More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_01060 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_01060  ribosomal protein L1  100 
 
 		 235 aa  468  1.0000000000000001e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.745230000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2471  50S ribosomal protein L1  67.83 
 
 		 231 aa  331  5e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000180886  hitchhiker  0.00777473 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0212  50S ribosomal protein L1  66.52 
 
 		 231 aa  322  3e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0231088  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2345  ribosomal protein L1  66.96 
 
 		 233 aa  322  3e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0238114  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0182  LSU ribosomal protein L1P  66.67 
 
 		 233 aa  320  9.000000000000001e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000240107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1928  ribosomal protein L1  68.26 
 
 		 232 aa  315  5e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0450124  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0275  50S ribosomal protein L1  64.63 
 
 		 232 aa  311  3.9999999999999997e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000501108  hitchhiker  0.000549627 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0388  ribosomal protein L1  62.39 
 
 		 241 aa  308  4e-83  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2723  ribosomal protein L1  64.63 
 
 		 233 aa  307  8e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0204  ribosomal protein L1  67.11 
 
 		 229 aa  306  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000198509  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0923  50S ribosomal protein L1  65.45 
 
 		 233 aa  303  1.0000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1530  50S ribosomal protein L1  62.95 
 
 		 230 aa  302  3.0000000000000004e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000127232  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3338  50S ribosomal protein L1  64.55 
 
 		 233 aa  301  8.000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000142685 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0357  50S ribosomal protein L1  63.72 
 
 		 230 aa  300  1e-80  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000538139 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0691  50S ribosomal protein L1  62.9 
 
 		 233 aa  293  1e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.4447699999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1373  50S ribosomal protein L1  57.14 
 
 		 242 aa  292  3e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00191675  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1324  ribosomal protein L1  56.65 
 
 		 242 aa  292  3e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1058  50S ribosomal protein L1  62.73 
 
 		 233 aa  291  4e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.30711  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0407  50S ribosomal protein L1  64.19 
 
 		 230 aa  291  6e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.3464e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1336  50S ribosomal protein L1  61.78 
 
 		 233 aa  291  6e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.167533  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0309  50S ribosomal protein L1  61.88 
 
 		 253 aa  290  1e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000338213  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1173  ribosomal protein L1  57.08 
 
 		 235 aa  289  2e-77  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000649528  unclonable  0.0000000262625 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0670  50S ribosomal protein L1  60.44 
 
 		 233 aa  289  2e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.759589  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0179  50S ribosomal protein L1  59.91 
 
 		 231 aa  288  3e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000606052  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2721  50S ribosomal protein L1  63.56 
 
 		 231 aa  289  3e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127574  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2866  50S ribosomal protein L1  59.56 
 
 		 234 aa  288  7e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0616  50S ribosomal protein L1  59.11 
 
 		 234 aa  286  2e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000217065 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2725  50S ribosomal protein L1  64.91 
 
 		 229 aa  286  2e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000462552  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2411  50S ribosomal protein L1  64.91 
 
 		 229 aa  286  2e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000512351  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0309  50S ribosomal protein L1  62.33 
 
 		 230 aa  285  2.9999999999999996e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0170319  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2362  50S ribosomal protein L1  64.93 
 
 		 234 aa  284  8e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.193513  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2274  50S ribosomal protein L1  64.93 
 
 		 234 aa  284  8e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0561  50S ribosomal protein L1  59.11 
 
 		 230 aa  283  1.0000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000069455  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0575  50S ribosomal protein L1  59.11 
 
 		 230 aa  283  1.0000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000352195  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1546  ribosomal protein L1  57.96 
 
 		 234 aa  284  1.0000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.826154 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2657  50S ribosomal protein L1P  57.33 
 
 		 235 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.106941  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3936  50S ribosomal protein L1  56.89 
 
 		 238 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1589  50S ribosomal protein L1  63.98 
 
 		 234 aa  281  7.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0856  50S ribosomal protein L1  65.78 
 
 		 230 aa  280  9e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000185888  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0092  50S ribosomal protein L1  67.11 
 
 		 230 aa  280  2e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000171982  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4328  50S ribosomal protein L1  56.44 
 
 		 238 aa  279  3e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5208  50S ribosomal protein L1  67.11 
 
 		 230 aa  278  4e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140164  unclonable  7.070390000000001e-26 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2784  ribosomal protein L1  58.67 
 
 		 234 aa  278  7e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0008683  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0118  50S ribosomal protein L1  67.11 
 
 		 230 aa  277  9e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000153199  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1624  50S ribosomal protein L1  58.15 
 
 		 230 aa  276  1e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2224  50S ribosomal protein L1  60.75 
 
 		 234 aa  276  1e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.009605 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2165  50S ribosomal protein L1P  59.38 
 
 		 230 aa  277  1e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0099  50S ribosomal protein L1  66.08 
 
 		 233 aa  277  1e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000132548  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0098  50S ribosomal protein L1  66.67 
 
 		 230 aa  276  2e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000678721  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0098  50S ribosomal protein L1  66.67 
 
