153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5258 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5258  membrane protein-like protein  100 
 
 
228 aa  472  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3116  protein of unknown function DUF421  53.51 
 
 
229 aa  239  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0519  protein of unknown function DUF421  46.7 
 
 
228 aa  212  3.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0625  protein of unknown function DUF421  46.49 
 
 
226 aa  203  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00740952  normal  0.965778 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3115  protein of unknown function DUF421  38.86 
 
 
229 aa  179  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5259  protein of unknown function DUF421  38.86 
 
 
229 aa  170  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0626  protein of unknown function DUF421  32.16 
 
 
239 aa  145  6e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0141494  normal  0.718153 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0520  protein of unknown function DUF421  33.48 
 
 
233 aa  129  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2617  hypothetical protein  26.99 
 
 
230 aa  122  5e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2194  protein of unknown function DUF421  27.56 
 
 
232 aa  112  7.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3232  protein of unknown function DUF421  29.39 
 
 
230 aa  107  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.151812  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1415  hypothetical protein  26.11 
 
 
227 aa  95.5  5e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.228022 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5467  protein of unknown function DUF421  24.07 
 
 
225 aa  93.6  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.244646 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2726  hypothetical protein  27.23 
 
 
230 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3028  membrane protein-like protein  27.23 
 
 
230 aa  91.7  9e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1130  hypothetical protein  23.56 
 
 
272 aa  87  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2791  hypothetical protein  23.56 
 
 
272 aa  87  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.169514  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1009  hypothetical protein  26.58 
 
 
230 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1074  hypothetical protein  26.58 
 
 
230 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.325553 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1089  hypothetical protein  26.13 
 
 
230 aa  85.1  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0981  hypothetical protein  26.13 
 
 
230 aa  85.1  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00314697  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00910  conserved inner membrane protein  25.23 
 
 
230 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2737  protein of unknown function DUF421  25.23 
 
 
230 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0253622  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00917  hypothetical protein  25.23 
 
 
230 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1012  hypothetical protein  25.23 
 
 
230 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000212287  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1003  hypothetical protein  25.23 
 
 
230 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0243553  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2690  hypothetical protein  25.23 
 
 
230 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.355377  normal  0.77182 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2215  hypothetical protein  25.23 
 
 
230 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.297842 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2422  hypothetical protein  25.23 
 
 
230 aa  84.7  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000473983  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1040  hypothetical protein  26.13 
 
 
230 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.169724  normal  0.241147 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1426  hypothetical protein  26.01 
 
 
230 aa  84  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.320436  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1067  hypothetical protein  24.77 
 
 
230 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0942748  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0321  hypothetical protein  31.21 
 
 
225 aa  73.9  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.911962  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2154  hypothetical protein  27.5 
 
 
188 aa  72.8  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0961076  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1555  hypothetical protein  26.09 
 
 
232 aa  72  0.000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0719  protein of unknown function DUF421  29.49 
 
 
286 aa  71.2  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2581  membrane protein-like protein  24.31 
 
 
172 aa  71.6  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.604139  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3383  hypothetical protein  27.46 
 
 
158 aa  70.5  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5983  hypothetical protein  26.62 
 
 
165 aa  68.6  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0201045 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12630  predicted membrane protein  28.28 
 
 
211 aa  68.2  0.00000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1348  hypothetical protein  24.86 
 
 
232 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4363  hypothetical protein  29.22 
 
 
167 aa  67.4  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0436  hypothetical protein  25.77 
 
 
224 aa  65.9  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617619  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3175  hypothetical protein  25.33 
 
 
227 aa  64.3  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.979599  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2513  hypothetical protein  27.71 
 
 
235 aa  62.8  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2566  hypothetical protein  25.9 
 
 
165 aa  62.8  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.31826  hitchhiker  0.0000735154 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3273  protein of unknown function DUF421  27.42 
 
 
232 aa  62.8  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3224  protein of unknown function DUF421  23.61 
 
 
173 aa  62.4  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826771  normal  0.0304981 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2415  hypothetical protein  26.19 
 
