More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0275 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_0275  50S ribosomal protein L1  100 
 
 		 232 aa  464  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000501108  hitchhiker  0.000549627 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0212  50S ribosomal protein L1  75.86 
 
 		 231 aa  362  2e-99  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0231088  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2471  50S ribosomal protein L1  73.89 
 
 		 231 aa  350  1e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000180886  hitchhiker  0.00777473 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0204  ribosomal protein L1  75.22 
 
 		 229 aa  340  1e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000198509  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1928  ribosomal protein L1  73.91 
 
 		 232 aa  337  8e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0450124  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2723  ribosomal protein L1  67.25 
 
 		 233 aa  325  4.0000000000000003e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0407  50S ribosomal protein L1  72.05 
 
 		 230 aa  323  1e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.3464e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1530  50S ribosomal protein L1  67.7 
 
 		 230 aa  323  1e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000127232  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2345  ribosomal protein L1  67.86 
 
 		 233 aa  319  3e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0238114  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2866  50S ribosomal protein L1  65.22 
 
 		 234 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01060  ribosomal protein L1  64.63 
 
 		 235 aa  311  3.9999999999999997e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.745230000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0616  50S ribosomal protein L1  65.65 
 
 		 234 aa  311  4.999999999999999e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000217065 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0179  50S ribosomal protein L1  64.35 
 
 		 231 aa  308  5e-83  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000606052  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0182  LSU ribosomal protein L1P  63.72 
 
 		 233 aa  304  6e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000240107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0670  50S ribosomal protein L1  63.64 
 
 		 233 aa  304  8.000000000000001e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.759589  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1058  50S ribosomal protein L1  63.64 
 
 		 233 aa  302  2.0000000000000002e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.30711  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2721  50S ribosomal protein L1  65.5 
 
 		 231 aa  302  4.0000000000000003e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127574  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0561  50S ribosomal protein L1  63.44 
 
 		 230 aa  301  7.000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000069455  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0575  50S ribosomal protein L1  63.44 
 
 		 230 aa  301  7.000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000352195  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1336  50S ribosomal protein L1  63.64 
 
 		 233 aa  300  1e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.167533  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2725  50S ribosomal protein L1  66.37 
 
 		 229 aa  300  1e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000462552  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2411  50S ribosomal protein L1  66.37 
 
 		 229 aa  300  1e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000512351  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0309  50S ribosomal protein L1  64.6 
 
 		 230 aa  300  2e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0170319  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0092  50S ribosomal protein L1  68.26 
 
 		 230 aa  297  9e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000171982  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0691  50S ribosomal protein L1  64.86 
 
 		 233 aa  297  1e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.4447699999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1373  50S ribosomal protein L1  61.37 
 
 		 242 aa  296  3e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00191675  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4679  50S ribosomal protein L1  63.04 
 
 		 235 aa  295  4e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000682303  decreased coverage  0.0030741 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0098  50S ribosomal protein L1  68.26 
 
 		 230 aa  293  1e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000678721  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0098  50S ribosomal protein L1  68.26 
 
 		 230 aa  293  1e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000382446  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0094  50S ribosomal protein L1  68.26 
 
 		 230 aa  293  1e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.15488e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0092  50S ribosomal protein L1  68.26 
 
 		 230 aa  293  1e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000339498  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0109  50S ribosomal protein L1  68.26 
 
 		 230 aa  293  1e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9844e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0098  50S ribosomal protein L1  68.26 
 
 		 230 aa  293  1e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000205875  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0128  50S ribosomal protein L1  68.26 
 
 		 230 aa  293  1e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000143327  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0856  50S ribosomal protein L1  64.91 
 
 		 230 aa  293  2e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000185888  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5208  50S ribosomal protein L1  67.39 
 
 		 230 aa  293  2e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140164  unclonable  7.070390000000001e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0118  50S ribosomal protein L1  67.83 
 
 		 230 aa  292  4e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000153199  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0099  50S ribosomal protein L1  65.65 
 
 		 233 aa  291  5e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000132548  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0923  50S ribosomal protein L1  62.83 
 
 		 233 aa  289  3e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0095  50S ribosomal protein L1  65.22 
 
 		 233 aa  288  4e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3338  50S ribosomal protein L1  61.95 
 
 		 233 aa  288  6e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000142685 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0354  50S ribosomal protein L1  61.06 
 
 		 229 aa  287  8e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000103528  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0093  50S ribosomal protein L1  66.96 
 
 		 230 aa  287  8e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000014838  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1510  ribosomal protein L1  61.5 
 
 		 235 aa  286  2e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000430301  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3692  ribosomal protein L1  62.28 
 
 		 230 aa  286  2e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000151678  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0480  50S ribosomal protein L1  58.7 
 
 		 233 aa  286  2e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.841279  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1546  ribosomal protein L1  59.73 
 
 		 234 aa  286  2.9999999999999996e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.826154 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0465  50S ribosomal protein L1  59.13 
 
 		 233 aa  284  7e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00222885  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0309  50S ribosomal protein L1  61.61 
 
 		 253 aa  284  8e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000338213  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0388  ribosomal protein L1  59.21 
 
