More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1489 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_1489  ribosomal protein L1  100 
 
 		 226 aa  446  1.0000000000000001e-124  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0841065  normal  0.34693 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2471  50S ribosomal protein L1  57.27 
 
 		 231 aa  272  4.0000000000000004e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000180886  hitchhiker  0.00777473 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2723  ribosomal protein L1  52.89 
 
 		 233 aa  266  2e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1173  ribosomal protein L1  55.81 
 
 		 235 aa  265  4e-70  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000649528  unclonable  0.0000000262625 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1510  ribosomal protein L1  55.66 
 
 		 235 aa  261  4.999999999999999e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000430301  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0275  50S ribosomal protein L1  54.67 
 
 		 232 aa  260  8.999999999999999e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000501108  hitchhiker  0.000549627 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2345  ribosomal protein L1  56.82 
 
 		 233 aa  260  1e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0238114  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1373  50S ribosomal protein L1  56.39 
 
 		 242 aa  259  3e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00191675  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0691  50S ribosomal protein L1  57.67 
 
 		 233 aa  258  6e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.4447699999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0212  50S ribosomal protein L1  54.02 
 
 		 231 aa  256  1e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0231088  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01060  ribosomal protein L1  54.91 
 
 		 235 aa  256  3e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.745230000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09650  LSU ribosomal protein L1P  58.04 
 
 		 238 aa  254  9e-67  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.284817  hitchhiker  0.000232644 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2657  50S ribosomal protein L1P  53.46 
 
 		 235 aa  253  1.0000000000000001e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.106941  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0357  50S ribosomal protein L1  53.18 
 
 		 230 aa  253  1.0000000000000001e-66  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000538139 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1805  50S ribosomal protein L1P  54.5 
 
 		 232 aa  253  2.0000000000000002e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.163663 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27781  50S ribosomal protein L1  55.86 
 
 		 244 aa  252  4.0000000000000004e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2470  50S ribosomal protein L1  58.94 
 
 		 235 aa  252  4.0000000000000004e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.538849  normal  0.0799081 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2362  50S ribosomal protein L1  57.82 
 
 		 234 aa  250  1e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.193513  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2274  50S ribosomal protein L1  57.82 
 
 		 234 aa  250  1e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2165  50S ribosomal protein L1P  50.68 
 
 		 230 aa  250  2e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0388  ribosomal protein L1  52.56 
 
 		 241 aa  249  2e-65  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3691  50S ribosomal protein L1  54.5 
 
 		 229 aa  248  5e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2957  50S ribosomal protein L1  54.09 
 
 		 231 aa  248  6e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0502013 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1589  50S ribosomal protein L1  56.87 
 
 		 234 aa  248  7e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0182  LSU ribosomal protein L1P  51.56 
 
 		 233 aa  247  1e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000240107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2993  50S ribosomal protein L1  53.12 
 
 		 235 aa  247  1e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1822  50S ribosomal protein L1  52.25 
 
 		 232 aa  247  1e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.122687  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0975  50S ribosomal protein L1  52.25 
 
 		 232 aa  246  1e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0199586 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0204  ribosomal protein L1  55.11 
 
 		 229 aa  247  1e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000198509  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4354  ribosomal protein L1  51.54 
 
 		 236 aa  246  2e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0480  50S ribosomal protein L1  54.95 
 
 		 233 aa  246  2e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.841279  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1019  50S ribosomal protein L1  50.88 
 
 		 238 aa  246  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00726287 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0577  ribosomal protein L1  52.19 
 
 		 236 aa  246  2e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0677262  hitchhiker  0.00322479 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2726  ribosomal protein L1  54.02 
 
 		 233 aa  246  2e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181132  normal  0.31349 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0923  50S ribosomal protein L1  54.95 
 
 		 233 aa  246  2e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3338  50S ribosomal protein L1  54.95 
 
 		 233 aa  246  3e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000142685 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3865  50S ribosomal protein L1  54.5 
 
 		 231 aa  246  3e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.100026 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4679  50S ribosomal protein L1  52.44 
 
 		 235 aa  246  3e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000682303  decreased coverage  0.0030741 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1928  ribosomal protein L1  56.25 
 
 		 232 aa  246  3e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0450124  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1530  50S ribosomal protein L1  52.04 
 
 		 230 aa  245  4e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000127232  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0261  50S ribosomal protein L1  54.3 
 
 		 232 aa  245  4e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2545  50S ribosomal protein L1  54.5 
 
 		 232 aa  245  4e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02211  50S ribosomal protein L1  53.15 
 
 		 234 aa  245  4e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.54632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08710  LSU ribosomal protein L1P  57.87 
 
 		 236 aa  245  4.9999999999999997e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.190625  hitchhiker  0.000000021546 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1739  50S ribosomal protein L1  50.44 
 
 		 238 aa  244  6e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1702  50S ribosomal protein L1  54.05 
 
 		 232 aa  244  6e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.311882  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0633  50S ribosomal protein L1  51.33 
 
 		 237 aa  244  6e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.238472  normal  0.846201 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0350  50S ribosomal protein L1  54.05 
 