 
166 aa  61.6  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.696624  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3332  hypothetical protein  24.68 
 
 
175 aa  61.6  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1469  hypothetical protein  29.58 
 
 
226 aa  61.6  0.000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2827  hypothetical protein  21.83 
 
 
165 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.209727  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3305  protein of unknown function DUF421  26 
 
 
258 aa  59.7  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00266927  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2084  protein of unknown function DUF421  23.95 
 
 
228 aa  59.7  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.138808  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2641  hypothetical protein  25 
 
 
175 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.865763  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2686  hypothetical protein  25 
 
 
175 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.565782  normal  0.0102559 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2670  hypothetical protein  24.83 
 
 
175 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1589  hypothetical protein  23.67 
 
 
185 aa  59.3  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2607  hypothetical protein  24.26 
 
 
165 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00192347  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2644  hypothetical protein  24.26 
 
 
165 aa  58.5  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0254116  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3992  hypothetical protein  25.35 
 
 
226 aa  58.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0566  hypothetical protein  23.84 
 
 
237 aa  57.4  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2247  protein of unknown function DUF421  25.69 
 
 
168 aa  57  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2406  hypothetical protein  24.19 
 
 
165 aa  55.8  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.285928  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0919  hypothetical protein  26.95 
 
 
155 aa  55.5  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.043093 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1938  protein of unknown function DUF421  22.52 
 
 
236 aa  55.1  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0854  hypothetical protein  26.95 
 
 
155 aa  54.7  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2636  protein of unknown function DUF421  23.97 
 
 
161 aa  54.3  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.753675  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4082  protein of unknown function DUF421  20.26 
 
 
171 aa  54.7  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2763  hypothetical protein  22 
 
 
165 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000337071 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2486  hypothetical protein  20.62 
 
 
163 aa  54.3  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0825  hypothetical protein  31.61 
 
 
205 aa  53.5  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.102228 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2332  hypothetical protein  22.67 
 
 
165 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.232765  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0792  protein of unknown function DUF421  24.31 
 
 
286 aa  53.5  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0711  protein of unknown function DUF421  24.48 
 
 
248 aa  53.1  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05340  predicted membrane protein  22.86 
 
 
242 aa  52.8  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00296282  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6410  membrane protein-like protein  26.39 
 
 
170 aa  53.1  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1313  protein of unknown function DUF421  27.52 
 
 
184 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4828  hypothetical protein  23.18 
 
 
289 aa  52.8  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3352  protein of unknown function DUF421  23.84 
 
 
173 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4999  hypothetical protein  23.61 
 
 
289 aa  52  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5235  hypothetical protein  23.61 
 
 
289 aa  52  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5379  hypothetical protein  23.61 
 
 
289 aa  52  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2563  hypothetical protein  21.33 
 
 
165 aa  52  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0702  hypothetical protein  24.66 
 
 
215 aa  52  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00491681  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0947  protein of unknown function DUF421  25.61 
 
 
178 aa  52  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.528971  normal  0.296252 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2764  hypothetical protein  23.12 
 
 
172 aa  51.6  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0434  hypothetical protein  21.53 
 
 
179 aa  51.2  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3285  membrane protein-like protein  25.48 
 
 
160 aa  51.6  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.22155  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0321  protein of unknown function DUF421  20.67 
 
 
241 aa  51.2  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.78667 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3820  hypothetical protein  26.17 
 
 
171 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2187  hypothetical protein  20.95 
 
 
289 aa  50.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000023722  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4843  hypothetical protein  22.52 
 
 
289 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0408  hypothetical protein  20.95 
 
 
289 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2827  membrane protein-like protein  25.69 
 
 
165 aa  50.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.138476 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5688  hypothetical protein  20.95 
 
 
289 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2090  hypothetical protein  23.08 
 
 
245 aa  50.4  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4212  protein of unknown function DUF421  20.95 
 
 
188 aa  49.7  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.983168 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5269  hypothetical protein  21.62 
 
 
289 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1504  hypothetical protein  25.66 
 
 
177 aa  48.9  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>