 		 241 aa  282  3.0000000000000004e-75  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0357  50S ribosomal protein L1  58.41 
 
 		 230 aa  281  4.0000000000000003e-75  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000538139 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0316  50S ribosomal protein L1  59.11 
 
 		 229 aa  280  1e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000103871  hitchhiker  0.000950319 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0643  50S ribosomal protein L1  56.28 
 
 		 232 aa  280  1e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0857628  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4019  ribosomal protein L1  58.04 
 
 		 235 aa  279  2e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.534035 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2993  50S ribosomal protein L1  60 
 
 		 235 aa  277  9e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1173  ribosomal protein L1  57.39 
 
 		 235 aa  277  1e-73  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000649528  unclonable  0.0000000262625 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2657  50S ribosomal protein L1P  59.82 
 
 		 235 aa  277  1e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.106941  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1822  50S ribosomal protein L1  60.18 
 
 		 232 aa  275  6e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.122687  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1146  ribosomal protein L1  59.29 
 
 		 236 aa  274  8e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000284572  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0699  ribosomal protein L1  58.41 
 
 		 234 aa  273  1.0000000000000001e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0241249  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2784  ribosomal protein L1  55.65 
 
 		 234 aa  272  3e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0008683  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2165  50S ribosomal protein L1P  58.11 
 
 		 230 aa  272  3e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2283  50S ribosomal protein L1  59.03 
 
 		 229 aa  271  6e-72  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00159003  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1589  50S ribosomal protein L1  60.65 
 
 		 234 aa  270  2e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2362  50S ribosomal protein L1  60.65 
 
 		 234 aa  269  2e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.193513  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2274  50S ribosomal protein L1  60.65 
 
 		 234 aa  269  2e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1633  50S ribosomal protein L1  56.09 
 
 		 235 aa  268  4e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.858056  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3471  50S ribosomal protein L1  58.77 
 
 		 230 aa  267  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0193  50S ribosomal protein L1  59.29 
 
 		 229 aa  266  2e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000225522  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0230  50S ribosomal protein L1  58.41 
 
 		 229 aa  266  2e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000338743  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0442  50S ribosomal protein L1  59.29 
 
 		 235 aa  266  2e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1452  50S ribosomal protein L1  60 
 
 		 235 aa  265  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0446  50S ribosomal protein L1  56.09 
 
 		 233 aa  266  2.9999999999999995e-70  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0241504  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0066  50S ribosomal protein L1  54.22 
 
 		 226 aa  265  5e-70  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1419  50S ribosomal protein L1  58.77 
 
 		 233 aa  265  5e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560035  normal  0.451837 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0975  50S ribosomal protein L1  57.58 
 
 		 232 aa  264  7e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0199586 
 
 
-
 
NC_002620  TC0592  50S ribosomal protein L1  52.61 
 
 		 232 aa  264  1e-69  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0784244  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2075  ribosomal protein L1  58.26 
 
 		 234 aa  263  1e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2682  50S ribosomal protein L1  58.85 
 
 		 229 aa  263  1e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000286692  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1321  50S ribosomal protein L1  58.59 
 
 		 233 aa  264  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.18039 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4354  ribosomal protein L1  58.48 
 
 		 236 aa  263  1e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2224  50S ribosomal protein L1  57.6 
 
 		 234 aa  263  2e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.009605 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1475  50S ribosomal protein L1  55.26 
 
 		 237 aa  263  2e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0729357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0350  ribosomal protein L1  55.75 
 
 		 234 aa  263  2e-69  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0695995  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3691  50S ribosomal protein L1  59.28 
 
 		 229 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3200  50S ribosomal protein L1  57.96 
 
 		 229 aa  262  3e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1940  50S ribosomal protein L1  57.39 
 
 		 229 aa  262  3e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.559759  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2957  50S ribosomal protein L1  55.75 
 
 		 231 aa  262  4e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0502013 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2278  50S ribosomal protein L1  58.37 
 
 		 229 aa  261  6e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.360769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2545  50S ribosomal protein L1  56.71 
 
 		 232 aa  261  6.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0358  50S ribosomal protein L1  57.08 
 
 		 236 aa  261  8.999999999999999e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.235543  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0525  50S ribosomal protein L1  54.35 
 
 		 233 aa  260  1e-68  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.546526  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1489  ribosomal protein L1  54.67 
 
 		 226 aa  260  1e-68  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0841065  normal  0.34693 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1965  50S ribosomal protein L1  60.18 
 
 		 229 aa  260  1e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0834753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0506  50S ribosomal protein L1  54.35 
 
 		 233 aa  260  1e-68  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.0000000000000573906  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1459  50S ribosomal protein L1  54.35 
 
 		 233 aa  260  1e-68  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000386293  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0336  50S ribosomal protein L1  56.28 
 
 		 232 aa  259  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28407  normal  0.840151 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0350  50S ribosomal protein L1  56.28 
 
 		 232 aa  259  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.81183  normal  0.731209 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1702  50S ribosomal protein L1  56.28 
 
 		 232 aa  259  2e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.311882  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2726  ribosomal protein L1  55.41 
 
 		 233 aa  259  2e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181132  normal  0.31349 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>