128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_89215 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009044  PICST_89215  predicted protein  100 
 
 		 217 aa  445  1.0000000000000001e-124  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01122  60S ribosomal protein L1 (AFU_orthologue; AFUA_1G11710)  74.19 
 
 		 217 aa  306  2.0000000000000002e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.455126  normal  0.294849 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03920  60s ribosomal protein l1-a (l10a), putative  67.26 
 
 		 226 aa  280  1e-74  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45590  Ribosomal protein L10a, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  64.98 
 
 		 216 aa  246  2e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00106944  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28359  predicted protein  55.26 
 
 		 229 aa  226  2e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.45008  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1421  50S ribosomal protein L1P  33.49 
 
 		 212 aa  105  6e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0163  50S ribosomal protein L1P  26.05 
 
 		 214 aa  92.8  4e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.636993 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0862  ribosomal protein L1  28.5 
 
 		 213 aa  88.6  6e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0465  50S ribosomal protein L1P  32.04 
 
 		 222 aa  87.4  1e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.464703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2251  50S ribosomal protein L1P  25.96 
 
 		 214 aa  87.8  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00000243616  normal  0.144507 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1928  50S ribosomal protein L1P  28.11 
 
 		 216 aa  86.3  3e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0656  50S ribosomal protein L1P  25.89 
 
 		 215 aa  84.7  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000420977  normal  0.316109 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1946  50S ribosomal protein L1P  30.1 
 
 		 213 aa  84.7  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0223976  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1601  50S ribosomal protein L1P  30.14 
 
 		 222 aa  83.6  0.000000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.670719  normal  0.978998 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0614  50S ribosomal protein L1P  32.21 
 
 		 213 aa  83.2  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0481513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0413  50S ribosomal protein L1P  26.05 
 
 		 213 aa  83.2  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0692285  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1517  ribosomal protein L1  26.64 
 
 		 210 aa  81.6  0.000000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2186  50S ribosomal protein L1P  28.28 
 
 		 212 aa  82  0.000000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1655  50S ribosomal protein L1P  30.1 
 
 		 222 aa  81.3  0.00000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0254  50S ribosomal protein L1P  27.92 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1581  50S ribosomal protein L1P  24.75 
 
 		 213 aa  79.3  0.00000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000241017  hitchhiker  0.00650077 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3518  ribosomal protein L1  26.64 
 
 		 210 aa  79.3  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0613577  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1413  50S ribosomal protein L1P  28.5 
 
 		 213 aa  78.6  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2535  50S ribosomal protein L1P  27.18 
 
 		 212 aa  77.4  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.305257  normal  0.182251 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1263  50S ribosomal protein L1P  28 
 
 		 213 aa  75.9  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.968535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0693  50S ribosomal protein L1P  28 
 
 		 213 aa  75.9  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1273  50S ribosomal protein L1P  29.35 
 
 		 213 aa  75.1  0.0000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0382  50S ribosomal protein L1  26.6 
 
 		 220 aa  71.2  0.00000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.929915 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1316  ribosomal protein L1  28.04 
 
 		 218 aa  67.8  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.685162  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1833  50S ribosomal protein L1P  31.4 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.927774 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1635  50S ribosomal protein L1P  26.29 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0573324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0189  50S ribosomal protein L1P  28.5 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0223  50S ribosomal protein L1P  28.97 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.449707  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0868  ribosomal protein L1  24.17 
 
 		 231 aa  57  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1321  50S ribosomal protein L1  25.38 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.18039 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0975  50S ribosomal protein L1  25.11 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0199586 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1820  50S ribosomal protein L1  24.87 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.186672  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1822  50S ribosomal protein L1  25.38 
 
 		 232 aa  54.7  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.122687  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2721  50S ribosomal protein L1  23.9 
 
 		 231 aa  54.3  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127574  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3691  50S ribosomal protein L1  24 
 
 		 229 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1419  50S ribosomal protein L1  24.87 
 
 		 233 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560035  normal  0.451837 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0309  50S ribosomal protein L1  23.41 
 
 		 230 aa  53.1  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0170319  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26035  predicted protein  25.93 
 
 		 266 aa  53.1  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1530  50S ribosomal protein L1  24.27 
 
 		 230 aa  52.8  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000127232  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3865  50S ribosomal protein L1  23.79 
 
 		 231 aa  52.4  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.100026 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0357  50S ribosomal protein L1  22.27 
 
 		 230 aa  52  0.000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000538139 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2334  ribosomal protein L1  23.33 
 
 		 231 aa  52  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000592022  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3471  50S ribosomal protein L1  22.22 
 
 		 230 aa  52  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3200  50S ribosomal protein L1  23.15 
 
 		 229 aa  51.6  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0643  50S ribosomal protein L1  25.13 
 
 		 232 aa  51.2  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0857628  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2726  ribosomal protein L1  23.18 
 
