More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0465 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_0465  50S ribosomal protein L1P  100 
 
 		 222 aa  433  1e-121  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.464703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1655  50S ribosomal protein L1P  82.88 
 
 		 222 aa  380  1e-105  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1601  50S ribosomal protein L1P  78.38 
 
 		 222 aa  358  3e-98  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.670719  normal  0.978998 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1833  50S ribosomal protein L1P  81.08 
 
 		 222 aa  338  5e-92  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.927774 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1928  50S ribosomal protein L1P  52.45 
 
 		 216 aa  208  4e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0223  50S ribosomal protein L1P  51.98 
 
 		 225 aa  187  1e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.449707  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0189  50S ribosomal protein L1P  43.81 
 
 		 213 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1421  50S ribosomal protein L1P  39.42 
 
 		 212 aa  161  6e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0862  ribosomal protein L1  44.39 
 
 		 213 aa  160  2e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1581  50S ribosomal protein L1P  38.57 
 
 		 213 aa  159  4e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000241017  hitchhiker  0.00650077 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0656  50S ribosomal protein L1P  36.97 
 
 		 215 aa  156  2e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000420977  normal  0.316109 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0413  50S ribosomal protein L1P  37.62 
 
 		 213 aa  154  9e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0692285  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1273  50S ribosomal protein L1P  38.89 
 
 		 213 aa  149  4e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1413  50S ribosomal protein L1P  37.2 
 
 		 213 aa  148  7e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1263  50S ribosomal protein L1P  36.23 
 
 		 213 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.968535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0693  50S ribosomal protein L1P  36.23 
 
 		 213 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0163  50S ribosomal protein L1P  36.59 
 
 		 214 aa  145  6e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.636993 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2251  50S ribosomal protein L1P  34.91 
 
 		 214 aa  144  1e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00000243616  normal  0.144507 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1316  ribosomal protein L1  37.8 
 
 		 218 aa  139  3e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.685162  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1946  50S ribosomal protein L1P  34.13 
 
 		 213 aa  133  3e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0223976  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0382  50S ribosomal protein L1  34.95 
 
 		 220 aa  133  3e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.929915 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0614  50S ribosomal protein L1P  36.14 
 
 		 213 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0481513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1635  50S ribosomal protein L1P  33.49 
 
 		 218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0573324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2186  50S ribosomal protein L1P  36.1 
 
 		 212 aa  125  7e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2535  50S ribosomal protein L1P  36.45 
 
 		 212 aa  122  5e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.305257  normal  0.182251 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0254  50S ribosomal protein L1P  37.56 
 
 		 212 aa  120  9.999999999999999e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1517  ribosomal protein L1  32.85 
 
 		 210 aa  106  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3518  ribosomal protein L1  32.85 
 
 		 210 aa  104  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0613577  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0744  50S ribosomal protein L1  34.01 
 
 		 233 aa  86.7  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00583178 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0350  50S ribosomal protein L1  30.88 
 
 		 232 aa  85.9  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.81183  normal  0.731209 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1702  50S ribosomal protein L1  30.88 
 
 		 232 aa  85.9  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.311882  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0336  50S ribosomal protein L1  30.88 
 
 		 232 aa  85.9  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28407  normal  0.840151 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3691  50S ribosomal protein L1  30.81 
 
 		 229 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1324  ribosomal protein L1  33.33 
 
 		 242 aa  84  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1344  50S ribosomal protein L1  31.47 
 
 		 231 aa  84  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0377064  normal  0.0460128 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3865  50S ribosomal protein L1  30.96 
 
 		 231 aa  82.8  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.100026 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0261  50S ribosomal protein L1  31.31 
 
 		 232 aa  82.4  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3471  50S ribosomal protein L1  29.44 
 
 		 230 aa  82  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2545  50S ribosomal protein L1  30.39 
 
 		 232 aa  82  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0230  50S ribosomal protein L1  31.31 
 
 		 232 aa  81.6  0.000000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.365606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2278  50S ribosomal protein L1  30.81 
 
 		 229 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.360769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3200  50S ribosomal protein L1  29.95 
 
 		 229 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2179  ribosomal protein L1  31.79 
 
 		 231 aa  80.5  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.965533 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0316  50S ribosomal protein L1  31.98 
 
 		 230 aa  79.7  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.246243  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0487  50S ribosomal protein L1  31.98 
 
 		 230 aa  79.7  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0570658  hitchhiker  0.00000155612 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0388  ribosomal protein L1  33.67 
 
 		 241 aa  79  0.00000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28359  predicted protein  27.04 
 
 		 229 aa  77.8  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.45008  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0212  50S ribosomal protein L1  30.88 
 
 		 231 aa  77.8  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0231088  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2334  ribosomal protein L1  29.95 
 
 		 231 aa  77.4  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000592022  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2723  ribosomal protein L1  29.74 
 
