More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0568 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_0568  50S ribosomal protein L1  100 
 
 
232 aa  462  1e-129  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000788355  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0975  50S ribosomal protein L1  76.19 
 
 
232 aa  362  2e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0199586 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1820  50S ribosomal protein L1  76.42 
 
 
231 aa  362  2e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.186672  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1822  50S ribosomal protein L1  75.11 
 
 
232 aa  355  5e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.122687  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1321  50S ribosomal protein L1  76.79 
 
 
233 aa  352  2.9999999999999997e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.18039 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1419  50S ribosomal protein L1  78.18 
 
 
233 aa  352  4e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560035  normal  0.451837 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1944  50S ribosomal protein L1  77.39 
 
 
233 aa  348  6e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.160034  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3865  50S ribosomal protein L1  74.67 
 
 
231 aa  347  1e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.100026 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1208  50S ribosomal protein L1  76.96 
 
 
233 aa  346  2e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1247  50S ribosomal protein L1  76.96 
 
 
233 aa  346  2e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.123881  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2278  50S ribosomal protein L1  75.23 
 
 
229 aa  343  8.999999999999999e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.360769  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3691  50S ribosomal protein L1  73.89 
 
 
229 aa  343  1e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1344  50S ribosomal protein L1  74.24 
 
 
231 aa  343  1e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0377064  normal  0.0460128 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3200  50S ribosomal protein L1  74.77 
 
 
229 aa  342  2e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3471  50S ribosomal protein L1  74.77 
 
 
230 aa  342  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409515  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1347  50S ribosomal protein L1  75.45 
 
 
230 aa  328  3e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1896  50S ribosomal protein L1  73.36 
 
 
235 aa  328  3e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0132214  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2726  ribosomal protein L1  70.67 
 
 
233 aa  327  9e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181132  normal  0.31349 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0365  50S ribosomal protein L1  72.49 
 
 
235 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.716572  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3361  50S ribosomal protein L1  71.86 
 
 
232 aa  325  4.0000000000000003e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.235181  normal  0.159163 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1702  50S ribosomal protein L1  66.38 
 
 
232 aa  324  6e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.311882  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0336  50S ribosomal protein L1  66.38 
 
 
232 aa  324  6e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28407  normal  0.840151 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0350  50S ribosomal protein L1  66.38 
 
 
232 aa  324  6e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.81183  normal  0.731209 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2545  50S ribosomal protein L1  66.81 
 
 
232 aa  323  1e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5086  50S ribosomal protein L1  73.01 
 
 
230 aa  320  9.999999999999999e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00155922  normal  0.872957 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1528  50S ribosomal protein L1  72.57 
 
 
230 aa  319  1.9999999999999998e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3843  50S ribosomal protein L1  72.05 
 
 
232 aa  319  3e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.528602  normal  0.697118 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1805  50S ribosomal protein L1P  68 
 
 
232 aa  317  7.999999999999999e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.163663 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0261  50S ribosomal protein L1  66.96 
 
 
232 aa  316  2e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2564  50S ribosomal protein L1  64.19 
 
 
232 aa  316  2e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0511824 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0744  50S ribosomal protein L1  67.7 
 
 
233 aa  316  2e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00583178 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0230  50S ribosomal protein L1  67.26 
 
 
232 aa  315  3e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.365606  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2957  50S ribosomal protein L1  66.97 
 
 
231 aa  309  2.9999999999999997e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0502013 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0564  50S ribosomal protein L1  65.04 
 
 
232 aa  306  2.0000000000000002e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1955  50S ribosomal protein L1  66.07 
 
 
230 aa  296  2e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.923861  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4480  50S ribosomal protein L1  71.88 
 
 
232 aa  292  4e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0876536  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1441  50S ribosomal protein L1  61.78 
 
 
232 aa  291  5e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0252476  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4368  50S ribosomal protein L1  71.43 
 
 
232 aa  291  7e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3999  50S ribosomal protein L1  71.43 
 
 
232 aa  291  7e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.981145 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2698  50S ribosomal protein L1  67.25 
 
 
233 aa  280  1e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0834  50S ribosomal protein L1  59.13 
 
 
233 aa  271  5.000000000000001e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1589  50S ribosomal protein L1  62.26 
 
 
234 aa  271  6e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2362  50S ribosomal protein L1  60.55 
 
 
234 aa  271  7e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.193513  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2274  50S ribosomal protein L1  60.55 
 
 
234 aa  271  7e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0923  50S ribosomal protein L1  58.41 
 
 
233 aa  270  2e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2471  50S ribosomal protein L1  57.78 
 
 
231 aa  269  2.9999999999999997e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000180886  hitchhiker  0.00777473 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0616  50S ribosomal protein L1  57.33 
 
 
234 aa  268  5e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000217065 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3338  50S ribosomal protein L1  57.52 
 
 
233 aa  267  1e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000142685 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2723  ribosomal protein L1  55.56 
 
 
233 aa  266  2e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2224  50S ribosomal protein L1  63.59 
 
 
234 aa  266  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.009605 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1058  50S ribosomal protein L1  56.39 
 
