of unknown function DUF421  36.8 
 
 
229 aa  160  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0626  protein of unknown function DUF421  33.18 
 
 
239 aa  156  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0141494  normal  0.718153 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0520  protein of unknown function DUF421  35.87 
 
 
233 aa  149  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2194  protein of unknown function DUF421  35.71 
 
 
232 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3232  protein of unknown function DUF421  31.58 
 
 
230 aa  124  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.151812  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2617  hypothetical protein  28.05 
 
 
230 aa  124  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1415  hypothetical protein  29.25 
 
 
227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.228022 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1009  hypothetical protein  30.52 
 
 
230 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1074  hypothetical protein  30.52 
 
 
230 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.325553 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1089  hypothetical protein  30.52 
 
 
230 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0981  hypothetical protein  30.52 
 
 
230 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00314697  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1040  hypothetical protein  30.52 
 
 
230 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.169724  normal  0.241147 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2726  hypothetical protein  30.05 
 
 
230 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3028  membrane protein-like protein  29.58 
 
 
230 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5467  protein of unknown function DUF421  28.84 
 
 
225 aa  97.4  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.244646 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2791  hypothetical protein  28.84 
 
 
272 aa  92.8  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.169514  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1130  hypothetical protein  28.84 
 
 
272 aa  92.4  5e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1426  hypothetical protein  26.76 
 
 
230 aa  91.7  9e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.320436  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00910  conserved inner membrane protein  27.19 
 
 
230 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2737  protein of unknown function DUF421  27.19 
 
 
230 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0253622  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1012  hypothetical protein  27.19 
 
 
230 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000212287  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1003  hypothetical protein  27.19 
 
 
230 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0243553  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2690  hypothetical protein  27.19 
 
 
230 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.355377  normal  0.77182 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2215  hypothetical protein  27.19 
 
 
230 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.297842 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2422  hypothetical protein  27.19 
 
 
230 aa  90.9  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000473983  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00917  hypothetical protein  27.19 
 
 
230 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1067  hypothetical protein  26.73 
 
 
230 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0942748  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2154  hypothetical protein  30.19 
 
 
188 aa  86.3  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0961076  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5983  hypothetical protein  30.77 
 
 
165 aa  83.2  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0201045 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3332  hypothetical protein  29.22 
 
 
175 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3383  hypothetical protein  32.62 
 
 
158 aa  76.6  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4363  hypothetical protein  28.57 
 
 
167 aa  72.4  0.000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1555  hypothetical protein  25.9 
 
 
232 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2827  hypothetical protein  27.81 
 
 
165 aa  69.7  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.209727  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1348  hypothetical protein  26.62 
 
 
232 aa  68.9  0.00000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6410  membrane protein-like protein  28.48 
 
 
170 aa  68.6  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2343  protein of unknown function DUF421  28.1 
 
 
170 aa  68.6  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2486  hypothetical protein  26.71 
 
 
163 aa  67  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4082  protein of unknown function DUF421  22.01 
 
 
171 aa  66.6  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1251  protein of unknown function DUF421  25.9 
 
 
175 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2581  membrane protein-like protein  23.13 
 
 
172 aa  63.5  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.604139  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1108  hypothetical protein  25.9 
 
 
175 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.628779  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2764  hypothetical protein  28.78 
 
 
172 aa  63.2  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12630  predicted membrane protein  23.02 
 
 
211 aa  62.8  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2566  hypothetical protein  25.9 
 
 
165 aa  62.4  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.31826  hitchhiker  0.0000735154 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5688  hypothetical protein  27.15 
 
 
289 aa  62  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4843  hypothetical protein  27.15 
 
 
289 aa  62  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2187  hypothetical protein  27.15 
 
 
289 aa  61.6  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000023722  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0408  hypothetical protein  25 
 
 
289 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3305  protein of unknown function DUF421  24.68 
 
 
258 aa  60.8  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00266927  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0321  hypothetical protein  22.3 
 
 
225 aa  61.2  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.911962  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2415  hypothetical protein  25.64 
 
 
166 aa  61.6  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.696624  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0947  protein of unknown function DUF421  23.12 
 
 
178 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.528971  normal  0.296252 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2247  protein of unknown function DUF421  25 
 
 
168 aa  60.5  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4828  hypothetical protein  26.49 
 
 
289 aa  60.1  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2513  hypothetical protein  23.12 
 
 
235 aa  60.1  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4999  hypothetical protein  26.49 
 
 
289 aa  59.3  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5379  hypothetical protein  26.49 
 
 
289 aa  59.3  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5235  hypothetical protein  26.49 
 
 
289 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3692  hypothetical protein  27.63 
 
 
289 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0719  protein of unknown function DUF421  26.28 
 
 
286 aa  58.5  0.00000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3563  hypothetical protein  24.48 
 
 
158 aa  58.5  0.00000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.9488  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5311  hypothetical protein  27.63 
 
 
289 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0854  hypothetical protein  24.36 
 
 
155 aa  58.2  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2189  hypothetical protein  27.08 
 
 
241 aa  57  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000145811  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2332  hypothetical protein  24.55 
 
 
165 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.232765  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2562  hypothetical protein  24.14 
 
 
164 aa  57  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2607  hypothetical protein  27.59 
 
 
165 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00192347  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5269  hypothetical protein  26.97 
 
 
289 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0919  hypothetical protein  24.36 
 
 
155 aa  56.6  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.043093 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3051  protein of unknown function DUF421  29.58 
 
 
155 aa  56.2  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2644  hypothetical protein  26.54 
 
 
165 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0254116  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0112  hypothetical protein  23.03 
 
 
166 aa  55.8  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2670  hypothetical protein  25.17 
 
 
175 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02060  predicted membrane protein  25.5 
 
 
164 aa  55.8  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0702  hypothetical protein  22.65 
 
 
215 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00491681  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2641  hypothetical protein  25.17 
 
 
175 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.865763  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2686  hypothetical protein  25.17 
 
 
175 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.565782  normal  0.0102559 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1313  protein of unknown function DUF421  21.33 
 
 
184 aa  55.5  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0566  hypothetical protein  20.92 
 
 
237 aa  55.1  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5253  hypothetical protein  26.97 
 
 
289 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0204  hypothetical protein  26.97 
 
 
289 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3175  hypothetical protein  20.95 
 
 
227 aa  54.3  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.979599  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0231  hypothetical protein  26.97 
 
 
289 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.723048  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0127  hypothetical protein  24.67 
 
 
241 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2084  protein of unknown function DUF421  20.11 
 
 
228 aa  54.3  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.138808  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2763  hypothetical protein  22.97 
 
 
165 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000337071 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3820  hypothetical protein  26.11 
 
 
171 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4943  hypothetical protein  26.32 
 
 
289 aa  53.5  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2411  hypothetical protein  23.29 
 
 
211 aa  53.1  0.000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1106  membrane protein-like protein  23.08 
 
 
227 aa  52.8  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00481139  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0436  hypothetical protein  20 
 
 
224 aa  52.8  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617619  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4224  hypothetical protein  24.83 
 
 
196 aa  52.4  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.434687  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2201  membrane protein-like protein  23.84 
 
 
186 aa  52.4  0.000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0792  protein of unknown function DUF421  23.23 
 
 
286 aa  52.4  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>