More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0365 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0365  50S ribosomal protein L1  100 
 
 		 235 aa  466  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.716572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1896  50S ribosomal protein L1  96.17 
 
 		 235 aa  427  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0132214  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0975  50S ribosomal protein L1  78.02 
 
 		 232 aa  380  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0199586 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3843  50S ribosomal protein L1  83.62 
 
 		 232 aa  378  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.528602  normal  0.697118 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1419  50S ribosomal protein L1  77.06 
 
 		 233 aa  371  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560035  normal  0.451837 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1820  50S ribosomal protein L1  76.62 
 
 		 231 aa  373  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.186672  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3865  50S ribosomal protein L1  77.92 
 
 		 231 aa  369  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.100026 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2278  50S ribosomal protein L1  76.89 
 
 		 229 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.360769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3471  50S ribosomal protein L1  76.11 
 
 		 230 aa  364  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1321  50S ribosomal protein L1  76.19 
 
 		 233 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.18039 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3200  50S ribosomal protein L1  76 
 
 		 229 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1344  50S ribosomal protein L1  76.62 
 
 		 231 aa  365  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0377064  normal  0.0460128 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3361  50S ribosomal protein L1  81.03 
 
 		 232 aa  363  1e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.235181  normal  0.159163 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4368  50S ribosomal protein L1  84.48 
 
 		 232 aa  362  3e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4480  50S ribosomal protein L1  84.05 
 
 		 232 aa  362  3e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0876536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3999  50S ribosomal protein L1  84.48 
 
 		 232 aa  362  3e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.981145 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1822  50S ribosomal protein L1  74.14 
 
 		 232 aa  362  4e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.122687  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3691  50S ribosomal protein L1  76 
 
 		 229 aa  359  2e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2726  ribosomal protein L1  75.43 
 
 		 233 aa  353  1e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181132  normal  0.31349 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2545  50S ribosomal protein L1  73.68 
 
 		 232 aa  351  4e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1528  50S ribosomal protein L1  77.88 
 
 		 230 aa  348  6e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0350  50S ribosomal protein L1  72.37 
 
 		 232 aa  346  1e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.81183  normal  0.731209 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1702  50S ribosomal protein L1  72.37 
 
 		 232 aa  346  1e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.311882  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0336  50S ribosomal protein L1  72.37 
 
 		 232 aa  346  1e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28407  normal  0.840151 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1347  50S ribosomal protein L1  76.99 
 
 		 230 aa  346  2e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5086  50S ribosomal protein L1  75.77 
 
 		 230 aa  341  5e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00155922  normal  0.872957 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1805  50S ribosomal protein L1P  68.97 
 
 		 232 aa  338  4e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.163663 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0261  50S ribosomal protein L1  71.88 
 
 		 232 aa  337  9e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1944  50S ribosomal protein L1  73.8 
 
 		 233 aa  336  1.9999999999999998e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.160034  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0744  50S ribosomal protein L1  68.67 
 
 		 233 aa  335  2.9999999999999997e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00583178 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0230  50S ribosomal protein L1  71.56 
 
 		 232 aa  335  5e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.365606  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1247  50S ribosomal protein L1  72.93 
 
 		 233 aa  333  1e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.123881  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1208  50S ribosomal protein L1  72.93 
 
 		 233 aa  333  1e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0564  50S ribosomal protein L1  68.89 
 
 		 232 aa  332  2e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2957  50S ribosomal protein L1  70.27 
 
 		 231 aa  329  2e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0502013 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0568  50S ribosomal protein L1  72.49 
 
 		 232 aa  329  2e-89  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000788355  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2564  50S ribosomal protein L1  65.95 
 
 		 232 aa  318  5e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0511824 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1955  50S ribosomal protein L1  67.11 
 
 		 230 aa  317  7.999999999999999e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.923861  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2698  50S ribosomal protein L1  67.67 
 
 		 233 aa  297  1e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1441  50S ribosomal protein L1  59.48 
 
 		 232 aa  289  3e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0252476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0834  50S ribosomal protein L1  60.87 
 
 		 233 aa  278  5e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1058  50S ribosomal protein L1  59.82 
 
 		 233 aa  277  1e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.30711  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1928  ribosomal protein L1  61.64 
 
 		 232 aa  276  2e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0450124  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2283  50S ribosomal protein L1  58.77 
 
 		 229 aa  276  2e-73  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00159003  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2866  50S ribosomal protein L1  59.31 
 
 		 234 aa  276  3e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2274  50S ribosomal protein L1  62.9 
 
 		 234 aa  276  3e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2362  50S ribosomal protein L1  62.9 
 
 		 234 aa  276  3e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.193513  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0616  50S ribosomal protein L1  60.26 
 
 		 234 aa  275  4e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000217065 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2471  50S ribosomal protein L1  57.96 
 
 		 231 aa  275  5e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000180886  hitchhiker  0.00777473 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1336  50S ribosomal protein L1  59.74 
 
 		 233 aa  275  6e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.167533  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2657  50S ribosomal protein L1P  57.94 
 
 		 235 aa  274  8e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.106941  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2993  50S ribosomal protein L1  58.95 
 
