More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1633 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1633  50S ribosomal protein L1  100 
 
 		 235 aa  468  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.858056  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2993  50S ribosomal protein L1  84.26 
 
 		 235 aa  402  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1452  50S ribosomal protein L1  80.43 
 
 		 235 aa  372  1e-102  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0442  50S ribosomal protein L1  80.85 
 
 		 235 aa  366  1e-100  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2075  ribosomal protein L1  64.53 
 
 		 234 aa  305  4.0000000000000004e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2784  ribosomal protein L1  59.74 
 
 		 234 aa  293  1e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0008683  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1546  ribosomal protein L1  58.37 
 
 		 234 aa  286  2e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.826154 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2866  50S ribosomal protein L1  58.7 
 
 		 234 aa  281  6.000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0616  50S ribosomal protein L1  58.37 
 
 		 234 aa  281  6.000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000217065 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1058  50S ribosomal protein L1  57.64 
 
 		 233 aa  275  4e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.30711  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3338  50S ribosomal protein L1  55.46 
 
 		 233 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000142685 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2471  50S ribosomal protein L1  56.89 
 
 		 231 aa  273  2.0000000000000002e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000180886  hitchhiker  0.00777473 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1336  50S ribosomal protein L1  57.64 
 
 		 233 aa  272  3e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.167533  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0699  ribosomal protein L1  56.09 
 
 		 234 aa  272  4.0000000000000004e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0241249  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4019  ribosomal protein L1  60.09 
 
 		 235 aa  271  6e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.534035 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0923  50S ribosomal protein L1  55.02 
 
 		 233 aa  271  8.000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0670  50S ribosomal protein L1  57.64 
 
 		 233 aa  270  1e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.759589  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1173  ribosomal protein L1  55.56 
 
 		 235 aa  269  2e-71  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000649528  unclonable  0.0000000262625 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0275  50S ribosomal protein L1  56.09 
 
 		 232 aa  268  4e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000501108  hitchhiker  0.000549627 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0212  50S ribosomal protein L1  54.94 
 
 		 231 aa  268  5.9999999999999995e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0231088  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0691  50S ribosomal protein L1  55.65 
 
 		 233 aa  265  5.999999999999999e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.4447699999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2545  50S ribosomal protein L1  59.29 
 
 		 232 aa  264  8.999999999999999e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1928  ribosomal protein L1  60.89 
 
 		 232 aa  264  1e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0450124  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1702  50S ribosomal protein L1  57.89 
 
 		 232 aa  262  4e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.311882  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0350  50S ribosomal protein L1  57.89 
 
 		 232 aa  262  4e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.81183  normal  0.731209 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0336  50S ribosomal protein L1  57.89 
 
 		 232 aa  262  4e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28407  normal  0.840151 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2723  ribosomal protein L1  55.56 
 
 		 233 aa  259  3e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3691  50S ribosomal protein L1  56.56 
 
 		 229 aa  258  4e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2362  50S ribosomal protein L1  55.14 
 
 		 234 aa  258  7e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.193513  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2274  50S ribosomal protein L1  55.14 
 
 		 234 aa  258  7e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1589  50S ribosomal protein L1  55.14 
 
 		 234 aa  258  7e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2278  50S ribosomal protein L1  56.11 
 
 		 229 aa  258  7e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.360769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01060  ribosomal protein L1  53.07 
 
 		 235 aa  256  1e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.745230000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3471  50S ribosomal protein L1  54.75 
 
 		 230 aa  256  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2726  ribosomal protein L1  55.46 
 
 		 233 aa  256  2e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181132  normal  0.31349 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1530  50S ribosomal protein L1  52.91 
 
 		 230 aa  255  5e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000127232  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3870  ribosomal protein L1  54.59 
 
 		 237 aa  254  7e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2224  50S ribosomal protein L1  54.42 
 
 		 234 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.009605 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3200  50S ribosomal protein L1  55.2 
 
 		 229 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0182  LSU ribosomal protein L1P  54.02 
 
 		 233 aa  253  2.0000000000000002e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000240107  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0179  50S ribosomal protein L1  52.17 
 
 		 231 aa  252  4.0000000000000004e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000606052  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2851  50S ribosomal protein L1  53.78 
 
 		 232 aa  250  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441128  normal  0.418553 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1805  50S ribosomal protein L1P  52.86 
 
 		 232 aa  250  1e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.163663 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2283  50S ribosomal protein L1  54.22 
 
 		 229 aa  250  1e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00159003  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3865  50S ribosomal protein L1  56 
 
 		 231 aa  249  2e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.100026 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0350  50S ribosomal protein L1  54.91 
 
 		 230 aa  248  5e-65  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0156912  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0388  ribosomal protein L1  52.19 
 
 		 241 aa  248  5e-65  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0575  50S ribosomal protein L1  51.3 
 
 		 230 aa  247  1e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000352195  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0561  50S ribosomal protein L1  51.3 
 
 		 230 aa  247  1e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000069455  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1344  50S ribosomal protein L1  55.46 
 
 		 231 aa  246  2e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0377064  normal  0.0460128 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0261  50S ribosomal protein L1  54.46 
 