 		 233 aa  51.2  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181132  normal  0.31349 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0275  50S ribosomal protein L1  25.63 
 
 		 232 aa  51.2  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000501108  hitchhiker  0.000549627 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2278  50S ribosomal protein L1  23.15 
 
 		 229 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.360769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1324  ribosomal protein L1  24 
 
 		 242 aa  50.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0358  50S ribosomal protein L1  25.94 
 
 		 236 aa  50.1  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.235543  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0522  ribosomal protein L1  23.08 
 
 		 235 aa  49.7  0.00003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2179  ribosomal protein L1  24.02 
 
 		 231 aa  49.7  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.965533 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1373  50S ribosomal protein L1  25.38 
 
 		 242 aa  49.7  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00191675  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2165  50S ribosomal protein L1P  25 
 
 		 230 aa  49.3  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0394  50S ribosomal protein L1  25.98 
 
 		 226 aa  48.9  0.00006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.351464  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2471  50S ribosomal protein L1  24.44 
 
 		 231 aa  48.9  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000180886  hitchhiker  0.00777473 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1822  ribosomal protein L1  24.51 
 
 		 242 aa  48.5  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2723  ribosomal protein L1  23.36 
 
 		 233 aa  47.4  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2657  50S ribosomal protein L1P  24.12 
 
 		 235 aa  48.1  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.106941  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3160  ribosomal protein L1  26.89 
 
 		 238 aa  47.8  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.496068  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1344  50S ribosomal protein L1  24.02 
 
 		 231 aa  47.8  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0377064  normal  0.0460128 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0205  50S ribosomal protein L1  23.66 
 
 		 235 aa  47  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4286  50S ribosomal protein L1  24.88 
 
 		 233 aa  47.4  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000185505  hitchhiker  0.000000513776 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02211  50S ribosomal protein L1  25.56 
 
 		 234 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.54632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3692  ribosomal protein L1  23.2 
 
 		 230 aa  47.4  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000151678  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04533  50S ribosomal protein L1  23.98 
 
 		 232 aa  47  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192671  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0487  50S ribosomal protein L1  27.13 
 
 		 230 aa  47.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0570658  hitchhiker  0.00000155612 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0316  50S ribosomal protein L1  27.13 
 
 		 230 aa  47.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.246243  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0170  50S ribosomal protein L1  25.67 
 
 		 229 aa  46.2  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000255215  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0746  50S ribosomal protein L1  23.98 
 
 		 232 aa  46.6  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.034048  normal  0.798017 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02231  50S ribosomal protein L1  22.77 
 
 		 235 aa  46.2  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0465  50S ribosomal protein L1  24.41 
 
 		 233 aa  45.8  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00222885  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0480  50S ribosomal protein L1  24.41 
 
 		 233 aa  45.8  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.841279  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02321  50S ribosomal protein L1  24.39 
 
 		 235 aa  45.8  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0123  50S ribosomal protein L1  24.88 
 
 		 237 aa  45.4  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.991337  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0697  50S ribosomal protein L1P  21.4 
 
 		 259 aa  45.4  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4354  ribosomal protein L1  22.39 
 
 		 236 aa  45.4  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0388  ribosomal protein L1  28.48 
 
 		 241 aa  45.1  0.0008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0212  50S ribosomal protein L1  23.79 
 
 		 231 aa  45.1  0.0008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0231088  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2545  50S ribosomal protein L1  22.33 
 
 		 232 aa  45.1  0.0009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0856  50S ribosomal protein L1  25.87 
 
 		 230 aa  45.1  0.0009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000185888  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4772  50S ribosomal protein L1  24.28 
 
 		 232 aa  44.7  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0687152  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1570  50S ribosomal protein L1  24.88 
 
 		 235 aa  44.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0350  50S ribosomal protein L1  26.11 
 
 		 230 aa  44.7  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0156912  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1805  50S ribosomal protein L1P  22.22 
 
 		 232 aa  44.7  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.163663 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02211  50S ribosomal protein L1  22.77 
 
 		 235 aa  44.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02791  50S ribosomal protein L1  24.88 
 
 		 235 aa  44.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.475982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27781  50S ribosomal protein L1  25.49 
 
 		 244 aa  44.3  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5086  50S ribosomal protein L1  25.13 
 
 		 230 aa  44.7  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00155922  normal  0.872957 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0846  50S ribosomal protein L1  22.07 
 
 		 235 aa  44.7  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000865088  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1865  50S ribosomal protein L1  22.33 
 
 		 232 aa  44.3  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000283442  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3843  50S ribosomal protein L1  25.37 
 
 		 232 aa  44.3  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.528602  normal  0.697118 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0182  LSU ribosomal protein L1P  23.08 
 
 		 233 aa  44.7  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000240107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2869  50S ribosomal protein L1  24.21 
 
 		 234 aa  44.3  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000234009  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1896  50S ribosomal protein L1  21.89 
 
 		 235 aa  44.7  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0132214  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>