More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2784 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2784  ribosomal protein L1  100 
 
 		 234 aa  467  1.0000000000000001e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0008683  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2075  ribosomal protein L1  65.38 
 
 		 234 aa  311  5.999999999999999e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2993  50S ribosomal protein L1  61.04 
 
 		 235 aa  302  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1546  ribosomal protein L1  60.43 
 
 		 234 aa  298  4e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.826154 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0442  50S ribosomal protein L1  64.94 
 
 		 235 aa  297  8e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1452  50S ribosomal protein L1  62.77 
 
 		 235 aa  296  2e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1633  50S ribosomal protein L1  59.74 
 
 		 235 aa  293  1e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.858056  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0670  50S ribosomal protein L1  60.7 
 
 		 233 aa  290  1e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.759589  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1336  50S ribosomal protein L1  61.57 
 
 		 233 aa  289  2e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.167533  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0212  50S ribosomal protein L1  60.44 
 
 		 231 aa  283  1.0000000000000001e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0231088  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0616  50S ribosomal protein L1  59.13 
 
 		 234 aa  281  5.000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000217065 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2471  50S ribosomal protein L1  56.89 
 
 		 231 aa  281  5.000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000180886  hitchhiker  0.00777473 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2866  50S ribosomal protein L1  58.26 
 
 		 234 aa  279  2e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1058  50S ribosomal protein L1  58.95 
 
 		 233 aa  278  5e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.30711  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4019  ribosomal protein L1  59.73 
 
 		 235 aa  278  7e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.534035 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01060  ribosomal protein L1  58.67 
 
 		 235 aa  278  7e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.745230000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0923  50S ribosomal protein L1  59.82 
 
 		 233 aa  277  1e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0699  ribosomal protein L1  55.11 
 
 		 234 aa  276  1e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0241249  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2723  ribosomal protein L1  58.22 
 
 		 233 aa  277  1e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1928  ribosomal protein L1  58.95 
 
 		 232 aa  277  1e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0450124  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3338  50S ribosomal protein L1  59.38 
 
 		 233 aa  275  4e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000142685 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1530  50S ribosomal protein L1  56.05 
 
 		 230 aa  273  2.0000000000000002e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000127232  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0275  50S ribosomal protein L1  55.65 
 
 		 232 aa  272  3e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000501108  hitchhiker  0.000549627 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0691  50S ribosomal protein L1  59.29 
 
 		 233 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.4447699999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2657  50S ribosomal protein L1P  53.88 
 
 		 235 aa  267  1e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.106941  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0099  50S ribosomal protein L1  58.95 
 
 		 233 aa  266  2e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000132548  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0179  50S ribosomal protein L1  53.48 
 
 		 231 aa  265  5.999999999999999e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000606052  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0095  50S ribosomal protein L1  58.95 
 
 		 233 aa  265  5.999999999999999e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1589  50S ribosomal protein L1  57.67 
 
 		 234 aa  264  8e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2274  50S ribosomal protein L1  57.67 
 
 		 234 aa  264  8.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2362  50S ribosomal protein L1  57.67 
 
 		 234 aa  264  8.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.193513  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2345  ribosomal protein L1  53.88 
 
 		 233 aa  263  2e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0238114  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0856  50S ribosomal protein L1  59.82 
 
 		 230 aa  260  2e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000185888  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0204  ribosomal protein L1  53.28 
 
 		 229 aa  259  2e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000198509  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0561  50S ribosomal protein L1  52.61 
 
 		 230 aa  259  3e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000069455  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0182  LSU ribosomal protein L1P  55.45 
 
 		 233 aa  259  3e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000240107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0575  50S ribosomal protein L1  52.61 
 
 		 230 aa  259  3e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000352195  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1173  ribosomal protein L1  51.3 
 
 		 235 aa  258  5.0000000000000005e-68  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000649528  unclonable  0.0000000262625 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0388  ribosomal protein L1  51.29 
 
 		 241 aa  258  7e-68  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2224  50S ribosomal protein L1  54.59 
 
 		 234 aa  256  2e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.009605 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2283  50S ribosomal protein L1  53.71 
 
 		 229 aa  255  4e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00159003  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0975  50S ribosomal protein L1  51.72 
 
 		 232 aa  253  1.0000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0199586 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1344  50S ribosomal protein L1  54.15 
 
 		 231 aa  253  2.0000000000000002e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0377064  normal  0.0460128 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3936  50S ribosomal protein L1  52.47 
 
 		 238 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3160  ribosomal protein L1  50.87 
 
 		 238 aa  253  2.0000000000000002e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.496068  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4354  ribosomal protein L1  52.19 
 
 		 236 aa  253  3e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3471  50S ribosomal protein L1  51.11 
 
 		 230 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5208  50S ribosomal protein L1  57.21 
 
 		 230 aa  251  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140164  unclonable  7.070390000000001e-26 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4679  50S ribosomal protein L1  51.49 
 
 		 235 aa  251  5.000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000682303  decreased coverage  0.0030741 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2726  ribosomal protein L1  51.97 
 