 		 233 aa  77  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2224  50S ribosomal protein L1  29.72 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.009605 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0525  50S ribosomal protein L1  29.46 
 
 		 233 aa  75.9  0.0000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.546526  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0564  50S ribosomal protein L1  28.96 
 
 		 232 aa  76.3  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0506  50S ribosomal protein L1  29.46 
 
 		 233 aa  75.9  0.0000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.0000000000000573906  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1459  50S ribosomal protein L1  29.46 
 
 		 233 aa  75.9  0.0000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000386293  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0709  50S ribosomal protein L1  30.15 
 
 		 232 aa  75.9  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.146158  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0868  ribosomal protein L1  30.26 
 
 		 231 aa  75.5  0.0000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1589  50S ribosomal protein L1  29.72 
 
 		 234 aa  75.9  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4772  50S ribosomal protein L1  29.49 
 
 		 232 aa  75.5  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0687152  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2726  ribosomal protein L1  30.46 
 
 		 233 aa  75.5  0.0000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181132  normal  0.31349 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2471  50S ribosomal protein L1  28.92 
 
 		 231 aa  75.5  0.0000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000180886  hitchhiker  0.00777473 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0846  50S ribosomal protein L1  30.56 
 
 		 235 aa  75.5  0.0000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000865088  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4354  ribosomal protein L1  29.85 
 
 		 236 aa  75.1  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1865  50S ribosomal protein L1  28.93 
 
 		 232 aa  75.1  0.0000000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000283442  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0350  50S ribosomal protein L1  30.46 
 
 		 230 aa  75.1  0.0000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0156912  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0324  50S ribosomal protein L1  28.93 
 
 		 232 aa  75.1  0.0000000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0128196  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0205  50S ribosomal protein L1  27.69 
 
 		 235 aa  75.1  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1321  50S ribosomal protein L1  29.23 
 
 		 233 aa  75.1  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.18039 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02321  50S ribosomal protein L1  27.18 
 
 		 235 aa  74.3  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0643  50S ribosomal protein L1  30.46 
 
 		 232 aa  74.3  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0857628  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2274  50S ribosomal protein L1  29.25 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2362  50S ribosomal protein L1  29.25 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.193513  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1820  50S ribosomal protein L1  28.21 
 
 		 231 aa  74.3  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.186672  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1419  50S ribosomal protein L1  29.23 
 
 		 233 aa  74.7  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560035  normal  0.451837 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02231  50S ribosomal protein L1  27.69 
 
 		 235 aa  74.3  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0975  50S ribosomal protein L1  29.74 
 
 		 232 aa  73.9  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0199586 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2165  50S ribosomal protein L1P  31.98 
 
 		 230 aa  73.9  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1822  50S ribosomal protein L1  30.05 
 
 		 232 aa  73.9  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.122687  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4286  50S ribosomal protein L1  31.96 
 
 		 233 aa  73.9  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000185505  hitchhiker  0.000000513776 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02211  50S ribosomal protein L1  27.69 
 
 		 235 aa  73.2  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0384  50S ribosomal protein L1  31 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0359  50S ribosomal protein L1  31 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00693  ribosomal protein L1  31.31 
 
 		 282 aa  73.2  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000527661  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0480  50S ribosomal protein L1  29.13 
 
 		 233 aa  72.8  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.841279  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3037  50S ribosomal protein L1  30 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0489009 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0923  50S ribosomal protein L1  29.13 
 
 		 233 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0595  50S ribosomal protein L1  29.65 
 
 		 233 aa  72.8  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00100936  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0170  50S ribosomal protein L1  30.1 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000255215  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3160  ribosomal protein L1  30.94 
 
 		 238 aa  72.8  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.496068  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2993  50S ribosomal protein L1  29.23 
 
 		 235 aa  72.4  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4679  50S ribosomal protein L1  27.14 
 
 		 235 aa  72  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000682303  decreased coverage  0.0030741 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27781  50S ribosomal protein L1  27.69 
 
 		 244 aa  72.4  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1058  50S ribosomal protein L1  29.63 
 
 		 233 aa  72  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.30711  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0616  50S ribosomal protein L1  30.39 
 
 		 234 aa  72  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000217065 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2866  50S ribosomal protein L1  29.9 
 
 		 234 aa  71.6  0.000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0395  50S ribosomal protein L1P  29.41 
 
 		 231 aa  71.6  0.000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.780238  hitchhiker  0.00704539 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1633  50S ribosomal protein L1  31.12 
 
 		 235 aa  71.6  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.858056  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2957  50S ribosomal protein L1  27.92 
 
 		 231 aa  71.6  0.000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0502013 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1805  50S ribosomal protein L1P  27.41 
 
 		 232 aa  71.6  0.000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.163663 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00228  50S ribosomal protein L1  30 
 
 		 233 aa  71.6  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>