 		 232 aa  246  2e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1822  50S ribosomal protein L1  55.11 
 
 		 232 aa  246  3e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.122687  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0577  ribosomal protein L1  52.99 
 
 		 236 aa  245  4e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0677262  hitchhiker  0.00322479 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1896  50S ribosomal protein L1  55.46 
 
 		 235 aa  245  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0132214  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0350  ribosomal protein L1  50.67 
 
 		 234 aa  244  6e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0695995  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0316  50S ribosomal protein L1  52.44 
 
 		 232 aa  245  6e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00176824  normal  0.225661 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2770  50S ribosomal protein L1  52.44 
 
 		 232 aa  245  6e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0337  50S ribosomal protein L1  52.44 
 
 		 232 aa  245  6e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29393  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0744  50S ribosomal protein L1  55.31 
 
 		 233 aa  244  6.999999999999999e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00583178 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3655  50S ribosomal protein L1  51.53 
 
 		 232 aa  244  9e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0381514  hitchhiker  0.000000879291 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1820  50S ribosomal protein L1  52.84 
 
 		 231 aa  244  9.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.186672  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2657  50S ribosomal protein L1P  54.26 
 
 		 235 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.106941  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0564  50S ribosomal protein L1  52.21 
 
 		 232 aa  243  9.999999999999999e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1373  50S ribosomal protein L1  51.29 
 
 		 242 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00191675  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3436  50S ribosomal protein L1  52 
 
 		 232 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0303  50S ribosomal protein L1  52.44 
 
 		 232 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.13038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0365  50S ribosomal protein L1  54.59 
 
 		 235 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.716572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0446  50S ribosomal protein L1  49.78 
 
 		 233 aa  243  3e-63  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0241504  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2564  50S ribosomal protein L1  50.66 
 
 		 232 aa  242  3e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0511824 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0357  50S ribosomal protein L1  51.56 
 
 		 230 aa  242  3e-63  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000538139 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0265  50S ribosomal protein L1  52 
 
 		 232 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.516489  normal  0.64831 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4679  50S ribosomal protein L1  52.38 
 
 		 235 aa  242  3.9999999999999997e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000682303  decreased coverage  0.0030741 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0256  50S ribosomal protein L1  52 
 
 		 232 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0257763  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2685  ribosomal protein L1  52.65 
 
 		 229 aa  242  3.9999999999999997e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0114395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4328  50S ribosomal protein L1  53.22 
 
 		 238 aa  242  3.9999999999999997e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3160  ribosomal protein L1  51.72 
 
 		 238 aa  242  5e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.496068  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1236  50S ribosomal protein L1  53.85 
 
 		 235 aa  241  5e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.988417  normal  0.475189 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2675  ribosomal protein L1  50.85 
 
 		 238 aa  241  7e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2957  50S ribosomal protein L1  50.9 
 
 		 231 aa  241  7e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0502013 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1321  50S ribosomal protein L1  53.33 
 
 		 233 aa  241  7.999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.18039 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0238  50S ribosomal protein L1  51.11 
 
 		 232 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.629603  normal  0.0137855 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3757  50S ribosomal protein L1  51.56 
 
 		 232 aa  241  9e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0092623  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2644  50S ribosomal protein L1  51.56 
 
 		 232 aa  241  9e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0687921  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3789  50S ribosomal protein L1  51.56 
 
 		 232 aa  241  9e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.042669  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1911  50S ribosomal protein L1  51.56 
 
 		 232 aa  241  9e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00000000299291  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3079  50S ribosomal protein L1  51.56 
 
 		 232 aa  241  9e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.22613  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3181  50S ribosomal protein L1  51.56 
 
 		 232 aa  241  9e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000145836  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3819  50S ribosomal protein L1  51.56 
 
 		 232 aa  241  9e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3466  50S ribosomal protein L1  51.56 
 
 		 232 aa  241  9e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0147067  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0975  50S ribosomal protein L1  52.44 
 
 		 232 aa  240  1e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0199586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4480  ribosomal protein L1  50.67 
 
 		 232 aa  240  1e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0192233  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0525  50S ribosomal protein L1  48.91 
 
 		 233 aa  239  2e-62  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.546526  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1459  50S ribosomal protein L1  48.91 
 
 		 233 aa  239  2e-62  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000386293  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0506  50S ribosomal protein L1  48.91 
 
 		 233 aa  239  2e-62  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.0000000000000573906  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29860  LSU ribosomal protein L1P  51.07 
 
 		 238 aa  240  2e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0316  50S ribosomal protein L1  50.91 
 
 		 229 aa  239  2e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000103871  hitchhiker  0.000950319 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0193  50S ribosomal protein L1  54.55 
 
 		 229 aa  239  2.9999999999999997e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000225522  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0856  50S ribosomal protein L1  52.19 
 
 		 230 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000185888  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3452  50S ribosomal protein L1  49.78 
 
 		 232 aa  239  4e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00102084  normal  0.0363138 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1419  50S ribosomal protein L1  53.39 
 
 		 233 aa  239  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560035  normal  0.451837 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>