More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2165 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2165  50S ribosomal protein L1P  100 
 
 		 230 aa  459  9.999999999999999e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1530  50S ribosomal protein L1  62.78 
 
 		 230 aa  296  2e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000127232  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2471  50S ribosomal protein L1  63.23 
 
 		 231 aa  291  9e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000180886  hitchhiker  0.00777473 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0182  LSU ribosomal protein L1P  60.18 
 
 		 233 aa  281  6.000000000000001e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000240107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2345  ribosomal protein L1  59.56 
 
 		 233 aa  280  2e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0238114  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1324  ribosomal protein L1  60.53 
 
 		 242 aa  279  3e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2657  50S ribosomal protein L1P  60.73 
 
 		 235 aa  278  6e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.106941  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01060  ribosomal protein L1  59.38 
 
 		 235 aa  277  1e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.745230000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1173  ribosomal protein L1  58.93 
 
 		 235 aa  276  2e-73  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000649528  unclonable  0.0000000262625 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0388  ribosomal protein L1  63.93 
 
 		 241 aa  274  8e-73  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0275  50S ribosomal protein L1  58.11 
 
 		 232 aa  272  3e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000501108  hitchhiker  0.000549627 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2723  ribosomal protein L1  60.09 
 
 		 233 aa  271  4.0000000000000004e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0212  50S ribosomal protein L1  59.91 
 
 		 231 aa  271  8.000000000000001e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0231088  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1236  50S ribosomal protein L1  58.59 
 
 		 235 aa  271  8.000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.988417  normal  0.475189 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0357  50S ribosomal protein L1  57.4 
 
 		 230 aa  270  1e-71  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000538139 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5963  50S ribosomal protein L1  58.72 
 
 		 236 aa  270  1e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4328  50S ribosomal protein L1  58.06 
 
 		 238 aa  267  8e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3936  50S ribosomal protein L1  57.6 
 
 		 238 aa  267  1e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4354  ribosomal protein L1  59.17 
 
 		 236 aa  267  1e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1928  ribosomal protein L1  62.95 
 
 		 232 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0450124  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1058  50S ribosomal protein L1  57.4 
 
 		 233 aa  264  8.999999999999999e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.30711  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0616  50S ribosomal protein L1  58.37 
 
 		 234 aa  262  3e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000217065 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2721  50S ribosomal protein L1  57.85 
 
 		 231 aa  262  4e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127574  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2274  50S ribosomal protein L1  58.96 
 
 		 234 aa  259  2e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2362  50S ribosomal protein L1  58.96 
 
 		 234 aa  259  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.193513  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0691  50S ribosomal protein L1  56.83 
 
 		 233 aa  259  3e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.4447699999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0577  ribosomal protein L1  58.14 
 
 		 236 aa  259  3e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0677262  hitchhiker  0.00322479 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0179  50S ribosomal protein L1  56.25 
 
 		 231 aa  258  4e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000606052  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0309  50S ribosomal protein L1  56.05 
 
 		 230 aa  258  4e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0170319  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2725  50S ribosomal protein L1  58.93 
 
 		 229 aa  258  6e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000462552  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2411  50S ribosomal protein L1  58.93 
 
 		 229 aa  258  6e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000512351  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0846  50S ribosomal protein L1  55.8 
 
 		 235 aa  258  7e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000865088  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2866  50S ribosomal protein L1  56.95 
 
 		 234 aa  257  8e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4523  ribosomal protein L1  59.21 
 
 		 239 aa  258  8e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1822  ribosomal protein L1  56.14 
 
 		 242 aa  257  9e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29860  LSU ribosomal protein L1P  57.67 
 
 		 238 aa  257  9e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1589  50S ribosomal protein L1  58.02 
 
 		 234 aa  256  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5111  ribosomal protein L1  59.05 
 
 		 225 aa  256  2e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.253072  normal  0.533351 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09650  LSU ribosomal protein L1P  59.82 
 
 		 238 aa  256  2e-67  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.284817  hitchhiker  0.000232644 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1624  50S ribosomal protein L1  56.95 
 
 		 230 aa  256  2e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0643  50S ribosomal protein L1  54.46 
 
 		 232 aa  255  3e-67  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0857628  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1373  50S ribosomal protein L1  56 
 
 		 242 aa  254  6e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00191675  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3338  50S ribosomal protein L1  56.56 
 
 		 233 aa  254  7e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000142685 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2283  50S ribosomal protein L1  56.74 
 
 		 229 aa  254  7e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00159003  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0924  50S ribosomal protein L1  57.85 
 
 		 235 aa  254  8e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0952  50S ribosomal protein L1  57.85 
 
 		 235 aa  254  8e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0941  50S ribosomal protein L1  57.85 
 
 		 235 aa  254  8e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0856  50S ribosomal protein L1  58.74 
 
 		 230 aa  254  9e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000185888  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0561  50S ribosomal protein L1  54.91 
 
 		 230 aa  254  9e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000069455  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0575  50S ribosomal protein L1  54.91 
 
