More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0614 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0614  50S ribosomal protein L1P  100 
 
 		 213 aa  428  1e-119  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0481513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1946  50S ribosomal protein L1P  62.44 
 
 		 213 aa  290  1e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0223976  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1421  50S ribosomal protein L1P  57.35 
 
 		 212 aa  248  4e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0862  ribosomal protein L1  53.85 
 
 		 213 aa  229  3e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0163  50S ribosomal protein L1P  43.93 
 
 		 214 aa  201  5e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.636993 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2535  50S ribosomal protein L1P  47.6 
 
 		 212 aa  196  2.0000000000000003e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.305257  normal  0.182251 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2251  50S ribosomal protein L1P  43.46 
 
 		 214 aa  191  6e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00000243616  normal  0.144507 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0413  50S ribosomal protein L1P  43.54 
 
 		 213 aa  190  1e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0692285  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0656  50S ribosomal protein L1P  42.25 
 
 		 215 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000420977  normal  0.316109 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0254  50S ribosomal protein L1P  46.89 
 
 		 212 aa  189  2.9999999999999997e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3518  ribosomal protein L1  47.64 
 
 		 210 aa  185  4e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0613577  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1517  ribosomal protein L1  46.7 
 
 		 210 aa  183  2.0000000000000003e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2186  50S ribosomal protein L1P  45.75 
 
 		 212 aa  182  3e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1581  50S ribosomal protein L1P  41.59 
 
 		 213 aa  181  9.000000000000001e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000241017  hitchhiker  0.00650077 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1413  50S ribosomal protein L1P  41.15 
 
 		 213 aa  169  2e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0189  50S ribosomal protein L1P  44.02 
 
 		 213 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1263  50S ribosomal protein L1P  40.19 
 
 		 213 aa  165  4e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.968535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0693  50S ribosomal protein L1P  40.19 
 
 		 213 aa  165  4e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1273  50S ribosomal protein L1P  39.71 
 
 		 213 aa  162  3e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0223  50S ribosomal protein L1P  37.38 
 
 		 225 aa  132  3e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.449707  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0382  50S ribosomal protein L1  37.84 
 
 		 220 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.929915 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0465  50S ribosomal protein L1P  36.14 
 
 		 222 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.464703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1928  50S ribosomal protein L1P  35.89 
 
 		 216 aa  125  5e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1655  50S ribosomal protein L1P  32.2 
 
 		 222 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1833  50S ribosomal protein L1P  33.49 
 
 		 222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.927774 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1601  50S ribosomal protein L1P  31.82 
 
 		 222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.670719  normal  0.978998 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1635  50S ribosomal protein L1P  33.66 
 
 		 218 aa  101  8e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0573324  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1316  ribosomal protein L1  32.87 
 
 		 218 aa  98.2  7e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.685162  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0395  50S ribosomal protein L1P  32.37 
 
 		 231 aa  95.5  5e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.780238  hitchhiker  0.00704539 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2685  ribosomal protein L1  31.28 
 
 		 229 aa  94.4  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0114395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0846  50S ribosomal protein L1  34.45 
 
 		 235 aa  94.4  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000865088  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4772  50S ribosomal protein L1  35.21 
 
 		 232 aa  93.6  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0687152  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0955  50S ribosomal protein L1  32.21 
 
 		 220 aa  91.7  8e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01060  ribosomal protein L1  35.47 
 
 		 235 aa  91.3  9e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.745230000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1865  50S ribosomal protein L1  33.66 
 
 		 232 aa  90.9  1e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000283442  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0324  50S ribosomal protein L1  33.66 
 
 		 232 aa  90.9  1e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0128196  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0709  50S ribosomal protein L1  32.06 
 
 		 232 aa  89.7  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.146158  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0166  50S ribosomal protein L1  32.84 
 
 		 220 aa  89.4  4e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2970  50S ribosomal protein L1  32.52 
 
 		 231 aa  89  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3317  50S ribosomal protein L1  32.52 
 
 		 231 aa  89  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.809364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0388  ribosomal protein L1  34.54 
 
 		 241 aa  87.8  1e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00228  50S ribosomal protein L1  32.39 
 
 		 233 aa  87.4  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2224  50S ribosomal protein L1  32.54 
 
 		 234 aa  87.8  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.009605 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002170  LSU ribosomal protein L1p (L10Ae)  32.39 
 
 		 233 aa  87.4  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000179792  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2362  50S ribosomal protein L1  30.59 
 
 		 234 aa  87  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.193513  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2274  50S ribosomal protein L1  30.59 
 
 		 234 aa  87  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3037  50S ribosomal protein L1  31.07 
 
 		 231 aa  86.7  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0489009 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0303  50S ribosomal protein L1  31.55 
 
 		 232 aa  86.3  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.13038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3655  50S ribosomal protein L1  31.55 
 