 		 235 aa  274  9e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1589  50S ribosomal protein L1  61.99 
 
 		 234 aa  274  9e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0670  50S ribosomal protein L1  59.83 
 
 		 233 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.759589  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4434  50S ribosomal protein L1  67.53 
 
 		 229 aa  273  2.0000000000000002e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0923  50S ribosomal protein L1  58.41 
 
 		 233 aa  272  4.0000000000000004e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3338  50S ribosomal protein L1  58.85 
 
 		 233 aa  271  8.000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000142685 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0691  50S ribosomal protein L1  59.47 
 
 		 233 aa  270  1e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.4447699999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1546  ribosomal protein L1  56.77 
 
 		 234 aa  268  5e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.826154 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0525  50S ribosomal protein L1  55.22 
 
 		 233 aa  268  7e-71  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.546526  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1459  50S ribosomal protein L1  55.22 
 
 		 233 aa  268  7e-71  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000386293  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0506  50S ribosomal protein L1  55.22 
 
 		 233 aa  268  7e-71  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.0000000000000573906  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0179  50S ribosomal protein L1  55.7 
 
 		 231 aa  267  8.999999999999999e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000606052  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01060  ribosomal protein L1  55.75 
 
 		 235 aa  266  2.9999999999999995e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.745230000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2723  ribosomal protein L1  55.75 
 
 		 233 aa  265  2.9999999999999995e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1530  50S ribosomal protein L1  57.71 
 
 		 230 aa  266  2.9999999999999995e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000127232  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2345  ribosomal protein L1  53.25 
 
 		 233 aa  265  5e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0238114  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0357  50S ribosomal protein L1  54.59 
 
 		 230 aa  264  7e-70  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000538139 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0575  50S ribosomal protein L1  54.82 
 
 		 230 aa  264  1e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000352195  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0561  50S ribosomal protein L1  54.82 
 
 		 230 aa  264  1e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000069455  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0350  50S ribosomal protein L1  58.18 
 
 		 230 aa  263  2e-69  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0156912  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4354  ribosomal protein L1  56.83 
 
 		 236 aa  263  2e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0204  ribosomal protein L1  58.08 
 
 		 229 aa  261  6.999999999999999e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000198509  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0350  ribosomal protein L1  55.26 
 
 		 234 aa  261  8e-69  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0695995  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2334  ribosomal protein L1  53.71 
 
 		 231 aa  261  8.999999999999999e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000592022  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2224  50S ribosomal protein L1  57.53 
 
 		 234 aa  261  8.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.009605 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1236  50S ribosomal protein L1  56.39 
 
 		 235 aa  260  1e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.988417  normal  0.475189 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0446  50S ribosomal protein L1  53.91 
 
 		 233 aa  260  1e-68  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0241504  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1519  50S ribosomal protein L1  60.26 
 
 		 229 aa  259  2e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00056705  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0275  50S ribosomal protein L1  55.22 
 
 		 232 aa  259  2e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000501108  hitchhiker  0.000549627 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3870  ribosomal protein L1  55.27 
 
 		 237 aa  260  2e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0837  50S ribosomal protein L1P  59.39 
 
 		 229 aa  260  2e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0423664  normal  0.0981496 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0395  50S ribosomal protein L1P  56.28 
 
 		 231 aa  258  5.0000000000000005e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.780238  hitchhiker  0.00704539 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1797  50S ribosomal protein L1  58.52 
 
 		 229 aa  258  5.0000000000000005e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00156418  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1173  ribosomal protein L1  55.02 
 
 		 235 aa  258  8e-68  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000649528  unclonable  0.0000000262625 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0324  50S ribosomal protein L1  53.95 
 
 		 232 aa  257  1e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0128196  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23970  LSU ribosomal protein L1P  57.59 
 
 		 239 aa  256  2e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0702955  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1865  50S ribosomal protein L1  53.95 
 
 		 232 aa  256  2e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000283442  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3348  50S ribosomal protein L1  56.33 
 
 		 232 aa  255  3e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.728506  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0303  50S ribosomal protein L1  53.22 
 
 		 232 aa  256  3e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.13038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3655  50S ribosomal protein L1  52.38 
 
 		 232 aa  255  4e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0381514  hitchhiker  0.000000879291 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2851  50S ribosomal protein L1  52.79 
 
 		 232 aa  254  6e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441128  normal  0.418553 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3936  50S ribosomal protein L1  53.74 
 
 		 238 aa  254  6e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1633  50S ribosomal protein L1  54.59 
 
 		 235 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.858056  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2770  50S ribosomal protein L1  54.08 
 
 		 232 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1666  50S ribosomal protein L1  52.17 
 
 		 233 aa  254  1.0000000000000001e-66  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0783627  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0316  50S ribosomal protein L1  54.08 
 
 		 232 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00176824  normal  0.225661 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1209  ribosomal protein L1  54.55 
 
 		 231 aa  253  1.0000000000000001e-66  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000136712 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4328  50S ribosomal protein L1  54.19 
 
 		 238 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0337  50S ribosomal protein L1  54.08 
 
 		 232 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29393  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>