 		 230 aa  254  9e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000352195  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0480  50S ribosomal protein L1  53.85 
 
 		 233 aa  253  1.0000000000000001e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.841279  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0923  50S ribosomal protein L1  56.11 
 
 		 233 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3160  ribosomal protein L1  56.42 
 
 		 238 aa  253  1.0000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.496068  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3865  50S ribosomal protein L1  57.14 
 
 		 231 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.100026 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1510  ribosomal protein L1  58.41 
 
 		 235 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000430301  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0066  50S ribosomal protein L1  53.39 
 
 		 226 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1209  ribosomal protein L1  56.56 
 
 		 231 aa  253  3e-66  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000136712 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0670  50S ribosomal protein L1  54.75 
 
 		 233 aa  252  3e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.759589  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1336  50S ribosomal protein L1  56.28 
 
 		 233 aa  252  3e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.167533  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1344  50S ribosomal protein L1  56.25 
 
 		 231 aa  251  8.000000000000001e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0377064  normal  0.0460128 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3691  50S ribosomal protein L1  55.8 
 
 		 229 aa  250  1e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2675  ribosomal protein L1  55.71 
 
 		 238 aa  250  1e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1489  ribosomal protein L1  50.68 
 
 		 226 aa  250  2e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0841065  normal  0.34693 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1015  ribosomal protein L1  60.73 
 
 		 237 aa  249  2e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08710  LSU ribosomal protein L1P  57.64 
 
 		 236 aa  249  2e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.190625  hitchhiker  0.000000021546 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0465  50S ribosomal protein L1  52.94 
 
 		 233 aa  249  3e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00222885  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2128  ribosomal protein L1  61.43 
 
 		 237 aa  249  3e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.628826  normal  0.786973 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0570  50S ribosomal protein L1  57.99 
 
 		 259 aa  248  4e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1113  ribosomal protein L1  58.26 
 
 		 238 aa  248  5e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15602  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl608  50S ribosomal protein L1  50.23 
 
 		 227 aa  248  7e-65  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2224  50S ribosomal protein L1  55.14 
 
 		 234 aa  248  7e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.009605 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6639  50S ribosomal protein L1  60.55 
 
 		 238 aa  247  9e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0975  50S ribosomal protein L1  54.26 
 
 		 232 aa  247  1e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0199586 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2957  50S ribosomal protein L1  55.16 
 
 		 231 aa  247  1e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0502013 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3471  50S ribosomal protein L1  54.46 
 
 		 230 aa  246  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1822  50S ribosomal protein L1  53.81 
 
 		 232 aa  247  1e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.122687  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0697  50S ribosomal protein L1P  53.19 
 
 		 259 aa  247  1e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1419  50S ribosomal protein L1  54.87 
 
 		 233 aa  246  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560035  normal  0.451837 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0743  ribosomal protein L1  58.41 
 
 		 237 aa  246  2e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1019  50S ribosomal protein L1  53.74 
 
 		 238 aa  246  3e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00726287 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0539  50S ribosomal protein L1  60 
 
 		 237 aa  245  4e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.653827  normal  0.0435444 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0487  50S ribosomal protein L1  56.05 
 
 		 230 aa  245  4e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0570658  hitchhiker  0.00000155612 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1475  50S ribosomal protein L1  55.36 
 
 		 237 aa  245  4e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0729357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0316  50S ribosomal protein L1  56.05 
 
 		 230 aa  245  4e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.246243  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2334  ribosomal protein L1  54.5 
 
 		 231 aa  244  6.999999999999999e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000592022  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0677  50S ribosomal protein L1  57.08 
 
 		 238 aa  244  6.999999999999999e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03650  50S ribosomal protein L1  61.47 
 
 		 239 aa  244  8e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.57947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0912  ribosomal protein L1  54.63 
 
 		 237 aa  244  9e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.911951  normal  0.174852 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6060  50S ribosomal protein L1  58.45 
 
 		 237 aa  244  9e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.166987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0354  50S ribosomal protein L1  55.16 
 
 		 229 aa  243  9.999999999999999e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000103528  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3200  50S ribosomal protein L1  54.02 
 
 		 229 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0204  ribosomal protein L1  55.36 
 
 		 229 aa  243  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000198509  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1070  50S ribosomal protein L1  58.26 
 
 		 237 aa  243  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.353105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0095  50S ribosomal protein L1  58.48 
 
 		 233 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2278  50S ribosomal protein L1  53.81 
 
 		 229 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.360769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0407  50S ribosomal protein L1  56.05 
 
 		 230 aa  242  3e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.3464e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3037  50S ribosomal protein L1  52.49 
 
 		 231 aa  242  3.9999999999999997e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0489009 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3327  50S ribosomal protein L1  56.19 
 
 		 240 aa  242  3.9999999999999997e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.24535  normal  0.407372 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2179  ribosomal protein L1  54.75 
 
 		 231 aa  242  3.9999999999999997e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.965533 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0613  ribosomal protein L1  58.6 
 
 		 238 aa  242  3.9999999999999997e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>