More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0955 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007799  ECH_0955  50S ribosomal protein L1  100 
 
 		 220 aa  442  1e-123  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0166  50S ribosomal protein L1  95 
 
 		 220 aa  429  1e-119  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0021  50S ribosomal protein L1  62.5 
 
 		 217 aa  259  2e-68  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0508427  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0395  50S ribosomal protein L1P  48.56 
 
 		 231 aa  209  2e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.780238  hitchhiker  0.00704539 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2723  ribosomal protein L1  47.85 
 
 		 233 aa  209  4e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002170  LSU ribosomal protein L1p (L10Ae)  49.28 
 
 		 233 aa  207  1e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000179792  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00228  50S ribosomal protein L1  49.28 
 
 		 233 aa  207  1e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0595  50S ribosomal protein L1  48.08 
 
 		 233 aa  206  2e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00100936  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3655  50S ribosomal protein L1  47.39 
 
 		 232 aa  204  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0381514  hitchhiker  0.000000879291 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0303  50S ribosomal protein L1  47.39 
 
 		 232 aa  204  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.13038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0316  50S ribosomal protein L1  46.92 
 
 		 232 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00176824  normal  0.225661 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2770  50S ribosomal protein L1  46.92 
 
 		 232 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0337  50S ribosomal protein L1  46.92 
 
 		 232 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29393  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3436  50S ribosomal protein L1  46.92 
 
 		 232 aa  202  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0256  50S ribosomal protein L1  46.92 
 
 		 232 aa  202  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0257763  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0265  50S ribosomal protein L1  46.92 
 
 		 232 aa  202  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.516489  normal  0.64831 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3348  50S ribosomal protein L1  47.62 
 
 		 232 aa  202  4e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.728506  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0388  ribosomal protein L1  43.66 
 
 		 241 aa  202  4e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2851  50S ribosomal protein L1  46.92 
 
 		 232 aa  201  8e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441128  normal  0.418553 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01060  ribosomal protein L1  47.37 
 
 		 235 aa  200  9.999999999999999e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.745230000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0238  50S ribosomal protein L1  45.97 
 
 		 232 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.629603  normal  0.0137855 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00693  ribosomal protein L1  45.5 
 
 		 282 aa  200  9.999999999999999e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000527661  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3181  50S ribosomal protein L1  45.97 
 
 		 232 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000145836  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2644  50S ribosomal protein L1  45.97 
 
 		 232 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0687921  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3466  50S ribosomal protein L1  45.97 
 
 		 232 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0147067  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3789  50S ribosomal protein L1  45.97 
 
 		 232 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.042669  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3819  50S ribosomal protein L1  45.97 
 
 		 232 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3079  50S ribosomal protein L1  45.97 
 
 		 232 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.22613  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3757  50S ribosomal protein L1  45.97 
 
 		 232 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0092623  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1911  50S ribosomal protein L1  45.97 
 
 		 232 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00000000299291  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4772  50S ribosomal protein L1  48.54 
 
 		 232 aa  199  3e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0687152  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2869  50S ribosomal protein L1  46.86 
 
 		 234 aa  198  3.9999999999999996e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000234009  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2726  ribosomal protein L1  45.93 
 
 		 233 aa  197  1.0000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181132  normal  0.31349 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2993  50S ribosomal protein L1  46.86 
 
 		 235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2970  50S ribosomal protein L1  47.12 
 
 		 231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0170  50S ribosomal protein L1  44.08 
 
 		 229 aa  197  1.0000000000000001e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000255215  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3317  50S ribosomal protein L1  47.12 
 
 		 231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.809364  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1530  50S ribosomal protein L1  43.87 
 
 		 230 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000127232  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0179  50S ribosomal protein L1  44.08 
 
 		 231 aa  196  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000606052  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2564  50S ribosomal protein L1  42.52 
 
 		 232 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0511824 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0561  50S ribosomal protein L1  44.71 
 
 		 230 aa  196  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000069455  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0575  50S ribosomal protein L1  44.71 
 
 		 230 aa  196  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000352195  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2471  50S ribosomal protein L1  43.64 
 
 		 231 aa  195  5.000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000180886  hitchhiker  0.00777473 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4286  50S ribosomal protein L1  42.18 
 
 		 233 aa  195  5.000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000185505  hitchhiker  0.000000513776 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1865  50S ribosomal protein L1  44.08 
 
 		 232 aa  194  9e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000283442  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0324  50S ribosomal protein L1  44.08 
 
 		 232 aa  194  9e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0128196  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0709  50S ribosomal protein L1  43.66 
 
 		 232 aa  194  1e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.146158  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0148  ribosomal protein L1  45.19 
 
 		 233 aa  194  1e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000518131  normal  0.0355944 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3037  50S ribosomal protein L1  45.67 
 
 		 231 aa  193  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0489009 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0856  50S ribosomal protein L1  49.06 
 
 		 230 aa  193  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000185888  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2179  ribosomal protein L1  45.97 
 