 		 232 aa  244  6e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.81183  normal  0.731209 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0336  50S ribosomal protein L1  54.05 
 
 		 232 aa  244  6e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28407  normal  0.840151 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0912  ribosomal protein L1  52.09 
 
 		 237 aa  244  6.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.911951  normal  0.174852 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1763  50S ribosomal protein L1  50.44 
 
 		 238 aa  244  6.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00323247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1955  50S ribosomal protein L1  58.18 
 
 		 230 aa  244  6.999999999999999e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.923861  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2866  50S ribosomal protein L1  54.75 
 
 		 234 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0179  50S ribosomal protein L1  51.36 
 
 		 231 aa  244  9.999999999999999e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000606052  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02791  50S ribosomal protein L1  56.46 
 
 		 235 aa  244  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.475982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1570  50S ribosomal protein L1  56.46 
 
 		 235 aa  244  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0407  50S ribosomal protein L1  55.41 
 
 		 230 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.3464e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2278  50S ribosomal protein L1  52.7 
 
 		 229 aa  243  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.360769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3200  50S ribosomal protein L1  51.77 
 
 		 229 aa  243  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02321  50S ribosomal protein L1  52.65 
 
 		 235 aa  243  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0643  50S ribosomal protein L1  53.15 
 
 		 232 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0857628  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0230  50S ribosomal protein L1  54.5 
 
 		 232 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.365606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2851  50S ribosomal protein L1  50.9 
 
 		 232 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441128  normal  0.418553 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0465  50S ribosomal protein L1  53.6 
 
 		 233 aa  242  3e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00222885  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1058  50S ribosomal protein L1  52.49 
 
 		 233 aa  242  3e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.30711  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0670  50S ribosomal protein L1  53.39 
 
 		 233 aa  242  3e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.759589  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1546  ribosomal protein L1  52.94 
 
 		 234 aa  242  3.9999999999999997e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.826154 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0616  50S ribosomal protein L1  54.3 
 
 		 234 aa  241  5e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000217065 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02211  50S ribosomal protein L1  52.21 
 
 		 235 aa  241  5e-63  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1896  50S ribosomal protein L1  54.09 
 
 		 235 aa  241  6e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0132214  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02231  50S ribosomal protein L1  52.21 
 
 		 235 aa  241  7e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2224  50S ribosomal protein L1  56.4 
 
 		 234 aa  241  7.999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.009605 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1820  50S ribosomal protein L1  51.33 
 
 		 231 aa  240  1e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.186672  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl608  50S ribosomal protein L1  52 
 
 		 227 aa  240  1e-62  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0205  50S ribosomal protein L1  52.7 
 
 		 235 aa  240  1e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3471  50S ribosomal protein L1  50.88 
 
 		 230 aa  240  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3655  50S ribosomal protein L1  49.56 
 
 		 232 aa  240  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0381514  hitchhiker  0.000000879291 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0303  50S ribosomal protein L1  50 
 
 		 232 aa  240  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.13038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4480  ribosomal protein L1  51.8 
 
 		 232 aa  240  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0192233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1236  50S ribosomal protein L1  53.49 
 
 		 235 aa  239  2e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.988417  normal  0.475189 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1336  50S ribosomal protein L1  52.27 
 
 		 233 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.167533  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0697  50S ribosomal protein L1P  50.89 
 
 		 259 aa  239  2.9999999999999997e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3160  ribosomal protein L1  51.87 
 
 		 238 aa  239  2.9999999999999997e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.496068  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2128  ribosomal protein L1  62.19 
 
 		 237 aa  239  2.9999999999999997e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.628826  normal  0.786973 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1321  50S ribosomal protein L1  52.73 
 
 		 233 aa  238  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.18039 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0846  50S ribosomal protein L1  50.89 
 
 		 235 aa  238  4e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000865088  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2685  ribosomal protein L1  51.13 
 
 		 229 aa  238  4e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0114395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0744  50S ribosomal protein L1  53.15 
 
 		 233 aa  238  4e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00583178 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5111  ribosomal protein L1  52.56 
 
 		 225 aa  238  5e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.253072  normal  0.533351 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29860  LSU ribosomal protein L1P  50.88 
 
 		 238 aa  238  5e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1324  ribosomal protein L1  49.54 
 
 		 242 aa  238  5e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5963  50S ribosomal protein L1  53.02 
 
 		 236 aa  238  6.999999999999999e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0564  50S ribosomal protein L1  52.04 
 
 		 232 aa  238  6.999999999999999e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3436  50S ribosomal protein L1  50 
 
 		 232 aa  238  8e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3870  ribosomal protein L1  50.9 
 
 		 237 aa  238  8e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1344  50S ribosomal protein L1  52.7 
 
 		 231 aa  238  8e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0377064  normal  0.0460128 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0365  50S ribosomal protein L1  52.73 
 
 		 235 aa  237  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.716572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4019  ribosomal protein L1  50.9 
 
 		 235 aa  237  1e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.534035 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0256  50S ribosomal protein L1  49.55 
 
 		 232 aa  237  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0257763  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4012  50S ribosomal protein L1  53.66 
 
 		 237 aa  236  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0669177  hitchhiker  0.0000000454495 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>