 		 230 aa  276  2e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000382446  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0094  50S ribosomal protein L1  66.67 
 
 		 230 aa  276  2e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.15488e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0092  50S ribosomal protein L1  66.67 
 
 		 230 aa  276  2e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000339498  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0128  50S ribosomal protein L1  66.67 
 
 		 230 aa  276  2e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000143327  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2993  50S ribosomal protein L1  57.71 
 
 		 235 aa  276  2e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0098  50S ribosomal protein L1  66.67 
 
 		 230 aa  276  2e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000205875  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0109  50S ribosomal protein L1  66.67 
 
 		 230 aa  276  2e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9844e-61 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0265  50S ribosomal protein L1  58.67 
 
 		 232 aa  276  3e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.516489  normal  0.64831 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0256  50S ribosomal protein L1  58.67 
 
 		 232 aa  276  3e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0257763  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4523  ribosomal protein L1  60.34 
 
 		 239 aa  276  3e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0095  50S ribosomal protein L1  65.2 
 
 		 233 aa  275  4e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4354  ribosomal protein L1  55.65 
 
 		 236 aa  275  4e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0480  50S ribosomal protein L1  59.73 
 
 		 233 aa  275  5e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.841279  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1236  50S ribosomal protein L1  58.15 
 
 		 235 aa  275  6e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.988417  normal  0.475189 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3655  50S ribosomal protein L1  59.11 
 
 		 232 aa  274  7e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0381514  hitchhiker  0.000000879291 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0303  50S ribosomal protein L1  59.11 
 
 		 232 aa  274  7e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.13038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2770  50S ribosomal protein L1  58.22 
 
 		 232 aa  274  7e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0316  50S ribosomal protein L1  58.22 
 
 		 232 aa  274  7e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00176824  normal  0.225661 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0337  50S ribosomal protein L1  58.22 
 
 		 232 aa  274  7e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29393  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0643  50S ribosomal protein L1  58.15 
 
 		 232 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0857628  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3471  50S ribosomal protein L1  57.08 
 
 		 230 aa  273  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0577  ribosomal protein L1  53.65 
 
 		 236 aa  273  1.0000000000000001e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0677262  hitchhiker  0.00322479 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3348  50S ribosomal protein L1  60.62 
 
 		 232 aa  273  1.0000000000000001e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.728506  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0093  50S ribosomal protein L1  66.22 
 
 		 230 aa  273  1.0000000000000001e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000014838  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3436  50S ribosomal protein L1  57.78 
 
 		 232 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0522  ribosomal protein L1  55.75 
 
 		 235 aa  273  2.0000000000000002e-72  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2283  50S ribosomal protein L1  56.89 
 
 		 229 aa  273  2.0000000000000002e-72  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00159003  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2564  50S ribosomal protein L1  57.78 
 
 		 232 aa  272  3e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0511824 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0395  50S ribosomal protein L1P  59.11 
 
 		 231 aa  272  3e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.780238  hitchhiker  0.00704539 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0465  50S ribosomal protein L1  59.29 
 
 		 233 aa  272  3e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00222885  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0238  50S ribosomal protein L1  58.22 
 
 		 232 aa  272  3e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.629603  normal  0.0137855 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2644  50S ribosomal protein L1  58.67 
 
 		 232 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0687921  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3181  50S ribosomal protein L1  58.67 
 
 		 232 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000145836  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3789  50S ribosomal protein L1  58.67 
 
 		 232 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.042669  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3079  50S ribosomal protein L1  58.67 
 
 		 232 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.22613  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3757  50S ribosomal protein L1  58.67 
 
 		 232 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0092623  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2851  50S ribosomal protein L1  57.78 
 
 		 232 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441128  normal  0.418553 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1911  50S ribosomal protein L1  58.67 
 
 		 232 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00000000299291  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3819  50S ribosomal protein L1  58.67 
 
 		 232 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3466  50S ribosomal protein L1  58.67 
 
 		 232 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0147067  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0350  ribosomal protein L1  57.27 
 
 		 234 aa  271  5.000000000000001e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0695995  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1805  50S ribosomal protein L1P  55.41 
 
 		 232 aa  270  2e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.163663 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0697  50S ribosomal protein L1P  55.26 
 
 		 259 aa  269  2e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2726  ribosomal protein L1  55.26 
 
 		 233 aa  269  2.9999999999999997e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181132  normal  0.31349 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1209  ribosomal protein L1  56.44 
 
 		 231 aa  268  5e-71  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000136712 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0846  50S ribosomal protein L1  56.58 
 
 		 235 aa  268  5.9999999999999995e-71  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000865088  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1510  ribosomal protein L1  55.22 
 
 		 235 aa  268  7e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000430301  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3692  ribosomal protein L1  59.47 
 
 		 230 aa  268  7e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000151678  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0699  ribosomal protein L1  55.75 
 
 		 234 aa  267  8.999999999999999e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0241249  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0506  50S ribosomal protein L1  53.88 
 
 		 233 aa  266  1e-70  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.0000000000000573906  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1459  50S ribosomal protein L1  53.88 
 
 		 233 aa  266  1e-70  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000386293  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>