 		 231 aa  192  2e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.965533 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3734  ribosomal protein L1  46.15 
 
 		 234 aa  192  4e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0691  50S ribosomal protein L1  44.29 
 
 		 233 aa  192  4e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.4447699999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0269  50S ribosomal protein L1  49.3 
 
 		 230 aa  192  5e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0927887  hitchhiker  0.00154879 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2334  ribosomal protein L1  43.93 
 
 		 231 aa  191  8e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000592022  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1822  50S ribosomal protein L1  44.29 
 
 		 232 aa  190  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.122687  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0744  50S ribosomal protein L1  44.39 
 
 		 233 aa  190  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00583178 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1633  50S ribosomal protein L1  46.19 
 
 		 235 aa  189  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.858056  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0212  50S ribosomal protein L1  43.33 
 
 		 231 aa  190  2e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0231088  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3471  50S ribosomal protein L1  43.06 
 
 		 230 aa  189  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2545  50S ribosomal protein L1  42.06 
 
 		 232 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2278  50S ribosomal protein L1  42.38 
 
 		 229 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.360769  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3338  50S ribosomal protein L1  43.81 
 
 		 233 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000142685 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0043  50S ribosomal protein L1  47.39 
 
 		 233 aa  189  4e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000236116  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0309  50S ribosomal protein L1P  44.86 
 
 		 231 aa  189  4e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0440135  normal  0.025275 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0160  50S ribosomal protein L1  46.63 
 
 		 233 aa  188  4e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000041056  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3200  50S ribosomal protein L1  41.9 
 
 		 229 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0923  50S ribosomal protein L1  43.81 
 
 		 233 aa  189  4e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0357  50S ribosomal protein L1  41.59 
 
 		 230 aa  188  5e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000538139 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0182  LSU ribosomal protein L1P  44.5 
 
 		 233 aa  188  5e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000240107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3691  50S ribosomal protein L1  41.9 
 
 		 229 aa  188  7e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0138  50S ribosomal protein L1  45.28 
 
 		 233 aa  187  7e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000376196  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1489  ribosomal protein L1  46.89 
 
 		 226 aa  187  8e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0841065  normal  0.34693 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0756  50S ribosomal protein L1  45.67 
 
 		 230 aa  187  8e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0487  50S ribosomal protein L1  45.71 
 
 		 230 aa  187  9e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0570658  hitchhiker  0.00000155612 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1419  50S ribosomal protein L1  45.71 
 
 		 233 aa  187  9e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560035  normal  0.451837 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3870  ribosomal protein L1  44.08 
 
 		 237 aa  187  9e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0316  50S ribosomal protein L1  45.71 
 
 		 230 aa  187  9e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.246243  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4482  50S ribosomal protein L1  45.41 
 
 		 234 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0567176  decreased coverage  0.0000000000000063048 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0274  50S ribosomal protein L1  45.41 
 
 		 234 aa  187  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000655427  normal  0.0476273 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1702  50S ribosomal protein L1  40.65 
 
 		 232 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.311882  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4556  50S ribosomal protein L1  45.41 
 
 		 234 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.103924  decreased coverage  0.00000000000032652 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0336  50S ribosomal protein L1  40.65 
 
 		 232 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28407  normal  0.840151 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4479  50S ribosomal protein L1  45.41 
 
 		 234 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0614276  hitchhiker  0.00155442 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4392  50S ribosomal protein L1  45.41 
 
 		 234 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168999  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0350  50S ribosomal protein L1  40.65 
 
 		 232 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.81183  normal  0.731209 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4360  50S ribosomal protein L1  45.41 
 
 		 234 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0197515  normal  0.388445 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1928  ribosomal protein L1  44.98 
 
 		 232 aa  187  1e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0450124  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0975  50S ribosomal protein L1  44.02 
 
 		 232 aa  186  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0199586 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0275  50S ribosomal protein L1  43.54 
 
 		 232 aa  186  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000501108  hitchhiker  0.000549627 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0633  50S ribosomal protein L1  42.45 
 
 		 237 aa  186  2e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.238472  normal  0.846201 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0066  50S ribosomal protein L1  45.24 
 
 		 226 aa  186  2e-46  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1589  50S ribosomal protein L1  43 
 
 		 234 aa  186  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1058  50S ribosomal protein L1  42.51 
 
 		 233 aa  186  3e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.30711  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2957  50S ribosomal protein L1  40.95 
 
 		 231 aa  186  3e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0502013 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2362  50S ribosomal protein L1  43 
 
 		 234 aa  186  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.193513  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2224  50S ribosomal protein L1  43.48 
 
 		 234 aa  186  3e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.009605 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1820  50S ribosomal protein L1  46.46 
 
 		 231 aa  186  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.186672  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1373  50S ribosomal protein L1  43.44 
 
 		 242 aa  186  3e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00191675  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2274  50S ribosomal protein L1  43 
 
 		 234 aa  186  3e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>