More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1413 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1413  50S ribosomal protein L1P  100 
 
 		 213 aa  431  1e-120  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0693  50S ribosomal protein L1P  96.24 
 
 		 213 aa  419  1e-116  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1263  50S ribosomal protein L1P  96.24 
 
 		 213 aa  419  1e-116  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.968535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1273  50S ribosomal protein L1P  89.67 
 
 		 213 aa  392  1e-108  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0189  50S ribosomal protein L1P  76.53 
 
 		 213 aa  315  2e-85  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0656  50S ribosomal protein L1P  44.71 
 
 		 215 aa  198  5e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000420977  normal  0.316109 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0862  ribosomal protein L1  46.89 
 
 		 213 aa  198  6e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1421  50S ribosomal protein L1P  43.69 
 
 		 212 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0163  50S ribosomal protein L1P  41.15 
 
 		 214 aa  182  3e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.636993 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2251  50S ribosomal protein L1P  40 
 
 		 214 aa  177  8e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00000243616  normal  0.144507 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0413  50S ribosomal protein L1P  42.38 
 
 		 213 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0692285  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0614  50S ribosomal protein L1P  41.15 
 
 		 213 aa  169  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0481513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2186  50S ribosomal protein L1P  41.71 
 
 		 212 aa  168  5e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1946  50S ribosomal protein L1P  40.1 
 
 		 213 aa  167  8e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0223976  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1581  50S ribosomal protein L1P  38.68 
 
 		 213 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000241017  hitchhiker  0.00650077 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0254  50S ribosomal protein L1P  38.86 
 
 		 212 aa  150  1e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0223  50S ribosomal protein L1P  44.78 
 
 		 225 aa  150  1e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.449707  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1655  50S ribosomal protein L1P  39.61 
 
 		 222 aa  150  2e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1928  50S ribosomal protein L1P  38.54 
 
 		 216 aa  148  5e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0465  50S ribosomal protein L1P  37.2 
 
 		 222 aa  148  6e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.464703  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2535  50S ribosomal protein L1P  38.05 
 
 		 212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.305257  normal  0.182251 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1601  50S ribosomal protein L1P  37.68 
 
 		 222 aa  146  3e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.670719  normal  0.978998 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1517  ribosomal protein L1  36.97 
 
 		 210 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1316  ribosomal protein L1  39.09 
 
 		 218 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.685162  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0382  50S ribosomal protein L1  39.67 
 
 		 220 aa  137  1e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.929915 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3518  ribosomal protein L1  36.02 
 
 		 210 aa  137  1e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0613577  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1635  50S ribosomal protein L1P  36.06 
 
 		 218 aa  126  2.0000000000000002e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0573324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1833  50S ribosomal protein L1P  37.68 
 
 		 222 aa  123  2e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.927774 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2274  50S ribosomal protein L1  37.02 
 
 		 234 aa  85.5  5e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2362  50S ribosomal protein L1  37.02 
 
 		 234 aa  85.5  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.193513  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2224  50S ribosomal protein L1  36.06 
 
 		 234 aa  84  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.009605 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1589  50S ribosomal protein L1  36.54 
 
 		 234 aa  84  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2726  ribosomal protein L1  30.81 
 
 		 233 aa  82.8  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181132  normal  0.31349 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0846  50S ribosomal protein L1  32.11 
 
 		 235 aa  80.1  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000865088  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1324  ribosomal protein L1  32.2 
 
 		 242 aa  80.1  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752665  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2970  50S ribosomal protein L1  32.57 
 
 		 231 aa  79.3  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0303  50S ribosomal protein L1  33.48 
 
 		 232 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.13038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3655  50S ribosomal protein L1  33.48 
 
 		 232 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0381514  hitchhiker  0.000000879291 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3317  50S ribosomal protein L1  32.57 
 
 		 231 aa  79.3  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.809364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3865  50S ribosomal protein L1  31.58 
 
 		 231 aa  78.6  0.00000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.100026 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0395  50S ribosomal protein L1P  31.5 
 
 		 231 aa  77.4  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.780238  hitchhiker  0.00704539 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3436  50S ribosomal protein L1  32.59 
 
 		 232 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14587  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3037  50S ribosomal protein L1  33.18 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0489009 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01060  ribosomal protein L1  33 
 
 		 235 aa  77.4  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.745230000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1805  50S ribosomal protein L1P  31.63 
 
 		 232 aa  77  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.163663 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0043  50S ribosomal protein L1  35.32 
 
 		 233 aa  77  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000236116  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0480  50S ribosomal protein L1  30.89 
 
 		 233 aa  76.3  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.841279  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0316  50S ribosomal protein L1  32.29 
 
 		 232 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00176824  normal  0.225661 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2770  50S ribosomal protein L1  32.29 
 
 		 232 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0337  50S ribosomal protein L1  32.29 
 
