More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0480 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0480  50S ribosomal protein L1  100 
 
 		 233 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.841279  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0465  50S ribosomal protein L1  96.57 
 
 		 233 aa  458  9.999999999999999e-129  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00222885  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0643  50S ribosomal protein L1  77.39 
 
 		 232 aa  370  1e-102  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0857628  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0846  50S ribosomal protein L1  73.48 
 
 		 235 aa  357  8e-98  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000865088  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0358  50S ribosomal protein L1  65.93 
 
 		 236 aa  307  1.0000000000000001e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.235543  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2471  50S ribosomal protein L1  64.16 
 
 		 231 aa  300  2e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000180886  hitchhiker  0.00777473 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1530  50S ribosomal protein L1  65.16 
 
 		 230 aa  296  2e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000127232  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2723  ribosomal protein L1  60.53 
 
 		 233 aa  288  6e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0275  50S ribosomal protein L1  58.7 
 
 		 232 aa  286  2e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000501108  hitchhiker  0.000549627 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0182  LSU ribosomal protein L1P  57.08 
 
 		 233 aa  280  2e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000240107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1928  ribosomal protein L1  61.9 
 
 		 232 aa  278  3e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0450124  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0212  50S ribosomal protein L1  56.71 
 
 		 231 aa  277  1e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0231088  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2721  50S ribosomal protein L1  61.16 
 
 		 231 aa  275  4e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127574  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01060  ribosomal protein L1  59.73 
 
 		 235 aa  275  5e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.745230000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0616  50S ribosomal protein L1  57.39 
 
 		 234 aa  273  1.0000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000217065 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1475  50S ribosomal protein L1  53.88 
 
 		 237 aa  273  1.0000000000000001e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0729357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0301  50S ribosomal protein L1  56.6 
 
 		 242 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000226656  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2866  50S ribosomal protein L1  56.52 
 
 		 234 aa  272  3e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0309  50S ribosomal protein L1  59.28 
 
 		 230 aa  272  3e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0170319  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1373  50S ribosomal protein L1  55.65 
 
 		 242 aa  271  5.000000000000001e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00191675  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0856  50S ribosomal protein L1  63.39 
 
 		 230 aa  271  6e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000185888  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1336  50S ribosomal protein L1  56.52 
 
 		 233 aa  271  6e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.167533  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2657  50S ribosomal protein L1P  56.25 
 
 		 235 aa  270  1e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.106941  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3692  ribosomal protein L1  56.58 
 
 		 230 aa  270  1e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000151678  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0670  50S ribosomal protein L1  55.36 
 
 		 233 aa  270  1e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.759589  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1510  ribosomal protein L1  56.65 
 
 		 235 aa  269  2e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000430301  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1058  50S ribosomal protein L1  57.39 
 
 		 233 aa  268  5.9999999999999995e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.30711  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3338  50S ribosomal protein L1  56.64 
 
 		 233 aa  266  2e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000142685 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0923  50S ribosomal protein L1  56.64 
 
 		 233 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1822  ribosomal protein L1  54.59 
 
 		 242 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1146  ribosomal protein L1  56.64 
 
 		 236 aa  266  2.9999999999999995e-70  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000284572  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0691  50S ribosomal protein L1  57.39 
 
 		 233 aa  265  4e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.4447699999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0388  ribosomal protein L1  53.95 
 
 		 241 aa  265  5e-70  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0095  50S ribosomal protein L1  60 
 
 		 233 aa  265  5e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1589  50S ribosomal protein L1  61.11 
 
 		 234 aa  264  8.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2362  50S ribosomal protein L1  60.65 
 
 		 234 aa  263  1e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.193513  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2274  50S ribosomal protein L1  60.65 
 
 		 234 aa  263  1e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1324  ribosomal protein L1  54.02 
 
 		 242 aa  261  6e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752665  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0099  50S ribosomal protein L1  59.57 
 
 		 233 aa  261  8.999999999999999e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000132548  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2224  50S ribosomal protein L1  58.8 
 
 		 234 aa  260  1e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.009605 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2725  50S ribosomal protein L1  58.41 
 
 		 229 aa  260  2e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000462552  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2411  50S ribosomal protein L1  58.41 
 
 		 229 aa  260  2e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000512351  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2345  ribosomal protein L1  55.36 
 
 		 233 aa  259  2e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0238114  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0357  50S ribosomal protein L1  55.65 
 
 		 230 aa  259  2e-68  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000538139 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2957  50S ribosomal protein L1  56.64 
 
 		 231 aa  258  7e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0502013 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0204  ribosomal protein L1  58.26 
 
 		 229 aa  257  1e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000198509  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1173  ribosomal protein L1  55.31 
 
 		 235 aa  256  2e-67  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000649528  unclonable  0.0000000262625 
 
 
-
 
NC_002620  TC0592  50S ribosomal protein L1  51.95 
 
 		 232 aa  256  3e-67  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0784244  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4354  ribosomal protein L1  53.57 
 
 		 236 aa  255  3e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0179  50S ribosomal protein L1  52.61 
 