 
233 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.30711  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2866  50S ribosomal protein L1  57.71 
 
 
234 aa  264  8e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0670  50S ribosomal protein L1  56.47 
 
 
233 aa  264  8e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.759589  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0525  50S ribosomal protein L1  56 
 
 
233 aa  263  2e-69  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.546526  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0506  50S ribosomal protein L1  56 
 
 
233 aa  263  2e-69  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.0000000000000573906  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1459  50S ribosomal protein L1  56 
 
 
233 aa  263  2e-69  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000386293  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2851  50S ribosomal protein L1  53.45 
 
 
232 aa  262  3e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441128  normal  0.418553 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0265  50S ribosomal protein L1  53.45 
 
 
232 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.516489  normal  0.64831 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0256  50S ribosomal protein L1  53.45 
 
 
232 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0257763  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0043  50S ribosomal protein L1  55.84 
 
 
233 aa  259  2e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000236116  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1336  50S ribosomal protein L1  57.52 
 
 
233 aa  259  2e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.167533  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3655  50S ribosomal protein L1  53.02 
 
 
232 aa  259  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0381514  hitchhiker  0.000000879291 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3348  50S ribosomal protein L1  57.33 
 
 
232 aa  259  3e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.728506  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4434  50S ribosomal protein L1  67.49 
 
 
229 aa  259  3e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0350  50S ribosomal protein L1  55.36 
 
 
230 aa  259  3e-68  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0156912  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2770  50S ribosomal protein L1  53.02 
 
 
232 aa  259  3e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0316  50S ribosomal protein L1  53.02 
 
 
232 aa  259  3e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00176824  normal  0.225661 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0337  50S ribosomal protein L1  53.02 
 
 
232 aa  259  3e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29393  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0303  50S ribosomal protein L1  52.59 
 
 
232 aa  258  4e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.13038  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0039  50S ribosomal protein L1  55.84 
 
 
233 aa  258  4e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00138059  hitchhiker  0.00000000000807787 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0691  50S ribosomal protein L1  56.95 
 
 
233 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.4447699999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1530  50S ribosomal protein L1  56.05 
 
 
230 aa  257  1e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000127232  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3436  50S ribosomal protein L1  52.59 
 
 
232 aa  256  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14587  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2970  50S ribosomal protein L1  54.15 
 
 
231 aa  256  3e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3317  50S ribosomal protein L1  54.15 
 
 
231 aa  256  3e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.809364  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0238  50S ribosomal protein L1  51.72 
 
 
232 aa  255  3e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.629603  normal  0.0137855 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4772  50S ribosomal protein L1  52.84 
 
 
232 aa  255  4e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0687152  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3037  50S ribosomal protein L1  52.84 
 
 
231 aa  254  8e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0489009 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2644  50S ribosomal protein L1  53.33 
 
 
232 aa  254  9e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0687921  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3466  50S ribosomal protein L1  53.33 
 
 
232 aa  254  9e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0147067  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3789  50S ribosomal protein L1  53.33 
 
 
232 aa  254  9e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.042669  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3819  50S ribosomal protein L1  53.33 
 
 
232 aa  254  9e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3079  50S ribosomal protein L1  53.33 
 
 
232 aa  254  9e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.22613  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3757  50S ribosomal protein L1  53.33 
 
 
232 aa  254  9e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0092623  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1911  50S ribosomal protein L1  53.33 
 
 
232 aa  254  9e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00000000299291  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3181  50S ribosomal protein L1  53.33 
 
 
232 aa  254  9e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000145836  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0395  50S ribosomal protein L1P  52.44 
 
 
231 aa  253  1.0000000000000001e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.780238  hitchhiker  0.00704539 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3870  ribosomal protein L1  53.28 
 
 
237 aa  253  2.0000000000000002e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01060  ribosomal protein L1  52.89 
 
 
235 aa  251  5.000000000000001e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.745230000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0446  50S ribosomal protein L1  55.11 
 
 
233 aa  251  6e-66  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0241504  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0837  50S ribosomal protein L1P  60.26 
 
 
229 aa  251  6e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0423664  normal  0.0981496 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2993  50S ribosomal protein L1  53.48 
 
 
235 aa  249  2e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0756  50S ribosomal protein L1  53.48 
 
 
230 aa  249  2e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00228  50S ribosomal protein L1  50.86 
 
 
233 aa  249  3e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0868  ribosomal protein L1  50.66 
 
 
231 aa  249  3e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002170  LSU ribosomal protein L1p (L10Ae)  50.86 
 
 
233 aa  249  3e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000179792  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00693  ribosomal protein L1  50.86 
 
 
282 aa  249  3e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000527661  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0275  50S ribosomal protein L1  54.42 
 
 
232 aa  248  4e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000501108  hitchhiker  0.000549627 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0182  LSU ribosomal protein L1P  55.87 
 
 
233 aa  248  8e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000240107  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1173  ribosomal protein L1  55.76 
 
 
235 aa  247  9e-65  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000649528  unclonable  0.0000000262625 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>