 		 233 aa  251  5.000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181132  normal  0.31349 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4328  50S ribosomal protein L1  52.91 
 
 		 238 aa  251  5.000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2675  ribosomal protein L1  49.15 
 
 		 238 aa  251  6e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0522  ribosomal protein L1  50.22 
 
 		 235 aa  251  6e-66  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1373  50S ribosomal protein L1  50.86 
 
 		 242 aa  251  8.000000000000001e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00191675  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0098  50S ribosomal protein L1  57.21 
 
 		 230 aa  250  1e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000678721  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0098  50S ribosomal protein L1  57.21 
 
 		 230 aa  250  1e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000382446  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0094  50S ribosomal protein L1  57.21 
 
 		 230 aa  250  1e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.15488e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0092  50S ribosomal protein L1  57.21 
 
 		 230 aa  250  1e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000339498  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0098  50S ribosomal protein L1  57.21 
 
 		 230 aa  250  1e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000205875  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0128  50S ribosomal protein L1  57.21 
 
 		 230 aa  250  1e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000143327  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0109  50S ribosomal protein L1  57.21 
 
 		 230 aa  250  1e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9844e-61 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0357  50S ribosomal protein L1  49.34 
 
 		 230 aa  250  1e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000538139 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1820  50S ribosomal protein L1  51.53 
 
 		 231 aa  249  2e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.186672  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0092  50S ribosomal protein L1  56.33 
 
 		 230 aa  249  3e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000171982  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0592  50S ribosomal protein L1  51.09 
 
 		 232 aa  248  4e-65  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0784244  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0118  50S ribosomal protein L1  56.77 
 
 		 230 aa  249  4e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000153199  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3865  50S ribosomal protein L1  51.97 
 
 		 231 aa  248  4e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.100026 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2721  50S ribosomal protein L1  56.7 
 
 		 231 aa  247  9e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127574  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0093  50S ribosomal protein L1  56.33 
 
 		 230 aa  247  1e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000014838  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5963  50S ribosomal protein L1  50.88 
 
 		 236 aa  247  1e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2545  50S ribosomal protein L1  53.95 
 
 		 232 aa  246  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0365  50S ribosomal protein L1  51.09 
 
 		 235 aa  246  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.716572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1419  50S ribosomal protein L1  51.56 
 
 		 233 aa  246  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560035  normal  0.451837 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0354  50S ribosomal protein L1  54.09 
 
 		 229 aa  246  2e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000103528  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1896  50S ribosomal protein L1  51.53 
 
 		 235 aa  246  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0132214  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2725  50S ribosomal protein L1  55.75 
 
 		 229 aa  246  2e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000462552  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2411  50S ribosomal protein L1  55.75 
 
 		 229 aa  246  2e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000512351  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1702  50S ribosomal protein L1  52.63 
 
 		 232 aa  246  3e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.311882  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0336  50S ribosomal protein L1  52.63 
 
 		 232 aa  246  3e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28407  normal  0.840151 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1441  50S ribosomal protein L1  54.46 
 
 		 232 aa  246  3e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0252476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1944  50S ribosomal protein L1  55.22 
 
 		 233 aa  245  3e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.160034  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0350  50S ribosomal protein L1  52.63 
 
 		 232 aa  246  3e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.81183  normal  0.731209 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3361  50S ribosomal protein L1  51.29 
 
 		 232 aa  245  4e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.235181  normal  0.159163 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2564  50S ribosomal protein L1  51.53 
 
 		 232 aa  245  4e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0511824 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1475  50S ribosomal protein L1  52.19 
 
 		 237 aa  245  4e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0729357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1321  50S ribosomal protein L1  51.11 
 
 		 233 aa  245  4.9999999999999997e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.18039 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1805  50S ribosomal protein L1P  50.88 
 
 		 232 aa  245  4.9999999999999997e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.163663 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0193  50S ribosomal protein L1  53.64 
 
 		 229 aa  245  4.9999999999999997e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000225522  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0697  50S ribosomal protein L1P  49.12 
 
 		 259 aa  244  6e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29860  LSU ribosomal protein L1P  50.22 
 
 		 238 aa  244  6.999999999999999e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1399  50S ribosomal protein L1  50.44 
 
 		 232 aa  244  6.999999999999999e-64  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1822  50S ribosomal protein L1  50.66 
 
 		 232 aa  244  6.999999999999999e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.122687  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3691  50S ribosomal protein L1  50.67 
 
 		 229 aa  244  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0643  50S ribosomal protein L1  50.43 
 
 		 232 aa  243  9.999999999999999e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0857628  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0407  50S ribosomal protein L1  51.56 
 
 		 230 aa  243  9.999999999999999e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.3464e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0309  50S ribosomal protein L1  54.26 
 
 		 230 aa  243  9.999999999999999e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0170319  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4480  ribosomal protein L1  50.22 
 
 		 232 aa  244  9.999999999999999e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0192233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2278  50S ribosomal protein L1  50.22 
 
 		 229 aa  243  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.360769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3200  50S ribosomal protein L1  49.78 
 
 		 229 aa  243  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0303  50S ribosomal protein L1  52.84 
 
 		 232 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.13038  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>