 		 231 aa  255  5e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000606052  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1822  50S ribosomal protein L1  53.48 
 
 		 232 aa  254  6e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.122687  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2283  50S ribosomal protein L1  53.48 
 
 		 229 aa  254  7e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00159003  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5111  ribosomal protein L1  53.33 
 
 		 225 aa  254  8e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.253072  normal  0.533351 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4679  50S ribosomal protein L1  53.48 
 
 		 235 aa  253  1.0000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000682303  decreased coverage  0.0030741 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2165  50S ribosomal protein L1P  53.85 
 
 		 230 aa  253  1.0000000000000001e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0577  ribosomal protein L1  51.77 
 
 		 236 aa  253  2.0000000000000002e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0677262  hitchhiker  0.00322479 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3037  50S ribosomal protein L1  53.04 
 
 		 231 aa  252  4.0000000000000004e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0489009 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3317  50S ribosomal protein L1  52.61 
 
 		 231 aa  251  8.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.809364  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2970  50S ribosomal protein L1  52.61 
 
 		 231 aa  251  8.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0446  50S ribosomal protein L1  53.25 
 
 		 233 aa  251  9.000000000000001e-66  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0241504  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1105  ribosomal protein L1  51.5 
 
 		 236 aa  250  1e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0193805  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2675  ribosomal protein L1  51.77 
 
 		 238 aa  249  3e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1624  50S ribosomal protein L1  52.17 
 
 		 230 aa  249  3e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0354  50S ribosomal protein L1  53.54 
 
 		 229 aa  248  4e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000103528  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0255  50S ribosomal protein L1  51.71 
 
 		 241 aa  249  4e-65  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000222102  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0309  50S ribosomal protein L1  52.19 
 
 		 253 aa  248  4e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000338213  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29860  LSU ribosomal protein L1P  51.77 
 
 		 238 aa  248  7e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl608  50S ribosomal protein L1  53.95 
 
 		 227 aa  248  7e-65  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1236  50S ribosomal protein L1  53.54 
 
 		 235 aa  247  9e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.988417  normal  0.475189 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0303  50S ribosomal protein L1  52.61 
 
 		 232 aa  247  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.13038  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3160  ribosomal protein L1  51.33 
 
 		 238 aa  247  1e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.496068  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2564  50S ribosomal protein L1  54.35 
 
 		 232 aa  246  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0511824 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2726  ribosomal protein L1  54.35 
 
 		 233 aa  246  2e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181132  normal  0.31349 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0883  50S ribosomal protein L1  51.29 
 
 		 237 aa  246  2e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.184517  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1489  ribosomal protein L1  54.95 
 
 		 226 aa  246  2e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0841065  normal  0.34693 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3655  50S ribosomal protein L1  51.5 
 
 		 232 aa  246  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0381514  hitchhiker  0.000000879291 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5963  50S ribosomal protein L1  52.23 
 
 		 236 aa  246  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1418  50S ribosomal protein L1P  50.44 
 
 		 230 aa  245  3e-64  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000214693  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0407  50S ribosomal protein L1  56.19 
 
 		 230 aa  245  4e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.3464e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0350  50S ribosomal protein L1  52.65 
 
 		 230 aa  245  4.9999999999999997e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0156912  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0316  50S ribosomal protein L1  53.04 
 
 		 230 aa  245  4.9999999999999997e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.246243  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0487  50S ribosomal protein L1  53.04 
 
 		 230 aa  245  4.9999999999999997e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0570658  hitchhiker  0.00000155612 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1911  50S ribosomal protein L1  52.36 
 
 		 232 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00000000299291  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2644  50S ribosomal protein L1  52.36 
 
 		 232 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0687921  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3789  50S ribosomal protein L1  52.36 
 
 		 232 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.042669  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3819  50S ribosomal protein L1  52.36 
 
 		 232 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3079  50S ribosomal protein L1  52.36 
 
 		 232 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.22613  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3757  50S ribosomal protein L1  52.36 
 
 		 232 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0092623  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3466  50S ribosomal protein L1  52.36 
 
 		 232 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0147067  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3181  50S ribosomal protein L1  52.36 
 
 		 232 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000145836  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0098  50S ribosomal protein L1  55.22 
 
 		 230 aa  244  9e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000678721  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0098  50S ribosomal protein L1  55.22 
 
 		 230 aa  244  9e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000382446  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0094  50S ribosomal protein L1  55.22 
 
 		 230 aa  244  9e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.15488e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0092  50S ribosomal protein L1  55.22 
 
 		 230 aa  244  9e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000339498  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0098  50S ribosomal protein L1  55.22 
 
 		 230 aa  244  9e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000205875  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0109  50S ribosomal protein L1  55.22 
 
 		 230 aa  244  9e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9844e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0128  50S ribosomal protein L1  55.22 
 
 		 230 aa  244  9e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000143327  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0093  50S ribosomal protein L1  55.65 
 
 		 230 aa  243  9.999999999999999e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000014838  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3436  50S ribosomal protein L1  51.93 
 
 		 232 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3200  50S ribosomal protein L1  53.98 
 
 		 229 aa  243  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.935977 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>