 		 232 aa  86.3  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0381514  hitchhiker  0.000000879291 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf143  50S ribosomal protein L1  35.45 
 
 		 230 aa  85.9  4e-16  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2179  ribosomal protein L1  32.04 
 
 		 231 aa  85.5  5e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.965533 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1589  50S ribosomal protein L1  30.14 
 
 		 234 aa  85.9  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0643  50S ribosomal protein L1  33.85 
 
 		 232 aa  85.1  8e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0857628  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2851  50S ribosomal protein L1  30.66 
 
 		 232 aa  85.1  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441128  normal  0.418553 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0255  50S ribosomal protein L1  29.95 
 
 		 241 aa  84.3  0.000000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000222102  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0923  50S ribosomal protein L1  34.72 
 
 		 233 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0465  50S ribosomal protein L1  30.61 
 
 		 233 aa  84  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00222885  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3436  50S ribosomal protein L1  29.72 
 
 		 232 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2770  50S ribosomal protein L1  30.1 
 
 		 232 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0238  50S ribosomal protein L1  30.1 
 
 		 232 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.629603  normal  0.0137855 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0316  50S ribosomal protein L1  30.1 
 
 		 232 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00176824  normal  0.225661 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0337  50S ribosomal protein L1  30.1 
 
 		 232 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29393  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3819  50S ribosomal protein L1  30.1 
 
 		 232 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0480  50S ribosomal protein L1  29.69 
 
 		 233 aa  83.2  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.841279  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2644  50S ribosomal protein L1  30.1 
 
 		 232 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0687921  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3757  50S ribosomal protein L1  30.1 
 
 		 232 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0092623  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3789  50S ribosomal protein L1  30.1 
 
 		 232 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.042669  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3181  50S ribosomal protein L1  30.1 
 
 		 232 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000145836  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3079  50S ribosomal protein L1  30.1 
 
 		 232 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.22613  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1911  50S ribosomal protein L1  30.1 
 
 		 232 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00000000299291  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3466  50S ribosomal protein L1  30.1 
 
 		 232 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0147067  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0170  50S ribosomal protein L1  32.51 
 
 		 229 aa  84  0.000000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000255215  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0301  50S ribosomal protein L1  31.34 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000226656  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0744  50S ribosomal protein L1  30.77 
 
 		 233 aa  84  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00583178 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1324  ribosomal protein L1  32.84 
 
 		 242 aa  82.8  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3471  50S ribosomal protein L1  32.55 
 
 		 230 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4679  50S ribosomal protein L1  31.31 
 
 		 235 aa  83.2  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000682303  decreased coverage  0.0030741 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1822  50S ribosomal protein L1  32.04 
 
 		 232 aa  82.8  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.122687  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0148  ribosomal protein L1  33.65 
 
 		 233 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000518131  normal  0.0355944 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3338  50S ribosomal protein L1  34.72 
 
 		 233 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000142685 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0039  50S ribosomal protein L1  32.04 
 
 		 233 aa  82  0.000000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00138059  hitchhiker  0.00000000000807787 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2334  ribosomal protein L1  32.37 
 
 		 231 aa  82  0.000000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000592022  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02211  50S ribosomal protein L1  32.56 
 
 		 235 aa  82  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0212  50S ribosomal protein L1  31.94 
 
 		 231 aa  82  0.000000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0231088  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2283  50S ribosomal protein L1  32.72 
 
 		 229 aa  82  0.000000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00159003  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2726  ribosomal protein L1  30.48 
 
 		 233 aa  82  0.000000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181132  normal  0.31349 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1373  50S ribosomal protein L1  31.12 
 
 		 242 aa  81.6  0.000000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00191675  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2957  50S ribosomal protein L1  32.14 
 
 		 231 aa  81.6  0.000000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0502013 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0043  50S ribosomal protein L1  32.08 
 
 		 233 aa  81.3  0.000000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000236116  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1058  50S ribosomal protein L1  33.33 
 
 		 233 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.30711  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0265  50S ribosomal protein L1  30.1 
 
 		 232 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.516489  normal  0.64831 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2993  50S ribosomal protein L1  32.42 
 
 		 235 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02211  50S ribosomal protein L1  30.14 
 
 		 234 aa  81.3  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.54632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02231  50S ribosomal protein L1  32.57 
 
 		 235 aa  81.3  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0256  50S ribosomal protein L1  30.1 
 
 		 232 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0257763  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0868  ribosomal protein L1  32.7 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0350  50S ribosomal protein L1  30.05 
 
 		 232 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.81183  normal  0.731209 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1702  50S ribosomal protein L1  30.05 
 
 		 232 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.311882  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0336  50S ribosomal protein L1  30.05 
 
 		 232 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28407  normal  0.840151 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4286  50S ribosomal protein L1  33.49 
 
 		 233 aa  80.5  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000185505  hitchhiker  0.000000513776 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>