 		 232 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29393  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0744  50S ribosomal protein L1  31.55 
 
 		 233 aa  76.3  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00583178 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00693  ribosomal protein L1  31.5 
 
 		 282 aa  76.3  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000527661  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1763  50S ribosomal protein L1  30.46 
 
 		 238 aa  76.3  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00323247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2851  50S ribosomal protein L1  32.74 
 
 		 232 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441128  normal  0.418553 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0238  50S ribosomal protein L1  32.59 
 
 		 232 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.629603  normal  0.0137855 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0256  50S ribosomal protein L1  33.18 
 
 		 232 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0257763  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0265  50S ribosomal protein L1  33.18 
 
 		 232 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.516489  normal  0.64831 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3471  50S ribosomal protein L1  32.14 
 
 		 230 aa  75.1  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0633  50S ribosomal protein L1  30.41 
 
 		 237 aa  75.1  0.0000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.238472  normal  0.846201 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2869  50S ribosomal protein L1  30.85 
 
 		 234 aa  74.7  0.0000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000234009  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0868  ribosomal protein L1  31.94 
 
 		 231 aa  74.3  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02211  50S ribosomal protein L1  30.33 
 
 		 234 aa  74.7  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.54632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3757  50S ribosomal protein L1  33 
 
 		 232 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0092623  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2644  50S ribosomal protein L1  33 
 
 		 232 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0687921  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1489  ribosomal protein L1  31.28 
 
 		 226 aa  74.3  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0841065  normal  0.34693 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3789  50S ribosomal protein L1  33 
 
 		 232 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.042669  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3819  50S ribosomal protein L1  33 
 
 		 232 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1739  50S ribosomal protein L1  29.95 
 
 		 238 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3079  50S ribosomal protein L1  33 
 
 		 232 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.22613  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1911  50S ribosomal protein L1  33 
 
 		 232 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00000000299291  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3181  50S ribosomal protein L1  33 
 
 		 232 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000145836  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3466  50S ribosomal protein L1  33 
 
 		 232 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0147067  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0756  50S ribosomal protein L1  32.56 
 
 		 230 aa  73.9  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2471  50S ribosomal protein L1  35.53 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000180886  hitchhiker  0.00777473 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4679  50S ribosomal protein L1  31.8 
 
 		 235 aa  73.9  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000682303  decreased coverage  0.0030741 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0595  50S ribosomal protein L1  31 
 
 		 233 aa  73.6  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00100936  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0465  50S ribosomal protein L1  31.87 
 
 		 233 aa  73.9  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00222885  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00228  50S ribosomal protein L1  30 
 
 		 233 aa  73.2  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0577  ribosomal protein L1  29.63 
 
 		 236 aa  73.2  0.000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0677262  hitchhiker  0.00322479 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3691  50S ribosomal protein L1  30.23 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002170  LSU ribosomal protein L1p (L10Ae)  30 
 
 		 233 aa  73.2  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000179792  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0309  50S ribosomal protein L1  31.25 
 
 		 253 aa  73.2  0.000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000338213  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27781  50S ribosomal protein L1  30.96 
 
 		 244 aa  73.2  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0575  50S ribosomal protein L1  31.19 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000352195  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1820  50S ribosomal protein L1  29.91 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.186672  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0039  50S ribosomal protein L1  33.95 
 
 		 233 aa  72.8  0.000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00138059  hitchhiker  0.00000000000807787 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1822  50S ribosomal protein L1  30.96 
 
 		 232 aa  72.4  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.122687  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2564  50S ribosomal protein L1  31.36 
 
 		 232 aa  72.4  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0511824 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0561  50S ribosomal protein L1  31.19 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000069455  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0357  50S ribosomal protein L1  33.49 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000538139 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0166  50S ribosomal protein L1  29.29 
 
 		 220 aa  72  0.000000000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2957  50S ribosomal protein L1  31.94 
 
 		 231 aa  72  0.000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0502013 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0975  50S ribosomal protein L1  30.77 
 
 		 232 aa  72  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0199586 
 
 
-
 
NC_004310  BR1247  50S ribosomal protein L1  31.6 
 
 		 233 aa  71.6  0.000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.123881  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1208  50S ribosomal protein L1  31.6 
 
 		 233 aa  71.6  0.000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4286  50S ribosomal protein L1  32.66 
 
 		 233 aa  71.6  0.000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000185505  hitchhiker  0.000000513776 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3348  50S ribosomal protein L1  33.49 
 
 		 232 aa  71.6  0.000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.728506  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2553  50S ribosomal protein L1  30.34 
 
 		 238 aa  71.6  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000296242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04533  50S ribosomal protein L1  33.94 
 
 		 232 aa  71.6  0.000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192671  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0336  50S ribosomal protein L1  29.44 
 
 		 232 aa  71.6  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28407  normal  0.840151 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>