More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0633 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0633  50S ribosomal protein L1  100 
 
 		 237 aa  476  1e-133  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.238472  normal  0.846201 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2553  50S ribosomal protein L1  83.97 
 
 		 238 aa  407  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000296242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4012  50S ribosomal protein L1  84.19 
 
 		 237 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0669177  hitchhiker  0.0000000454495 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1039  50S ribosomal protein L1  81.43 
 
 		 238 aa  397  1e-109  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0123648  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0264  50S ribosomal protein L1  81.43 
 
 		 238 aa  388  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0248875  normal  0.0562332 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1019  50S ribosomal protein L1  78.15 
 
 		 238 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00726287 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1739  50S ribosomal protein L1  79.75 
 
 		 238 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1763  50S ribosomal protein L1  79.75 
 
 		 238 aa  386  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00323247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2470  50S ribosomal protein L1  74.78 
 
 		 235 aa  367  1e-101  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.538849  normal  0.0799081 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02211  50S ribosomal protein L1  74.24 
 
 		 234 aa  363  2e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.54632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27781  50S ribosomal protein L1  73.04 
 
 		 244 aa  359  3e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02321  50S ribosomal protein L1  67.97 
 
 		 235 aa  344  7e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1570  50S ribosomal protein L1  68.83 
 
 		 235 aa  342  4e-93  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02791  50S ribosomal protein L1  68.83 
 
 		 235 aa  342  4e-93  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.475982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02231  50S ribosomal protein L1  67.1 
 
 		 235 aa  340  9e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0205  50S ribosomal protein L1  66.67 
 
 		 235 aa  339  2e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02211  50S ribosomal protein L1  66.23 
 
 		 235 aa  337  8e-92  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2155  50S ribosomal protein L1  72.05 
 
 		 235 aa  321  5e-87  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.243526  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_12802  Plastid ribosomal protein L1 large ribosomal subunit  65.84 
 
 		 209 aa  258  4e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.397521  normal  0.194456 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2723  ribosomal protein L1  55.16 
 
 		 233 aa  256  2e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01060  ribosomal protein L1  52.61 
 
 		 235 aa  253  2.0000000000000002e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.745230000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0182  LSU ribosomal protein L1P  54.05 
 
 		 233 aa  249  3e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000240107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1173  ribosomal protein L1  56.6 
 
 		 235 aa  247  1e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000649528  unclonable  0.0000000262625 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0388  ribosomal protein L1  54.46 
 
 		 241 aa  246  3e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1489  ribosomal protein L1  51.33 
 
 		 226 aa  244  6e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0841065  normal  0.34693 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2471  50S ribosomal protein L1  53.25 
 
 		 231 aa  244  9.999999999999999e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000180886  hitchhiker  0.00777473 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1475  50S ribosomal protein L1  51.9 
 
 		 237 aa  243  3e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0729357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2345  ribosomal protein L1  53.66 
 
 		 233 aa  241  9e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0238114  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2362  50S ribosomal protein L1  55.98 
 
 		 234 aa  239  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.193513  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2274  50S ribosomal protein L1  55.98 
 
 		 234 aa  239  2e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1510  ribosomal protein L1  51.5 
 
 		 235 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000430301  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1373  50S ribosomal protein L1  50.64 
 
 		 242 aa  238  5.999999999999999e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00191675  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1589  50S ribosomal protein L1  55.14 
 
 		 234 aa  237  9e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2165  50S ribosomal protein L1P  53.3 
 
 		 230 aa  237  1e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0912  ribosomal protein L1  52.56 
 
 		 237 aa  237  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.911951  normal  0.174852 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0846  50S ribosomal protein L1  50.88 
 
 		 235 aa  232  3e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000865088  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2657  50S ribosomal protein L1P  51.64 
 
 		 235 aa  232  5e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.106941  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0575  50S ribosomal protein L1  47.37 
 
 		 230 aa  231  6e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000352195  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0561  50S ribosomal protein L1  47.37 
 
 		 230 aa  231  6e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000069455  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5111  ribosomal protein L1  50 
 
 		 225 aa  231  8.000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.253072  normal  0.533351 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3691  50S ribosomal protein L1  48.2 
 
 		 229 aa  230  1e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0506  50S ribosomal protein L1  45.89 
 
 		 233 aa  229  2e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.0000000000000573906  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0525  50S ribosomal protein L1  45.89 
 
 		 233 aa  229  2e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.546526  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0522  ribosomal protein L1  48.67 
 
 		 235 aa  229  2e-59  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1459  50S ribosomal protein L1  45.89 
 
 		 233 aa  229  2e-59  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000386293  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0350  ribosomal protein L1  47.44 
 
 		 234 aa  229  2e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0695995  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0275  50S ribosomal protein L1  49.56 
 
 		 232 aa  229  3e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000501108  hitchhiker  0.000549627 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0975  50S ribosomal protein L1  48.88 
 
 		 232 aa  229  3e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0199586 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0179  50S ribosomal protein L1  46.49 
 
 		 231 aa  229  4e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000606052  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3471  50S ribosomal protein L1  47.35 
 
