More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1570 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1570  50S ribosomal protein L1  100 
 
 		 235 aa  476  1e-133  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02791  50S ribosomal protein L1  100 
 
 		 235 aa  476  1e-133  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.475982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02321  50S ribosomal protein L1  79.49 
 
 		 235 aa  397  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27781  50S ribosomal protein L1  79.49 
 
 		 244 aa  397  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2470  50S ribosomal protein L1  78.97 
 
 		 235 aa  396  1e-109  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.538849  normal  0.0799081 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02211  50S ribosomal protein L1  78.63 
 
 		 234 aa  391  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.54632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02231  50S ribosomal protein L1  78.21 
 
 		 235 aa  391  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0205  50S ribosomal protein L1  77.78 
 
 		 235 aa  389  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02211  50S ribosomal protein L1  77.35 
 
 		 235 aa  388  1e-107  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2155  50S ribosomal protein L1  76.92 
 
 		 235 aa  360  1e-98  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.243526  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4012  50S ribosomal protein L1  67.24 
 
 		 237 aa  346  2e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0669177  hitchhiker  0.0000000454495 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1039  50S ribosomal protein L1  67.97 
 
 		 238 aa  343  2e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0123648  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0633  50S ribosomal protein L1  68.83 
 
 		 237 aa  342  4e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.238472  normal  0.846201 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2553  50S ribosomal protein L1  67.1 
 
 		 238 aa  338  5.9999999999999996e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000296242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1019  50S ribosomal protein L1  65.52 
 
 		 238 aa  337  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00726287 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1739  50S ribosomal protein L1  66.81 
 
 		 238 aa  337  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1763  50S ribosomal protein L1  66.81 
 
 		 238 aa  337  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00323247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0264  50S ribosomal protein L1  68.83 
 
 		 238 aa  322  4e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0248875  normal  0.0562332 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1373  50S ribosomal protein L1  53.36 
 
 		 242 aa  258  5.0000000000000005e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00191675  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1822  50S ribosomal protein L1  52.4 
 
 		 232 aa  256  2e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.122687  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0388  ribosomal protein L1  52.83 
 
 		 241 aa  255  5e-67  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1822  ribosomal protein L1  54.27 
 
 		 242 aa  249  2e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_12802  Plastid ribosomal protein L1 large ribosomal subunit  63.37 
 
 		 209 aa  249  3e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.397521  normal  0.194456 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1475  50S ribosomal protein L1  52.12 
 
 		 237 aa  247  1e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0729357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2723  ribosomal protein L1  52 
 
 		 233 aa  246  2e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0179  50S ribosomal protein L1  50.87 
 
 		 231 aa  244  6e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000606052  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2278  50S ribosomal protein L1  51.8 
 
 		 229 aa  244  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.360769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1805  50S ribosomal protein L1P  52 
 
 		 232 aa  244  9e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.163663 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3200  50S ribosomal protein L1  50.66 
 
 		 229 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1489  ribosomal protein L1  56.46 
 
 		 226 aa  244  9.999999999999999e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0841065  normal  0.34693 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3691  50S ribosomal protein L1  51.35 
 
 		 229 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2726  ribosomal protein L1  52.4 
 
 		 233 aa  243  1.9999999999999999e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181132  normal  0.31349 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1344  50S ribosomal protein L1  51.56 
 
 		 231 aa  242  3e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0377064  normal  0.0460128 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01060  ribosomal protein L1  49.14 
 
 		 235 aa  241  7.999999999999999e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.745230000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1173  ribosomal protein L1  49.79 
 
 		 235 aa  241  7.999999999999999e-63  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000649528  unclonable  0.0000000262625 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2957  50S ribosomal protein L1  50.22 
 
 		 231 aa  241  9e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0502013 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1510  ribosomal protein L1  51.5 
 
 		 235 aa  239  2e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000430301  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3865  50S ribosomal protein L1  51.11 
 
 		 231 aa  239  2e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.100026 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0561  50S ribosomal protein L1  51.56 
 
 		 230 aa  239  2.9999999999999997e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000069455  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0975  50S ribosomal protein L1  49.78 
 
 		 232 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0199586 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0575  50S ribosomal protein L1  51.56 
 
 		 230 aa  239  2.9999999999999997e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000352195  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1820  50S ribosomal protein L1  50.67 
 
 		 231 aa  239  2.9999999999999997e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.186672  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0744  50S ribosomal protein L1  48.07 
 
 		 233 aa  239  2.9999999999999997e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00583178 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1321  50S ribosomal protein L1  53.11 
 
 		 233 aa  238  5e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.18039 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3471  50S ribosomal protein L1  53.85 
 
 		 230 aa  238  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2471  50S ribosomal protein L1  51.6 
 
 		 231 aa  237  9e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000180886  hitchhiker  0.00777473 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2274  50S ribosomal protein L1  54.03 
 
 		 234 aa  236  2e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1589  50S ribosomal protein L1  54.03 
 
 		 234 aa  236  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2362  50S ribosomal protein L1  54.03 
 
 		 234 aa  236  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.193513  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2345  ribosomal protein L1  53.17 
 
 		 233 aa  236  2e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0238114  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1419  50S ribosomal protein L1  53.66 
 
 		 233 aa  236  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560035  normal  0.451837 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2866  50S ribosomal protein L1  51.3 
 
 		 234 aa  235  4e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0182  LSU ribosomal protein L1P  50.68 
 
 		 233 aa  235  4e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000240107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0261  50S ribosomal protein L1  51.23 
 
 		 232 aa  235  5.0000000000000005e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0446  50S ribosomal protein L1  48.05 
 
 		 233 aa  234  6e-61  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0241504  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0212  50S ribosomal protein L1  51.56 
 
 		 231 aa  234  7e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0231088  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0564  50S ribosomal protein L1  48.67 
 
 		 232 aa  234  1.0000000000000001e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1530  50S ribosomal protein L1  52.58 
 
 		 230 aa  233  1.0000000000000001e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000127232  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2851  50S ribosomal protein L1  49.33 
 
 		 232 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441128  normal  0.418553 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1666  50S ribosomal protein L1  47.64 
 
 		 233 aa  233  2.0000000000000002e-60  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0783627  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0522  ribosomal protein L1  48.89 
 
 		 235 aa  233  2.0000000000000002e-60  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0230  50S ribosomal protein L1  51.23 
 
 		 232 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.365606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0275  50S ribosomal protein L1  50.87 
 
 		 232 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000501108  hitchhiker  0.000549627 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09650  LSU ribosomal protein L1P  52.89 
 
 		 238 aa  232  3e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.284817  hitchhiker  0.000232644 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1955  50S ribosomal protein L1  52 
 
 		 230 aa  233  3e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.923861  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4679  50S ribosomal protein L1  49.15 
 
 		 235 aa  233  3e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000682303  decreased coverage  0.0030741 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2224  50S ribosomal protein L1  52.13 
 
 		 234 aa  232  3e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.009605 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3819  50S ribosomal protein L1  48.91 
 
 		 232 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1911  50S ribosomal protein L1  48.91 
 
 		 232 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00000000299291  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0525  50S ribosomal protein L1  45.92 
 
 		 233 aa  232  4.0000000000000004e-60  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.546526  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2644  50S ribosomal protein L1  48.91 
 
 		 232 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0687921  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3789  50S ribosomal protein L1  48.91 
 
 		 232 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.042669  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0616  50S ribosomal protein L1  50.87 
 
 		 234 aa  232  4.0000000000000004e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000217065 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3757  50S ribosomal protein L1  48.91 
 
 		 232 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0092623  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3079  50S ribosomal protein L1  48.91 
 
 		 232 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.22613  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0506  50S ribosomal protein L1  45.92 
 
 		 233 aa  232  4.0000000000000004e-60  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.0000000000000573906  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3466  50S ribosomal protein L1  48.91 
 
 		 232 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0147067  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1459  50S ribosomal protein L1  45.92 
 
 		 233 aa  232  4.0000000000000004e-60  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000386293  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3181  50S ribosomal protein L1  48.91 
 
 		 232 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000145836  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2721  50S ribosomal protein L1  54.85 
 
 		 231 aa  231  6e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127574  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2685  ribosomal protein L1  49.56 
 
 		 229 aa  231  6e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0114395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3436  50S ribosomal protein L1  48.91 
 
 		 232 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0350  ribosomal protein L1  47.41 
 
 		 234 aa  231  8.000000000000001e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0695995  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3037  50S ribosomal protein L1  49.33 
 
 		 231 aa  230  1e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0489009 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3655  50S ribosomal protein L1  48.44 
 
 		 232 aa  230  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0381514  hitchhiker  0.000000879291 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0303  50S ribosomal protein L1  48.03 
 
 		 232 aa  230  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.13038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2770  50S ribosomal protein L1  49.33 
 
 		 232 aa  230  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0337  50S ribosomal protein L1  49.33 
 
 		 232 aa  230  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29393  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0316  50S ribosomal protein L1  49.33 
 
 		 232 aa  230  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00176824  normal  0.225661 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0256  50S ribosomal protein L1  48.89 
 
 		 232 aa  229  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0257763  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0265  50S ribosomal protein L1  48.89 
 
 		 232 aa  229  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.516489  normal  0.64831 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2564  50S ribosomal protein L1  47.6 
 
 		 232 aa  229  3e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0511824 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0568  50S ribosomal protein L1  54.37 
 
 		 232 aa  229  3e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000788355  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3317  50S ribosomal protein L1  49.33 
 
 		 231 aa  229  4e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.809364  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2970  50S ribosomal protein L1  49.33 
 
 		 231 aa  229  4e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0238  50S ribosomal protein L1  48.44 
 
 		 232 aa  228  6e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.629603  normal  0.0137855 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0395  50S ribosomal protein L1P  46.67 
 
 		 231 aa  228  6e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.780238  hitchhiker  0.00704539 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2657  50S ribosomal protein L1P  48.15 
 
 		 235 aa  228  9e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.106941  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2545  50S ribosomal protein L1  49.01 
 
 		 232 aa  227  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2283  50S ribosomal protein L1  50.67 
 
 		 229 aa  227  1e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00159003  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>