 		 230 aa  229  4e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409515  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2685  ribosomal protein L1  49.78 
 
 		 229 aa  228  4e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0114395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1822  ribosomal protein L1  50.21 
 
 		 242 aa  229  4e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1822  50S ribosomal protein L1  47.58 
 
 		 232 aa  228  5e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.122687  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2993  50S ribosomal protein L1  53.27 
 
 		 235 aa  228  7e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4679  50S ribosomal protein L1  49.78 
 
 		 235 aa  228  7e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000682303  decreased coverage  0.0030741 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1666  50S ribosomal protein L1  48.48 
 
 		 233 aa  228  7e-59  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0783627  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2224  50S ribosomal protein L1  52.45 
 
 		 234 aa  228  8e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.009605 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1633  50S ribosomal protein L1  50.45 
 
 		 235 aa  227  9e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.858056  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1324  ribosomal protein L1  48.89 
 
 		 242 aa  227  1e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752665  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1530  50S ribosomal protein L1  48.68 
 
 		 230 aa  227  2e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000127232  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0446  50S ribosomal protein L1  46.75 
 
 		 233 aa  227  2e-58  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0241504  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1058  50S ribosomal protein L1  47.53 
 
 		 233 aa  226  2e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.30711  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0212  50S ribosomal protein L1  48.43 
 
 		 231 aa  226  3e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0231088  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1928  ribosomal protein L1  53.36 
 
 		 232 aa  226  3e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0450124  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2957  50S ribosomal protein L1  48.44 
 
 		 231 aa  226  3e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0502013 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1702  50S ribosomal protein L1  50.25 
 
 		 232 aa  225  4e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.311882  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0350  50S ribosomal protein L1  50.25 
 
 		 232 aa  225  4e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.81183  normal  0.731209 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0336  50S ribosomal protein L1  50.25 
 
 		 232 aa  225  4e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28407  normal  0.840151 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1419  50S ribosomal protein L1  48.87 
 
 		 233 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560035  normal  0.451837 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5963  50S ribosomal protein L1  51.16 
 
 		 236 aa  225  5.0000000000000005e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09650  LSU ribosomal protein L1P  51.09 
 
 		 238 aa  225  5.0000000000000005e-58  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.284817  hitchhiker  0.000232644 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0643  50S ribosomal protein L1  49.55 
 
 		 232 aa  225  5.0000000000000005e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0857628  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1321  50S ribosomal protein L1  47.56 
 
 		 233 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.18039 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3200  50S ribosomal protein L1  46.26 
 
 		 229 aa  224  9e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1820  50S ribosomal protein L1  47.53 
 
 		 231 aa  224  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.186672  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4354  ribosomal protein L1  49.34 
 
 		 236 aa  224  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0350  50S ribosomal protein L1  45.22 
 
 		 230 aa  223  1e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0156912  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0204  ribosomal protein L1  50.22 
 
 		 229 aa  224  1e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000198509  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0744  50S ribosomal protein L1  50.74 
 
 		 233 aa  224  1e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00583178 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0883  50S ribosomal protein L1  49.06 
 
 		 237 aa  223  2e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.184517  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23970  LSU ribosomal protein L1P  50.93 
 
 		 239 aa  223  2e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0702955  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0616  50S ribosomal protein L1  48.67 
 
 		 234 aa  223  2e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000217065 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2278  50S ribosomal protein L1  46.85 
 
 		 229 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.360769  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3338  50S ribosomal protein L1  48.43 
 
 		 233 aa  223  2e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000142685 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0670  50S ribosomal protein L1  48.21 
 
 		 233 aa  223  2e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.759589  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2726  ribosomal protein L1  46.64 
 
 		 233 aa  223  2e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181132  normal  0.31349 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0923  50S ribosomal protein L1  48.43 
 
 		 233 aa  223  3e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0577  ribosomal protein L1  51.22 
 
 		 236 aa  222  4.9999999999999996e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0677262  hitchhiker  0.00322479 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2866  50S ribosomal protein L1  48.02 
 
 		 234 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2545  50S ribosomal protein L1  50.25 
 
 		 232 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2564  50S ribosomal protein L1  50.25 
 
 		 232 aa  220  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0511824 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0407  50S ribosomal protein L1  50.89 
 
 		 230 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.3464e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3692  ribosomal protein L1  51.38 
 
 		 230 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000151678  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1236  50S ribosomal protein L1  49.57 
 
 		 235 aa  220  9.999999999999999e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.988417  normal  0.475189 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1209  ribosomal protein L1  48.9 
 
 		 231 aa  220  1.9999999999999999e-56  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000136712 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2851  50S ribosomal protein L1  48.88 
 
 		 232 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441128  normal  0.418553 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0395  50S ribosomal protein L1P  47.98 
 
 		 231 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.780238  hitchhiker  0.00704539 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0303  50S ribosomal protein L1  48.46 
 
 		 232 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.13038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0697  50S ribosomal protein L1P  47.73 
 
 		 259 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0265  50S ribosomal protein L1  49.78 
 
 		 232 aa  219  3e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.516489  normal  0.64831 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>